Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FXK8

Protein Details
Accession C5FXK8    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-50DSDTELPLKRQKKKPETQALDMMAHydrophilic
333-360KEAKEAKQDNRNSKKRKRSETKGPGAHVBasic
768-792GGAGSIKRWDKRHKKYVLRQNDEDGHydrophilic
841-864STGGIPSRKYRHNKEQAPKAADKYHydrophilic
900-930LKNSEDIRKARKQLEKRKEKNARPSKKGKGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
333-354KEAKEAKQDNRNSKKRKRSETK
779-779R
819-827WKKGKRLGR
851-930RHNKEQAPKAADKYRGDYEKMKKKGDAMQKRREDAGLPTYGGKKNVKSELKNSEDIRKARKQLEKRKEKNARPSKKGKGR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.666, nucl 11.5, cyto 11.5, cyto_mito 8.333, mito_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012541  DBP10_C  
IPR033517  DDX54/DBP10_DEAD-box_helicase  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08147  DBP10CT  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17959  DEADc_DDX54  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MRQRAASPAQSEAEFDICKSLFAADDDSDTELPLKRQKKKPETQALDMMAELEGDGEDDGDATFIAAEQSVMNRKASTLKGRTVKKGGGFQAMGLNPNLLKAITRKGFSVPTPIQRKTIPLLLDDQDVVGMARTGSGKTAAFVIPMIEKLKSHSTKVGARGLILSPSRELALQTLKVVKELGRGTDLKCVLLVGGDSLEEQFGYMAGNPDIIIATPGRFLHLKVEMSLDLSSIRLFEMGFAAQLTEILHALPSSRQTLLFSATLPKSLVEFARAGLQEPTLIRLDADSKISPELQSAFFTVKSADKEGALLHILHDLIKIPTGETEAGKLAAKEAKEAKQDNRNSKKRKRSETKGPGAHVIPAEHSTIVFVATKHHVEYIATLLRHSGFAVSYAYGSLNQTARKIQVQNFRAGISNILVVTDVAARGIDIPVLANVINYDFPSQPKIFIHRVGRTARAGQKGWSYSLIRDSDAPYLIDLQLFLGRQLLMGRAATENANYAEDIVVGSLPRRSLESHCEYVDKLLSEDVDIEGLRSVSIRGEKLYMKTRNSASAESAKRAKDIVAADAWGTMHPLFNDESSRLEAEREQMLARVGGYKPQETVFEVMGKRGGKSGNEEAVEVMRKIRSVMERKKLRRELASQSLPLQNTQAAQIDDESGENMSDASAKEDDDAPIQGDPDMSLADESDLEVTFSYPKQGKSRSNTQDGNQSNSFQNPEYFMSYTPTSISLTENRGYGVHTGSNSNTSFVEASRSATMDLNGDEGARGLGGAGSIKRWDKRHKKYVLRQNDEDGSKGEKLVRGESGAKIAASFRSGRFDSWKKGKRLGRLPRVGEMENSNLGSTGGIPSRKYRHNKEQAPKAADKYRGDYEKMKKKGDAMQKRREDAGLPTYGGKKNVKSELKNSEDIRKARKQLEKRKEKNARPSKKGKGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.2
3 0.21
4 0.18
5 0.18
6 0.17
7 0.16
8 0.14
9 0.15
10 0.18
11 0.14
12 0.16
13 0.17
14 0.2
15 0.19
16 0.18
17 0.19
18 0.18
19 0.21
20 0.28
21 0.36
22 0.43
23 0.52
24 0.62
25 0.71
26 0.79
27 0.86
28 0.88
29 0.87
30 0.84
31 0.83
32 0.75
33 0.65
34 0.54
35 0.44
36 0.32
37 0.24
38 0.17
39 0.09
40 0.06
41 0.05
42 0.05
43 0.04
44 0.04
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.05
55 0.05
56 0.1
57 0.16
58 0.18
59 0.19
60 0.19
61 0.21
62 0.26
63 0.32
64 0.38
65 0.37
66 0.44
67 0.52
68 0.58
69 0.64
70 0.65
71 0.64
72 0.59
73 0.61
74 0.57
75 0.56
76 0.49
77 0.43
78 0.44
79 0.4
80 0.36
81 0.29
82 0.26
83 0.18
84 0.19
85 0.18
86 0.1
87 0.11
88 0.12
89 0.21
90 0.24
91 0.26
92 0.26
93 0.29
94 0.34
95 0.33
96 0.4
97 0.36
98 0.42
99 0.49
100 0.5
101 0.5
102 0.47
103 0.5
104 0.44
105 0.44
106 0.35
107 0.29
108 0.32
109 0.3
110 0.3
111 0.27
112 0.22
113 0.16
114 0.15
115 0.13
116 0.08
117 0.07
118 0.05
119 0.06
120 0.07
121 0.08
122 0.09
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.14
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.13
133 0.15
134 0.13
135 0.13
136 0.16
137 0.26
138 0.27
139 0.29
140 0.32
141 0.36
142 0.41
143 0.47
144 0.49
145 0.4
146 0.38
147 0.37
148 0.33
149 0.33
150 0.28
151 0.24
152 0.18
153 0.18
154 0.18
155 0.16
156 0.15
157 0.13
158 0.17
159 0.17
160 0.19
161 0.23
162 0.22
163 0.22
164 0.23
165 0.2
166 0.22
167 0.22
168 0.22
169 0.22
170 0.24
171 0.24
172 0.31
173 0.3
174 0.24
175 0.22
176 0.2
177 0.15
178 0.14
179 0.13
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.09
203 0.09
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.15
208 0.2
209 0.2
210 0.19
211 0.21
212 0.19
213 0.2
214 0.2
215 0.15
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.07
220 0.07
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.07
225 0.06
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.07
239 0.09
240 0.11
241 0.11
242 0.12
243 0.13
244 0.15
245 0.17
246 0.16
247 0.15
248 0.19
249 0.18
250 0.19
251 0.18
252 0.17
253 0.15
254 0.16
255 0.16
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.16
260 0.16
261 0.17
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.14
266 0.17
267 0.12
268 0.12
269 0.1
270 0.1
271 0.13
272 0.12
273 0.15
274 0.13
275 0.13
276 0.14
277 0.15
278 0.14
279 0.13
280 0.14
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.13
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.14
290 0.15
291 0.14
292 0.13
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.12
297 0.1
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.07
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.09
312 0.1
313 0.1
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.1
318 0.12
319 0.12
320 0.14
321 0.18
322 0.21
323 0.26
324 0.3
325 0.34
326 0.4
327 0.47
328 0.54
329 0.61
330 0.66
331 0.7
332 0.76
333 0.82
334 0.82
335 0.86
336 0.85
337 0.83
338 0.85
339 0.86
340 0.87
341 0.81
342 0.74
343 0.66
344 0.57
345 0.5
346 0.39
347 0.29
348 0.2
349 0.16
350 0.15
351 0.11
352 0.1
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.06
358 0.08
359 0.11
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.11
364 0.11
365 0.11
366 0.13
367 0.14
368 0.13
369 0.13
370 0.13
371 0.13
372 0.13
373 0.12
374 0.09
375 0.05
376 0.06
377 0.07
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.09
385 0.1
386 0.11
387 0.12
388 0.13
389 0.14
390 0.17
391 0.21
392 0.24
393 0.31
394 0.33
395 0.35
396 0.35
397 0.34
398 0.31
399 0.28
400 0.22
401 0.14
402 0.13
403 0.08
404 0.07
405 0.07
406 0.05
407 0.06
408 0.05
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.03
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.04
420 0.04
421 0.03
422 0.04
423 0.04
424 0.05
425 0.05
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.12
430 0.12
431 0.13
432 0.14
433 0.19
434 0.19
435 0.24
436 0.29
437 0.28
438 0.33
439 0.33
440 0.35
441 0.31
442 0.34
443 0.34
444 0.33
445 0.3
446 0.26
447 0.28
448 0.27
449 0.26
450 0.24
451 0.19
452 0.16
453 0.2
454 0.2
455 0.16
456 0.16
457 0.17
458 0.15
459 0.15
460 0.15
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.09
465 0.07
466 0.06
467 0.07
468 0.07
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.07
475 0.06
476 0.06
477 0.07
478 0.06
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.08
485 0.07
486 0.07
487 0.06
488 0.06
489 0.05
490 0.04
491 0.04
492 0.03
493 0.04
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.06
498 0.08
499 0.11
500 0.18
501 0.23
502 0.24
503 0.25
504 0.26
505 0.24
506 0.24
507 0.23
508 0.16
509 0.11
510 0.09
511 0.09
512 0.08
513 0.08
514 0.07
515 0.06
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.06
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.11
528 0.13
529 0.16
530 0.25
531 0.29
532 0.29
533 0.33
534 0.34
535 0.37
536 0.38
537 0.35
538 0.3
539 0.33
540 0.33
541 0.32
542 0.35
543 0.29
544 0.27
545 0.27
546 0.24
547 0.2
548 0.19
549 0.17
550 0.13
551 0.13
552 0.13
553 0.13
554 0.13
555 0.08
556 0.08
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.1
564 0.1
565 0.11
566 0.12
567 0.13
568 0.12
569 0.12
570 0.12
571 0.13
572 0.14
573 0.13
574 0.11
575 0.11
576 0.12
577 0.11
578 0.1
579 0.11
580 0.1
581 0.14
582 0.15
583 0.15
584 0.15
585 0.16
586 0.17
587 0.15
588 0.17
589 0.14
590 0.17
591 0.17
592 0.16
593 0.19
594 0.18
595 0.17
596 0.18
597 0.18
598 0.14
599 0.2
600 0.24
601 0.25
602 0.25
603 0.24
604 0.23
605 0.23
606 0.23
607 0.18
608 0.15
609 0.11
610 0.11
611 0.11
612 0.15
613 0.2
614 0.29
615 0.37
616 0.46
617 0.55
618 0.62
619 0.71
620 0.74
621 0.71
622 0.68
623 0.65
624 0.63
625 0.62
626 0.61
627 0.51
628 0.48
629 0.48
630 0.42
631 0.36
632 0.29
633 0.21
634 0.17
635 0.17
636 0.16
637 0.12
638 0.12
639 0.12
640 0.12
641 0.11
642 0.11
643 0.1
644 0.07
645 0.07
646 0.06
647 0.05
648 0.05
649 0.06
650 0.06
651 0.08
652 0.08
653 0.09
654 0.1
655 0.11
656 0.12
657 0.12
658 0.12
659 0.1
660 0.1
661 0.1
662 0.09
663 0.08
664 0.08
665 0.07
666 0.06
667 0.05
668 0.05
669 0.05
670 0.05
671 0.05
672 0.05
673 0.06
674 0.05
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.08
679 0.08
680 0.13
681 0.15
682 0.19
683 0.25
684 0.32
685 0.4
686 0.45
687 0.56
688 0.58
689 0.63
690 0.63
691 0.59
692 0.61
693 0.56
694 0.55
695 0.46
696 0.41
697 0.35
698 0.33
699 0.33
700 0.25
701 0.23
702 0.2
703 0.2
704 0.21
705 0.21
706 0.19
707 0.21
708 0.2
709 0.2
710 0.18
711 0.17
712 0.14
713 0.14
714 0.16
715 0.16
716 0.2
717 0.21
718 0.2
719 0.2
720 0.19
721 0.19
722 0.18
723 0.16
724 0.14
725 0.14
726 0.16
727 0.16
728 0.21
729 0.2
730 0.2
731 0.17
732 0.17
733 0.16
734 0.14
735 0.18
736 0.14
737 0.16
738 0.16
739 0.17
740 0.17
741 0.17
742 0.18
743 0.14
744 0.14
745 0.13
746 0.11
747 0.11
748 0.09
749 0.08
750 0.08
751 0.06
752 0.05
753 0.04
754 0.04
755 0.04
756 0.06
757 0.06
758 0.08
759 0.12
760 0.17
761 0.22
762 0.29
763 0.4
764 0.49
765 0.59
766 0.68
767 0.74
768 0.81
769 0.86
770 0.9
771 0.9
772 0.88
773 0.81
774 0.77
775 0.74
776 0.65
777 0.56
778 0.47
779 0.4
780 0.32
781 0.3
782 0.26
783 0.22
784 0.23
785 0.25
786 0.24
787 0.23
788 0.25
789 0.25
790 0.25
791 0.23
792 0.21
793 0.18
794 0.18
795 0.16
796 0.16
797 0.17
798 0.15
799 0.21
800 0.22
801 0.24
802 0.32
803 0.37
804 0.44
805 0.52
806 0.59
807 0.58
808 0.66
809 0.7
810 0.71
811 0.75
812 0.76
813 0.76
814 0.77
815 0.75
816 0.73
817 0.72
818 0.64
819 0.56
820 0.49
821 0.42
822 0.36
823 0.33
824 0.26
825 0.21
826 0.2
827 0.16
828 0.13
829 0.13
830 0.15
831 0.16
832 0.18
833 0.25
834 0.32
835 0.41
836 0.49
837 0.55
838 0.62
839 0.71
840 0.79
841 0.83
842 0.86
843 0.87
844 0.85
845 0.81
846 0.77
847 0.73
848 0.71
849 0.64
850 0.59
851 0.58
852 0.55
853 0.54
854 0.56
855 0.59
856 0.62
857 0.66
858 0.65
859 0.58
860 0.59
861 0.64
862 0.66
863 0.67
864 0.66
865 0.7
866 0.74
867 0.75
868 0.72
869 0.65
870 0.56
871 0.51
872 0.48
873 0.41
874 0.33
875 0.34
876 0.37
877 0.39
878 0.43
879 0.41
880 0.39
881 0.43
882 0.52
883 0.57
884 0.57
885 0.62
886 0.66
887 0.68
888 0.7
889 0.66
890 0.66
891 0.65
892 0.65
893 0.65
894 0.64
895 0.65
896 0.67
897 0.73
898 0.75
899 0.77
900 0.83
901 0.86
902 0.85
903 0.88
904 0.9
905 0.9
906 0.9
907 0.9
908 0.9
909 0.88
910 0.9