FuNGI

C5FVZ0

Protein Details

Accession

C5FVZ0

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
330-350	GGTPVRKKKRKGAQTNPSAYS	Hydrophilic
435-460	LDKWDDRRVHAKRKGAQGRRGKNGNE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
121-126	KGKGKK
335-340	RKKKRK
443-456	VHAKRKGAQGRRGK

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPTKQWMYVNSLDKKSATKYQLFHRSQNDPLIHDPEAEDRILHVVGGPNPASSAKPSSSKRETGTLRDLDEEFKSATRKNEGEAANYGIFYDDSKYDYMQHLRGLDEGVGGSHFIEAKTKGKGKKGMKLEDALKEISLDGDSADDFTYGDANDDILSTASSYVRKATYQDQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREALEALEDDAYVDEECDEDIFDNLVAGGHDAEVDPDEWRDTYIEEDEGWESDATEKAPVQHDKSTDSQIPVTPDSASDTNKPSQPPNNEQIPDMEEHEGDWLKEFAKYKKDIKGNKGVANGDDNASELRTTASTLFTLGGTPVRKKKRKGAQTNPSAYSMTSSSLARTEGHRLLDDRFERMEALYSLDEGEEYEGSSMADDMSVASGLSRFSRFSKLSQAPSLVANDRDVPLRSDFNDVMDGFLDKWDDRRVHAKRKGAQGRRGKNGNEVIGMKMLDEVRQGLGPPRLSTNAFGKV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.48
3	0.47
4	0.47
5	0.45
6	0.44
7	0.45
8	0.53
9	0.63
10	0.64
11	0.66
12	0.64
13	0.63
14	0.61
15	0.65
16	0.57
17	0.5
18	0.5
19	0.48
20	0.41
21	0.37
22	0.33
23	0.29
24	0.28
25	0.24
26	0.2
27	0.15
28	0.17
29	0.16
30	0.14
31	0.12
32	0.14
33	0.16
34	0.21
35	0.2
36	0.18
37	0.19
38	0.2
39	0.19
40	0.18
41	0.21
42	0.2
43	0.28
44	0.32
45	0.4
46	0.46
47	0.5
48	0.5
49	0.54
50	0.55
51	0.54
52	0.58
53	0.52
54	0.47
55	0.45
56	0.43
57	0.37
58	0.34
59	0.29
60	0.22
61	0.2
62	0.22
63	0.22
64	0.25
65	0.29
66	0.29
67	0.29
68	0.36
69	0.34
70	0.35
71	0.34
72	0.34
73	0.28
74	0.27
75	0.25
76	0.17
77	0.16
78	0.13
79	0.13
80	0.09
81	0.1
82	0.12
83	0.12
84	0.14
85	0.19
86	0.23
87	0.22
88	0.25
89	0.24
90	0.24
91	0.24
92	0.22
93	0.17
94	0.14
95	0.11
96	0.09
97	0.07
98	0.07
99	0.06
100	0.06
101	0.07
102	0.06
103	0.09
104	0.11
105	0.14
106	0.21
107	0.27
108	0.31
109	0.37
110	0.46
111	0.49
112	0.55
113	0.61
114	0.62
115	0.59
116	0.61
117	0.59
118	0.54
119	0.51
120	0.43
121	0.34
122	0.27
123	0.23
124	0.18
125	0.13
126	0.08
127	0.06
128	0.05
129	0.05
130	0.06
131	0.06
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.06
136	0.06
137	0.07
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.05
144	0.05
145	0.05
146	0.06
147	0.07
148	0.08
149	0.08
150	0.1
151	0.11
152	0.12
153	0.14
154	0.18
155	0.25
156	0.29
157	0.33
158	0.33
159	0.34
160	0.35
161	0.33
162	0.27
163	0.21
164	0.16
165	0.12
166	0.11
167	0.09
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.06
172	0.08
173	0.09
174	0.08
175	0.09
176	0.13
177	0.13
178	0.13
179	0.13
180	0.12
181	0.12
182	0.12
183	0.11
184	0.08
185	0.07
186	0.07
187	0.07
188	0.06
189	0.05
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.03
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.03
206	0.03
207	0.03
208	0.03
209	0.04
210	0.04
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.08
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.07
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.06
232	0.07
233	0.07
234	0.08
235	0.12
236	0.14
237	0.17
238	0.19
239	0.19
240	0.22
241	0.24
242	0.26
243	0.24
244	0.23
245	0.21
246	0.2
247	0.21
248	0.19
249	0.17
250	0.14
251	0.12
252	0.14
253	0.14
254	0.14
255	0.14
256	0.17
257	0.19
258	0.22
259	0.23
260	0.23
261	0.29
262	0.33
263	0.37
264	0.39
265	0.43
266	0.41
267	0.4
268	0.38
269	0.33
270	0.28
271	0.24
272	0.19
273	0.12
274	0.11
275	0.13
276	0.12
277	0.1
278	0.1
279	0.08
280	0.08
281	0.11
282	0.14
283	0.16
284	0.22
285	0.27
286	0.31
287	0.38
288	0.46
289	0.5
290	0.53
291	0.6
292	0.59
293	0.59
294	0.58
295	0.51
296	0.44
297	0.4
298	0.34
299	0.24
300	0.19
301	0.15
302	0.11
303	0.11
304	0.09
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.08
312	0.09
313	0.09
314	0.08
315	0.08
316	0.08
317	0.11
318	0.12
319	0.17
320	0.25
321	0.35
322	0.42
323	0.47
324	0.56
325	0.62
326	0.71
327	0.77
328	0.8
329	0.8
330	0.83
331	0.85
332	0.78
333	0.7
334	0.59
335	0.48
336	0.39
337	0.29
338	0.21
339	0.15
340	0.13
341	0.12
342	0.12
343	0.14
344	0.13
345	0.14
346	0.19
347	0.2
348	0.22
349	0.23
350	0.23
351	0.24
352	0.31
353	0.3
354	0.27
355	0.24
356	0.23
357	0.22
358	0.21
359	0.21
360	0.14
361	0.15
362	0.13
363	0.12
364	0.12
365	0.11
366	0.11
367	0.08
368	0.09
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.05
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.05
382	0.04
383	0.04
384	0.05
385	0.06
386	0.08
387	0.09
388	0.11
389	0.13
390	0.21
391	0.22
392	0.24
393	0.34
394	0.39
395	0.43
396	0.45
397	0.45
398	0.39
399	0.4
400	0.41
401	0.34
402	0.29
403	0.25
404	0.23
405	0.22
406	0.24
407	0.23
408	0.22
409	0.22
410	0.24
411	0.24
412	0.28
413	0.27
414	0.26
415	0.29
416	0.26
417	0.23
418	0.21
419	0.2
420	0.14
421	0.15
422	0.15
423	0.11
424	0.14
425	0.2
426	0.21
427	0.23
428	0.34
429	0.41
430	0.5
431	0.57
432	0.64
433	0.64
434	0.74
435	0.81
436	0.8
437	0.81
438	0.81
439	0.83
440	0.83
441	0.83
442	0.74
443	0.72
444	0.7
445	0.63
446	0.58
447	0.5
448	0.42
449	0.38
450	0.35
451	0.27
452	0.24
453	0.21
454	0.17
455	0.17
456	0.16
457	0.15
458	0.16
459	0.17
460	0.19
461	0.25
462	0.27
463	0.27
464	0.3
465	0.32
466	0.33
467	0.36

C5FVZ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer