Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FV27

Protein Details
Accession C5FV27    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-26GSDGDIDPRRKRRRISPPETGPYVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-15RRKRRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MGSDGDIDPRRKRRRISPPETGPYVLRPLLEDVPVQAEDGEGQAHITCVEYWNENLYVGTSAGEILHFVSLPPEPGLEDGSPSFILASRQPITSLARSTSSSGIQQILVLPTASKACVLCNGSVFFYSLPELSPAYGTTKVSNCNWIGGLDLDEPNMDDGDEAPDPIIMLGMQDKIMLVRIGEGPRRVRNIEFPGCLIANRRGTIACVADSRSYALLEVEHRQKIPLFPISSNDEYDDFKVENIPSRSSSPALDKVLAASNGNSGAKSHGRSTSLNAIAASSERHQQGVQPDISGTSTPESLADSKSSKPTGSHDRRLSIPSRSPSAAPADGLGQKPLPPTPTPTPKRNTATLKPHIMSPTPSEFLLITGTDASNPAVGMFVNLEGETAERGTIEFQTYPDAIVLDNGGNDPRSNPSGNSDDGYILAVVNIAADAEEGCAEEKCLEVQRWDVNPGEGERQRSLITISLENHNAGPVGIGQTVSPNNVNFADVGELLQVVRLNVPDLRTPGSVTPPKSSDPRTEASIEQLQKEKELFENDSDGSKHGSSVKPRRGWEAERNEEESNFAKTLGYVQSNIVLWEGSQIWRVLRNPLALQLENALLLTQDLEGARSCRIANKAAIIEMMGGLDSILPRTATESLGLNYVKEKASLLLFRDLIATEPEHQTPSAIKAVEDALTAGELDPRIILLFTPLLREEILQGPQGIWVCAGLTKVVDAFLEVSGEQDGATKFNLTEPVLRMLVRYLTSWHLKRGYGSVTDDTYVFDSVDSALLRLLLHLDAKHNEANGMASASAVRPELNRLVDNWKGNFTRAVELLELYQRLFVLSRLYQSRKMAGHVLRTWRRTIEGEKDVGGEMTIPAVELQVRKYLVKIRDPNLVEEYGLWLAARNPKLGIQVFSDDTSRVQLDPPQVIRILKDRAPGAVQVYLEHLVFTKNITRYADDLISYYLDTVLSVLESSPEARSSLIESYSTYRALRPPKPSYLSFISDNAPSEPWWQSRLRLLQLLGSGARSQFTSATSPPSDLPYSIPAVLERIEPFKNELVSECIILGGRQGRHHDALHLLTHGLGDYDSAIRYCLFEGSGTAPQSMFLRKFSPSESQKELFAGLLREFLQITDPYDRTERTGDLLARFAPLFDVREVLDLIPHDWSVDVLSEYFARALRDLVSESRNAKVQRALSAGLNLKVCADFIKESEKIGGWIQNVDQIKPLKGDRDKGVQSEPGAATVAGNEEPPNDAGAQIRPDDTLKIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.83
3 0.83
4 0.84
5 0.84
6 0.85
7 0.82
8 0.74
9 0.64
10 0.57
11 0.53
12 0.43
13 0.33
14 0.27
15 0.27
16 0.28
17 0.27
18 0.24
19 0.2
20 0.22
21 0.22
22 0.2
23 0.15
24 0.13
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.06
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.1
36 0.13
37 0.14
38 0.15
39 0.19
40 0.19
41 0.18
42 0.18
43 0.16
44 0.15
45 0.14
46 0.13
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.09
57 0.09
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.16
64 0.14
65 0.15
66 0.14
67 0.16
68 0.16
69 0.15
70 0.15
71 0.12
72 0.14
73 0.14
74 0.21
75 0.2
76 0.2
77 0.21
78 0.24
79 0.28
80 0.3
81 0.31
82 0.27
83 0.27
84 0.28
85 0.3
86 0.3
87 0.27
88 0.25
89 0.24
90 0.23
91 0.21
92 0.2
93 0.19
94 0.18
95 0.16
96 0.14
97 0.12
98 0.12
99 0.13
100 0.13
101 0.12
102 0.11
103 0.11
104 0.18
105 0.2
106 0.2
107 0.22
108 0.24
109 0.23
110 0.24
111 0.23
112 0.17
113 0.16
114 0.16
115 0.13
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.14
123 0.16
124 0.17
125 0.2
126 0.23
127 0.27
128 0.28
129 0.33
130 0.3
131 0.3
132 0.29
133 0.25
134 0.23
135 0.19
136 0.2
137 0.16
138 0.16
139 0.14
140 0.13
141 0.14
142 0.13
143 0.12
144 0.09
145 0.06
146 0.06
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.04
156 0.05
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.09
164 0.09
165 0.07
166 0.09
167 0.14
168 0.18
169 0.23
170 0.28
171 0.32
172 0.37
173 0.42
174 0.42
175 0.4
176 0.43
177 0.48
178 0.49
179 0.45
180 0.41
181 0.39
182 0.37
183 0.36
184 0.32
185 0.3
186 0.28
187 0.27
188 0.27
189 0.24
190 0.25
191 0.28
192 0.25
193 0.2
194 0.17
195 0.19
196 0.19
197 0.19
198 0.2
199 0.17
200 0.15
201 0.14
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.19
206 0.24
207 0.25
208 0.25
209 0.27
210 0.28
211 0.29
212 0.31
213 0.32
214 0.29
215 0.27
216 0.31
217 0.37
218 0.37
219 0.35
220 0.32
221 0.26
222 0.25
223 0.26
224 0.24
225 0.17
226 0.15
227 0.18
228 0.17
229 0.23
230 0.24
231 0.25
232 0.25
233 0.27
234 0.29
235 0.27
236 0.28
237 0.26
238 0.3
239 0.3
240 0.29
241 0.26
242 0.25
243 0.28
244 0.27
245 0.22
246 0.16
247 0.15
248 0.17
249 0.17
250 0.15
251 0.11
252 0.15
253 0.18
254 0.2
255 0.21
256 0.22
257 0.25
258 0.26
259 0.31
260 0.35
261 0.34
262 0.33
263 0.29
264 0.26
265 0.23
266 0.22
267 0.2
268 0.12
269 0.16
270 0.15
271 0.16
272 0.16
273 0.19
274 0.23
275 0.28
276 0.27
277 0.22
278 0.22
279 0.21
280 0.22
281 0.19
282 0.15
283 0.1
284 0.1
285 0.09
286 0.09
287 0.11
288 0.11
289 0.12
290 0.14
291 0.15
292 0.17
293 0.22
294 0.23
295 0.22
296 0.22
297 0.27
298 0.35
299 0.42
300 0.49
301 0.49
302 0.5
303 0.52
304 0.55
305 0.53
306 0.48
307 0.46
308 0.41
309 0.41
310 0.39
311 0.37
312 0.35
313 0.36
314 0.3
315 0.23
316 0.2
317 0.19
318 0.21
319 0.21
320 0.2
321 0.15
322 0.15
323 0.17
324 0.18
325 0.18
326 0.16
327 0.22
328 0.29
329 0.4
330 0.44
331 0.5
332 0.53
333 0.58
334 0.62
335 0.63
336 0.62
337 0.6
338 0.64
339 0.64
340 0.66
341 0.58
342 0.57
343 0.51
344 0.45
345 0.38
346 0.34
347 0.31
348 0.26
349 0.25
350 0.22
351 0.2
352 0.19
353 0.18
354 0.13
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.04
378 0.05
379 0.06
380 0.07
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.12
385 0.12
386 0.12
387 0.11
388 0.1
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.08
399 0.1
400 0.13
401 0.14
402 0.14
403 0.17
404 0.2
405 0.21
406 0.21
407 0.19
408 0.16
409 0.15
410 0.15
411 0.11
412 0.07
413 0.06
414 0.05
415 0.04
416 0.04
417 0.03
418 0.03
419 0.02
420 0.02
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.04
426 0.04
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.06
431 0.09
432 0.1
433 0.1
434 0.13
435 0.18
436 0.19
437 0.21
438 0.21
439 0.18
440 0.19
441 0.2
442 0.24
443 0.21
444 0.23
445 0.21
446 0.22
447 0.21
448 0.21
449 0.2
450 0.16
451 0.16
452 0.16
453 0.17
454 0.18
455 0.19
456 0.19
457 0.18
458 0.15
459 0.13
460 0.1
461 0.08
462 0.06
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.08
468 0.09
469 0.1
470 0.1
471 0.09
472 0.1
473 0.11
474 0.11
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.07
479 0.08
480 0.06
481 0.06
482 0.05
483 0.06
484 0.06
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.06
489 0.07
490 0.09
491 0.1
492 0.11
493 0.14
494 0.14
495 0.15
496 0.15
497 0.21
498 0.24
499 0.24
500 0.25
501 0.25
502 0.27
503 0.3
504 0.31
505 0.3
506 0.3
507 0.3
508 0.3
509 0.3
510 0.28
511 0.28
512 0.32
513 0.28
514 0.25
515 0.27
516 0.24
517 0.22
518 0.23
519 0.19
520 0.15
521 0.17
522 0.17
523 0.14
524 0.16
525 0.16
526 0.17
527 0.16
528 0.15
529 0.14
530 0.12
531 0.12
532 0.13
533 0.16
534 0.23
535 0.32
536 0.39
537 0.43
538 0.44
539 0.49
540 0.49
541 0.52
542 0.53
543 0.53
544 0.52
545 0.49
546 0.52
547 0.46
548 0.42
549 0.38
550 0.3
551 0.23
552 0.16
553 0.14
554 0.1
555 0.09
556 0.12
557 0.12
558 0.12
559 0.1
560 0.1
561 0.12
562 0.12
563 0.12
564 0.1
565 0.07
566 0.06
567 0.07
568 0.07
569 0.06
570 0.07
571 0.08
572 0.08
573 0.11
574 0.12
575 0.13
576 0.15
577 0.16
578 0.15
579 0.19
580 0.21
581 0.18
582 0.18
583 0.16
584 0.14
585 0.12
586 0.12
587 0.07
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.03
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.05
596 0.06
597 0.06
598 0.07
599 0.07
600 0.1
601 0.12
602 0.13
603 0.14
604 0.15
605 0.15
606 0.14
607 0.14
608 0.11
609 0.09
610 0.07
611 0.06
612 0.04
613 0.03
614 0.03
615 0.03
616 0.03
617 0.03
618 0.03
619 0.03
620 0.03
621 0.05
622 0.06
623 0.06
624 0.07
625 0.08
626 0.08
627 0.11
628 0.11
629 0.1
630 0.1
631 0.11
632 0.11
633 0.1
634 0.1
635 0.08
636 0.09
637 0.11
638 0.12
639 0.14
640 0.14
641 0.14
642 0.14
643 0.13
644 0.12
645 0.11
646 0.1
647 0.09
648 0.1
649 0.11
650 0.11
651 0.11
652 0.11
653 0.1
654 0.12
655 0.13
656 0.11
657 0.11
658 0.11
659 0.12
660 0.12
661 0.11
662 0.08
663 0.05
664 0.05
665 0.06
666 0.05
667 0.05
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.04
675 0.04
676 0.05
677 0.06
678 0.07
679 0.07
680 0.08
681 0.08
682 0.08
683 0.09
684 0.1
685 0.12
686 0.11
687 0.11
688 0.1
689 0.12
690 0.12
691 0.1
692 0.07
693 0.06
694 0.05
695 0.06
696 0.06
697 0.05
698 0.04
699 0.04
700 0.04
701 0.05
702 0.04
703 0.04
704 0.05
705 0.05
706 0.05
707 0.05
708 0.05
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.06
713 0.06
714 0.06
715 0.07
716 0.07
717 0.07
718 0.08
719 0.11
720 0.1
721 0.13
722 0.14
723 0.16
724 0.17
725 0.17
726 0.16
727 0.14
728 0.15
729 0.12
730 0.11
731 0.1
732 0.13
733 0.19
734 0.2
735 0.24
736 0.24
737 0.24
738 0.24
739 0.25
740 0.24
741 0.2
742 0.22
743 0.2
744 0.18
745 0.18
746 0.17
747 0.15
748 0.14
749 0.12
750 0.09
751 0.07
752 0.06
753 0.06
754 0.08
755 0.07
756 0.06
757 0.06
758 0.06
759 0.06
760 0.06
761 0.06
762 0.05
763 0.06
764 0.07
765 0.1
766 0.1
767 0.13
768 0.14
769 0.13
770 0.13
771 0.12
772 0.12
773 0.1
774 0.09
775 0.06
776 0.05
777 0.06
778 0.06
779 0.06
780 0.06
781 0.06
782 0.06
783 0.09
784 0.12
785 0.14
786 0.14
787 0.15
788 0.2
789 0.24
790 0.27
791 0.25
792 0.27
793 0.26
794 0.26
795 0.27
796 0.24
797 0.22
798 0.2
799 0.2
800 0.15
801 0.15
802 0.15
803 0.14
804 0.13
805 0.1
806 0.1
807 0.08
808 0.08
809 0.08
810 0.08
811 0.1
812 0.1
813 0.14
814 0.2
815 0.23
816 0.27
817 0.28
818 0.33
819 0.3
820 0.31
821 0.34
822 0.31
823 0.35
824 0.35
825 0.43
826 0.44
827 0.45
828 0.45
829 0.39
830 0.39
831 0.35
832 0.35
833 0.34
834 0.32
835 0.31
836 0.3
837 0.3
838 0.27
839 0.24
840 0.19
841 0.11
842 0.07
843 0.06
844 0.05
845 0.04
846 0.04
847 0.04
848 0.06
849 0.06
850 0.08
851 0.11
852 0.13
853 0.13
854 0.15
855 0.22
856 0.25
857 0.33
858 0.39
859 0.38
860 0.45
861 0.46
862 0.48
863 0.44
864 0.39
865 0.3
866 0.23
867 0.23
868 0.15
869 0.14
870 0.1
871 0.07
872 0.1
873 0.16
874 0.17
875 0.16
876 0.16
877 0.18
878 0.23
879 0.24
880 0.23
881 0.19
882 0.21
883 0.21
884 0.22
885 0.21
886 0.17
887 0.16
888 0.16
889 0.14
890 0.12
891 0.11
892 0.14
893 0.17
894 0.21
895 0.22
896 0.22
897 0.23
898 0.23
899 0.24
900 0.26
901 0.27
902 0.24
903 0.26
904 0.25
905 0.25
906 0.26
907 0.25
908 0.22
909 0.2
910 0.18
911 0.15
912 0.16
913 0.16
914 0.14
915 0.13
916 0.11
917 0.09
918 0.09
919 0.1
920 0.14
921 0.15
922 0.18
923 0.2
924 0.21
925 0.22
926 0.26
927 0.25
928 0.19
929 0.19
930 0.16
931 0.15
932 0.14
933 0.12
934 0.09
935 0.07
936 0.07
937 0.06
938 0.05
939 0.04
940 0.04
941 0.04
942 0.05
943 0.05
944 0.07
945 0.07
946 0.08
947 0.08
948 0.08
949 0.09
950 0.11
951 0.13
952 0.13
953 0.12
954 0.13
955 0.17
956 0.19
957 0.2
958 0.18
959 0.18
960 0.23
961 0.31
962 0.36
963 0.41
964 0.45
965 0.51
966 0.56
967 0.55
968 0.55
969 0.52
970 0.5
971 0.43
972 0.39
973 0.34
974 0.3
975 0.3
976 0.25
977 0.2
978 0.17
979 0.19
980 0.21
981 0.2
982 0.23
983 0.23
984 0.24
985 0.3
986 0.35
987 0.35
988 0.34
989 0.33
990 0.32
991 0.31
992 0.31
993 0.24
994 0.2
995 0.18
996 0.14
997 0.14
998 0.11
999 0.11
1000 0.1
1001 0.12
1002 0.14
1003 0.14
1004 0.2
1005 0.2
1006 0.22
1007 0.22
1008 0.25
1009 0.24
1010 0.21
1011 0.22
1012 0.19
1013 0.21
1014 0.2
1015 0.19
1016 0.15
1017 0.16
1018 0.16
1019 0.16
1020 0.15
1021 0.16
1022 0.17
1023 0.17
1024 0.2
1025 0.22
1026 0.22
1027 0.2
1028 0.2
1029 0.21
1030 0.21
1031 0.2
1032 0.17
1033 0.14
1034 0.13
1035 0.13
1036 0.14
1037 0.15
1038 0.17
1039 0.2
1040 0.25
1041 0.29
1042 0.32
1043 0.33
1044 0.32
1045 0.31
1046 0.31
1047 0.29
1048 0.25
1049 0.2
1050 0.17
1051 0.16
1052 0.14
1053 0.1
1054 0.07
1055 0.06
1056 0.06
1057 0.07
1058 0.08
1059 0.08
1060 0.09
1061 0.09
1062 0.1
1063 0.1
1064 0.1
1065 0.09
1066 0.08
1067 0.1
1068 0.14
1069 0.18
1070 0.19
1071 0.19
1072 0.18
1073 0.18
1074 0.2
1075 0.24
1076 0.22
1077 0.19
1078 0.21
1079 0.22
1080 0.24
1081 0.27
1082 0.35
1083 0.35
1084 0.4
1085 0.45
1086 0.44
1087 0.43
1088 0.42
1089 0.39
1090 0.3
1091 0.26
1092 0.22
1093 0.16
1094 0.17
1095 0.17
1096 0.17
1097 0.16
1098 0.15
1099 0.16
1100 0.14
1101 0.18
1102 0.21
1103 0.21
1104 0.23
1105 0.27
1106 0.27
1107 0.27
1108 0.29
1109 0.26
1110 0.23
1111 0.29
1112 0.29
1113 0.27
1114 0.29
1115 0.26
1116 0.25
1117 0.24
1118 0.2
1119 0.17
1120 0.16
1121 0.17
1122 0.15
1123 0.16
1124 0.14
1125 0.16
1126 0.17
1127 0.14
1128 0.15
1129 0.13
1130 0.13
1131 0.14
1132 0.13
1133 0.11
1134 0.1
1135 0.11
1136 0.09
1137 0.1
1138 0.1
1139 0.08
1140 0.1
1141 0.1
1142 0.11
1143 0.12
1144 0.12
1145 0.12
1146 0.12
1147 0.13
1148 0.13
1149 0.15
1150 0.17
1151 0.2
1152 0.21
1153 0.25
1154 0.26
1155 0.28
1156 0.32
1157 0.32
1158 0.32
1159 0.34
1160 0.35
1161 0.36
1162 0.37
1163 0.36
1164 0.32
1165 0.38
1166 0.38
1167 0.36
1168 0.33
1169 0.28
1170 0.26
1171 0.24
1172 0.22
1173 0.17
1174 0.17
1175 0.14
1176 0.15
1177 0.22
1178 0.21
1179 0.23
1180 0.26
1181 0.25
1182 0.23
1183 0.25
1184 0.27
1185 0.21
1186 0.23
1187 0.22
1188 0.26
1189 0.27
1190 0.26
1191 0.28
1192 0.27
1193 0.28
1194 0.3
1195 0.32
1196 0.35
1197 0.39
1198 0.45
1199 0.45
1200 0.52
1201 0.53
1202 0.53
1203 0.55
1204 0.5
1205 0.45
1206 0.46
1207 0.4
1208 0.32
1209 0.29
1210 0.25
1211 0.2
1212 0.17
1213 0.18
1214 0.11
1215 0.11
1216 0.11
1217 0.1
1218 0.13
1219 0.13
1220 0.14
1221 0.12
1222 0.12
1223 0.14
1224 0.18
1225 0.2
1226 0.2
1227 0.2
1228 0.2
1229 0.21