Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FSF3

Protein Details
Accession C5FSF3    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-110AENLPVHRTKRRKLGNQRDNTAESHydrophilic
127-152DESTTQKQKTRKPAKPSEKGQKSEKTHydrophilic
300-323TSEGNGKRKQTKKAKRSAKSKITTHydrophilic
358-381AEKAPSNRKNTKPKSKKAIPGRAEHydrophilic
638-664IKPSSVPPKGTRKPKKITSKEITNPARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-163QKTRKPAKPSEKGQKSEKTANLRLRGKVKK
305-319GKRKQTKKAKRSAKS
363-376SNRKNTKPKSKKAI
646-653KGTRKPKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, cyto 2.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MTDHGPDALDAFSPPRVGSASPVVISLVSPALTQMTVTPIDNSPKLPFNLAQGLESDLESHSDASNPLHPNVSHPMTRVALGEKAGAENLPVHRTKRRKLGNQRDNTAESMEDLVDCSRNHFQPAEDESTTQKQKTRKPAKPSEKGQKSEKTANLRLRGKVKKASDTQVLVPIDKSAQDPSQKFASQHRADEENGGLHLEEATSRRDYWTPIKDTNSASIDLTGSPVSIQADKAQAKSKDFRELMSEFNFSRETSHEVEAGCQLVNDKPTTKQLLEFMPQNCRTSKSLDSESLDTGTSSTSEGNGKRKQTKKAKRSAKSKITTITSLTTGRYESSLAPEGDHIPSSLVDNMVESIQPAEKAPSNRKNTKPKSKKAIPGRAECYALLKPAPTMEALKTIENQALLFGTSSQLERESSPNVYGLEPELGRDEVKSNSIQNISSEPSTGMGVSRFSKSKNLWGASSRDLDGYLLNVDMIDLVDPTPKITPKPGDERQSNLSNKNTERNIPEESSLLGEQVNAKDVELPDCLAGEISTSDTMQNSFEYLNTTNSQDGPVDDSMPNYDQLSTPELAKKLASFGFRPIKKRERIIELLEKCWESKRKSCIEPTTKPAILSTPQVVIQPIPPNANSKFMDSDSAIKPSSVPPKGTRKPKKITSKEITNPARSSWSTAKNLKSSSKPTDNMPDSMGSQSYVQPEIIEIEDSTDENLLESSKQPRDYRGAHTLASRSASSHITPQISSAPSQTVPIQTRASAGTNEKEIVDLPDIFLQITNAVKAQPRIRSVNGVKQPTWHEKIVMYDPIWLDDLTLWLNVEGFKLIKEDREVHPYLVREWCESKGICCCFRNKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.14
4 0.14
5 0.17
6 0.22
7 0.23
8 0.22
9 0.23
10 0.22
11 0.2
12 0.2
13 0.17
14 0.12
15 0.09
16 0.08
17 0.08
18 0.09
19 0.09
20 0.09
21 0.09
22 0.11
23 0.12
24 0.13
25 0.16
26 0.18
27 0.24
28 0.25
29 0.27
30 0.27
31 0.31
32 0.32
33 0.33
34 0.31
35 0.31
36 0.37
37 0.35
38 0.32
39 0.27
40 0.28
41 0.25
42 0.24
43 0.19
44 0.12
45 0.13
46 0.13
47 0.13
48 0.11
49 0.11
50 0.13
51 0.14
52 0.21
53 0.22
54 0.23
55 0.26
56 0.26
57 0.29
58 0.36
59 0.38
60 0.33
61 0.31
62 0.35
63 0.32
64 0.33
65 0.3
66 0.25
67 0.23
68 0.22
69 0.22
70 0.17
71 0.17
72 0.16
73 0.15
74 0.13
75 0.14
76 0.17
77 0.2
78 0.23
79 0.26
80 0.34
81 0.43
82 0.49
83 0.55
84 0.63
85 0.68
86 0.76
87 0.84
88 0.86
89 0.87
90 0.85
91 0.82
92 0.74
93 0.65
94 0.55
95 0.43
96 0.34
97 0.26
98 0.2
99 0.14
100 0.12
101 0.11
102 0.13
103 0.13
104 0.17
105 0.21
106 0.22
107 0.25
108 0.25
109 0.25
110 0.29
111 0.35
112 0.37
113 0.32
114 0.32
115 0.34
116 0.41
117 0.43
118 0.39
119 0.38
120 0.38
121 0.46
122 0.56
123 0.62
124 0.62
125 0.69
126 0.78
127 0.84
128 0.86
129 0.88
130 0.88
131 0.87
132 0.84
133 0.82
134 0.79
135 0.75
136 0.74
137 0.71
138 0.68
139 0.67
140 0.69
141 0.7
142 0.67
143 0.66
144 0.67
145 0.68
146 0.65
147 0.65
148 0.62
149 0.62
150 0.62
151 0.62
152 0.6
153 0.55
154 0.51
155 0.5
156 0.46
157 0.38
158 0.32
159 0.27
160 0.21
161 0.19
162 0.18
163 0.14
164 0.17
165 0.24
166 0.25
167 0.27
168 0.33
169 0.34
170 0.34
171 0.38
172 0.45
173 0.41
174 0.43
175 0.44
176 0.41
177 0.39
178 0.4
179 0.34
180 0.24
181 0.21
182 0.18
183 0.14
184 0.11
185 0.1
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.11
190 0.12
191 0.12
192 0.15
193 0.16
194 0.2
195 0.27
196 0.34
197 0.37
198 0.4
199 0.43
200 0.45
201 0.45
202 0.47
203 0.41
204 0.34
205 0.28
206 0.24
207 0.21
208 0.17
209 0.17
210 0.11
211 0.08
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.17
219 0.18
220 0.21
221 0.27
222 0.28
223 0.32
224 0.38
225 0.39
226 0.42
227 0.4
228 0.39
229 0.37
230 0.36
231 0.36
232 0.32
233 0.32
234 0.22
235 0.24
236 0.24
237 0.19
238 0.19
239 0.17
240 0.18
241 0.19
242 0.2
243 0.2
244 0.19
245 0.2
246 0.19
247 0.18
248 0.14
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.12
253 0.12
254 0.13
255 0.14
256 0.18
257 0.23
258 0.22
259 0.22
260 0.23
261 0.26
262 0.27
263 0.31
264 0.28
265 0.33
266 0.35
267 0.35
268 0.33
269 0.33
270 0.32
271 0.31
272 0.33
273 0.3
274 0.31
275 0.33
276 0.35
277 0.33
278 0.32
279 0.28
280 0.24
281 0.18
282 0.15
283 0.11
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.07
288 0.11
289 0.14
290 0.22
291 0.26
292 0.32
293 0.41
294 0.47
295 0.56
296 0.63
297 0.7
298 0.72
299 0.78
300 0.82
301 0.82
302 0.86
303 0.86
304 0.85
305 0.79
306 0.74
307 0.69
308 0.62
309 0.54
310 0.46
311 0.37
312 0.29
313 0.26
314 0.22
315 0.18
316 0.15
317 0.13
318 0.12
319 0.12
320 0.1
321 0.12
322 0.16
323 0.15
324 0.15
325 0.15
326 0.16
327 0.16
328 0.15
329 0.12
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.09
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.11
347 0.15
348 0.24
349 0.32
350 0.39
351 0.47
352 0.55
353 0.65
354 0.71
355 0.78
356 0.8
357 0.79
358 0.82
359 0.81
360 0.82
361 0.81
362 0.82
363 0.77
364 0.74
365 0.69
366 0.61
367 0.54
368 0.45
369 0.38
370 0.28
371 0.23
372 0.16
373 0.12
374 0.1
375 0.09
376 0.1
377 0.07
378 0.08
379 0.08
380 0.12
381 0.13
382 0.14
383 0.14
384 0.14
385 0.14
386 0.13
387 0.12
388 0.08
389 0.07
390 0.06
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.07
399 0.08
400 0.09
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.12
405 0.12
406 0.12
407 0.11
408 0.1
409 0.1
410 0.09
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.09
417 0.08
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.12
422 0.13
423 0.13
424 0.12
425 0.13
426 0.13
427 0.12
428 0.12
429 0.1
430 0.09
431 0.09
432 0.08
433 0.07
434 0.06
435 0.07
436 0.08
437 0.1
438 0.11
439 0.12
440 0.17
441 0.17
442 0.24
443 0.29
444 0.29
445 0.28
446 0.3
447 0.33
448 0.31
449 0.31
450 0.25
451 0.19
452 0.17
453 0.16
454 0.13
455 0.1
456 0.07
457 0.05
458 0.05
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.05
467 0.05
468 0.06
469 0.08
470 0.08
471 0.09
472 0.13
473 0.16
474 0.2
475 0.29
476 0.34
477 0.4
478 0.41
479 0.44
480 0.45
481 0.49
482 0.48
483 0.43
484 0.41
485 0.38
486 0.38
487 0.41
488 0.38
489 0.33
490 0.33
491 0.32
492 0.32
493 0.28
494 0.27
495 0.21
496 0.2
497 0.18
498 0.16
499 0.13
500 0.09
501 0.08
502 0.09
503 0.09
504 0.11
505 0.08
506 0.08
507 0.11
508 0.11
509 0.13
510 0.11
511 0.11
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.07
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.07
524 0.07
525 0.08
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.07
530 0.1
531 0.11
532 0.13
533 0.14
534 0.15
535 0.15
536 0.15
537 0.16
538 0.13
539 0.12
540 0.13
541 0.12
542 0.13
543 0.13
544 0.13
545 0.14
546 0.14
547 0.15
548 0.11
549 0.12
550 0.1
551 0.11
552 0.14
553 0.13
554 0.14
555 0.17
556 0.17
557 0.17
558 0.17
559 0.15
560 0.15
561 0.17
562 0.18
563 0.16
564 0.23
565 0.32
566 0.35
567 0.4
568 0.46
569 0.52
570 0.55
571 0.61
572 0.59
573 0.57
574 0.58
575 0.59
576 0.61
577 0.54
578 0.51
579 0.47
580 0.42
581 0.35
582 0.36
583 0.37
584 0.32
585 0.37
586 0.42
587 0.47
588 0.51
589 0.58
590 0.62
591 0.64
592 0.65
593 0.64
594 0.64
595 0.58
596 0.53
597 0.45
598 0.38
599 0.31
600 0.28
601 0.24
602 0.17
603 0.17
604 0.18
605 0.18
606 0.15
607 0.17
608 0.2
609 0.2
610 0.21
611 0.21
612 0.25
613 0.26
614 0.31
615 0.28
616 0.26
617 0.27
618 0.25
619 0.27
620 0.23
621 0.28
622 0.23
623 0.25
624 0.23
625 0.2
626 0.2
627 0.23
628 0.31
629 0.29
630 0.31
631 0.35
632 0.45
633 0.54
634 0.64
635 0.69
636 0.69
637 0.75
638 0.81
639 0.86
640 0.84
641 0.86
642 0.84
643 0.83
644 0.81
645 0.82
646 0.79
647 0.73
648 0.66
649 0.57
650 0.53
651 0.43
652 0.43
653 0.4
654 0.41
655 0.41
656 0.47
657 0.5
658 0.5
659 0.54
660 0.53
661 0.52
662 0.52
663 0.54
664 0.56
665 0.52
666 0.52
667 0.58
668 0.55
669 0.5
670 0.45
671 0.37
672 0.31
673 0.31
674 0.27
675 0.17
676 0.15
677 0.16
678 0.17
679 0.17
680 0.15
681 0.13
682 0.13
683 0.14
684 0.14
685 0.12
686 0.09
687 0.1
688 0.11
689 0.11
690 0.11
691 0.1
692 0.09
693 0.08
694 0.09
695 0.07
696 0.08
697 0.11
698 0.17
699 0.21
700 0.28
701 0.29
702 0.34
703 0.4
704 0.44
705 0.48
706 0.49
707 0.47
708 0.43
709 0.45
710 0.43
711 0.38
712 0.37
713 0.3
714 0.22
715 0.22
716 0.23
717 0.21
718 0.24
719 0.26
720 0.25
721 0.25
722 0.25
723 0.28
724 0.27
725 0.27
726 0.23
727 0.22
728 0.2
729 0.22
730 0.23
731 0.24
732 0.26
733 0.3
734 0.3
735 0.27
736 0.28
737 0.29
738 0.28
739 0.25
740 0.26
741 0.25
742 0.26
743 0.26
744 0.25
745 0.23
746 0.21
747 0.2
748 0.19
749 0.16
750 0.15
751 0.17
752 0.17
753 0.17
754 0.16
755 0.13
756 0.12
757 0.13
758 0.12
759 0.11
760 0.13
761 0.16
762 0.22
763 0.27
764 0.32
765 0.36
766 0.41
767 0.43
768 0.51
769 0.53
770 0.58
771 0.61
772 0.61
773 0.55
774 0.55
775 0.6
776 0.6
777 0.59
778 0.51
779 0.44
780 0.39
781 0.45
782 0.44
783 0.42
784 0.33
785 0.33
786 0.31
787 0.31
788 0.31
789 0.25
790 0.2
791 0.15
792 0.16
793 0.13
794 0.13
795 0.11
796 0.1
797 0.11
798 0.1
799 0.1
800 0.11
801 0.1
802 0.1
803 0.13
804 0.15
805 0.17
806 0.22
807 0.27
808 0.29
809 0.37
810 0.39
811 0.38
812 0.42
813 0.4
814 0.39
815 0.41
816 0.39
817 0.36
818 0.37
819 0.36
820 0.38
821 0.37
822 0.36
823 0.38
824 0.42
825 0.44
826 0.45