Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LQ00

Protein Details
Accession A0A5C3LQ00    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-72DEEESKDKDKKKSKDKDKEESEDKDAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-172SKDKDKKKSKDKDKEESEDKDKEESKDKDKEESKDKDKEESKDKNKEESKDKDKEESKDKDKEESKDKDKEDKNKEDKNKEDKEDKEDKEGKDQAGKEREGEEGKEDKEGKDQAEKEGKGK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.333, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007527  Znf_SWIM  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MRRGEECVDEENKKGMKDEKDMKEGKEGKEEGEEEGKEGGKEEGEKEDEEESKDKDKKKSKDKDKEESEDKDKEESKDKDKEESKDKDKEESKDKNKEESKDKDKEESKDKDKEESKDKDKEDKNKEDKNKEDKEDKEDKEGKDQAGKEREGEEGKEDKEGKDQAEKEGKGKEDEEEGKKGVEGGKEEKEEGEEEEGGEGEDVGIICTPISSSIGHTLCTCPSFDTDAPCVHIPPPLMWAYPVLSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.36
4 0.43
5 0.51
6 0.51
7 0.58
8 0.61
9 0.59
10 0.62
11 0.62
12 0.56
13 0.54
14 0.48
15 0.41
16 0.43
17 0.42
18 0.35
19 0.35
20 0.32
21 0.24
22 0.26
23 0.25
24 0.19
25 0.19
26 0.16
27 0.12
28 0.13
29 0.13
30 0.16
31 0.17
32 0.18
33 0.18
34 0.21
35 0.21
36 0.23
37 0.24
38 0.22
39 0.29
40 0.34
41 0.38
42 0.44
43 0.53
44 0.59
45 0.67
46 0.75
47 0.78
48 0.83
49 0.86
50 0.87
51 0.86
52 0.85
53 0.81
54 0.77
55 0.72
56 0.65
57 0.57
58 0.52
59 0.47
60 0.41
61 0.43
62 0.41
63 0.42
64 0.45
65 0.45
66 0.48
67 0.51
68 0.53
69 0.53
70 0.57
71 0.57
72 0.57
73 0.57
74 0.57
75 0.57
76 0.57
77 0.57
78 0.59
79 0.61
80 0.63
81 0.63
82 0.64
83 0.64
84 0.64
85 0.63
86 0.61
87 0.61
88 0.59
89 0.59
90 0.58
91 0.58
92 0.58
93 0.59
94 0.58
95 0.57
96 0.57
97 0.57
98 0.57
99 0.57
100 0.57
101 0.57
102 0.57
103 0.57
104 0.56
105 0.57
106 0.58
107 0.58
108 0.62
109 0.61
110 0.63
111 0.64
112 0.65
113 0.7
114 0.68
115 0.7
116 0.7
117 0.67
118 0.62
119 0.61
120 0.55
121 0.56
122 0.58
123 0.51
124 0.5
125 0.51
126 0.47
127 0.47
128 0.48
129 0.41
130 0.37
131 0.38
132 0.36
133 0.36
134 0.35
135 0.29
136 0.28
137 0.29
138 0.25
139 0.24
140 0.21
141 0.19
142 0.19
143 0.22
144 0.22
145 0.2
146 0.23
147 0.25
148 0.22
149 0.26
150 0.26
151 0.28
152 0.35
153 0.36
154 0.34
155 0.36
156 0.36
157 0.31
158 0.31
159 0.25
160 0.24
161 0.29
162 0.31
163 0.29
164 0.28
165 0.26
166 0.26
167 0.26
168 0.22
169 0.18
170 0.18
171 0.19
172 0.24
173 0.25
174 0.25
175 0.24
176 0.23
177 0.22
178 0.2
179 0.18
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.1
185 0.09
186 0.07
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.09
200 0.17
201 0.17
202 0.19
203 0.2
204 0.21
205 0.22
206 0.23
207 0.21
208 0.15
209 0.17
210 0.22
211 0.23
212 0.26
213 0.27
214 0.28
215 0.32
216 0.31
217 0.3
218 0.24
219 0.26
220 0.22
221 0.2
222 0.23
223 0.2
224 0.2
225 0.19
226 0.21