Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3M7H0

Protein Details
Accession A0A5C3M7H0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-40GKSRRSRSKASTPGPSRLKRKNTNASEAPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-45KSRRSRSKASTPGPSRLKRKNTNASEAPASKRKK
860-893ARGNHGSASPDRNWRGGERPRGQRRSGGRGRARD
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012921  SPOC_C  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07744  SPOC  
PF07500  TFIIS_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51321  TFIIS_CENTRAL  
CDD cd21538  SPOC_TFIIS  
Amino Acid Sequences MSDGDRSDDDGKSRRSRSKASTPGPSRLKRKNTNASEAPASKRKKSSESTPSAADDPVRKYCLGKLEELFRDIFLRYPHVRDDHQKEGEDMQDGENKSTFISRTLEELTELEKEALISESKQFADELERCLYDTYSEPDKQGDPHAGGKYKDRFRMIQFNLSKVDRVVIHQRITTANISPKEISMMSSTDLADEETKQSIMIAEKEALEHSILQRSTAPRAKITHKGLQDIEDVNGEQFSSGERERQRDREMENEEKRERELLARLSATQRQRTASVSVPPESPIVAQSPSSERWGGPPPVPLHAMSSPVDEMAPTRPLFVNTQSELMVQEPELNLADLINIEDDLPGSATTSSTLLTALASPLDGPNVSAVEIESSSPVSMSSTTGISPFAPRPEEMGRSASFDLSSLWGGPKDDSPAATPMDISPPTEVIHTPPQTDEDRQGVSIEHEIEEADDHDFDMFLEEKEPIQVPEPSAESLQAAFDASPQVWSGKITMPLDSTIPQETPVVGRQMGGRHIPHDSLLWKTLFPSELLRIDGRVAVENSSKYLLQMRMNATKELIAATFTPADEGARTPFKVLSDFLIAKDRHGLVFPWGNRAKEHHPGRELYIIPLRASEPLPDYMEFLDDLKLPKIRQVDYLIGIWVLNKGKLVAPPAPPPQPAAISSTSSEGPLDTPSVPISAPHSVPTNLNIPVFNNTPPVPSPVGPIPPNSLVPALVPPSAPPAPPLSVTPSALAAEVASLTPEQIQMVLRTLASTASLPLPVPTPPQTQPLPPPPSMAMPPMPPRPGWPTPPPGFYPPPPPSHLASHTPPHPPQPPRFNRNDTGRQWESSPHDRDWAPGPSAGRGGVGGREWAPGPGARGNHGSASPDRNWRGGERPRGQRRSGGRGRARDGNNSPQRPADSGWASRRQRNDSRGGGTPNGGAHW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.61
3 0.67
4 0.7
5 0.74
6 0.76
7 0.75
8 0.78
9 0.75
10 0.79
11 0.8
12 0.8
13 0.78
14 0.78
15 0.81
16 0.8
17 0.85
18 0.86
19 0.83
20 0.84
21 0.81
22 0.76
23 0.74
24 0.69
25 0.66
26 0.64
27 0.61
28 0.59
29 0.61
30 0.6
31 0.6
32 0.62
33 0.65
34 0.67
35 0.69
36 0.66
37 0.63
38 0.61
39 0.54
40 0.49
41 0.43
42 0.37
43 0.35
44 0.36
45 0.35
46 0.32
47 0.32
48 0.35
49 0.4
50 0.37
51 0.37
52 0.36
53 0.42
54 0.44
55 0.45
56 0.41
57 0.33
58 0.32
59 0.27
60 0.26
61 0.19
62 0.24
63 0.25
64 0.27
65 0.32
66 0.35
67 0.39
68 0.46
69 0.51
70 0.54
71 0.55
72 0.53
73 0.5
74 0.48
75 0.45
76 0.38
77 0.32
78 0.25
79 0.26
80 0.26
81 0.26
82 0.24
83 0.22
84 0.19
85 0.21
86 0.19
87 0.16
88 0.18
89 0.17
90 0.2
91 0.23
92 0.23
93 0.21
94 0.21
95 0.2
96 0.19
97 0.19
98 0.15
99 0.13
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.13
106 0.16
107 0.16
108 0.17
109 0.16
110 0.15
111 0.22
112 0.23
113 0.24
114 0.24
115 0.24
116 0.24
117 0.25
118 0.25
119 0.18
120 0.19
121 0.19
122 0.23
123 0.24
124 0.24
125 0.26
126 0.27
127 0.27
128 0.29
129 0.28
130 0.24
131 0.29
132 0.34
133 0.36
134 0.36
135 0.42
136 0.47
137 0.49
138 0.53
139 0.51
140 0.5
141 0.52
142 0.61
143 0.57
144 0.58
145 0.53
146 0.51
147 0.52
148 0.48
149 0.43
150 0.33
151 0.32
152 0.22
153 0.25
154 0.3
155 0.31
156 0.32
157 0.32
158 0.33
159 0.32
160 0.34
161 0.32
162 0.27
163 0.29
164 0.28
165 0.3
166 0.29
167 0.27
168 0.27
169 0.25
170 0.21
171 0.17
172 0.16
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.12
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.13
192 0.14
193 0.14
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.17
199 0.16
200 0.17
201 0.2
202 0.22
203 0.29
204 0.33
205 0.33
206 0.31
207 0.36
208 0.41
209 0.45
210 0.5
211 0.49
212 0.46
213 0.49
214 0.46
215 0.43
216 0.41
217 0.34
218 0.28
219 0.22
220 0.2
221 0.15
222 0.14
223 0.11
224 0.08
225 0.06
226 0.06
227 0.09
228 0.1
229 0.16
230 0.19
231 0.25
232 0.31
233 0.36
234 0.39
235 0.41
236 0.43
237 0.45
238 0.49
239 0.53
240 0.55
241 0.57
242 0.55
243 0.51
244 0.49
245 0.42
246 0.36
247 0.3
248 0.28
249 0.24
250 0.25
251 0.25
252 0.25
253 0.27
254 0.33
255 0.34
256 0.34
257 0.33
258 0.31
259 0.32
260 0.33
261 0.32
262 0.3
263 0.31
264 0.29
265 0.28
266 0.27
267 0.27
268 0.25
269 0.22
270 0.18
271 0.13
272 0.12
273 0.11
274 0.1
275 0.11
276 0.14
277 0.15
278 0.18
279 0.18
280 0.16
281 0.19
282 0.25
283 0.26
284 0.24
285 0.28
286 0.27
287 0.28
288 0.3
289 0.26
290 0.24
291 0.22
292 0.23
293 0.17
294 0.18
295 0.15
296 0.14
297 0.14
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.13
302 0.11
303 0.13
304 0.13
305 0.15
306 0.17
307 0.2
308 0.22
309 0.2
310 0.21
311 0.19
312 0.19
313 0.18
314 0.17
315 0.14
316 0.08
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.06
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.05
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.1
377 0.1
378 0.12
379 0.13
380 0.13
381 0.16
382 0.18
383 0.2
384 0.19
385 0.21
386 0.19
387 0.21
388 0.21
389 0.18
390 0.15
391 0.13
392 0.12
393 0.1
394 0.09
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.11
405 0.13
406 0.13
407 0.12
408 0.12
409 0.09
410 0.12
411 0.12
412 0.11
413 0.09
414 0.09
415 0.1
416 0.1
417 0.1
418 0.1
419 0.17
420 0.17
421 0.17
422 0.17
423 0.19
424 0.21
425 0.22
426 0.21
427 0.16
428 0.16
429 0.15
430 0.16
431 0.13
432 0.12
433 0.12
434 0.1
435 0.08
436 0.08
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.08
455 0.07
456 0.08
457 0.09
458 0.09
459 0.1
460 0.11
461 0.11
462 0.1
463 0.1
464 0.09
465 0.08
466 0.07
467 0.06
468 0.05
469 0.04
470 0.04
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.06
478 0.07
479 0.09
480 0.13
481 0.13
482 0.13
483 0.14
484 0.14
485 0.15
486 0.14
487 0.13
488 0.1
489 0.1
490 0.1
491 0.1
492 0.09
493 0.1
494 0.1
495 0.11
496 0.1
497 0.1
498 0.11
499 0.12
500 0.14
501 0.16
502 0.15
503 0.14
504 0.16
505 0.15
506 0.14
507 0.14
508 0.13
509 0.12
510 0.14
511 0.13
512 0.12
513 0.13
514 0.13
515 0.12
516 0.12
517 0.12
518 0.12
519 0.13
520 0.15
521 0.14
522 0.13
523 0.13
524 0.14
525 0.12
526 0.11
527 0.11
528 0.1
529 0.12
530 0.12
531 0.12
532 0.12
533 0.12
534 0.1
535 0.14
536 0.16
537 0.16
538 0.21
539 0.24
540 0.29
541 0.31
542 0.31
543 0.27
544 0.24
545 0.22
546 0.18
547 0.14
548 0.08
549 0.07
550 0.08
551 0.08
552 0.08
553 0.08
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.09
559 0.11
560 0.11
561 0.12
562 0.13
563 0.13
564 0.14
565 0.14
566 0.13
567 0.15
568 0.16
569 0.16
570 0.22
571 0.22
572 0.21
573 0.24
574 0.22
575 0.18
576 0.18
577 0.18
578 0.14
579 0.2
580 0.2
581 0.26
582 0.28
583 0.28
584 0.28
585 0.33
586 0.33
587 0.37
588 0.43
589 0.39
590 0.4
591 0.4
592 0.42
593 0.43
594 0.39
595 0.32
596 0.31
597 0.27
598 0.23
599 0.23
600 0.2
601 0.17
602 0.17
603 0.15
604 0.13
605 0.14
606 0.16
607 0.15
608 0.16
609 0.14
610 0.14
611 0.13
612 0.11
613 0.1
614 0.1
615 0.11
616 0.12
617 0.15
618 0.14
619 0.18
620 0.21
621 0.21
622 0.23
623 0.26
624 0.27
625 0.26
626 0.27
627 0.23
628 0.19
629 0.18
630 0.14
631 0.13
632 0.11
633 0.1
634 0.09
635 0.1
636 0.12
637 0.14
638 0.17
639 0.19
640 0.21
641 0.27
642 0.32
643 0.34
644 0.32
645 0.32
646 0.31
647 0.28
648 0.25
649 0.23
650 0.2
651 0.19
652 0.19
653 0.2
654 0.18
655 0.17
656 0.16
657 0.12
658 0.1
659 0.1
660 0.11
661 0.09
662 0.1
663 0.1
664 0.1
665 0.1
666 0.1
667 0.13
668 0.14
669 0.14
670 0.15
671 0.17
672 0.18
673 0.19
674 0.21
675 0.21
676 0.19
677 0.2
678 0.19
679 0.17
680 0.2
681 0.21
682 0.19
683 0.19
684 0.17
685 0.19
686 0.19
687 0.22
688 0.21
689 0.19
690 0.22
691 0.22
692 0.28
693 0.26
694 0.27
695 0.28
696 0.27
697 0.27
698 0.25
699 0.22
700 0.16
701 0.16
702 0.17
703 0.15
704 0.13
705 0.12
706 0.11
707 0.17
708 0.18
709 0.17
710 0.16
711 0.17
712 0.18
713 0.19
714 0.21
715 0.21
716 0.23
717 0.23
718 0.23
719 0.2
720 0.19
721 0.18
722 0.16
723 0.1
724 0.07
725 0.07
726 0.06
727 0.05
728 0.05
729 0.05
730 0.06
731 0.06
732 0.06
733 0.07
734 0.08
735 0.09
736 0.11
737 0.12
738 0.11
739 0.11
740 0.11
741 0.1
742 0.1
743 0.09
744 0.08
745 0.09
746 0.1
747 0.1
748 0.1
749 0.11
750 0.11
751 0.15
752 0.18
753 0.22
754 0.23
755 0.28
756 0.3
757 0.33
758 0.4
759 0.46
760 0.48
761 0.43
762 0.44
763 0.41
764 0.42
765 0.4
766 0.35
767 0.28
768 0.28
769 0.34
770 0.36
771 0.37
772 0.33
773 0.35
774 0.4
775 0.43
776 0.44
777 0.45
778 0.48
779 0.5
780 0.55
781 0.55
782 0.53
783 0.53
784 0.49
785 0.52
786 0.48
787 0.49
788 0.49
789 0.48
790 0.45
791 0.45
792 0.47
793 0.44
794 0.43
795 0.45
796 0.46
797 0.5
798 0.49
799 0.5
800 0.54
801 0.55
802 0.59
803 0.63
804 0.69
805 0.7
806 0.76
807 0.76
808 0.76
809 0.78
810 0.78
811 0.72
812 0.72
813 0.67
814 0.6
815 0.54
816 0.52
817 0.5
818 0.5
819 0.5
820 0.42
821 0.44
822 0.42
823 0.44
824 0.43
825 0.4
826 0.33
827 0.31
828 0.31
829 0.28
830 0.29
831 0.26
832 0.21
833 0.16
834 0.15
835 0.14
836 0.13
837 0.14
838 0.13
839 0.15
840 0.15
841 0.15
842 0.16
843 0.15
844 0.17
845 0.19
846 0.2
847 0.21
848 0.24
849 0.26
850 0.26
851 0.26
852 0.27
853 0.27
854 0.32
855 0.33
856 0.39
857 0.4
858 0.41
859 0.43
860 0.43
861 0.48
862 0.5
863 0.56
864 0.57
865 0.65
866 0.73
867 0.77
868 0.76
869 0.75
870 0.73
871 0.74
872 0.73
873 0.73
874 0.71
875 0.72
876 0.75
877 0.76
878 0.71
879 0.7
880 0.67
881 0.68
882 0.69
883 0.65
884 0.62
885 0.57
886 0.56
887 0.5
888 0.46
889 0.43
890 0.39
891 0.43
892 0.48
893 0.54
894 0.57
895 0.6
896 0.65
897 0.66
898 0.69
899 0.68
900 0.69
901 0.67
902 0.66
903 0.67
904 0.64
905 0.58
906 0.51
907 0.46