FuNGI

A0A5C3LSA6

Protein Details

Accession

A0A5C3LSA6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
487-513	TQESETSTKSRKRRKTNKPRDTTTPAG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
315-322	KRKGKRKR
496-505	SRKRRKTNKP

Subcellular Location(s)

cyto 16, nucl 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011665 BRF1_TBP-bd_dom IPR013763 Cyclin-like_dom IPR036915 Cyclin-like_sf IPR000812 TFIIB IPR013150 TFIIB_cyclin IPR013137 Znf_TFIIB
Gene Ontology	GO:0017025 F:TBP-class protein binding GO:0070897 P:transcription preinitiation complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF07741 BRF1 PF08271 TF_Zn_Ribbon PF00382 TFIIB
PROSITE	View protein in PROSITE PS51134 ZF_TFIIB
CDD	cd20553 CYCLIN_TFIIIB90_rpt1 cd20554 CYCLIN_TFIIIB90_rpt2

Amino Acid Sequences

MPVCNDCGGTVIEYDQAAGNGFCVKCGTVVEENTIVSEVAFGETSNGAAMVQGSFVGQGATHARMSGPYGNRGSNESREQTIANASKKIQSIANVLRLSEVVCLAATRMYTLAVEHKFTKGRKSLNVVAVCLYVACRQKETRNYMLIDFSDLLQVNVFELGHTYLQLVQTLNLRLPLVDPSHYISRFAALLEFGDDTHKVATDAVRLVQRFDRDWMTRGRRPAGICGAALLLAARMNNFRRSVEEIVQVVKIADTTLKKRLDEFKATPSGSLTLADFRNVWLEDEMDPPAFTKGKEREEAEKAAAADGLDMEEAKRKGKRKRVAELSDDEDATTEAHRATIDPSLLNEGILASTVETPLFNPDPDDDLSNIDPILLQASLPTSSSSTITPTLTPPPTTLVEEAVSTLVAEEVSVFLQNEQGAMLSEALDEAEERRLAQIGVVDELLGLDEDELDRFILTDDEVRIKERVWVELNRDYLEALAAKGDTQESETSTKSRKRRKTNKPRDTTTPAGNSAAESVQNLIKKNPKYSKRINYDALKDLFVEGGGAPSFTAAMTTGNDDKDDDDLYTMGMDDDKSDGMMVIVEEEPGTVVAAPHKTVESRLKRRALDDVDDLDVEEMSDDEKDEGYGWDDGYEQEV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.12
3	0.11
4	0.11
5	0.1
6	0.1
7	0.14
8	0.14
9	0.14
10	0.14
11	0.15
12	0.14
13	0.16
14	0.2
15	0.2
16	0.21
17	0.25
18	0.25
19	0.25
20	0.24
21	0.24
22	0.18
23	0.13
24	0.12
25	0.08
26	0.08
27	0.08
28	0.07
29	0.08
30	0.09
31	0.09
32	0.08
33	0.08
34	0.06
35	0.07
36	0.07
37	0.05
38	0.05
39	0.05
40	0.05
41	0.05
42	0.06
43	0.05
44	0.05
45	0.07
46	0.1
47	0.12
48	0.12
49	0.12
50	0.13
51	0.14
52	0.17
53	0.23
54	0.23
55	0.28
56	0.31
57	0.33
58	0.34
59	0.38
60	0.39
61	0.37
62	0.41
63	0.37
64	0.36
65	0.36
66	0.35
67	0.32
68	0.36
69	0.36
70	0.32
71	0.33
72	0.32
73	0.35
74	0.36
75	0.36
76	0.3
77	0.26
78	0.31
79	0.34
80	0.4
81	0.36
82	0.35
83	0.33
84	0.31
85	0.29
86	0.22
87	0.16
88	0.08
89	0.08
90	0.08
91	0.07
92	0.08
93	0.08
94	0.07
95	0.07
96	0.07
97	0.08
98	0.09
99	0.15
100	0.16
101	0.19
102	0.2
103	0.24
104	0.29
105	0.31
106	0.38
107	0.37
108	0.41
109	0.44
110	0.51
111	0.54
112	0.57
113	0.57
114	0.5
115	0.45
116	0.39
117	0.33
118	0.25
119	0.19
120	0.16
121	0.19
122	0.19
123	0.22
124	0.25
125	0.33
126	0.42
127	0.48
128	0.49
129	0.49
130	0.5
131	0.47
132	0.47
133	0.4
134	0.34
135	0.27
136	0.21
137	0.19
138	0.17
139	0.16
140	0.13
141	0.13
142	0.1
143	0.1
144	0.09
145	0.05
146	0.06
147	0.08
148	0.07
149	0.08
150	0.08
151	0.09
152	0.1
153	0.12
154	0.11
155	0.1
156	0.14
157	0.15
158	0.15
159	0.14
160	0.14
161	0.12
162	0.13
163	0.15
164	0.13
165	0.13
166	0.14
167	0.17
168	0.23
169	0.23
170	0.23
171	0.2
172	0.2
173	0.19
174	0.18
175	0.14
176	0.08
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.07
181	0.08
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.07
187	0.08
188	0.09
189	0.1
190	0.11
191	0.13
192	0.16
193	0.16
194	0.18
195	0.2
196	0.21
197	0.2
198	0.22
199	0.25
200	0.23
201	0.26
202	0.33
203	0.38
204	0.4
205	0.43
206	0.43
207	0.42
208	0.41
209	0.43
210	0.39
211	0.32
212	0.28
213	0.24
214	0.21
215	0.17
216	0.15
217	0.1
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.08
223	0.11
224	0.14
225	0.16
226	0.16
227	0.18
228	0.24
229	0.27
230	0.26
231	0.28
232	0.25
233	0.25
234	0.25
235	0.22
236	0.16
237	0.12
238	0.09
239	0.06
240	0.08
241	0.1
242	0.13
243	0.2
244	0.22
245	0.23
246	0.26
247	0.34
248	0.36
249	0.41
250	0.4
251	0.39
252	0.43
253	0.43
254	0.4
255	0.33
256	0.28
257	0.21
258	0.19
259	0.14
260	0.11
261	0.11
262	0.12
263	0.11
264	0.1
265	0.12
266	0.12
267	0.12
268	0.09
269	0.1
270	0.1
271	0.11
272	0.12
273	0.1
274	0.09
275	0.09
276	0.1
277	0.1
278	0.09
279	0.15
280	0.19
281	0.23
282	0.26
283	0.28
284	0.32
285	0.35
286	0.37
287	0.31
288	0.27
289	0.23
290	0.2
291	0.18
292	0.12
293	0.08
294	0.06
295	0.06
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.08
300	0.08
301	0.11
302	0.15
303	0.22
304	0.3
305	0.39
306	0.48
307	0.51
308	0.6
309	0.67
310	0.68
311	0.66
312	0.62
313	0.56
314	0.49
315	0.41
316	0.32
317	0.22
318	0.17
319	0.13
320	0.09
321	0.06
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.07
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.08
331	0.11
332	0.11
333	0.1
334	0.09
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.05
345	0.08
346	0.09
347	0.08
348	0.09
349	0.09
350	0.12
351	0.13
352	0.14
353	0.11
354	0.12
355	0.13
356	0.12
357	0.11
358	0.09
359	0.08
360	0.06
361	0.07
362	0.05
363	0.04
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.08
372	0.08
373	0.1
374	0.11
375	0.11
376	0.12
377	0.13
378	0.18
379	0.18
380	0.18
381	0.17
382	0.19
383	0.19
384	0.2
385	0.19
386	0.15
387	0.14
388	0.13
389	0.13
390	0.1
391	0.08
392	0.06
393	0.06
394	0.04
395	0.04
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.04
400	0.04
401	0.05
402	0.04
403	0.06
404	0.06
405	0.06
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.06
410	0.06
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.04
416	0.04
417	0.05
418	0.06
419	0.06
420	0.07
421	0.07
422	0.08
423	0.08
424	0.08
425	0.1
426	0.09
427	0.1
428	0.09
429	0.09
430	0.08
431	0.08
432	0.07
433	0.05
434	0.04
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.08
447	0.09
448	0.13
449	0.13
450	0.15
451	0.16
452	0.15
453	0.21
454	0.19
455	0.22
456	0.23
457	0.26
458	0.3
459	0.35
460	0.36
461	0.32
462	0.31
463	0.26
464	0.22
465	0.2
466	0.14
467	0.09
468	0.08
469	0.07
470	0.07
471	0.07
472	0.08
473	0.07
474	0.08
475	0.09
476	0.11
477	0.14
478	0.15
479	0.18
480	0.25
481	0.32
482	0.39
483	0.48
484	0.56
485	0.65
486	0.75
487	0.83
488	0.87
489	0.91
490	0.93
491	0.93
492	0.9
493	0.87
494	0.84
495	0.78
496	0.74
497	0.68
498	0.59
499	0.5
500	0.44
501	0.35
502	0.29
503	0.24
504	0.17
505	0.12
506	0.12
507	0.14
508	0.16
509	0.17
510	0.2
511	0.27
512	0.31
513	0.4
514	0.48
515	0.53
516	0.59
517	0.69
518	0.74
519	0.75
520	0.78
521	0.77
522	0.75
523	0.72
524	0.71
525	0.63
526	0.53
527	0.45
528	0.38
529	0.3
530	0.22
531	0.17
532	0.09
533	0.09
534	0.08
535	0.08
536	0.07
537	0.07
538	0.07
539	0.06
540	0.06
541	0.04
542	0.06
543	0.07
544	0.11
545	0.14
546	0.14
547	0.15
548	0.15
549	0.16
550	0.16
551	0.17
552	0.13
553	0.11
554	0.11
555	0.1
556	0.1
557	0.09
558	0.08
559	0.07
560	0.07
561	0.07
562	0.08
563	0.08
564	0.08
565	0.08
566	0.08
567	0.07
568	0.07
569	0.07
570	0.08
571	0.08
572	0.08
573	0.08
574	0.07
575	0.08
576	0.07
577	0.08
578	0.05
579	0.06
580	0.11
581	0.13
582	0.13
583	0.15
584	0.16
585	0.17
586	0.23
587	0.32
588	0.39
589	0.47
590	0.55
591	0.62
592	0.63
593	0.65
594	0.68
595	0.64
596	0.58
597	0.54
598	0.48
599	0.43
600	0.4
601	0.37
602	0.28
603	0.22
604	0.16
605	0.11
606	0.08
607	0.06
608	0.06
609	0.07
610	0.07
611	0.08
612	0.08
613	0.09
614	0.1
615	0.12
616	0.13
617	0.13
618	0.12
619	0.13

A0A5C3LSA6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer