FuNGI

A0A5C3MBM5

Protein Details

Accession

A0A5C3MBM5

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
270-305	RREINKKTKSGDKKLRKQLKTAKKKKYDRPDPVANF	Basic
718-748	SGAVRGKKKASLREKQQKLRAHINKSKKSKH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
269-295	HRREINKKTKSGDKKLRKQLKTAKKKK
664-664	K
677-711	QKGREGRDKFGSHKGKQNKEVPSSSTNREKARNKP
718-748	SGAVRGKKKASLREKQQKLRAHINKSKKSKH

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, cyto_nucl 9.333, mito 8.5, cyto_mito 8.333, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MGRGVLLTSNLPQLQNLIKRDPIAYKEEFLQQWNHYDSIRQIFKINPDEQAHHFRELVAFISQVATCYPKETAEFPSHISTLLLESYGILSPDTRKTLVQNLVMLRNKDVITSIELLKSLFPLLPRTTSSTLRSFIRKTILSDIRMANMRTKNHKLNRAVQAMLFGMVERGMGGEVVGDKGKVRAGAGLNTDGRSANSEEAMWAIILAKELWRKGVWTDAKTVSIVAQGCFHPIAKVQSASVHFFLGSEDEVEDSDEEEEEVDVRGLHHRREINKKTKSGDKKLRKQLKTAKKKKYDRPDPVANFPAIQLLHDPQTFSEKLYDVLNNYDKRFLLDHKILLMQLVSRVMGAHKLCVLGFYTYIVKYLTHRQLRVPAILVALAQSVHDLTPPDAVTPVIRKLAQEFVHPGVASEVIAAGINSIREVCRRQPWAMEEDLLGDLIEYRKSRDKAVTSAARGLLRLYREVNPSLLKKRERGKEATMGLATGSQPLPYGYSAEAAIDIEGLSLLEDHLQKLREEDGVEADEDDEAAWNGWDVGSDSEDDDSESEGWINVDDDDNNLVISDSEDESDDKMTGTSAATAESAVIETRISTLATTKILTPADFALLNDLRLQAAAKAVEAGGGSKAKRKLATLEANKKATTNAGQVPEDVFISENDILGPRKKAKADYAERMASIQKGREGRDKFGSHKGKQNKEVPSSSTNREKARNKPIMMILSSGAVRGKKKASLREKQQKLRAHINKSKKSKH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.33
3	0.36
4	0.35
5	0.36
6	0.37
7	0.41
8	0.43
9	0.39
10	0.39
11	0.37
12	0.35
13	0.35
14	0.41
15	0.39
16	0.36
17	0.38
18	0.33
19	0.37
20	0.37
21	0.36
22	0.29
23	0.3
24	0.33
25	0.37
26	0.38
27	0.33
28	0.33
29	0.35
30	0.43
31	0.48
32	0.44
33	0.43
34	0.42
35	0.45
36	0.48
37	0.54
38	0.5
39	0.44
40	0.43
41	0.36
42	0.34
43	0.3
44	0.27
45	0.18
46	0.15
47	0.12
48	0.14
49	0.13
50	0.12
51	0.12
52	0.13
53	0.12
54	0.14
55	0.15
56	0.15
57	0.17
58	0.19
59	0.24
60	0.27
61	0.29
62	0.29
63	0.32
64	0.31
65	0.29
66	0.26
67	0.21
68	0.17
69	0.15
70	0.12
71	0.08
72	0.08
73	0.09
74	0.1
75	0.1
76	0.08
77	0.09
78	0.12
79	0.17
80	0.2
81	0.2
82	0.2
83	0.23
84	0.32
85	0.36
86	0.36
87	0.36
88	0.37
89	0.45
90	0.48
91	0.46
92	0.39
93	0.38
94	0.34
95	0.3
96	0.27
97	0.2
98	0.19
99	0.21
100	0.21
101	0.18
102	0.18
103	0.18
104	0.17
105	0.16
106	0.13
107	0.11
108	0.11
109	0.15
110	0.17
111	0.2
112	0.22
113	0.27
114	0.3
115	0.33
116	0.36
117	0.35
118	0.36
119	0.37
120	0.41
121	0.37
122	0.37
123	0.39
124	0.37
125	0.36
126	0.42
127	0.45
128	0.41
129	0.44
130	0.41
131	0.38
132	0.4
133	0.38
134	0.36
135	0.35
136	0.39
137	0.42
138	0.48
139	0.54
140	0.58
141	0.66
142	0.65
143	0.69
144	0.72
145	0.68
146	0.62
147	0.52
148	0.46
149	0.38
150	0.32
151	0.22
152	0.13
153	0.09
154	0.08
155	0.07
156	0.05
157	0.05
158	0.04
159	0.04
160	0.04
161	0.04
162	0.05
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.07
167	0.08
168	0.09
169	0.09
170	0.09
171	0.12
172	0.14
173	0.17
174	0.19
175	0.23
176	0.23
177	0.23
178	0.23
179	0.19
180	0.18
181	0.17
182	0.17
183	0.13
184	0.12
185	0.12
186	0.11
187	0.11
188	0.11
189	0.08
190	0.06
191	0.06
192	0.05
193	0.06
194	0.06
195	0.08
196	0.11
197	0.12
198	0.14
199	0.13
200	0.14
201	0.14
202	0.23
203	0.26
204	0.25
205	0.3
206	0.3
207	0.3
208	0.3
209	0.29
210	0.21
211	0.19
212	0.18
213	0.13
214	0.14
215	0.13
216	0.14
217	0.14
218	0.14
219	0.11
220	0.12
221	0.15
222	0.15
223	0.16
224	0.14
225	0.18
226	0.21
227	0.23
228	0.21
229	0.18
230	0.16
231	0.15
232	0.15
233	0.11
234	0.09
235	0.07
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.07
240	0.07
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.04
251	0.05
252	0.12
253	0.14
254	0.15
255	0.19
256	0.24
257	0.3
258	0.41
259	0.5
260	0.54
261	0.59
262	0.63
263	0.62
264	0.67
265	0.7
266	0.69
267	0.71
268	0.71
269	0.74
270	0.81
271	0.87
272	0.79
273	0.79
274	0.79
275	0.79
276	0.8
277	0.8
278	0.8
279	0.8
280	0.87
281	0.88
282	0.88
283	0.88
284	0.86
285	0.84
286	0.83
287	0.77
288	0.73
289	0.66
290	0.55
291	0.44
292	0.35
293	0.3
294	0.19
295	0.16
296	0.12
297	0.1
298	0.13
299	0.13
300	0.13
301	0.1
302	0.15
303	0.15
304	0.14
305	0.15
306	0.12
307	0.13
308	0.15
309	0.15
310	0.11
311	0.15
312	0.2
313	0.21
314	0.21
315	0.23
316	0.21
317	0.21
318	0.22
319	0.2
320	0.21
321	0.21
322	0.2
323	0.19
324	0.2
325	0.19
326	0.17
327	0.15
328	0.09
329	0.07
330	0.07
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.09
339	0.1
340	0.09
341	0.1
342	0.11
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.08
347	0.08
348	0.09
349	0.09
350	0.08
351	0.1
352	0.17
353	0.24
354	0.26
355	0.27
356	0.28
357	0.35
358	0.36
359	0.35
360	0.29
361	0.21
362	0.18
363	0.17
364	0.15
365	0.08
366	0.07
367	0.06
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.05
374	0.05
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.08
381	0.09
382	0.1
383	0.1
384	0.11
385	0.11
386	0.12
387	0.18
388	0.18
389	0.18
390	0.19
391	0.18
392	0.2
393	0.19
394	0.18
395	0.12
396	0.12
397	0.1
398	0.07
399	0.05
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.03
404	0.03
405	0.03
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.06
410	0.09
411	0.13
412	0.19
413	0.23
414	0.24
415	0.27
416	0.29
417	0.31
418	0.29
419	0.26
420	0.19
421	0.17
422	0.16
423	0.13
424	0.1
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.08
429	0.07
430	0.1
431	0.16
432	0.18
433	0.2
434	0.24
435	0.26
436	0.27
437	0.35
438	0.38
439	0.33
440	0.35
441	0.35
442	0.3
443	0.28
444	0.26
445	0.2
446	0.16
447	0.17
448	0.16
449	0.17
450	0.2
451	0.21
452	0.22
453	0.23
454	0.26
455	0.31
456	0.35
457	0.34
458	0.38
459	0.45
460	0.51
461	0.52
462	0.53
463	0.51
464	0.52
465	0.51
466	0.48
467	0.39
468	0.32
469	0.26
470	0.22
471	0.17
472	0.12
473	0.1
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.09
478	0.08
479	0.09
480	0.07
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.08
485	0.07
486	0.06
487	0.05
488	0.05
489	0.04
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.06
496	0.06
497	0.07
498	0.1
499	0.12
500	0.12
501	0.13
502	0.15
503	0.14
504	0.14
505	0.14
506	0.13
507	0.13
508	0.13
509	0.12
510	0.11
511	0.09
512	0.08
513	0.07
514	0.05
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.05
523	0.05
524	0.06
525	0.07
526	0.07
527	0.08
528	0.08
529	0.08
530	0.07
531	0.08
532	0.08
533	0.07
534	0.07
535	0.07
536	0.07
537	0.07
538	0.07
539	0.06
540	0.07
541	0.07
542	0.08
543	0.08
544	0.08
545	0.08
546	0.07
547	0.07
548	0.06
549	0.07
550	0.08
551	0.07
552	0.08
553	0.09
554	0.09
555	0.1
556	0.11
557	0.1
558	0.08
559	0.08
560	0.08
561	0.08
562	0.07
563	0.08
564	0.07
565	0.08
566	0.07
567	0.07
568	0.07
569	0.07
570	0.07
571	0.05
572	0.06
573	0.05
574	0.05
575	0.06
576	0.07
577	0.07
578	0.06
579	0.08
580	0.1
581	0.12
582	0.12
583	0.12
584	0.16
585	0.17
586	0.17
587	0.16
588	0.15
589	0.15
590	0.15
591	0.14
592	0.17
593	0.16
594	0.17
595	0.16
596	0.16
597	0.14
598	0.14
599	0.14
600	0.08
601	0.1
602	0.1
603	0.09
604	0.09
605	0.09
606	0.1
607	0.09
608	0.09
609	0.09
610	0.13
611	0.13
612	0.19
613	0.23
614	0.26
615	0.28
616	0.29
617	0.32
618	0.38
619	0.48
620	0.52
621	0.59
622	0.62
623	0.64
624	0.62
625	0.57
626	0.49
627	0.42
628	0.35
629	0.31
630	0.29
631	0.31
632	0.31
633	0.32
634	0.32
635	0.29
636	0.25
637	0.19
638	0.14
639	0.09
640	0.14
641	0.13
642	0.12
643	0.11
644	0.14
645	0.16
646	0.19
647	0.25
648	0.25
649	0.31
650	0.34
651	0.38
652	0.44
653	0.52
654	0.57
655	0.6
656	0.62
657	0.59
658	0.56
659	0.54
660	0.47
661	0.41
662	0.36
663	0.3
664	0.29
665	0.31
666	0.35
667	0.43
668	0.44
669	0.45
670	0.51
671	0.52
672	0.51
673	0.57
674	0.62
675	0.58
676	0.64
677	0.69
678	0.69
679	0.73
680	0.77
681	0.75
682	0.73
683	0.72
684	0.68
685	0.66
686	0.62
687	0.6
688	0.62
689	0.6
690	0.58
691	0.64
692	0.65
693	0.67
694	0.72
695	0.75
696	0.67
697	0.67
698	0.67
699	0.64
700	0.58
701	0.5
702	0.39
703	0.33
704	0.31
705	0.25
706	0.22
707	0.2
708	0.21
709	0.24
710	0.28
711	0.32
712	0.39
713	0.49
714	0.56
715	0.63
716	0.72
717	0.78
718	0.84
719	0.87
720	0.89
721	0.87
722	0.84
723	0.85
724	0.82
725	0.82
726	0.81
727	0.82
728	0.84

A0A5C3MBM5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer