FuNGI

A0A5C3LSG6

Protein Details

Accession

A0A5C3LSG6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
37-59	DKPGGRKGSSKIRSHRNRPMDAI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
42-49	RKGSSKIR

Subcellular Location(s)

mito 18, nucl 3, cyto 2, extr 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR032675 LRR_dom_sf IPR032710 NTF2-like_dom_sf IPR018222 Nuclear_transport_factor_2_euk IPR030217 NXF_fam IPR005637 TAP_C_dom IPR009060 UBA-like_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0051028 P:mRNA transport
Pfam	View protein in Pfam PF03943 TAP_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS50177 NTF2_DOMAIN PS51281 TAP_C
CDD	cd14342 UBA_TAP-C

Amino Acid Sequences

MSFSSPTPAPGSRALASTALRNAGLIDRDATMRDVSDKPGGRKGSSKIRSHRNRPMDAITGKDQAGPSSRMLSTRSHASSSDPLAIRGASRPTQAGRIRRNALSLNGNTGLSGVSVRVSKTKPVEAWRQFVKSRWNPETRFLNLERMIDDDIVKKYNLTPPGHGGGPRDAAVIYKLAAELTPEVQTLSLAHNNLNGVQLTYLSKYLPRLANLSLEGNNIRQWKDLEFISARQNKMVHLRELILTGNPIRELEYKHGRGESYKQEMSRRLTSLEVLDQEAITQISFDVPQPSTSAGVVQKPNATSFPYEMGPSFITGVDGALVSNFLIRFFNAFDSTRQALLSVYAPNATFSFSANTSIPARARISGYQHHLPNQKKLEWGIWLKGGDGGSRNLSRLAVGVEKGMKSLHIGGEAVMKAIGQLPATRHEIAGPPERFCVDAFPVVCGTGMGLMVIVHGQFTEVGAEGIRSFDRTFILAPADEGTRARQDGWDVMILSDQWTIRSYSSHEAWTPGPMLVQAELKPKASKQTYDATKLSQDQQAVLAQLSEVQRNVVLKLIGRTNLNVKFAVDCLVPNGWDLEQAVKNFNEVKANLGKEAFL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.29
3	0.28
4	0.29
5	0.27
6	0.24
7	0.22
8	0.21
9	0.2
10	0.2
11	0.21
12	0.18
13	0.16
14	0.16
15	0.17
16	0.18
17	0.18
18	0.15
19	0.14
20	0.18
21	0.18
22	0.21
23	0.28
24	0.32
25	0.34
26	0.42
27	0.44
28	0.42
29	0.47
30	0.5
31	0.53
32	0.56
33	0.61
34	0.63
35	0.7
36	0.78
37	0.82
38	0.85
39	0.84
40	0.8
41	0.77
42	0.73
43	0.7
44	0.62
45	0.57
46	0.51
47	0.46
48	0.4
49	0.38
50	0.33
51	0.27
52	0.29
53	0.26
54	0.24
55	0.25
56	0.25
57	0.24
58	0.26
59	0.27
60	0.26
61	0.32
62	0.33
63	0.3
64	0.29
65	0.32
66	0.35
67	0.35
68	0.38
69	0.31
70	0.29
71	0.28
72	0.28
73	0.24
74	0.23
75	0.25
76	0.19
77	0.21
78	0.23
79	0.24
80	0.32
81	0.38
82	0.43
83	0.46
84	0.52
85	0.56
86	0.54
87	0.56
88	0.5
89	0.48
90	0.47
91	0.4
92	0.36
93	0.33
94	0.31
95	0.27
96	0.25
97	0.2
98	0.12
99	0.11
100	0.06
101	0.07
102	0.08
103	0.09
104	0.15
105	0.16
106	0.22
107	0.25
108	0.3
109	0.33
110	0.39
111	0.49
112	0.48
113	0.53
114	0.53
115	0.54
116	0.51
117	0.5
118	0.55
119	0.51
120	0.56
121	0.57
122	0.6
123	0.57
124	0.63
125	0.66
126	0.58
127	0.57
128	0.5
129	0.49
130	0.43
131	0.42
132	0.34
133	0.3
134	0.28
135	0.22
136	0.21
137	0.17
138	0.17
139	0.18
140	0.17
141	0.15
142	0.17
143	0.22
144	0.28
145	0.26
146	0.27
147	0.29
148	0.32
149	0.33
150	0.32
151	0.29
152	0.24
153	0.24
154	0.22
155	0.18
156	0.15
157	0.14
158	0.14
159	0.12
160	0.09
161	0.07
162	0.07
163	0.06
164	0.06
165	0.07
166	0.07
167	0.08
168	0.09
169	0.08
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.1
175	0.12
176	0.12
177	0.12
178	0.13
179	0.14
180	0.14
181	0.15
182	0.11
183	0.09
184	0.08
185	0.09
186	0.09
187	0.1
188	0.1
189	0.09
190	0.1
191	0.11
192	0.17
193	0.18
194	0.18
195	0.2
196	0.2
197	0.22
198	0.22
199	0.23
200	0.18
201	0.17
202	0.17
203	0.15
204	0.18
205	0.18
206	0.17
207	0.16
208	0.17
209	0.16
210	0.18
211	0.17
212	0.18
213	0.17
214	0.18
215	0.26
216	0.3
217	0.29
218	0.29
219	0.29
220	0.27
221	0.33
222	0.35
223	0.27
224	0.24
225	0.25
226	0.23
227	0.23
228	0.22
229	0.14
230	0.12
231	0.11
232	0.1
233	0.09
234	0.08
235	0.09
236	0.11
237	0.13
238	0.18
239	0.25
240	0.27
241	0.28
242	0.29
243	0.27
244	0.27
245	0.3
246	0.31
247	0.29
248	0.3
249	0.3
250	0.33
251	0.38
252	0.41
253	0.39
254	0.34
255	0.28
256	0.26
257	0.25
258	0.23
259	0.19
260	0.15
261	0.12
262	0.11
263	0.1
264	0.09
265	0.09
266	0.07
267	0.05
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.05
273	0.07
274	0.07
275	0.08
276	0.09
277	0.09
278	0.1
279	0.09
280	0.11
281	0.1
282	0.13
283	0.14
284	0.14
285	0.16
286	0.15
287	0.16
288	0.15
289	0.15
290	0.11
291	0.12
292	0.13
293	0.11
294	0.11
295	0.11
296	0.11
297	0.1
298	0.1
299	0.09
300	0.07
301	0.07
302	0.06
303	0.06
304	0.05
305	0.04
306	0.04
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.05
315	0.06
316	0.06
317	0.08
318	0.09
319	0.11
320	0.11
321	0.16
322	0.17
323	0.17
324	0.16
325	0.14
326	0.12
327	0.12
328	0.13
329	0.09
330	0.08
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.09
335	0.1
336	0.08
337	0.08
338	0.1
339	0.09
340	0.11
341	0.11
342	0.13
343	0.13
344	0.15
345	0.15
346	0.16
347	0.16
348	0.16
349	0.17
350	0.18
351	0.21
352	0.24
353	0.29
354	0.31
355	0.32
356	0.36
357	0.42
358	0.43
359	0.46
360	0.46
361	0.42
362	0.38
363	0.38
364	0.34
365	0.33
366	0.33
367	0.27
368	0.25
369	0.23
370	0.22
371	0.22
372	0.21
373	0.16
374	0.15
375	0.14
376	0.15
377	0.15
378	0.16
379	0.14
380	0.14
381	0.13
382	0.12
383	0.12
384	0.1
385	0.1
386	0.11
387	0.13
388	0.13
389	0.13
390	0.12
391	0.11
392	0.1
393	0.12
394	0.11
395	0.09
396	0.1
397	0.09
398	0.13
399	0.13
400	0.12
401	0.1
402	0.09
403	0.08
404	0.1
405	0.1
406	0.07
407	0.08
408	0.1
409	0.14
410	0.18
411	0.18
412	0.17
413	0.17
414	0.2
415	0.23
416	0.31
417	0.29
418	0.26
419	0.27
420	0.28
421	0.27
422	0.24
423	0.23
424	0.16
425	0.18
426	0.17
427	0.17
428	0.17
429	0.17
430	0.16
431	0.13
432	0.1
433	0.06
434	0.06
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.03
442	0.03
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.06
451	0.05
452	0.07
453	0.07
454	0.08
455	0.08
456	0.09
457	0.1
458	0.11
459	0.12
460	0.12
461	0.14
462	0.12
463	0.13
464	0.13
465	0.13
466	0.13
467	0.13
468	0.14
469	0.15
470	0.15
471	0.15
472	0.15
473	0.16
474	0.18
475	0.19
476	0.19
477	0.17
478	0.16
479	0.16
480	0.15
481	0.14
482	0.15
483	0.12
484	0.11
485	0.12
486	0.13
487	0.13
488	0.14
489	0.17
490	0.2
491	0.23
492	0.25
493	0.25
494	0.26
495	0.26
496	0.28
497	0.25
498	0.19
499	0.17
500	0.14
501	0.15
502	0.13
503	0.16
504	0.15
505	0.21
506	0.23
507	0.25
508	0.27
509	0.27
510	0.35
511	0.37
512	0.37
513	0.35
514	0.43
515	0.47
516	0.52
517	0.52
518	0.46
519	0.46
520	0.47
521	0.47
522	0.41
523	0.35
524	0.29
525	0.29
526	0.28
527	0.24
528	0.2
529	0.16
530	0.12
531	0.16
532	0.17
533	0.17
534	0.15
535	0.15
536	0.17
537	0.18
538	0.18
539	0.17
540	0.17
541	0.17
542	0.21
543	0.25
544	0.26
545	0.27
546	0.29
547	0.34
548	0.37
549	0.37
550	0.33
551	0.3
552	0.28
553	0.27
554	0.27
555	0.2
556	0.15
557	0.16
558	0.17
559	0.16
560	0.15
561	0.17
562	0.14
563	0.15
564	0.15
565	0.18
566	0.21
567	0.22
568	0.26
569	0.24
570	0.27
571	0.29
572	0.3
573	0.31
574	0.27
575	0.31
576	0.34
577	0.36
578	0.36

A0A5C3LSG6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer