FuNGI

A0A5C3M6A0

Protein Details

Accession

A0A5C3M6A0

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
53-97	YQECRATQKLKKRTSEGRKGIDERERRPVQRKRKRKTPVEIDLSE	Hydrophilic
112-137	IEAILKPKKASRQRKKKNNDEVLDSF	Hydrophilic
735-757	DEEEKIRTRKAKKPRMKTSATPA	Hydrophilic
900-925	ASPPPTQKVKTLRRVRRLAPARRISF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
61-88	KLKKRTSEGRKGIDERERRPVQRKRKRK
117-128	KPKKASRQRKKK
739-751	KIRTRKAKKPRMK
831-832	KK

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035441 TFIIS/LEDGF_dom_sf IPR017923 TFIIS_N
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08711 Med26
PROSITE	View protein in PROSITE PS51319 TFIIS_N

Amino Acid Sequences

MPVNPDLEREVFGGSDSELSSDENEELQDKSQARISRRKDVEESSGADSEDDYQECRATQKLKKRTSEGRKGIDERERRPVQRKRKRKTPVEIDLSELPPEQASKIRLDMQIEAILKPKKASRQRKKKNNDEVLDSFADDEVARLREAMNTAAEEDIRANSEKLPATAKLKLLPEAMDTLRKASLAQSMIDNNLLEGVKRWLEPLPDRSLPALNIQREFFNIIKKMEFIDSSVLKESGLGRVVLFYTKCKRVTPDIARIANDLVSTWSRPIIKRSASYRDRVIPVAQDGGEGVDMRAGEKLNAILARAKEAEKGRVKRNAVMIPQRELGSYTVAPKLNAGIGRGSLSVDVDIERRRKNAERLRTLTRKVTMKRSNGLSPLAIVLPHPPLPRRRSSLLSANSASAPHTPRSCASPACSSIFLAPAANRKSTDSWNSSNAADDQEFEWKSDQVRLLSRTLDALPAHLVTPFNGPIPPSNLLDKIARGVSEAKGPIDWPHSIRATRVKLIELARLKAKEDSLERRRGIAEVPEIEIDDGSNYSYYHNGAENPLNVNPVGLGSRRPLYRQSSMDFMNVAGTNLKENDNITKLSNRLQRTGYHPYSRPQIHRRSSSPPRSEDVPSLINPSTPSSSTLNTLSSLASHPRALRRTTSSLSSTSISMLSNSSNGMLQDPRVQRVRRSDSFCAPAPVPPPKDMPASSIGVKRAPSFGALAQEAKKEAGQNRHGRKNSASYPSSDEEEKIRTRKAKKPRMKTSATPASSRMDTPPPSSPSVMSSSPAQSVDMAPSPPIKDRTPVRKSKGPVTCLEVNTKILKSPSTKIKGTHGSEDKPASKKEGEKRPTKMNLQRNPSMFGAELPQLRCSPNVPVSPTLKRSRSPPVPAPTRALSPSVPIVLSPPATIIASPPPTQKVKTLRRVRRLAPARRISFGSLAPGDEADADGEGEDDLPSGTGRGCLGSAFQLH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.12
3	0.11
4	0.11
5	0.1
6	0.11
7	0.12
8	0.13
9	0.13
10	0.12
11	0.13
12	0.13
13	0.14
14	0.14
15	0.2
16	0.19
17	0.2
18	0.26
19	0.31
20	0.36
21	0.45
22	0.5
23	0.54
24	0.58
25	0.63
26	0.63
27	0.62
28	0.63
29	0.58
30	0.55
31	0.49
32	0.45
33	0.39
34	0.33
35	0.28
36	0.24
37	0.22
38	0.19
39	0.16
40	0.15
41	0.16
42	0.17
43	0.18
44	0.2
45	0.25
46	0.32
47	0.41
48	0.51
49	0.59
50	0.66
51	0.72
52	0.78
53	0.81
54	0.84
55	0.83
56	0.81
57	0.81
58	0.78
59	0.77
60	0.76
61	0.73
62	0.67
63	0.68
64	0.68
65	0.66
66	0.72
67	0.74
68	0.76
69	0.79
70	0.85
71	0.84
72	0.87
73	0.91
74	0.91
75	0.91
76	0.91
77	0.9
78	0.88
79	0.79
80	0.74
81	0.69
82	0.6
83	0.5
84	0.39
85	0.29
86	0.21
87	0.21
88	0.17
89	0.17
90	0.17
91	0.19
92	0.22
93	0.27
94	0.29
95	0.31
96	0.31
97	0.29
98	0.32
99	0.31
100	0.28
101	0.29
102	0.3
103	0.28
104	0.29
105	0.31
106	0.35
107	0.44
108	0.55
109	0.6
110	0.68
111	0.79
112	0.87
113	0.93
114	0.94
115	0.95
116	0.94
117	0.87
118	0.84
119	0.75
120	0.7
121	0.6
122	0.49
123	0.39
124	0.28
125	0.24
126	0.15
127	0.13
128	0.1
129	0.11
130	0.1
131	0.1
132	0.11
133	0.12
134	0.14
135	0.15
136	0.13
137	0.13
138	0.13
139	0.14
140	0.14
141	0.12
142	0.12
143	0.11
144	0.11
145	0.12
146	0.12
147	0.13
148	0.18
149	0.18
150	0.18
151	0.21
152	0.22
153	0.25
154	0.29
155	0.29
156	0.3
157	0.31
158	0.32
159	0.3
160	0.27
161	0.24
162	0.24
163	0.24
164	0.24
165	0.22
166	0.22
167	0.21
168	0.2
169	0.19
170	0.16
171	0.2
172	0.17
173	0.17
174	0.18
175	0.19
176	0.2
177	0.21
178	0.19
179	0.13
180	0.15
181	0.14
182	0.11
183	0.11
184	0.13
185	0.14
186	0.14
187	0.15
188	0.15
189	0.2
190	0.25
191	0.29
192	0.33
193	0.33
194	0.34
195	0.35
196	0.34
197	0.3
198	0.33
199	0.34
200	0.3
201	0.31
202	0.31
203	0.29
204	0.29
205	0.32
206	0.25
207	0.25
208	0.25
209	0.25
210	0.24
211	0.24
212	0.25
213	0.23
214	0.22
215	0.16
216	0.18
217	0.18
218	0.19
219	0.21
220	0.19
221	0.17
222	0.18
223	0.17
224	0.15
225	0.15
226	0.13
227	0.11
228	0.12
229	0.12
230	0.14
231	0.14
232	0.17
233	0.22
234	0.28
235	0.3
236	0.31
237	0.35
238	0.39
239	0.49
240	0.51
241	0.54
242	0.57
243	0.58
244	0.56
245	0.53
246	0.47
247	0.37
248	0.29
249	0.19
250	0.13
251	0.12
252	0.12
253	0.11
254	0.14
255	0.16
256	0.18
257	0.22
258	0.26
259	0.29
260	0.33
261	0.38
262	0.45
263	0.46
264	0.49
265	0.49
266	0.48
267	0.47
268	0.43
269	0.39
270	0.31
271	0.28
272	0.27
273	0.21
274	0.15
275	0.13
276	0.11
277	0.11
278	0.09
279	0.07
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.08
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.12
292	0.12
293	0.14
294	0.15
295	0.16
296	0.19
297	0.21
298	0.29
299	0.34
300	0.39
301	0.43
302	0.49
303	0.51
304	0.5
305	0.54
306	0.51
307	0.48
308	0.51
309	0.47
310	0.43
311	0.43
312	0.39
313	0.33
314	0.29
315	0.23
316	0.18
317	0.16
318	0.15
319	0.18
320	0.18
321	0.18
322	0.17
323	0.17
324	0.16
325	0.15
326	0.14
327	0.1
328	0.1
329	0.11
330	0.11
331	0.1
332	0.08
333	0.08
334	0.07
335	0.06
336	0.07
337	0.08
338	0.12
339	0.17
340	0.19
341	0.2
342	0.24
343	0.29
344	0.38
345	0.45
346	0.5
347	0.54
348	0.58
349	0.66
350	0.67
351	0.66
352	0.61
353	0.58
354	0.55
355	0.5
356	0.55
357	0.54
358	0.52
359	0.54
360	0.53
361	0.51
362	0.46
363	0.43
364	0.32
365	0.25
366	0.22
367	0.17
368	0.12
369	0.09
370	0.09
371	0.09
372	0.13
373	0.14
374	0.16
375	0.23
376	0.27
377	0.33
378	0.36
379	0.38
380	0.38
381	0.41
382	0.47
383	0.44
384	0.44
385	0.39
386	0.35
387	0.32
388	0.28
389	0.24
390	0.19
391	0.17
392	0.15
393	0.15
394	0.16
395	0.16
396	0.2
397	0.21
398	0.19
399	0.2
400	0.21
401	0.23
402	0.24
403	0.23
404	0.2
405	0.18
406	0.18
407	0.15
408	0.12
409	0.1
410	0.15
411	0.16
412	0.17
413	0.17
414	0.18
415	0.2
416	0.23
417	0.27
418	0.26
419	0.27
420	0.28
421	0.3
422	0.28
423	0.26
424	0.23
425	0.19
426	0.14
427	0.13
428	0.11
429	0.14
430	0.14
431	0.14
432	0.14
433	0.13
434	0.14
435	0.16
436	0.17
437	0.14
438	0.17
439	0.19
440	0.19
441	0.19
442	0.18
443	0.17
444	0.15
445	0.16
446	0.12
447	0.1
448	0.1
449	0.09
450	0.09
451	0.09
452	0.09
453	0.07
454	0.09
455	0.08
456	0.08
457	0.08
458	0.09
459	0.09
460	0.13
461	0.14
462	0.13
463	0.14
464	0.14
465	0.16
466	0.16
467	0.15
468	0.13
469	0.11
470	0.1
471	0.1
472	0.11
473	0.1
474	0.12
475	0.12
476	0.11
477	0.11
478	0.11
479	0.11
480	0.12
481	0.13
482	0.11
483	0.14
484	0.16
485	0.16
486	0.18
487	0.24
488	0.24
489	0.26
490	0.26
491	0.23
492	0.25
493	0.26
494	0.3
495	0.25
496	0.24
497	0.24
498	0.24
499	0.24
500	0.21
501	0.2
502	0.17
503	0.2
504	0.28
505	0.31
506	0.38
507	0.37
508	0.37
509	0.37
510	0.35
511	0.31
512	0.24
513	0.21
514	0.15
515	0.15
516	0.14
517	0.14
518	0.13
519	0.12
520	0.09
521	0.06
522	0.05
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.05
527	0.06
528	0.06
529	0.07
530	0.08
531	0.08
532	0.1
533	0.12
534	0.13
535	0.14
536	0.14
537	0.14
538	0.13
539	0.12
540	0.1
541	0.08
542	0.08
543	0.06
544	0.07
545	0.08
546	0.13
547	0.13
548	0.15
549	0.2
550	0.24
551	0.29
552	0.31
553	0.31
554	0.3
555	0.31
556	0.3
557	0.25
558	0.2
559	0.17
560	0.14
561	0.12
562	0.09
563	0.08
564	0.09
565	0.1
566	0.11
567	0.09
568	0.1
569	0.12
570	0.13
571	0.14
572	0.15
573	0.16
574	0.17
575	0.23
576	0.28
577	0.27
578	0.29
579	0.3
580	0.31
581	0.35
582	0.43
583	0.42
584	0.41
585	0.41
586	0.41
587	0.47
588	0.49
589	0.5
590	0.49
591	0.54
592	0.55
593	0.59
594	0.6
595	0.61
596	0.66
597	0.69
598	0.66
599	0.6
600	0.56
601	0.54
602	0.52
603	0.45
604	0.38
605	0.31
606	0.25
607	0.26
608	0.23
609	0.21
610	0.19
611	0.19
612	0.17
613	0.15
614	0.18
615	0.16
616	0.16
617	0.18
618	0.18
619	0.17
620	0.16
621	0.16
622	0.13
623	0.12
624	0.12
625	0.13
626	0.13
627	0.14
628	0.16
629	0.22
630	0.25
631	0.27
632	0.29
633	0.32
634	0.36
635	0.36
636	0.38
637	0.34
638	0.32
639	0.32
640	0.29
641	0.23
642	0.19
643	0.17
644	0.14
645	0.12
646	0.11
647	0.09
648	0.09
649	0.08
650	0.08
651	0.08
652	0.08
653	0.09
654	0.09
655	0.1
656	0.18
657	0.19
658	0.23
659	0.29
660	0.3
661	0.34
662	0.43
663	0.5
664	0.49
665	0.55
666	0.56
667	0.54
668	0.57
669	0.54
670	0.48
671	0.39
672	0.35
673	0.32
674	0.35
675	0.32
676	0.3
677	0.31
678	0.3
679	0.33
680	0.31
681	0.29
682	0.26
683	0.26
684	0.27
685	0.28
686	0.27
687	0.25
688	0.26
689	0.24
690	0.22
691	0.19
692	0.17
693	0.15
694	0.15
695	0.17
696	0.17
697	0.19
698	0.18
699	0.19
700	0.19
701	0.18
702	0.18
703	0.19
704	0.23
705	0.29
706	0.36
707	0.45
708	0.53
709	0.62
710	0.63
711	0.61
712	0.6
713	0.59
714	0.57
715	0.56
716	0.49
717	0.42
718	0.45
719	0.44
720	0.43
721	0.36
722	0.3
723	0.25
724	0.28
725	0.31
726	0.29
727	0.33
728	0.38
729	0.44
730	0.52
731	0.6
732	0.66
733	0.71
734	0.78
735	0.83
736	0.84
737	0.83
738	0.81
739	0.8
740	0.79
741	0.72
742	0.63
743	0.55
744	0.5
745	0.45
746	0.4
747	0.34
748	0.3
749	0.29
750	0.31
751	0.36
752	0.35
753	0.37
754	0.37
755	0.33
756	0.3
757	0.32
758	0.29
759	0.23
760	0.23
761	0.22
762	0.23
763	0.22
764	0.2
765	0.16
766	0.16
767	0.18
768	0.17
769	0.15
770	0.14
771	0.17
772	0.18
773	0.22
774	0.25
775	0.24
776	0.28
777	0.37
778	0.46
779	0.53
780	0.61
781	0.63
782	0.66
783	0.69
784	0.72
785	0.72
786	0.65
787	0.59
788	0.57
789	0.56
790	0.51
791	0.53
792	0.45
793	0.4
794	0.4
795	0.37
796	0.32
797	0.27
798	0.29
799	0.27
800	0.32
801	0.39
802	0.42
803	0.45
804	0.44
805	0.51
806	0.56
807	0.56
808	0.59
809	0.55
810	0.52
811	0.54
812	0.58
813	0.56
814	0.52
815	0.49
816	0.45
817	0.44
818	0.49
819	0.53
820	0.57
821	0.59
822	0.63
823	0.67
824	0.72
825	0.74
826	0.76
827	0.76
828	0.76
829	0.76
830	0.75
831	0.77
832	0.69
833	0.66
834	0.57
835	0.49
836	0.39
837	0.31
838	0.27
839	0.24
840	0.27
841	0.23
842	0.26
843	0.25
844	0.26
845	0.26
846	0.24
847	0.27
848	0.29
849	0.33
850	0.34
851	0.38
852	0.43
853	0.49
854	0.55
855	0.56
856	0.54
857	0.52
858	0.53
859	0.57
860	0.6
861	0.61
862	0.63
863	0.64
864	0.68
865	0.69
866	0.69
867	0.62
868	0.58
869	0.51
870	0.45
871	0.36
872	0.31
873	0.31
874	0.27
875	0.23
876	0.19
877	0.19
878	0.19
879	0.19
880	0.16
881	0.14
882	0.13
883	0.14
884	0.14
885	0.13
886	0.17
887	0.21
888	0.23
889	0.26
890	0.31
891	0.34
892	0.36
893	0.42
894	0.46
895	0.52
896	0.6
897	0.68
898	0.72
899	0.78
900	0.85
901	0.82
902	0.82
903	0.82
904	0.82
905	0.81
906	0.81
907	0.75
908	0.71
909	0.69
910	0.61
911	0.54
912	0.45
913	0.41
914	0.32
915	0.29
916	0.26
917	0.23
918	0.19
919	0.16
920	0.15
921	0.09
922	0.08
923	0.07
924	0.06
925	0.07
926	0.06
927	0.06
928	0.06
929	0.06
930	0.05
931	0.06
932	0.06
933	0.06
934	0.07
935	0.08
936	0.08
937	0.09
938	0.09
939	0.09
940	0.11

A0A5C3M6A0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer