Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LT43

Protein Details
Accession A0A5C3LT43    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
554-577LLSQRFWRRGKRGKWYKRRALIQTHydrophilic
909-934DEKEDDKPSTTRKRKRETPATSSTQKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
561-572RRGKRGKWYKRR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_mito 7.5, cyto 7, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033315  Fan1-like  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
IPR014883  VRR_NUC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004528  F:phosphodiesterase I activity  
GO:0036297  P:interstrand cross-link repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF08774  VRR_NUC  
CDD cd22326  FAN1-like  
Amino Acid Sequences MAGNASPRRLIQTLIFGAYTVDKDVIEQDLDRRDEESRAERAGNGTAGSRRPSAYLDCMEQMINTVFTHEKHLLTDQEWSVFSKFASLSYDTRYVISRLVLRKPNQWLAVLSPGIQKYKGEIGETGLQVAIEHLCRPLDDLLKDEDTKVDVLVKQEDEREVIDLTLDSDDEDVQPTTPIPLPQINALADPSASPTAETVDSVMNALFEADADELKVDYLCESEEHMSQEEILNRLTVDQLKLLLKRFKCTPKNPTPTMISSLLHQTTTQSVLGFLSTKSPKGKGKVSDDHLRQMRLPFAVKKFDHNWKGKSQNQEARLKEMSMQMLGKCVRVNYNFYRLVRRLHIINFRSTEHPTSLLLPALLTRFNKRVYPEYSHARNGAIWATREDLLKYEQALALEARIDELLEAIDADTRAKAKTPTPSKRDRFITLVPPAAGGSSATPLKTPVSASTARRTTTSGGVTHKMEVDEGEIYEVSDTPTIQKAKILKEIYEKWIKTLWEGAVMAKQEQSMERTPALERFEPGYVYTRVANKTANAYGSLKEYQAEFDTIQALLSQRFWRRGKRGKWYKRRALIQTDYLSKDPNVPKVKDRNILVQAYDGLLEALNDEDTGLVWRPNLVSRIRKLEKVLKIPEPVEVQDKLRKAESITIKAARVPAVQLDGNGRPVKGKENTPPAPGETISSHFSPIVKKPDVPEFTKPKPKTGKSSWKGRDGEIVNVETRALEYYEDQGFKGFHSETRILTTLFALLFWDVIFTDIPGAFETAYQSAPLDMAEDSFYHARKDLIDARLRDIKSGKAREILEKHDEKYREKNVWCIGVRWDMCERCDLVEIVECLGGPSLATICRLFCEDYAGRNSGVPDLIVWNAEKRLCKFVEVKGPGDRPQENQKLWFDTLLGASAAVEVCLVVDEKEDDKPSTTRKRKRETPATSSTQKSKKIVKDIESEDEGELDYDQLEQEESDDHKLPALLSKHRRTEAPEGYVEKLSLPFPSKATPLRPPASTPVRRVNRVQVLTTNPIPIAGSC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.24
4 0.25
5 0.24
6 0.22
7 0.15
8 0.13
9 0.11
10 0.12
11 0.14
12 0.14
13 0.14
14 0.14
15 0.18
16 0.24
17 0.26
18 0.26
19 0.26
20 0.26
21 0.27
22 0.32
23 0.33
24 0.3
25 0.31
26 0.32
27 0.31
28 0.31
29 0.32
30 0.28
31 0.22
32 0.22
33 0.23
34 0.26
35 0.28
36 0.28
37 0.25
38 0.26
39 0.28
40 0.29
41 0.31
42 0.32
43 0.32
44 0.31
45 0.31
46 0.29
47 0.26
48 0.24
49 0.19
50 0.17
51 0.13
52 0.15
53 0.15
54 0.16
55 0.23
56 0.23
57 0.22
58 0.23
59 0.27
60 0.27
61 0.26
62 0.32
63 0.27
64 0.27
65 0.27
66 0.28
67 0.25
68 0.22
69 0.21
70 0.19
71 0.17
72 0.16
73 0.19
74 0.2
75 0.21
76 0.26
77 0.3
78 0.26
79 0.28
80 0.28
81 0.25
82 0.24
83 0.25
84 0.27
85 0.28
86 0.36
87 0.43
88 0.44
89 0.5
90 0.56
91 0.6
92 0.56
93 0.52
94 0.46
95 0.41
96 0.44
97 0.37
98 0.31
99 0.29
100 0.29
101 0.29
102 0.28
103 0.25
104 0.22
105 0.28
106 0.28
107 0.24
108 0.22
109 0.25
110 0.3
111 0.3
112 0.27
113 0.2
114 0.18
115 0.17
116 0.17
117 0.14
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.13
124 0.16
125 0.2
126 0.2
127 0.22
128 0.25
129 0.29
130 0.3
131 0.28
132 0.25
133 0.21
134 0.2
135 0.18
136 0.17
137 0.15
138 0.17
139 0.21
140 0.22
141 0.22
142 0.24
143 0.24
144 0.22
145 0.21
146 0.2
147 0.16
148 0.14
149 0.13
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.15
167 0.17
168 0.18
169 0.2
170 0.23
171 0.21
172 0.2
173 0.19
174 0.17
175 0.13
176 0.12
177 0.13
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.05
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.09
209 0.11
210 0.12
211 0.14
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.18
216 0.17
217 0.17
218 0.15
219 0.14
220 0.12
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.12
225 0.12
226 0.15
227 0.18
228 0.21
229 0.26
230 0.31
231 0.3
232 0.33
233 0.4
234 0.47
235 0.53
236 0.59
237 0.64
238 0.67
239 0.75
240 0.74
241 0.71
242 0.66
243 0.59
244 0.56
245 0.48
246 0.37
247 0.3
248 0.33
249 0.29
250 0.24
251 0.21
252 0.17
253 0.16
254 0.18
255 0.17
256 0.11
257 0.11
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.09
262 0.14
263 0.15
264 0.18
265 0.21
266 0.25
267 0.3
268 0.34
269 0.41
270 0.41
271 0.48
272 0.53
273 0.57
274 0.61
275 0.59
276 0.62
277 0.59
278 0.53
279 0.47
280 0.41
281 0.37
282 0.3
283 0.31
284 0.29
285 0.29
286 0.36
287 0.34
288 0.38
289 0.41
290 0.49
291 0.54
292 0.55
293 0.55
294 0.55
295 0.63
296 0.62
297 0.65
298 0.64
299 0.62
300 0.63
301 0.67
302 0.6
303 0.57
304 0.54
305 0.45
306 0.39
307 0.35
308 0.28
309 0.22
310 0.23
311 0.17
312 0.21
313 0.21
314 0.19
315 0.17
316 0.17
317 0.2
318 0.2
319 0.26
320 0.25
321 0.32
322 0.36
323 0.37
324 0.44
325 0.4
326 0.42
327 0.39
328 0.37
329 0.33
330 0.34
331 0.41
332 0.36
333 0.39
334 0.37
335 0.36
336 0.37
337 0.36
338 0.33
339 0.25
340 0.24
341 0.2
342 0.2
343 0.19
344 0.16
345 0.13
346 0.11
347 0.1
348 0.1
349 0.12
350 0.11
351 0.14
352 0.17
353 0.18
354 0.21
355 0.23
356 0.29
357 0.31
358 0.36
359 0.38
360 0.43
361 0.46
362 0.45
363 0.43
364 0.37
365 0.33
366 0.27
367 0.25
368 0.19
369 0.16
370 0.14
371 0.15
372 0.16
373 0.17
374 0.16
375 0.14
376 0.14
377 0.14
378 0.13
379 0.13
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.05
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.06
402 0.08
403 0.1
404 0.12
405 0.21
406 0.31
407 0.4
408 0.45
409 0.56
410 0.58
411 0.64
412 0.65
413 0.59
414 0.53
415 0.48
416 0.49
417 0.41
418 0.39
419 0.32
420 0.28
421 0.24
422 0.2
423 0.16
424 0.09
425 0.06
426 0.06
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.08
431 0.08
432 0.09
433 0.09
434 0.08
435 0.12
436 0.16
437 0.19
438 0.24
439 0.26
440 0.26
441 0.26
442 0.27
443 0.24
444 0.24
445 0.24
446 0.2
447 0.2
448 0.23
449 0.22
450 0.22
451 0.21
452 0.17
453 0.15
454 0.12
455 0.1
456 0.08
457 0.07
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.1
468 0.11
469 0.11
470 0.14
471 0.17
472 0.19
473 0.27
474 0.26
475 0.24
476 0.29
477 0.32
478 0.35
479 0.38
480 0.35
481 0.3
482 0.32
483 0.3
484 0.24
485 0.25
486 0.19
487 0.14
488 0.15
489 0.14
490 0.13
491 0.13
492 0.13
493 0.1
494 0.1
495 0.08
496 0.09
497 0.12
498 0.11
499 0.12
500 0.12
501 0.13
502 0.14
503 0.16
504 0.19
505 0.16
506 0.15
507 0.15
508 0.16
509 0.15
510 0.15
511 0.16
512 0.13
513 0.14
514 0.15
515 0.16
516 0.17
517 0.18
518 0.18
519 0.15
520 0.17
521 0.17
522 0.16
523 0.14
524 0.14
525 0.13
526 0.16
527 0.16
528 0.13
529 0.12
530 0.12
531 0.11
532 0.11
533 0.12
534 0.09
535 0.08
536 0.09
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.07
541 0.06
542 0.08
543 0.12
544 0.14
545 0.22
546 0.24
547 0.31
548 0.39
549 0.48
550 0.53
551 0.6
552 0.69
553 0.73
554 0.81
555 0.85
556 0.84
557 0.83
558 0.83
559 0.77
560 0.74
561 0.67
562 0.62
563 0.55
564 0.5
565 0.45
566 0.38
567 0.33
568 0.26
569 0.29
570 0.25
571 0.3
572 0.32
573 0.31
574 0.38
575 0.45
576 0.51
577 0.49
578 0.48
579 0.47
580 0.45
581 0.45
582 0.38
583 0.3
584 0.25
585 0.2
586 0.18
587 0.11
588 0.06
589 0.05
590 0.05
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.03
595 0.03
596 0.03
597 0.03
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.05
602 0.06
603 0.07
604 0.09
605 0.12
606 0.16
607 0.21
608 0.24
609 0.33
610 0.35
611 0.37
612 0.39
613 0.44
614 0.46
615 0.48
616 0.5
617 0.45
618 0.46
619 0.44
620 0.43
621 0.36
622 0.31
623 0.27
624 0.23
625 0.22
626 0.24
627 0.25
628 0.23
629 0.22
630 0.22
631 0.19
632 0.25
633 0.28
634 0.28
635 0.31
636 0.32
637 0.31
638 0.32
639 0.32
640 0.25
641 0.2
642 0.16
643 0.12
644 0.13
645 0.13
646 0.12
647 0.14
648 0.14
649 0.18
650 0.19
651 0.18
652 0.16
653 0.17
654 0.23
655 0.23
656 0.27
657 0.29
658 0.38
659 0.41
660 0.42
661 0.42
662 0.37
663 0.35
664 0.31
665 0.26
666 0.18
667 0.18
668 0.18
669 0.17
670 0.17
671 0.15
672 0.16
673 0.18
674 0.21
675 0.26
676 0.25
677 0.26
678 0.28
679 0.36
680 0.4
681 0.4
682 0.44
683 0.44
684 0.5
685 0.59
686 0.57
687 0.57
688 0.62
689 0.62
690 0.62
691 0.65
692 0.69
693 0.65
694 0.75
695 0.72
696 0.72
697 0.69
698 0.61
699 0.59
700 0.49
701 0.48
702 0.4
703 0.36
704 0.27
705 0.26
706 0.25
707 0.16
708 0.15
709 0.11
710 0.08
711 0.07
712 0.07
713 0.11
714 0.14
715 0.15
716 0.14
717 0.15
718 0.15
719 0.14
720 0.17
721 0.14
722 0.12
723 0.17
724 0.19
725 0.19
726 0.23
727 0.24
728 0.21
729 0.21
730 0.19
731 0.15
732 0.13
733 0.12
734 0.09
735 0.07
736 0.07
737 0.06
738 0.06
739 0.04
740 0.05
741 0.05
742 0.05
743 0.07
744 0.07
745 0.08
746 0.08
747 0.08
748 0.07
749 0.08
750 0.09
751 0.09
752 0.09
753 0.08
754 0.08
755 0.08
756 0.08
757 0.07
758 0.07
759 0.06
760 0.06
761 0.07
762 0.07
763 0.1
764 0.12
765 0.13
766 0.12
767 0.13
768 0.13
769 0.13
770 0.19
771 0.23
772 0.27
773 0.33
774 0.34
775 0.38
776 0.45
777 0.44
778 0.42
779 0.37
780 0.37
781 0.4
782 0.43
783 0.41
784 0.4
785 0.41
786 0.46
787 0.49
788 0.47
789 0.47
790 0.46
791 0.45
792 0.46
793 0.48
794 0.44
795 0.49
796 0.51
797 0.5
798 0.48
799 0.53
800 0.5
801 0.55
802 0.52
803 0.44
804 0.41
805 0.41
806 0.4
807 0.37
808 0.39
809 0.33
810 0.32
811 0.33
812 0.3
813 0.23
814 0.25
815 0.22
816 0.16
817 0.18
818 0.18
819 0.16
820 0.15
821 0.13
822 0.11
823 0.11
824 0.1
825 0.05
826 0.05
827 0.06
828 0.06
829 0.08
830 0.09
831 0.09
832 0.1
833 0.13
834 0.13
835 0.12
836 0.19
837 0.19
838 0.23
839 0.27
840 0.28
841 0.26
842 0.26
843 0.27
844 0.21
845 0.2
846 0.15
847 0.11
848 0.12
849 0.12
850 0.12
851 0.12
852 0.12
853 0.15
854 0.18
855 0.22
856 0.23
857 0.3
858 0.29
859 0.33
860 0.35
861 0.38
862 0.46
863 0.45
864 0.46
865 0.47
866 0.49
867 0.5
868 0.53
869 0.49
870 0.43
871 0.5
872 0.55
873 0.49
874 0.51
875 0.5
876 0.49
877 0.48
878 0.44
879 0.34
880 0.27
881 0.25
882 0.2
883 0.16
884 0.1
885 0.09
886 0.09
887 0.09
888 0.07
889 0.06
890 0.04
891 0.04
892 0.05
893 0.05
894 0.05
895 0.06
896 0.08
897 0.1
898 0.14
899 0.17
900 0.18
901 0.21
902 0.25
903 0.33
904 0.42
905 0.51
906 0.57
907 0.65
908 0.74
909 0.8
910 0.87
911 0.89
912 0.87
913 0.85
914 0.84
915 0.82
916 0.79
917 0.75
918 0.73
919 0.7
920 0.67
921 0.65
922 0.65
923 0.65
924 0.68
925 0.7
926 0.67
927 0.68
928 0.67
929 0.67
930 0.6
931 0.54
932 0.44
933 0.36
934 0.3
935 0.22
936 0.17
937 0.11
938 0.08
939 0.07
940 0.07
941 0.07
942 0.07
943 0.06
944 0.07
945 0.1
946 0.12
947 0.16
948 0.19
949 0.18
950 0.19
951 0.2
952 0.2
953 0.24
954 0.27
955 0.33
956 0.4
957 0.49
958 0.55
959 0.57
960 0.59
961 0.59
962 0.64
963 0.62
964 0.58
965 0.56
966 0.52
967 0.52
968 0.51
969 0.44
970 0.36
971 0.29
972 0.24
973 0.22
974 0.23
975 0.22
976 0.23
977 0.27
978 0.3
979 0.35
980 0.4
981 0.44
982 0.49
983 0.51
984 0.51
985 0.51
986 0.55
987 0.6
988 0.6
989 0.59
990 0.61
991 0.65
992 0.68
993 0.69
994 0.7
995 0.69
996 0.66
997 0.63
998 0.58
999 0.56
1000 0.58
1001 0.55
1002 0.47
1003 0.37
1004 0.33