FuNGI

A0A5C3M682

Protein Details

Accession

A0A5C3M682

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
261-280	EGEGKKRKKGKGKDKAKEET	Basic
463-483	GEKAKSKKELGRLKNKTKVLA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
249-277	LKRKRGEGEEGEEGEGKKRKKGKGKDKAK
465-478	KAKSKKELGRLKNK

Subcellular Location(s)

cyto 13.5, cyto_nucl 9, E.R. 4, nucl 3.5, mito 2, extr 1, pero 1, cysk 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028884 Trm82 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0036265 P:RNA (guanine-N7)-methylation GO:0030488 P:tRNA methylation
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1

Amino Acid Sequences

MSVYPHSHLFVGPSETVVISGPHIQVLSTTTGDILHSTVNFEDEKRGAVIESGPVRCAAVDKSNKYLITTAEDKMLKLWEIGGLKLLSERELPKKPTGLAFRADSQKLLTSDKFGDIFSYPFTYVPLTVKQKRDALSSHENPSSGQLILGHASPLNAFLLTSDEKYIVTADRDEHIRVSWYPQGYNIEMYCLGHLKFVSAIHIPHLDPSMLISGGGDPVLKIWDWMAGDLKHEVNVLDTIDPYMAVRALKRKRGEGEEGEEGEGKKRKKGKGKDKAKEETPDTGTPVAEGSEAAAEEKTEEAAKGEPSEPEKILVIHKIDSLDAEGCLWIVFSAVGTTALFTFPFKAGVTSSDIRAFDFGLPVIDFSITGDGEIWVNLDAQWKSTDLATSEASTKAVRVMHFVSQELKEVSEKALVSALNTKSLLQATPEELKKLDLYGDLTSMPKYSDSEAAEATPEVAAGGEKAKSKKELGRLKNKTKVLAKMAVSAATGDARAGEDELEEPETKRTKSEHGDEAEVKKNEDVVMAES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.18
3	0.18
4	0.16
5	0.13
6	0.1
7	0.15
8	0.14
9	0.14
10	0.14
11	0.13
12	0.14
13	0.16
14	0.17
15	0.13
16	0.13
17	0.12
18	0.13
19	0.13
20	0.13
21	0.12
22	0.1
23	0.1
24	0.12
25	0.12
26	0.14
27	0.14
28	0.15
29	0.19
30	0.17
31	0.19
32	0.17
33	0.17
34	0.15
35	0.16
36	0.16
37	0.17
38	0.23
39	0.22
40	0.22
41	0.22
42	0.22
43	0.2
44	0.21
45	0.18
46	0.21
47	0.29
48	0.32
49	0.37
50	0.42
51	0.42
52	0.42
53	0.41
54	0.33
55	0.31
56	0.31
57	0.26
58	0.29
59	0.29
60	0.27
61	0.27
62	0.27
63	0.21
64	0.18
65	0.18
66	0.15
67	0.16
68	0.16
69	0.18
70	0.16
71	0.15
72	0.17
73	0.17
74	0.14
75	0.17
76	0.21
77	0.25
78	0.32
79	0.37
80	0.39
81	0.41
82	0.42
83	0.45
84	0.48
85	0.43
86	0.41
87	0.39
88	0.41
89	0.45
90	0.43
91	0.37
92	0.31
93	0.33
94	0.3
95	0.31
96	0.26
97	0.23
98	0.24
99	0.26
100	0.25
101	0.2
102	0.2
103	0.17
104	0.17
105	0.15
106	0.16
107	0.14
108	0.13
109	0.14
110	0.13
111	0.14
112	0.16
113	0.21
114	0.27
115	0.34
116	0.38
117	0.42
118	0.46
119	0.46
120	0.47
121	0.42
122	0.41
123	0.44
124	0.45
125	0.45
126	0.42
127	0.4
128	0.37
129	0.37
130	0.31
131	0.21
132	0.16
133	0.11
134	0.11
135	0.12
136	0.12
137	0.09
138	0.08
139	0.08
140	0.07
141	0.08
142	0.07
143	0.06
144	0.06
145	0.05
146	0.09
147	0.1
148	0.11
149	0.11
150	0.11
151	0.11
152	0.11
153	0.12
154	0.1
155	0.1
156	0.1
157	0.11
158	0.13
159	0.15
160	0.15
161	0.15
162	0.14
163	0.15
164	0.14
165	0.17
166	0.19
167	0.19
168	0.18
169	0.2
170	0.23
171	0.21
172	0.23
173	0.19
174	0.16
175	0.15
176	0.15
177	0.13
178	0.12
179	0.11
180	0.1
181	0.1
182	0.09
183	0.1
184	0.09
185	0.11
186	0.11
187	0.11
188	0.12
189	0.14
190	0.13
191	0.13
192	0.14
193	0.11
194	0.09
195	0.1
196	0.09
197	0.07
198	0.07
199	0.06
200	0.05
201	0.06
202	0.06
203	0.05
204	0.03
205	0.04
206	0.05
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.06
211	0.07
212	0.07
213	0.1
214	0.1
215	0.11
216	0.12
217	0.12
218	0.1
219	0.11
220	0.1
221	0.08
222	0.08
223	0.08
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.07
234	0.15
235	0.19
236	0.26
237	0.27
238	0.31
239	0.33
240	0.37
241	0.41
242	0.35
243	0.36
244	0.33
245	0.32
246	0.29
247	0.26
248	0.22
249	0.21
250	0.22
251	0.18
252	0.2
253	0.26
254	0.31
255	0.4
256	0.5
257	0.58
258	0.64
259	0.75
260	0.78
261	0.8
262	0.8
263	0.74
264	0.69
265	0.6
266	0.54
267	0.47
268	0.4
269	0.33
270	0.28
271	0.24
272	0.19
273	0.16
274	0.12
275	0.07
276	0.06
277	0.05
278	0.04
279	0.04
280	0.05
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.06
290	0.07
291	0.09
292	0.09
293	0.11
294	0.13
295	0.16
296	0.15
297	0.15
298	0.15
299	0.14
300	0.15
301	0.16
302	0.15
303	0.13
304	0.14
305	0.13
306	0.13
307	0.12
308	0.12
309	0.09
310	0.08
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.04
317	0.03
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.07
330	0.07
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.09
335	0.1
336	0.16
337	0.15
338	0.17
339	0.19
340	0.19
341	0.19
342	0.19
343	0.18
344	0.13
345	0.12
346	0.11
347	0.08
348	0.08
349	0.08
350	0.08
351	0.07
352	0.06
353	0.06
354	0.08
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.07
362	0.05
363	0.06
364	0.06
365	0.11
366	0.1
367	0.12
368	0.13
369	0.13
370	0.13
371	0.13
372	0.14
373	0.1
374	0.13
375	0.13
376	0.13
377	0.14
378	0.14
379	0.15
380	0.13
381	0.13
382	0.13
383	0.15
384	0.14
385	0.16
386	0.18
387	0.22
388	0.23
389	0.24
390	0.24
391	0.22
392	0.25
393	0.22
394	0.21
395	0.17
396	0.17
397	0.17
398	0.17
399	0.16
400	0.13
401	0.15
402	0.14
403	0.15
404	0.21
405	0.2
406	0.2
407	0.2
408	0.2
409	0.2
410	0.21
411	0.2
412	0.15
413	0.16
414	0.17
415	0.24
416	0.25
417	0.25
418	0.24
419	0.25
420	0.23
421	0.22
422	0.19
423	0.13
424	0.15
425	0.14
426	0.15
427	0.14
428	0.15
429	0.15
430	0.14
431	0.13
432	0.11
433	0.12
434	0.13
435	0.18
436	0.19
437	0.2
438	0.2
439	0.2
440	0.2
441	0.18
442	0.17
443	0.11
444	0.09
445	0.07
446	0.06
447	0.06
448	0.05
449	0.07
450	0.1
451	0.15
452	0.18
453	0.21
454	0.25
455	0.3
456	0.36
457	0.44
458	0.52
459	0.57
460	0.66
461	0.73
462	0.79
463	0.83
464	0.8
465	0.78
466	0.75
467	0.72
468	0.68
469	0.65
470	0.57
471	0.54
472	0.52
473	0.44
474	0.37
475	0.3
476	0.24
477	0.17
478	0.16
479	0.1
480	0.09
481	0.08
482	0.09
483	0.09
484	0.08
485	0.08
486	0.09
487	0.11
488	0.14
489	0.14
490	0.14
491	0.21
492	0.26
493	0.25
494	0.28
495	0.29
496	0.34
497	0.42
498	0.47
499	0.49
500	0.49
501	0.56
502	0.58
503	0.61
504	0.62
505	0.55
506	0.49
507	0.42
508	0.39
509	0.32
510	0.28

A0A5C3M682

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer