Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3MDA1

Protein Details
Accession A0A5C3MDA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
174-198ALKAKEEKDRKEREKQERIQKEQLEBasic
448-476FVAQRRMLRKPTRNSRVQQKRPRSRTLTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-189ALKAKEEKDRKEREKQ
Subcellular Location(s) cyto 13.5cyto_nucl 13.5, nucl 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044059  Csn1/TTC4_wheel  
IPR000554  Ribosomal_S7e  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005840  C:ribosome  
GO:0051879  F:Hsp90 protein binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01251  Ribosomal_S7e  
PF18972  Wheel  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00948  RIBOSOMAL_S7E  
PS50005  TPR  
CDD cd21377  CTWD_Cns1-like  
Amino Acid Sequences MAAPTVGPLPKSTKTPEEALAAFDSIPLFMKSLPSEDSDNAALAALQSLAYEGTPDEIAQNFKEQGNDYFKGKRYREAIGFYTQGVDAKPTDNTIMEALLCNRAACNLELKNYGSVLRDCSSALTLNEKSSKAYYRSAMALVALERVEEALDCCDRCLSYDRENKGVQTLRERALKAKEEKDRKEREKQERIQKEQLEKRIMDAAFRQRNLINIPRPDGSANPYSPHWDPDDATQSTLVLPVFFLYPQYATSDVISEFAEDTPFAAHIAAMFPPETPPPEWDAKHEYVDGQLVIYAMTHRKRLLKVGKKMTLRDVCNAAKAKEGEPRDGLEVKDGCLTFVVVPKGDVEKKWMSVNHKILRTANAPTTAPDEIETSVAQALIDLENNVPELKTELRALQISAAREVDVRGGKKAIVIFVPVPQLKAFHKVQQRLTRELEKKFSDRHVVFVAQRRMLRKPTRNSRVQQKRPRSRTLTSVHEKILEDLVFPTEIVGKRTRVAVDGSKLLKVFLDSKDATSLEYKLDSFSSVYRRLTGKDVVFEFPVIAQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.42
3 0.43
4 0.42
5 0.39
6 0.38
7 0.34
8 0.28
9 0.24
10 0.2
11 0.17
12 0.12
13 0.13
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.14
18 0.14
19 0.16
20 0.18
21 0.19
22 0.22
23 0.22
24 0.25
25 0.23
26 0.22
27 0.19
28 0.17
29 0.14
30 0.1
31 0.1
32 0.06
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.06
39 0.05
40 0.07
41 0.07
42 0.08
43 0.09
44 0.11
45 0.13
46 0.14
47 0.18
48 0.19
49 0.2
50 0.22
51 0.23
52 0.28
53 0.33
54 0.34
55 0.34
56 0.38
57 0.43
58 0.51
59 0.5
60 0.5
61 0.47
62 0.51
63 0.53
64 0.52
65 0.49
66 0.44
67 0.44
68 0.37
69 0.35
70 0.28
71 0.24
72 0.18
73 0.17
74 0.13
75 0.13
76 0.14
77 0.13
78 0.15
79 0.14
80 0.15
81 0.13
82 0.13
83 0.11
84 0.12
85 0.13
86 0.14
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.13
91 0.14
92 0.13
93 0.18
94 0.17
95 0.2
96 0.23
97 0.25
98 0.25
99 0.24
100 0.24
101 0.21
102 0.2
103 0.21
104 0.2
105 0.19
106 0.17
107 0.18
108 0.18
109 0.17
110 0.16
111 0.18
112 0.18
113 0.21
114 0.25
115 0.24
116 0.25
117 0.26
118 0.3
119 0.28
120 0.31
121 0.29
122 0.28
123 0.29
124 0.28
125 0.25
126 0.19
127 0.17
128 0.13
129 0.13
130 0.1
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.13
144 0.17
145 0.19
146 0.26
147 0.35
148 0.37
149 0.41
150 0.42
151 0.41
152 0.42
153 0.42
154 0.35
155 0.34
156 0.36
157 0.35
158 0.4
159 0.4
160 0.38
161 0.4
162 0.45
163 0.44
164 0.47
165 0.52
166 0.56
167 0.63
168 0.68
169 0.72
170 0.71
171 0.76
172 0.78
173 0.79
174 0.81
175 0.82
176 0.83
177 0.82
178 0.82
179 0.8
180 0.75
181 0.74
182 0.7
183 0.69
184 0.64
185 0.54
186 0.48
187 0.47
188 0.41
189 0.33
190 0.31
191 0.34
192 0.34
193 0.34
194 0.35
195 0.29
196 0.31
197 0.33
198 0.35
199 0.32
200 0.28
201 0.31
202 0.3
203 0.31
204 0.29
205 0.26
206 0.23
207 0.22
208 0.2
209 0.19
210 0.19
211 0.22
212 0.21
213 0.22
214 0.2
215 0.16
216 0.16
217 0.18
218 0.24
219 0.21
220 0.21
221 0.19
222 0.17
223 0.15
224 0.16
225 0.12
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.06
230 0.05
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.05
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.13
266 0.16
267 0.17
268 0.19
269 0.25
270 0.25
271 0.25
272 0.24
273 0.21
274 0.17
275 0.18
276 0.14
277 0.08
278 0.07
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.09
284 0.1
285 0.12
286 0.13
287 0.17
288 0.19
289 0.27
290 0.36
291 0.42
292 0.49
293 0.57
294 0.62
295 0.61
296 0.62
297 0.62
298 0.59
299 0.51
300 0.45
301 0.42
302 0.36
303 0.38
304 0.38
305 0.3
306 0.27
307 0.27
308 0.26
309 0.26
310 0.27
311 0.24
312 0.24
313 0.24
314 0.23
315 0.24
316 0.22
317 0.21
318 0.19
319 0.18
320 0.2
321 0.19
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.1
326 0.14
327 0.14
328 0.1
329 0.11
330 0.12
331 0.16
332 0.17
333 0.16
334 0.18
335 0.19
336 0.2
337 0.24
338 0.27
339 0.28
340 0.35
341 0.44
342 0.45
343 0.45
344 0.46
345 0.44
346 0.45
347 0.42
348 0.36
349 0.3
350 0.26
351 0.24
352 0.22
353 0.24
354 0.2
355 0.18
356 0.15
357 0.14
358 0.12
359 0.13
360 0.12
361 0.09
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.08
377 0.08
378 0.1
379 0.11
380 0.12
381 0.14
382 0.15
383 0.15
384 0.17
385 0.19
386 0.18
387 0.19
388 0.18
389 0.16
390 0.16
391 0.16
392 0.16
393 0.18
394 0.18
395 0.18
396 0.18
397 0.18
398 0.2
399 0.21
400 0.18
401 0.14
402 0.15
403 0.14
404 0.16
405 0.23
406 0.21
407 0.21
408 0.19
409 0.21
410 0.2
411 0.26
412 0.26
413 0.27
414 0.35
415 0.4
416 0.49
417 0.56
418 0.59
419 0.59
420 0.62
421 0.65
422 0.63
423 0.62
424 0.6
425 0.56
426 0.55
427 0.54
428 0.53
429 0.53
430 0.47
431 0.46
432 0.42
433 0.41
434 0.42
435 0.47
436 0.48
437 0.43
438 0.46
439 0.45
440 0.47
441 0.52
442 0.57
443 0.58
444 0.62
445 0.68
446 0.74
447 0.8
448 0.82
449 0.84
450 0.85
451 0.86
452 0.86
453 0.87
454 0.88
455 0.87
456 0.9
457 0.86
458 0.79
459 0.77
460 0.72
461 0.71
462 0.68
463 0.65
464 0.57
465 0.54
466 0.5
467 0.43
468 0.41
469 0.31
470 0.24
471 0.2
472 0.2
473 0.16
474 0.15
475 0.14
476 0.15
477 0.16
478 0.19
479 0.22
480 0.22
481 0.23
482 0.27
483 0.27
484 0.24
485 0.27
486 0.3
487 0.31
488 0.36
489 0.37
490 0.36
491 0.35
492 0.33
493 0.29
494 0.25
495 0.25
496 0.2
497 0.26
498 0.24
499 0.26
500 0.3
501 0.29
502 0.28
503 0.26
504 0.25
505 0.2
506 0.21
507 0.2
508 0.17
509 0.18
510 0.17
511 0.16
512 0.2
513 0.25
514 0.28
515 0.29
516 0.32
517 0.34
518 0.36
519 0.39
520 0.42
521 0.38
522 0.4
523 0.41
524 0.39
525 0.38
526 0.36
527 0.31