Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LX50

Protein Details
Accession A0A5C3LX50    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-36KDDKTFGMKNKNKSAKVKQEVARHydrophilic
243-262ESFAKWKKTRMDKKTAEQEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-67KEKEKALREKEKLAE
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 6, pero 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032378  ZC3H15/TMA46_C  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF16543  DFRP_C  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPPKAKQASGSKVKDDKTFGMKNKNKSAKVKQEVARIQAQTALSGKSRAVLEKEKEKALREKEKLAEEKRLKEEAALLKPVQTQKVPFGVDPKTVLCAFYKAGHCEKGTKCKFSHDMNVGRKVEKKNLYEDNREEKLADTMDTWDDEKLQKVVMSKAGNPRTTTDIVCRHFIQAIESQKFGWFWECPNGENCQYRHALPPGFMLKSQRKAAEDAAKSNVISLEEFLEVERHKLGTNLTPVTPESFAKWKKTRMDKKTAEQEAMRKAKESHSAAGKSNGMSGRDLFQYNPEWFEDEEEGDASDDWDLTQYRRQKEEEDAAAEELRIADLALTEGYREGEEAGTSEGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.6
3 0.55
4 0.54
5 0.58
6 0.56
7 0.6
8 0.64
9 0.67
10 0.73
11 0.77
12 0.76
13 0.77
14 0.81
15 0.8
16 0.82
17 0.82
18 0.77
19 0.78
20 0.75
21 0.7
22 0.67
23 0.57
24 0.49
25 0.44
26 0.39
27 0.31
28 0.28
29 0.25
30 0.19
31 0.2
32 0.19
33 0.18
34 0.2
35 0.2
36 0.24
37 0.29
38 0.34
39 0.41
40 0.45
41 0.48
42 0.49
43 0.51
44 0.54
45 0.56
46 0.6
47 0.56
48 0.59
49 0.58
50 0.63
51 0.67
52 0.62
53 0.64
54 0.59
55 0.63
56 0.61
57 0.58
58 0.5
59 0.42
60 0.45
61 0.42
62 0.4
63 0.36
64 0.31
65 0.31
66 0.35
67 0.37
68 0.33
69 0.28
70 0.25
71 0.25
72 0.3
73 0.3
74 0.26
75 0.28
76 0.27
77 0.27
78 0.27
79 0.24
80 0.22
81 0.2
82 0.21
83 0.16
84 0.16
85 0.15
86 0.19
87 0.22
88 0.23
89 0.26
90 0.28
91 0.28
92 0.34
93 0.36
94 0.42
95 0.43
96 0.44
97 0.42
98 0.45
99 0.5
100 0.46
101 0.5
102 0.47
103 0.52
104 0.53
105 0.61
106 0.55
107 0.52
108 0.54
109 0.49
110 0.49
111 0.47
112 0.43
113 0.42
114 0.49
115 0.53
116 0.53
117 0.55
118 0.55
119 0.49
120 0.47
121 0.41
122 0.32
123 0.29
124 0.23
125 0.18
126 0.11
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.12
140 0.16
141 0.17
142 0.19
143 0.28
144 0.32
145 0.33
146 0.32
147 0.32
148 0.32
149 0.32
150 0.29
151 0.26
152 0.28
153 0.28
154 0.29
155 0.28
156 0.24
157 0.24
158 0.23
159 0.2
160 0.19
161 0.23
162 0.22
163 0.21
164 0.21
165 0.2
166 0.2
167 0.18
168 0.15
169 0.09
170 0.09
171 0.16
172 0.16
173 0.17
174 0.18
175 0.21
176 0.23
177 0.27
178 0.26
179 0.23
180 0.23
181 0.24
182 0.26
183 0.26
184 0.24
185 0.19
186 0.23
187 0.22
188 0.22
189 0.22
190 0.24
191 0.26
192 0.31
193 0.33
194 0.32
195 0.3
196 0.31
197 0.36
198 0.38
199 0.34
200 0.31
201 0.31
202 0.29
203 0.28
204 0.26
205 0.22
206 0.14
207 0.12
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.12
221 0.14
222 0.19
223 0.19
224 0.19
225 0.2
226 0.2
227 0.21
228 0.21
229 0.17
230 0.15
231 0.22
232 0.25
233 0.33
234 0.37
235 0.42
236 0.49
237 0.6
238 0.67
239 0.67
240 0.75
241 0.73
242 0.77
243 0.81
244 0.76
245 0.69
246 0.62
247 0.59
248 0.58
249 0.57
250 0.48
251 0.4
252 0.38
253 0.39
254 0.44
255 0.42
256 0.37
257 0.39
258 0.41
259 0.41
260 0.44
261 0.41
262 0.33
263 0.34
264 0.32
265 0.25
266 0.23
267 0.23
268 0.21
269 0.22
270 0.22
271 0.18
272 0.19
273 0.23
274 0.23
275 0.24
276 0.22
277 0.21
278 0.21
279 0.24
280 0.22
281 0.17
282 0.17
283 0.15
284 0.15
285 0.13
286 0.13
287 0.1
288 0.08
289 0.07
290 0.06
291 0.08
292 0.09
293 0.11
294 0.18
295 0.25
296 0.3
297 0.35
298 0.38
299 0.39
300 0.46
301 0.52
302 0.5
303 0.46
304 0.43
305 0.4
306 0.38
307 0.34
308 0.27
309 0.19
310 0.14
311 0.1
312 0.08
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.07
317 0.06
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.1