Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5C3MBK1

Protein Details
Accession A0A5C3MBK1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-236SDRSRSRSKSGSRSKSRNKGRGGSGSRSKSRSRSGSRRSRSGTHydrophilic
254-275FLSRSRSRSRSDSRFRSHSRSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
196-244RSRSRSKSGSRSKSRNKGRGGSGSRSKSRSRSGSRRSRSGTRSPTRSRS
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 14.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANTTVTGAQAIHGQNPQFLVETVIRNRIYESTYWKEHCFALTAESLIDKAIEVKFIGGVYGNQRPTEFLCLLLKLLQIQPEKEILVEYLRAEEFKYLRALAAFYIRMTFRAVDVYELLEPLLKDYRKLRERNMAGYSLTYFDEFIYALLTEERVCDIILPRLAKRQTLEENGDIGPRKSRLLDAMEGKSEDGSDRSRSRSKSGSRSKSRNKGRGGSGSRSKSRSRSGSRRSRSGTRSPTRSRSRTTSNPDLRFLSRSRSRSRSDSRFRSHSRSISPDRMDIDASS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.22
4 0.23
5 0.18
6 0.17
7 0.18
8 0.18
9 0.23
10 0.25
11 0.31
12 0.31
13 0.3
14 0.31
15 0.29
16 0.28
17 0.26
18 0.31
19 0.3
20 0.36
21 0.39
22 0.39
23 0.39
24 0.38
25 0.35
26 0.3
27 0.24
28 0.2
29 0.18
30 0.17
31 0.15
32 0.14
33 0.13
34 0.11
35 0.1
36 0.06
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.1
45 0.07
46 0.09
47 0.12
48 0.18
49 0.19
50 0.19
51 0.19
52 0.21
53 0.22
54 0.26
55 0.22
56 0.18
57 0.19
58 0.19
59 0.19
60 0.19
61 0.17
62 0.14
63 0.15
64 0.19
65 0.19
66 0.19
67 0.2
68 0.2
69 0.2
70 0.18
71 0.16
72 0.11
73 0.1
74 0.11
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.12
81 0.12
82 0.12
83 0.14
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.1
89 0.12
90 0.11
91 0.09
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.09
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.12
110 0.11
111 0.13
112 0.17
113 0.26
114 0.32
115 0.35
116 0.38
117 0.43
118 0.45
119 0.48
120 0.47
121 0.39
122 0.32
123 0.3
124 0.26
125 0.18
126 0.16
127 0.11
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.04
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.05
144 0.06
145 0.09
146 0.11
147 0.13
148 0.13
149 0.19
150 0.2
151 0.21
152 0.21
153 0.24
154 0.26
155 0.29
156 0.32
157 0.26
158 0.28
159 0.26
160 0.28
161 0.23
162 0.19
163 0.17
164 0.15
165 0.15
166 0.13
167 0.14
168 0.15
169 0.18
170 0.22
171 0.24
172 0.25
173 0.25
174 0.25
175 0.24
176 0.21
177 0.17
178 0.13
179 0.1
180 0.11
181 0.15
182 0.17
183 0.22
184 0.28
185 0.3
186 0.34
187 0.4
188 0.45
189 0.5
190 0.59
191 0.64
192 0.68
193 0.76
194 0.82
195 0.84
196 0.87
197 0.85
198 0.81
199 0.77
200 0.73
201 0.73
202 0.69
203 0.67
204 0.66
205 0.65
206 0.64
207 0.62
208 0.6
209 0.56
210 0.58
211 0.59
212 0.6
213 0.63
214 0.68
215 0.74
216 0.77
217 0.8
218 0.79
219 0.78
220 0.75
221 0.74
222 0.75
223 0.73
224 0.75
225 0.74
226 0.78
227 0.79
228 0.78
229 0.75
230 0.72
231 0.71
232 0.71
233 0.72
234 0.73
235 0.73
236 0.71
237 0.69
238 0.66
239 0.59
240 0.54
241 0.47
242 0.46
243 0.44
244 0.47
245 0.52
246 0.54
247 0.58
248 0.63
249 0.71
250 0.72
251 0.74
252 0.78
253 0.78
254 0.8
255 0.81
256 0.8
257 0.78
258 0.75
259 0.71
260 0.71
261 0.7
262 0.7
263 0.67
264 0.63
265 0.57
266 0.52