Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3MEL9

Protein Details
Accession A0A5C3MEL9    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-133IAKPSDQKDKERKEKKAKRRPGRRGSKAVPGEBasic
153-179GTDEAAKPKKKKKKSTRKAKAKAAEGEBasic
199-223GSATAKKPRTRKPKAPRPPRPAGEDBasic
258-279VTSARIVRRRWGQPRKSKGYGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-128KDKERKEKKAKRRPGRRGSK
158-175AKPKKKKKKSTRKAKAKA
203-219AKKPRTRKPKAPRPPRP
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 13.333, nucl 10, mito_nucl 6.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAQAAPVTENGVPPTTQDTVEEAPGFKVFVGNLAYSTTDEGLKAFFEPVQSDILSVQVILRGTRSAGYGFVALASAEAVQKAVDALDKKELEGRQVIVEIAKPSDQKDKERKEKKAKRRPGRRGSKAVPGEVSEAEANGEVPKTEGEAVSGTDEAAKPKKKKKKSTRKAKAKAAEGEASEGVTPAPVTEGEAGAVDGSATAKKPRTRKPKAPRPPRPAGEDPAGEPSTTMLFVANLGFNIDDAGLAALFTDAEIHVTSARIVRRRWGQPRKSKGYGFVDVGSEEEQKKAIEALQGKEVGGRAIAVKVAVNTPHDESGDEAKPADATASAPAAADAPAAVPAAAPAASAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.2
4 0.19
5 0.19
6 0.18
7 0.21
8 0.21
9 0.25
10 0.25
11 0.21
12 0.2
13 0.2
14 0.19
15 0.14
16 0.14
17 0.1
18 0.12
19 0.14
20 0.13
21 0.13
22 0.14
23 0.15
24 0.14
25 0.16
26 0.13
27 0.11
28 0.11
29 0.11
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.1
36 0.11
37 0.13
38 0.15
39 0.14
40 0.13
41 0.12
42 0.12
43 0.11
44 0.1
45 0.09
46 0.08
47 0.09
48 0.08
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.11
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.08
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.08
73 0.09
74 0.11
75 0.18
76 0.18
77 0.19
78 0.24
79 0.24
80 0.24
81 0.24
82 0.24
83 0.18
84 0.18
85 0.18
86 0.13
87 0.15
88 0.13
89 0.12
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.23
94 0.26
95 0.32
96 0.42
97 0.51
98 0.59
99 0.68
100 0.76
101 0.78
102 0.86
103 0.88
104 0.89
105 0.9
106 0.9
107 0.92
108 0.93
109 0.93
110 0.93
111 0.91
112 0.89
113 0.82
114 0.81
115 0.72
116 0.63
117 0.53
118 0.43
119 0.36
120 0.27
121 0.24
122 0.15
123 0.12
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.06
128 0.06
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.14
145 0.2
146 0.25
147 0.34
148 0.44
149 0.53
150 0.64
151 0.73
152 0.79
153 0.83
154 0.89
155 0.91
156 0.93
157 0.93
158 0.91
159 0.86
160 0.8
161 0.73
162 0.65
163 0.56
164 0.45
165 0.37
166 0.28
167 0.22
168 0.15
169 0.11
170 0.08
171 0.05
172 0.05
173 0.03
174 0.04
175 0.03
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.07
190 0.12
191 0.17
192 0.25
193 0.34
194 0.45
195 0.54
196 0.64
197 0.73
198 0.8
199 0.86
200 0.9
201 0.91
202 0.89
203 0.89
204 0.82
205 0.79
206 0.72
207 0.66
208 0.59
209 0.49
210 0.41
211 0.37
212 0.34
213 0.25
214 0.21
215 0.17
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.11
248 0.15
249 0.19
250 0.2
251 0.26
252 0.35
253 0.44
254 0.54
255 0.61
256 0.67
257 0.73
258 0.83
259 0.85
260 0.83
261 0.75
262 0.73
263 0.69
264 0.64
265 0.55
266 0.46
267 0.38
268 0.32
269 0.31
270 0.24
271 0.21
272 0.17
273 0.15
274 0.14
275 0.13
276 0.14
277 0.13
278 0.13
279 0.16
280 0.2
281 0.22
282 0.26
283 0.26
284 0.26
285 0.27
286 0.25
287 0.19
288 0.15
289 0.13
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.12
297 0.14
298 0.15
299 0.17
300 0.2
301 0.22
302 0.21
303 0.2
304 0.21
305 0.25
306 0.25
307 0.23
308 0.2
309 0.19
310 0.18
311 0.18
312 0.16
313 0.1
314 0.08
315 0.1
316 0.11
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.06
330 0.07
331 0.07