Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3M3D1

Protein Details
Accession A0A5C3M3D1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
370-392LTSMVVKKKKKAPEDSNAGKRKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
376-383KKKKKAPE
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.833, cyto 9, mito_nucl 8.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MASSPSSATPAPITATEVTVESSVEQAKRAFALKKYEQAVDHYATALELVTQQYGDSAPETADLYFSYGKALLENAVTQSSVLGKEQQADEGQEEDSRASGSGPGFAGPILSFSGDIEDEGDDRAVDLFAQDDQEDEQESDNEAGDDAEPEDDFNAAWEVLDLARAIYDKQAQETDDEEVKLKLADTYIALGDVSLETEKFDQAITDYEEGLKLKVDLLPTSSRQIAEAHYKLSMVLDLTSGRLSDAIVHAEKALESVERRLAELRDGLSGQLPSAPVEAKSDAKGKGKASLTRLVRDDLVQNMSKSQIENEVKELTGLREDLALKVEELKTTPNKSLEVSAPALAAQALDQELNGGSSSGTAPTVINDLTSMVVKKKKKAPEDSNAGKRKAETDADETNTEKKARLDTPES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.17
4 0.16
5 0.16
6 0.14
7 0.14
8 0.1
9 0.12
10 0.15
11 0.15
12 0.17
13 0.16
14 0.18
15 0.2
16 0.24
17 0.27
18 0.27
19 0.36
20 0.39
21 0.46
22 0.48
23 0.5
24 0.46
25 0.47
26 0.47
27 0.4
28 0.36
29 0.29
30 0.25
31 0.21
32 0.2
33 0.14
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.1
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.13
71 0.13
72 0.16
73 0.17
74 0.19
75 0.18
76 0.19
77 0.19
78 0.16
79 0.16
80 0.13
81 0.13
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.07
87 0.1
88 0.09
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.07
96 0.08
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.04
116 0.05
117 0.06
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.1
156 0.1
157 0.12
158 0.13
159 0.13
160 0.14
161 0.15
162 0.16
163 0.14
164 0.14
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.1
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.05
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.07
205 0.1
206 0.12
207 0.13
208 0.15
209 0.16
210 0.14
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.19
215 0.19
216 0.17
217 0.17
218 0.17
219 0.16
220 0.15
221 0.13
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.06
243 0.07
244 0.09
245 0.12
246 0.12
247 0.13
248 0.15
249 0.15
250 0.16
251 0.17
252 0.16
253 0.14
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.15
269 0.19
270 0.21
271 0.25
272 0.29
273 0.27
274 0.33
275 0.36
276 0.38
277 0.38
278 0.42
279 0.41
280 0.41
281 0.42
282 0.37
283 0.33
284 0.3
285 0.28
286 0.23
287 0.25
288 0.22
289 0.21
290 0.2
291 0.21
292 0.2
293 0.19
294 0.16
295 0.22
296 0.23
297 0.24
298 0.26
299 0.26
300 0.25
301 0.25
302 0.25
303 0.16
304 0.15
305 0.14
306 0.11
307 0.13
308 0.14
309 0.14
310 0.15
311 0.14
312 0.12
313 0.16
314 0.17
315 0.15
316 0.15
317 0.2
318 0.24
319 0.27
320 0.32
321 0.29
322 0.3
323 0.31
324 0.34
325 0.31
326 0.29
327 0.28
328 0.24
329 0.21
330 0.2
331 0.19
332 0.15
333 0.12
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.05
345 0.06
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.11
353 0.1
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.12
359 0.13
360 0.17
361 0.25
362 0.29
363 0.37
364 0.45
365 0.53
366 0.6
367 0.69
368 0.73
369 0.76
370 0.81
371 0.84
372 0.86
373 0.85
374 0.78
375 0.69
376 0.61
377 0.53
378 0.49
379 0.44
380 0.39
381 0.37
382 0.41
383 0.43
384 0.44
385 0.43
386 0.41
387 0.4
388 0.36
389 0.32
390 0.28
391 0.32
392 0.34