Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3M8U3

Protein Details
Accession A0A5C3M8U3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-279GKTKNAPKARAKKEEKVFLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-61PAKEAAPAPPAPARGSQKPRGGPAARGGKYYARGGK
86-109EGGGRGRGRGARGGAGAPRGGRRP
263-276KNAPKARAKKEEKV
282-323ARFERPDRGGGRGRGRGGDRGGDRGDRGRGGRGGRGGARGGR
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 12, nucl 10, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MSVATKNPFALLDDDASRPSSPPPAPAKEAAPAPPAPARGSQKPRGGPAARGGKYYARGGKSAPKDASQNLNAEEPVVDGQQRKFEGGGRGRGRGARGGAGAPRGGRRPFDRHSQTGKTDSDKKIHQSWGGDDGNQELQAEQAANVDAGAEAAGDAAPAANEWATGEATSADAWAAPAGEAATAPDADKTEREGRPRREREPEEEDNTLTLEQYLAQQKDKESVVPKLETRKANEGADANIWKDVVPLSKNEEEDAYFVGKTKNAPKARAKKEEKVFLEIDARFERPDRGGGRGRGRGGDRGGDRGDRGRGGRGGRGGARGGRQNGPTPAVNVDDQTAFPSLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.23
4 0.21
5 0.2
6 0.2
7 0.24
8 0.22
9 0.29
10 0.36
11 0.4
12 0.44
13 0.46
14 0.46
15 0.43
16 0.45
17 0.4
18 0.36
19 0.31
20 0.3
21 0.3
22 0.3
23 0.27
24 0.31
25 0.35
26 0.4
27 0.48
28 0.53
29 0.57
30 0.59
31 0.61
32 0.63
33 0.59
34 0.53
35 0.54
36 0.56
37 0.49
38 0.47
39 0.45
40 0.4
41 0.41
42 0.44
43 0.41
44 0.33
45 0.33
46 0.34
47 0.41
48 0.42
49 0.47
50 0.42
51 0.38
52 0.4
53 0.42
54 0.48
55 0.42
56 0.39
57 0.33
58 0.32
59 0.29
60 0.26
61 0.22
62 0.15
63 0.13
64 0.11
65 0.11
66 0.13
67 0.14
68 0.19
69 0.19
70 0.19
71 0.19
72 0.22
73 0.29
74 0.31
75 0.4
76 0.37
77 0.39
78 0.4
79 0.41
80 0.38
81 0.33
82 0.29
83 0.21
84 0.2
85 0.19
86 0.19
87 0.18
88 0.18
89 0.16
90 0.17
91 0.2
92 0.2
93 0.22
94 0.25
95 0.31
96 0.33
97 0.42
98 0.46
99 0.48
100 0.54
101 0.55
102 0.54
103 0.52
104 0.51
105 0.46
106 0.48
107 0.45
108 0.42
109 0.4
110 0.41
111 0.41
112 0.42
113 0.39
114 0.32
115 0.31
116 0.34
117 0.32
118 0.28
119 0.22
120 0.21
121 0.19
122 0.18
123 0.16
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.02
145 0.02
146 0.02
147 0.02
148 0.02
149 0.02
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.1
177 0.17
178 0.19
179 0.27
180 0.35
181 0.44
182 0.54
183 0.6
184 0.61
185 0.64
186 0.65
187 0.65
188 0.65
189 0.62
190 0.55
191 0.51
192 0.45
193 0.36
194 0.33
195 0.25
196 0.17
197 0.11
198 0.06
199 0.05
200 0.09
201 0.14
202 0.15
203 0.16
204 0.18
205 0.18
206 0.22
207 0.22
208 0.22
209 0.2
210 0.24
211 0.26
212 0.27
213 0.29
214 0.33
215 0.39
216 0.39
217 0.41
218 0.43
219 0.43
220 0.41
221 0.41
222 0.34
223 0.29
224 0.29
225 0.26
226 0.19
227 0.16
228 0.15
229 0.12
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.13
235 0.18
236 0.22
237 0.22
238 0.23
239 0.23
240 0.2
241 0.19
242 0.2
243 0.15
244 0.11
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.16
249 0.22
250 0.3
251 0.33
252 0.4
253 0.49
254 0.59
255 0.67
256 0.74
257 0.75
258 0.75
259 0.79
260 0.81
261 0.74
262 0.69
263 0.6
264 0.52
265 0.51
266 0.42
267 0.39
268 0.32
269 0.29
270 0.25
271 0.25
272 0.26
273 0.2
274 0.27
275 0.24
276 0.28
277 0.35
278 0.41
279 0.48
280 0.51
281 0.51
282 0.5
283 0.5
284 0.49
285 0.44
286 0.44
287 0.38
288 0.37
289 0.38
290 0.34
291 0.34
292 0.33
293 0.34
294 0.31
295 0.31
296 0.31
297 0.33
298 0.34
299 0.37
300 0.35
301 0.37
302 0.36
303 0.37
304 0.35
305 0.34
306 0.37
307 0.39
308 0.4
309 0.41
310 0.41
311 0.44
312 0.44
313 0.45
314 0.41
315 0.36
316 0.34
317 0.31
318 0.29
319 0.24
320 0.23
321 0.2
322 0.19
323 0.19