Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3M9K4

Protein Details
Accession A0A5C3M9K4    Localization Confidence Low Confidence Score 7.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-256SKSNLKPVKSSHRRSRRTQVQKRDWAHVIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 11.5cyto_nucl 11.5, nucl 10.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MDVEKQTKLIQQIVHPRREDASALLKDLHLAGIPSREQIHQELEERLLLPRQTLPSNWLPHYQVHWEQPLSVSSLLTFEPSPPPTHLSFIRAGIDGRVTGYVESPNPRISTGLTSSSLDRAPAPSKSFVRGKSGHVPFWPGGLEDATTSALSSEAEQRISKGLRTVPPGFRRGLRLLGDLAEDDEILDLDEDEKDIGKQTDDNMVSVQDEPDVSLNQATGIDALLPTSKSNLKPVKSSHRRSRRTQVQKRDWAHVIDVNTPLVNFHELVPAMAHKYPFELDTFQKQAVYHLEMGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAEKHMTRAIYTSPIKALSNQKFRDFKQTFSASSVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYKGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDAERGVVWEEVIIMLPDHVNIILLSATVPNTKEFADWVGRTKKKDIYVISTPQRPVPLEHHLYAGRELYKIVDANRNFLGQGYKAAGEALRRKQDKEREAAGMPPVQRVGARGTAPQRGQQRSGTPARGGPLAIRGRGGAPVRTIHTAADKNLYVHLLGHLRKKGLLPVVVFTFSKKRCEENAGTLTNQDLCTSVEKSEVHVAIEKALSRLKGSDKKLPQIARMRDLLSRGIGIHHGGLLPLVKELVEILFARGLVKILFATETFAMGVNMPAKCVVFSSIRKHDGRNFRDILPGEYTQMAGRAGRRGLDPTGTVIIVANDTLPEQTTLHHMMLGTPGKLSSQFRLTYNMILNLLRVEALRVEEMIKRSFSENASQRLLPDQQKKVVDSEKALSSLQKLSCEACTPVIETLYDDSLAVVDMNQRMLEMAASHPQGAKLLNPGRIVVLRDGHFRSNNVGILLKQAPVHALDSGLLDKVKTYYVLALVDPDTKSNRRDIDPQAVPPLWPPKPESLLVEDGVYDVRAVPLTSITLVTSRTIKVEVDNIVDRHLISRMREGVAALQALVTEWSSQGSIPEVDWSRMRSLEFQDVLRSRNAMEKRLENKGCLLCPDFNEHYSIIHGEKVLRSNIASLKLAISDQNLELIPDYEQRVEVLKEMKFIDENSTVLLKGRVACEINSANELVLTELILENTLSSYDPEEVVALLSCFVFQEKTDVEPVIPPKLEAGRDAILAISDRVGRIQDSHKVAVEDFRTTLKFGLVEVVYEWAKGMPFEQITALTDVAEGTIVRVITRLDETCREVRDAARVIGDAELFKKMEEAQIKIKRDIVFAASLYF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.55
3 0.53
4 0.5
5 0.49
6 0.43
7 0.37
8 0.38
9 0.32
10 0.32
11 0.31
12 0.29
13 0.27
14 0.26
15 0.22
16 0.13
17 0.12
18 0.12
19 0.15
20 0.16
21 0.18
22 0.2
23 0.21
24 0.23
25 0.25
26 0.29
27 0.28
28 0.31
29 0.31
30 0.3
31 0.31
32 0.29
33 0.28
34 0.27
35 0.23
36 0.22
37 0.24
38 0.27
39 0.28
40 0.28
41 0.32
42 0.36
43 0.42
44 0.43
45 0.43
46 0.41
47 0.41
48 0.44
49 0.46
50 0.43
51 0.43
52 0.46
53 0.41
54 0.4
55 0.38
56 0.36
57 0.31
58 0.26
59 0.2
60 0.14
61 0.15
62 0.14
63 0.15
64 0.13
65 0.12
66 0.18
67 0.2
68 0.23
69 0.24
70 0.28
71 0.28
72 0.32
73 0.32
74 0.3
75 0.31
76 0.31
77 0.31
78 0.28
79 0.27
80 0.23
81 0.23
82 0.18
83 0.16
84 0.15
85 0.13
86 0.12
87 0.13
88 0.15
89 0.17
90 0.21
91 0.23
92 0.26
93 0.26
94 0.26
95 0.25
96 0.24
97 0.26
98 0.25
99 0.27
100 0.25
101 0.26
102 0.27
103 0.29
104 0.27
105 0.22
106 0.2
107 0.2
108 0.22
109 0.25
110 0.28
111 0.32
112 0.34
113 0.4
114 0.45
115 0.43
116 0.47
117 0.45
118 0.48
119 0.51
120 0.54
121 0.51
122 0.46
123 0.49
124 0.41
125 0.4
126 0.34
127 0.24
128 0.21
129 0.17
130 0.16
131 0.11
132 0.12
133 0.11
134 0.1
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.15
141 0.15
142 0.18
143 0.19
144 0.2
145 0.25
146 0.27
147 0.26
148 0.24
149 0.28
150 0.31
151 0.38
152 0.44
153 0.47
154 0.53
155 0.55
156 0.53
157 0.5
158 0.51
159 0.47
160 0.46
161 0.4
162 0.35
163 0.33
164 0.31
165 0.29
166 0.23
167 0.2
168 0.14
169 0.11
170 0.09
171 0.08
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.1
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.14
187 0.22
188 0.22
189 0.23
190 0.2
191 0.2
192 0.2
193 0.19
194 0.18
195 0.1
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.06
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.11
215 0.16
216 0.16
217 0.26
218 0.32
219 0.33
220 0.39
221 0.46
222 0.54
223 0.6
224 0.69
225 0.7
226 0.74
227 0.79
228 0.81
229 0.85
230 0.85
231 0.86
232 0.86
233 0.86
234 0.86
235 0.89
236 0.85
237 0.8
238 0.73
239 0.63
240 0.56
241 0.49
242 0.4
243 0.34
244 0.31
245 0.25
246 0.22
247 0.19
248 0.16
249 0.14
250 0.13
251 0.11
252 0.1
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.14
257 0.14
258 0.15
259 0.16
260 0.16
261 0.12
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.15
266 0.16
267 0.17
268 0.24
269 0.26
270 0.25
271 0.26
272 0.25
273 0.26
274 0.27
275 0.27
276 0.21
277 0.19
278 0.19
279 0.17
280 0.17
281 0.14
282 0.1
283 0.06
284 0.05
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.05
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.13
312 0.14
313 0.18
314 0.2
315 0.21
316 0.21
317 0.22
318 0.23
319 0.26
320 0.34
321 0.36
322 0.44
323 0.45
324 0.51
325 0.54
326 0.55
327 0.61
328 0.53
329 0.47
330 0.46
331 0.46
332 0.4
333 0.38
334 0.38
335 0.26
336 0.25
337 0.23
338 0.14
339 0.1
340 0.09
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.09
349 0.08
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.12
365 0.11
366 0.1
367 0.11
368 0.13
369 0.14
370 0.14
371 0.15
372 0.12
373 0.13
374 0.13
375 0.11
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.07
380 0.06
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.07
387 0.09
388 0.1
389 0.07
390 0.07
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.08
395 0.06
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.05
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.05
413 0.06
414 0.07
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.11
422 0.15
423 0.15
424 0.21
425 0.3
426 0.33
427 0.35
428 0.39
429 0.4
430 0.39
431 0.44
432 0.4
433 0.38
434 0.41
435 0.46
436 0.47
437 0.47
438 0.44
439 0.4
440 0.4
441 0.33
442 0.3
443 0.27
444 0.29
445 0.29
446 0.29
447 0.3
448 0.28
449 0.29
450 0.27
451 0.24
452 0.18
453 0.14
454 0.13
455 0.11
456 0.12
457 0.12
458 0.13
459 0.19
460 0.18
461 0.21
462 0.22
463 0.21
464 0.19
465 0.19
466 0.18
467 0.11
468 0.13
469 0.11
470 0.1
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.12
475 0.18
476 0.22
477 0.29
478 0.3
479 0.33
480 0.4
481 0.48
482 0.49
483 0.48
484 0.45
485 0.41
486 0.41
487 0.4
488 0.35
489 0.3
490 0.25
491 0.21
492 0.18
493 0.14
494 0.13
495 0.13
496 0.13
497 0.13
498 0.13
499 0.16
500 0.19
501 0.24
502 0.25
503 0.28
504 0.33
505 0.32
506 0.34
507 0.33
508 0.33
509 0.34
510 0.38
511 0.35
512 0.29
513 0.27
514 0.26
515 0.24
516 0.21
517 0.15
518 0.18
519 0.18
520 0.17
521 0.16
522 0.15
523 0.15
524 0.19
525 0.19
526 0.13
527 0.12
528 0.14
529 0.15
530 0.16
531 0.16
532 0.13
533 0.17
534 0.17
535 0.16
536 0.18
537 0.16
538 0.15
539 0.16
540 0.16
541 0.11
542 0.1
543 0.11
544 0.13
545 0.15
546 0.19
547 0.2
548 0.2
549 0.21
550 0.21
551 0.22
552 0.2
553 0.21
554 0.17
555 0.17
556 0.17
557 0.18
558 0.17
559 0.15
560 0.2
561 0.18
562 0.23
563 0.23
564 0.24
565 0.25
566 0.32
567 0.33
568 0.33
569 0.38
570 0.34
571 0.33
572 0.3
573 0.28
574 0.23
575 0.21
576 0.13
577 0.08
578 0.08
579 0.1
580 0.11
581 0.1
582 0.12
583 0.12
584 0.13
585 0.16
586 0.15
587 0.14
588 0.15
589 0.15
590 0.13
591 0.13
592 0.12
593 0.1
594 0.11
595 0.1
596 0.08
597 0.1
598 0.15
599 0.22
600 0.25
601 0.32
602 0.34
603 0.38
604 0.43
605 0.42
606 0.43
607 0.44
608 0.44
609 0.38
610 0.38
611 0.35
612 0.31
613 0.31
614 0.25
615 0.17
616 0.14
617 0.11
618 0.1
619 0.09
620 0.08
621 0.07
622 0.06
623 0.06
624 0.05
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.04
629 0.04
630 0.04
631 0.03
632 0.04
633 0.03
634 0.04
635 0.04
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.06
640 0.06
641 0.06
642 0.05
643 0.05
644 0.04
645 0.04
646 0.05
647 0.04
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.07
656 0.08
657 0.08
658 0.08
659 0.08
660 0.08
661 0.08
662 0.08
663 0.1
664 0.11
665 0.15
666 0.21
667 0.27
668 0.33
669 0.34
670 0.36
671 0.41
672 0.47
673 0.47
674 0.47
675 0.44
676 0.39
677 0.43
678 0.41
679 0.36
680 0.3
681 0.27
682 0.21
683 0.18
684 0.18
685 0.13
686 0.13
687 0.11
688 0.08
689 0.09
690 0.1
691 0.1
692 0.11
693 0.12
694 0.13
695 0.13
696 0.14
697 0.13
698 0.12
699 0.12
700 0.11
701 0.1
702 0.08
703 0.08
704 0.07
705 0.06
706 0.05
707 0.04
708 0.04
709 0.04
710 0.04
711 0.05
712 0.05
713 0.06
714 0.09
715 0.12
716 0.12
717 0.12
718 0.12
719 0.11
720 0.16
721 0.17
722 0.13
723 0.11
724 0.11
725 0.11
726 0.13
727 0.14
728 0.12
729 0.15
730 0.17
731 0.18
732 0.23
733 0.24
734 0.25
735 0.25
736 0.24
737 0.2
738 0.18
739 0.18
740 0.13
741 0.12
742 0.08
743 0.07
744 0.06
745 0.05
746 0.06
747 0.06
748 0.06
749 0.08
750 0.1
751 0.13
752 0.14
753 0.14
754 0.14
755 0.15
756 0.17
757 0.17
758 0.22
759 0.25
760 0.28
761 0.3
762 0.3
763 0.29
764 0.3
765 0.34
766 0.33
767 0.36
768 0.35
769 0.38
770 0.39
771 0.4
772 0.4
773 0.39
774 0.34
775 0.28
776 0.28
777 0.24
778 0.24
779 0.23
780 0.2
781 0.18
782 0.21
783 0.2
784 0.18
785 0.17
786 0.17
787 0.18
788 0.19
789 0.18
790 0.14
791 0.13
792 0.13
793 0.13
794 0.12
795 0.11
796 0.1
797 0.1
798 0.09
799 0.09
800 0.08
801 0.07
802 0.06
803 0.06
804 0.05
805 0.04
806 0.06
807 0.07
808 0.07
809 0.07
810 0.07
811 0.07
812 0.07
813 0.07
814 0.05
815 0.06
816 0.1
817 0.11
818 0.11
819 0.12
820 0.12
821 0.13
822 0.12
823 0.12
824 0.16
825 0.19
826 0.23
827 0.23
828 0.23
829 0.24
830 0.25
831 0.26
832 0.2
833 0.2
834 0.18
835 0.22
836 0.24
837 0.26
838 0.26
839 0.25
840 0.26
841 0.24
842 0.24
843 0.2
844 0.19
845 0.15
846 0.19
847 0.19
848 0.17
849 0.15
850 0.14
851 0.13
852 0.14
853 0.14
854 0.1
855 0.09
856 0.08
857 0.09
858 0.09
859 0.1
860 0.08
861 0.07
862 0.07
863 0.08
864 0.08
865 0.08
866 0.08
867 0.08
868 0.1
869 0.11
870 0.1
871 0.11
872 0.12
873 0.14
874 0.14
875 0.15
876 0.18
877 0.19
878 0.21
879 0.24
880 0.27
881 0.27
882 0.34
883 0.37
884 0.43
885 0.43
886 0.44
887 0.44
888 0.41
889 0.37
890 0.35
891 0.37
892 0.29
893 0.28
894 0.29
895 0.28
896 0.31
897 0.32
898 0.31
899 0.28
900 0.29
901 0.27
902 0.24
903 0.19
904 0.16
905 0.15
906 0.13
907 0.08
908 0.05
909 0.05
910 0.05
911 0.06
912 0.05
913 0.06
914 0.06
915 0.07
916 0.07
917 0.07
918 0.08
919 0.09
920 0.1
921 0.12
922 0.11
923 0.12
924 0.13
925 0.13
926 0.13
927 0.16
928 0.17
929 0.19
930 0.22
931 0.21
932 0.22
933 0.22
934 0.2
935 0.18
936 0.19
937 0.18
938 0.15
939 0.21
940 0.22
941 0.23
942 0.23
943 0.22
944 0.21
945 0.21
946 0.19
947 0.13
948 0.1
949 0.09
950 0.09
951 0.09
952 0.07
953 0.05
954 0.05
955 0.06
956 0.06
957 0.06
958 0.07
959 0.08
960 0.09
961 0.08
962 0.14
963 0.15
964 0.17
965 0.19
966 0.21
967 0.21
968 0.22
969 0.23
970 0.21
971 0.24
972 0.29
973 0.3
974 0.28
975 0.34
976 0.34
977 0.35
978 0.32
979 0.29
980 0.22
981 0.28
982 0.3
983 0.28
984 0.3
985 0.37
986 0.41
987 0.5
988 0.51
989 0.44
990 0.49
991 0.47
992 0.44
993 0.39
994 0.38
995 0.3
996 0.31
997 0.37
998 0.33
999 0.29
1000 0.31
1001 0.27
1002 0.24
1003 0.23
1004 0.23
1005 0.16
1006 0.15
1007 0.15
1008 0.14
1009 0.17
1010 0.2
1011 0.2
1012 0.19
1013 0.19
1014 0.21
1015 0.24
1016 0.26
1017 0.24
1018 0.21
1019 0.2
1020 0.2
1021 0.2
1022 0.17
1023 0.15
1024 0.14
1025 0.13
1026 0.15
1027 0.14
1028 0.13
1029 0.13
1030 0.13
1031 0.12
1032 0.13
1033 0.15
1034 0.13
1035 0.14
1036 0.14
1037 0.16
1038 0.16
1039 0.18
1040 0.2
1041 0.19
1042 0.22
1043 0.22
1044 0.23
1045 0.22
1046 0.22
1047 0.25
1048 0.21
1049 0.21
1050 0.19
1051 0.2
1052 0.18
1053 0.18
1054 0.18
1055 0.14
1056 0.15
1057 0.16
1058 0.18
1059 0.19
1060 0.19
1061 0.23
1062 0.25
1063 0.25
1064 0.24
1065 0.23
1066 0.18
1067 0.17
1068 0.17
1069 0.12
1070 0.09
1071 0.07
1072 0.06
1073 0.06
1074 0.07
1075 0.07
1076 0.06
1077 0.06
1078 0.06
1079 0.07
1080 0.06
1081 0.07
1082 0.09
1083 0.1
1084 0.1
1085 0.1
1086 0.1
1087 0.1
1088 0.1
1089 0.1
1090 0.08
1091 0.07
1092 0.07
1093 0.06
1094 0.06
1095 0.07
1096 0.07
1097 0.07
1098 0.12
1099 0.13
1100 0.16
1101 0.18
1102 0.19
1103 0.18
1104 0.23
1105 0.26
1106 0.27
1107 0.26
1108 0.23
1109 0.25
1110 0.28
1111 0.29
1112 0.25
1113 0.27
1114 0.22
1115 0.22
1116 0.22
1117 0.18
1118 0.15
1119 0.15
1120 0.14
1121 0.11
1122 0.1
1123 0.1
1124 0.11
1125 0.12
1126 0.12
1127 0.15
1128 0.2
1129 0.26
1130 0.31
1131 0.33
1132 0.34
1133 0.35
1134 0.35
1135 0.37
1136 0.35
1137 0.29
1138 0.25
1139 0.26
1140 0.25
1141 0.24
1142 0.25
1143 0.2
1144 0.18
1145 0.15
1146 0.2
1147 0.17
1148 0.16
1149 0.16
1150 0.19
1151 0.17
1152 0.16
1153 0.16
1154 0.11
1155 0.12
1156 0.11
1157 0.11
1158 0.13
1159 0.14
1160 0.15
1161 0.15
1162 0.16
1163 0.18
1164 0.2
1165 0.19
1166 0.13
1167 0.13
1168 0.12
1169 0.1
1170 0.1
1171 0.07
1172 0.06
1173 0.08
1174 0.08
1175 0.08
1176 0.09
1177 0.09
1178 0.11
1179 0.16
1180 0.17
1181 0.19
1182 0.24
1183 0.3
1184 0.34
1185 0.36
1186 0.36
1187 0.35
1188 0.34
1189 0.38
1190 0.37
1191 0.33
1192 0.3
1193 0.28
1194 0.26
1195 0.25
1196 0.24
1197 0.18
1198 0.16
1199 0.17
1200 0.16
1201 0.15
1202 0.16
1203 0.15
1204 0.21
1205 0.24
1206 0.27
1207 0.34
1208 0.43
1209 0.48
1210 0.49
1211 0.54
1212 0.48
1213 0.45
1214 0.44
1215 0.37
1216 0.32