FuNGI

A0A5C3MD24

Protein Details

Accession

A0A5C3MD24

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
304-326	APKAAAPPKKKTKREPKSAAEIT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
232-320	RPPSPKPPPPKPRVVKPLPKRRSPPPPAPKPAAIAPPPAPKPTPTPKAAPAPAPTPKPPPSVPKAVPKSAPAAPKAAAPPKKKTKREPK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 12.333, nucl 11.5, cyto 10, cyto_mito 8.499, mito 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027093 EAF_fam IPR019194 Tscrpt_elong_fac_Eaf_N
Gene Ontology	GO:0032783 C:super elongation complex GO:0003746 F:translation elongation factor activity GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF09816 EAF

Amino Acid Sequences

MASNSNSWMPAQGRHAVTVGSSLTRALKARKSQGSAPPTKAKHDRDFYSFRYNFKPGTIDSSKPGTIQVRESGEHREVLVEQPSTNPGEVHVFRGKEQPSKSVDCLLIFDEETMTFTLEKLDSYMTLTHDRRAISTVPAPPPPSGTSKCINITATPLTLSLCIESAASSPAPTKGKGKGRDIDYEDQLERDLLDLAEEDAEGEVDDEVEILNPITYRQEEEEEEGEEIFIPRPPSPKPPPPKPRVVKPLPKRRSPPPPAPKPAAIAPPPAPKPTPTPKAAPAPAPTPKPPPSVPKAVPKSAPAAPKAAAPPKKKTKREPKSAAEITYADEEELSFGRPAVATRVSPMPVTAPVSSGLALPGADSFAPLPGAMSSTSRAPPPPPISVPVLSDSEEEDQWEAVPMEEEDVHSIAGDIFGDDEPQDIDINELEAELNNELLDGDSDEDFLAAAVEEVPESPRLTNEPMSLNRLVGGSMDSDDDFSSSDDSDDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.33
3	0.28
4	0.26
5	0.24
6	0.21
7	0.15
8	0.13
9	0.13
10	0.15
11	0.18
12	0.22
13	0.25
14	0.32
15	0.39
16	0.48
17	0.54
18	0.57
19	0.61
20	0.67
21	0.71
22	0.7
23	0.69
24	0.69
25	0.64
26	0.67
27	0.69
28	0.68
29	0.68
30	0.68
31	0.66
32	0.64
33	0.68
34	0.65
35	0.67
36	0.61
37	0.56
38	0.54
39	0.53
40	0.46
41	0.42
42	0.4
43	0.3
44	0.37
45	0.37
46	0.33
47	0.33
48	0.37
49	0.36
50	0.32
51	0.36
52	0.32
53	0.3
54	0.31
55	0.33
56	0.32
57	0.32
58	0.34
59	0.35
60	0.32
61	0.31
62	0.27
63	0.23
64	0.2
65	0.22
66	0.24
67	0.19
68	0.17
69	0.18
70	0.2
71	0.21
72	0.2
73	0.17
74	0.13
75	0.2
76	0.2
77	0.24
78	0.27
79	0.26
80	0.27
81	0.35
82	0.37
83	0.36
84	0.38
85	0.38
86	0.39
87	0.43
88	0.43
89	0.41
90	0.39
91	0.33
92	0.32
93	0.27
94	0.23
95	0.18
96	0.16
97	0.12
98	0.11
99	0.11
100	0.1
101	0.1
102	0.08
103	0.08
104	0.1
105	0.09
106	0.09
107	0.09
108	0.09
109	0.09
110	0.11
111	0.13
112	0.13
113	0.21
114	0.22
115	0.23
116	0.26
117	0.26
118	0.25
119	0.26
120	0.24
121	0.2
122	0.25
123	0.29
124	0.29
125	0.32
126	0.33
127	0.3
128	0.32
129	0.3
130	0.31
131	0.28
132	0.29
133	0.29
134	0.31
135	0.32
136	0.32
137	0.3
138	0.24
139	0.25
140	0.23
141	0.2
142	0.16
143	0.15
144	0.13
145	0.12
146	0.12
147	0.08
148	0.07
149	0.07
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.08
157	0.12
158	0.14
159	0.15
160	0.18
161	0.24
162	0.32
163	0.38
164	0.43
165	0.45
166	0.47
167	0.53
168	0.55
169	0.52
170	0.46
171	0.43
172	0.37
173	0.31
174	0.27
175	0.2
176	0.14
177	0.1
178	0.09
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.03
191	0.03
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.04
201	0.05
202	0.06
203	0.07
204	0.08
205	0.1
206	0.11
207	0.13
208	0.14
209	0.13
210	0.13
211	0.12
212	0.11
213	0.09
214	0.09
215	0.07
216	0.07
217	0.08
218	0.09
219	0.11
220	0.13
221	0.21
222	0.27
223	0.36
224	0.43
225	0.52
226	0.61
227	0.65
228	0.73
229	0.7
230	0.72
231	0.73
232	0.73
233	0.72
234	0.72
235	0.78
236	0.74
237	0.75
238	0.71
239	0.69
240	0.72
241	0.69
242	0.7
243	0.69
244	0.72
245	0.71
246	0.7
247	0.64
248	0.55
249	0.51
250	0.46
251	0.36
252	0.3
253	0.28
254	0.3
255	0.31
256	0.3
257	0.27
258	0.24
259	0.29
260	0.34
261	0.37
262	0.33
263	0.35
264	0.38
265	0.44
266	0.44
267	0.41
268	0.35
269	0.34
270	0.35
271	0.35
272	0.33
273	0.33
274	0.35
275	0.36
276	0.36
277	0.38
278	0.38
279	0.43
280	0.44
281	0.48
282	0.5
283	0.49
284	0.48
285	0.43
286	0.42
287	0.39
288	0.39
289	0.3
290	0.27
291	0.24
292	0.25
293	0.28
294	0.32
295	0.35
296	0.36
297	0.44
298	0.52
299	0.62
300	0.67
301	0.73
302	0.76
303	0.79
304	0.85
305	0.85
306	0.8
307	0.81
308	0.77
309	0.68
310	0.59
311	0.49
312	0.4
313	0.33
314	0.26
315	0.16
316	0.12
317	0.1
318	0.09
319	0.09
320	0.09
321	0.07
322	0.06
323	0.07
324	0.07
325	0.08
326	0.1
327	0.12
328	0.11
329	0.13
330	0.16
331	0.17
332	0.16
333	0.16
334	0.14
335	0.14
336	0.17
337	0.15
338	0.13
339	0.13
340	0.13
341	0.13
342	0.12
343	0.1
344	0.07
345	0.07
346	0.06
347	0.05
348	0.06
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.07
358	0.07
359	0.08
360	0.09
361	0.12
362	0.14
363	0.15
364	0.16
365	0.17
366	0.25
367	0.28
368	0.32
369	0.31
370	0.33
371	0.36
372	0.36
373	0.36
374	0.31
375	0.28
376	0.24
377	0.22
378	0.21
379	0.19
380	0.17
381	0.16
382	0.14
383	0.12
384	0.11
385	0.13
386	0.11
387	0.08
388	0.09
389	0.08
390	0.09
391	0.1
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.09
397	0.09
398	0.07
399	0.07
400	0.07
401	0.05
402	0.06
403	0.06
404	0.07
405	0.06
406	0.07
407	0.07
408	0.08
409	0.08
410	0.07
411	0.08
412	0.07
413	0.09
414	0.08
415	0.08
416	0.07
417	0.07
418	0.09
419	0.08
420	0.08
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.06
427	0.08
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.07
434	0.06
435	0.04
436	0.05
437	0.04
438	0.05
439	0.05
440	0.06
441	0.07
442	0.09
443	0.1
444	0.11
445	0.12
446	0.16
447	0.2
448	0.24
449	0.26
450	0.31
451	0.33
452	0.38
453	0.38
454	0.34
455	0.31
456	0.27
457	0.24
458	0.17
459	0.15
460	0.11
461	0.1
462	0.12
463	0.11
464	0.12
465	0.12
466	0.12
467	0.11
468	0.11
469	0.12
470	0.1

A0A5C3MD24

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer