Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LZ47

Protein Details
Accession A0A5C3LZ47    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
145-175LKVLKITKPPSRTRRGDKKRRMKLLAPHSQIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-167LKITKPPSRTRRGDKKRRMK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045055  DNA2/NAM7-like  
IPR041679  DNA2/NAM7-like_C  
IPR041677  DNA2/NAM7_AAA_11  
IPR026122  MOV-10/SDE3_DEXXQ/H-box  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR047187  SF1_C_Upf1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0032574  F:5'-3' RNA helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13086  AAA_11  
PF13087  AAA_12  
CDD cd18038  DEXXQc_Helz-like  
cd18808  SF1_C_Upf1  
Amino Acid Sequences MNQHHHIHLTHTHAPHHQMIHPNGIPRIDQAGLIPTLHPTPGMYNLHAPINPSSASRNAVSPIQTGPIIQTNGNGGHYFSRNGTHSTSQYSQSQHLGTHVAAAKSTLSPDSTPVHNEDIHEFWKGRIAPLPGFSSRPGLLPTRELKVLKITKPPSRTRRGDKKRRMKLLAPHSQITGQEVGEDSSSDTLIIRPEESETSNHELDKYAEIFVPQYLKDIQTRLHTLQPIPPVNMYPSLRYRQTYLPPQLIDHSNKLDYSPLLEAPPLATDALSHSLTIESYYEHWISILRWELDTTSSEREQITLWKIGIKVVIWDDSEFLLFVPGIRENYPRLDIGDLLQMREVFEQQQTGSGRAFEGRVMATRKREGFVHFYSPTLRQHIQSIVPHALTQEDNIPLLFNISFLVNARPLCTMASAAATLRDVLSTPSSEHEVARKWLFPNPEDLNSGAQAANGKYVDEDQWHDKGLNTEQRSAAAFVALYQSKIPYLISGPPGTGKTRSIVEMVLQILRVQPEGCILLCAPSNPATDTLVQRLRSVLLPKDMLRLNDHNRTFAEVPSNIMPYCHVEDNKFALPPWETLMKRRVVACSCLDASALVMAQCTNMSLTKLEEEIVSNLHPFRHQIHQAQPHWTHLIIDEAAQGSEPELLIPMSVVVTRPATNGIATLLPQLVLCGDINQLGPVVASENARNAELDVSLLERLSERSVYTSHSYKRPSEPPSLQTWSPFIHLVKNYRSHPAILMPPSALFYDDSLEPCAKNGIIQWSGLSNPRLPIKFIGNETKEECIDERASWYNVGEIEQTLAAITSLLSQKQLCKPALRAKDIGVMSPWREQVWKLRERLRKEGLRDVDVGTVEDYQGRESRVVIISCVRSNVRFLDEDHKKGLGLFLSRKRMNVAITRAKELLIVIGNGDVLQRDPYWRSFLQFMLRNQLYIGPHLNLEWDGSYISRLESQLKDALNGDDTEDQGIVMAGGMIRELLKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.48
3 0.47
4 0.44
5 0.45
6 0.46
7 0.51
8 0.49
9 0.49
10 0.46
11 0.44
12 0.39
13 0.32
14 0.33
15 0.25
16 0.22
17 0.19
18 0.21
19 0.2
20 0.2
21 0.18
22 0.16
23 0.17
24 0.16
25 0.16
26 0.12
27 0.13
28 0.2
29 0.23
30 0.24
31 0.27
32 0.29
33 0.33
34 0.32
35 0.33
36 0.27
37 0.27
38 0.25
39 0.22
40 0.24
41 0.23
42 0.26
43 0.24
44 0.24
45 0.24
46 0.26
47 0.27
48 0.25
49 0.23
50 0.22
51 0.21
52 0.19
53 0.2
54 0.22
55 0.22
56 0.2
57 0.2
58 0.21
59 0.22
60 0.24
61 0.21
62 0.17
63 0.2
64 0.22
65 0.22
66 0.2
67 0.24
68 0.24
69 0.27
70 0.3
71 0.31
72 0.31
73 0.36
74 0.38
75 0.36
76 0.39
77 0.4
78 0.38
79 0.37
80 0.36
81 0.3
82 0.28
83 0.27
84 0.22
85 0.25
86 0.26
87 0.22
88 0.21
89 0.21
90 0.2
91 0.18
92 0.2
93 0.15
94 0.13
95 0.13
96 0.17
97 0.2
98 0.2
99 0.22
100 0.24
101 0.26
102 0.25
103 0.27
104 0.27
105 0.27
106 0.26
107 0.27
108 0.24
109 0.21
110 0.26
111 0.25
112 0.24
113 0.25
114 0.28
115 0.27
116 0.3
117 0.35
118 0.3
119 0.32
120 0.31
121 0.3
122 0.27
123 0.26
124 0.25
125 0.24
126 0.24
127 0.28
128 0.31
129 0.3
130 0.35
131 0.34
132 0.32
133 0.38
134 0.43
135 0.41
136 0.47
137 0.5
138 0.53
139 0.61
140 0.69
141 0.69
142 0.72
143 0.76
144 0.77
145 0.82
146 0.86
147 0.89
148 0.9
149 0.91
150 0.91
151 0.93
152 0.89
153 0.85
154 0.83
155 0.83
156 0.82
157 0.76
158 0.67
159 0.59
160 0.54
161 0.47
162 0.4
163 0.31
164 0.21
165 0.16
166 0.15
167 0.14
168 0.12
169 0.12
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.12
181 0.14
182 0.15
183 0.16
184 0.19
185 0.24
186 0.25
187 0.25
188 0.23
189 0.22
190 0.22
191 0.24
192 0.2
193 0.16
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.16
199 0.12
200 0.14
201 0.14
202 0.16
203 0.18
204 0.19
205 0.2
206 0.23
207 0.28
208 0.28
209 0.32
210 0.33
211 0.32
212 0.35
213 0.4
214 0.38
215 0.34
216 0.33
217 0.29
218 0.28
219 0.33
220 0.29
221 0.25
222 0.28
223 0.31
224 0.33
225 0.33
226 0.35
227 0.35
228 0.41
229 0.46
230 0.46
231 0.47
232 0.45
233 0.45
234 0.45
235 0.44
236 0.41
237 0.35
238 0.33
239 0.29
240 0.28
241 0.27
242 0.25
243 0.19
244 0.18
245 0.16
246 0.14
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.11
251 0.12
252 0.1
253 0.08
254 0.06
255 0.06
256 0.08
257 0.12
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.09
265 0.06
266 0.08
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.14
274 0.17
275 0.14
276 0.14
277 0.15
278 0.15
279 0.16
280 0.17
281 0.16
282 0.16
283 0.16
284 0.17
285 0.17
286 0.17
287 0.16
288 0.19
289 0.2
290 0.18
291 0.18
292 0.19
293 0.19
294 0.19
295 0.2
296 0.15
297 0.14
298 0.13
299 0.14
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.11
304 0.11
305 0.09
306 0.08
307 0.06
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.08
312 0.09
313 0.1
314 0.12
315 0.13
316 0.16
317 0.18
318 0.16
319 0.16
320 0.15
321 0.14
322 0.14
323 0.19
324 0.16
325 0.15
326 0.16
327 0.15
328 0.15
329 0.15
330 0.15
331 0.09
332 0.1
333 0.1
334 0.09
335 0.15
336 0.15
337 0.15
338 0.15
339 0.14
340 0.14
341 0.13
342 0.14
343 0.08
344 0.09
345 0.08
346 0.12
347 0.15
348 0.18
349 0.21
350 0.25
351 0.26
352 0.26
353 0.28
354 0.27
355 0.29
356 0.29
357 0.33
358 0.28
359 0.28
360 0.29
361 0.3
362 0.29
363 0.28
364 0.26
365 0.2
366 0.22
367 0.24
368 0.26
369 0.24
370 0.26
371 0.23
372 0.21
373 0.21
374 0.18
375 0.17
376 0.13
377 0.12
378 0.11
379 0.1
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.08
384 0.09
385 0.08
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.09
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.11
416 0.11
417 0.12
418 0.13
419 0.14
420 0.17
421 0.18
422 0.19
423 0.18
424 0.21
425 0.23
426 0.2
427 0.25
428 0.25
429 0.25
430 0.24
431 0.24
432 0.21
433 0.19
434 0.2
435 0.13
436 0.1
437 0.1
438 0.09
439 0.1
440 0.09
441 0.08
442 0.07
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.11
447 0.12
448 0.13
449 0.14
450 0.14
451 0.13
452 0.15
453 0.18
454 0.23
455 0.21
456 0.23
457 0.22
458 0.23
459 0.23
460 0.22
461 0.17
462 0.1
463 0.09
464 0.07
465 0.09
466 0.09
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.08
472 0.07
473 0.05
474 0.06
475 0.08
476 0.1
477 0.1
478 0.11
479 0.12
480 0.13
481 0.14
482 0.14
483 0.12
484 0.11
485 0.12
486 0.13
487 0.12
488 0.11
489 0.1
490 0.11
491 0.11
492 0.1
493 0.09
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.08
498 0.06
499 0.05
500 0.06
501 0.07
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.09
510 0.1
511 0.1
512 0.11
513 0.11
514 0.13
515 0.14
516 0.17
517 0.19
518 0.19
519 0.19
520 0.18
521 0.18
522 0.18
523 0.2
524 0.17
525 0.16
526 0.17
527 0.17
528 0.21
529 0.22
530 0.21
531 0.22
532 0.26
533 0.28
534 0.34
535 0.34
536 0.32
537 0.3
538 0.34
539 0.3
540 0.25
541 0.25
542 0.17
543 0.18
544 0.18
545 0.19
546 0.15
547 0.14
548 0.13
549 0.12
550 0.14
551 0.15
552 0.15
553 0.14
554 0.17
555 0.21
556 0.21
557 0.19
558 0.16
559 0.15
560 0.16
561 0.15
562 0.15
563 0.18
564 0.17
565 0.21
566 0.26
567 0.27
568 0.27
569 0.28
570 0.3
571 0.25
572 0.29
573 0.26
574 0.25
575 0.23
576 0.21
577 0.2
578 0.15
579 0.13
580 0.1
581 0.09
582 0.05
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.05
589 0.05
590 0.06
591 0.06
592 0.07
593 0.08
594 0.08
595 0.09
596 0.08
597 0.09
598 0.09
599 0.09
600 0.09
601 0.09
602 0.09
603 0.09
604 0.09
605 0.1
606 0.13
607 0.18
608 0.22
609 0.26
610 0.34
611 0.43
612 0.45
613 0.51
614 0.49
615 0.45
616 0.42
617 0.37
618 0.29
619 0.2
620 0.2
621 0.13
622 0.12
623 0.1
624 0.09
625 0.09
626 0.08
627 0.08
628 0.06
629 0.06
630 0.05
631 0.04
632 0.04
633 0.04
634 0.04
635 0.04
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.05
640 0.05
641 0.07
642 0.08
643 0.08
644 0.1
645 0.1
646 0.1
647 0.1
648 0.1
649 0.08
650 0.08
651 0.09
652 0.08
653 0.07
654 0.07
655 0.07
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.05
660 0.06
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.06
666 0.06
667 0.05
668 0.06
669 0.06
670 0.07
671 0.08
672 0.1
673 0.11
674 0.11
675 0.11
676 0.11
677 0.1
678 0.09
679 0.09
680 0.07
681 0.07
682 0.07
683 0.07
684 0.06
685 0.06
686 0.07
687 0.08
688 0.09
689 0.08
690 0.1
691 0.11
692 0.15
693 0.18
694 0.23
695 0.26
696 0.31
697 0.35
698 0.38
699 0.44
700 0.48
701 0.49
702 0.52
703 0.52
704 0.5
705 0.53
706 0.54
707 0.48
708 0.42
709 0.39
710 0.32
711 0.29
712 0.27
713 0.21
714 0.22
715 0.26
716 0.3
717 0.33
718 0.38
719 0.38
720 0.41
721 0.41
722 0.36
723 0.34
724 0.33
725 0.33
726 0.29
727 0.28
728 0.23
729 0.22
730 0.22
731 0.2
732 0.17
733 0.11
734 0.09
735 0.11
736 0.11
737 0.13
738 0.14
739 0.15
740 0.14
741 0.14
742 0.15
743 0.12
744 0.12
745 0.13
746 0.17
747 0.16
748 0.17
749 0.17
750 0.16
751 0.18
752 0.22
753 0.21
754 0.17
755 0.19
756 0.25
757 0.25
758 0.26
759 0.28
760 0.29
761 0.31
762 0.34
763 0.4
764 0.36
765 0.39
766 0.39
767 0.39
768 0.34
769 0.31
770 0.27
771 0.22
772 0.22
773 0.18
774 0.2
775 0.21
776 0.22
777 0.21
778 0.2
779 0.18
780 0.17
781 0.17
782 0.15
783 0.11
784 0.11
785 0.1
786 0.1
787 0.08
788 0.07
789 0.06
790 0.05
791 0.05
792 0.07
793 0.09
794 0.1
795 0.12
796 0.13
797 0.19
798 0.26
799 0.33
800 0.32
801 0.34
802 0.41
803 0.49
804 0.56
805 0.55
806 0.5
807 0.46
808 0.51
809 0.47
810 0.41
811 0.34
812 0.3
813 0.27
814 0.29
815 0.29
816 0.22
817 0.23
818 0.24
819 0.3
820 0.36
821 0.41
822 0.43
823 0.51
824 0.58
825 0.64
826 0.71
827 0.71
828 0.69
829 0.67
830 0.7
831 0.66
832 0.62
833 0.57
834 0.49
835 0.42
836 0.35
837 0.3
838 0.22
839 0.17
840 0.14
841 0.14
842 0.13
843 0.13
844 0.15
845 0.15
846 0.15
847 0.15
848 0.2
849 0.22
850 0.22
851 0.21
852 0.25
853 0.27
854 0.27
855 0.31
856 0.28
857 0.24
858 0.26
859 0.28
860 0.26
861 0.24
862 0.26
863 0.33
864 0.38
865 0.41
866 0.41
867 0.39
868 0.35
869 0.33
870 0.33
871 0.26
872 0.25
873 0.3
874 0.35
875 0.44
876 0.46
877 0.46
878 0.47
879 0.46
880 0.45
881 0.44
882 0.46
883 0.46
884 0.48
885 0.51
886 0.48
887 0.45
888 0.41
889 0.33
890 0.27
891 0.19
892 0.16
893 0.12
894 0.12
895 0.12
896 0.11
897 0.11
898 0.08
899 0.07
900 0.09
901 0.09
902 0.13
903 0.17
904 0.19
905 0.26
906 0.26
907 0.29
908 0.29
909 0.32
910 0.37
911 0.41
912 0.4
913 0.44
914 0.44
915 0.4
916 0.38
917 0.4
918 0.33
919 0.3
920 0.31
921 0.22
922 0.22
923 0.22
924 0.23
925 0.18
926 0.18
927 0.15
928 0.12
929 0.11
930 0.11
931 0.12
932 0.11
933 0.12
934 0.13
935 0.14
936 0.19
937 0.2
938 0.24
939 0.28
940 0.28
941 0.29
942 0.28
943 0.28
944 0.25
945 0.24
946 0.23
947 0.2
948 0.2
949 0.19
950 0.17
951 0.15
952 0.12
953 0.12
954 0.08
955 0.06
956 0.06
957 0.05
958 0.05
959 0.05
960 0.05