FuNGI

C5FN46

Protein Details

Accession

C5FN46

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
118-147	AGPQPSLSPKPHRRLKPKEQKTVRKLLRES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
116-147	KPAGPQPSLSPKPHRRLKPKEQKTVRKLLRES

Subcellular Location(s)

nucl 10, cyto 8, mito 5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Pfam	View protein in Pfam PF01535 PPR

Amino Acid Sequences

MSHGHVVWRGVGVSYPDHHPDSWAKEETAREKQSMSTRTVAIDGLWLCFRPSLGRLFSEPTRQRFPFDDAIYSPRRAFHSSPKCPFAPTFNLLTVAEPTGSSVPESGGEEAGQSKKPAGPQPSLSPKPHRRLKPKEQKTVRKLLRESKLPSGLKQRTNGNLENTLQNVVEKCPSHSAALEVVTELVRNRHVRPETRHYRAMILANTQCIKGSAKQVEALLDDMEKNGIVADSGTLHAALKALAVHPDYLLRSEIIHKLRERWLSLSPAGWHNVATGYIREGQFEMALETLEHMRLQHVPVQGWLYSLLMYNLADYGEFDELLHILRSRVEAGLTFSPNLWHHLLDASSVAMHAELTQFIWEQQVELGHLNPPYGICDNVLAISARTGNSRLATSVFKVLGKRNSVLTLNDYESLVDTYVEAHDIDSAIRILCTMGSSSVGIKAGSTRTLLSHFIMAKVAPTSVWETFKRLKRDEDLEMPLPLVNVALELCAHLGEVQTAWDLYRELHTLCSSGVETSTFNILFSACRGSNNADLAGFFVQEMIQMKILPDRKTYENLILLCVELSRFEIAYKYLLEMAGSGFELSRQAKQDIREKCHGQEDEHAFKLLHDSAVRKPASRGIIRPHRVRRAFSLPVSGKGAVAEEERNMDETAPYPHRD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.22
3	0.25
4	0.27
5	0.27
6	0.29
7	0.33
8	0.36
9	0.4
10	0.39
11	0.36
12	0.38
13	0.45
14	0.49
15	0.53
16	0.5
17	0.44
18	0.42
19	0.47
20	0.51
21	0.49
22	0.45
23	0.4
24	0.37
25	0.37
26	0.37
27	0.31
28	0.22
29	0.23
30	0.19
31	0.17
32	0.17
33	0.16
34	0.16
35	0.16
36	0.16
37	0.14
38	0.16
39	0.21
40	0.22
41	0.25
42	0.27
43	0.32
44	0.35
45	0.42
46	0.47
47	0.46
48	0.52
49	0.5
50	0.51
51	0.5
52	0.53
53	0.51
54	0.46
55	0.44
56	0.37
57	0.43
58	0.44
59	0.42
60	0.37
61	0.32
62	0.34
63	0.35
64	0.37
65	0.41
66	0.48
67	0.55
68	0.61
69	0.63
70	0.6
71	0.58
72	0.56
73	0.52
74	0.48
75	0.42
76	0.39
77	0.34
78	0.36
79	0.33
80	0.32
81	0.27
82	0.2
83	0.17
84	0.13
85	0.13
86	0.12
87	0.12
88	0.11
89	0.1
90	0.09
91	0.1
92	0.12
93	0.11
94	0.11
95	0.1
96	0.11
97	0.14
98	0.16
99	0.16
100	0.15
101	0.16
102	0.18
103	0.23
104	0.3
105	0.32
106	0.34
107	0.37
108	0.45
109	0.54
110	0.58
111	0.58
112	0.62
113	0.65
114	0.7
115	0.75
116	0.76
117	0.76
118	0.8
119	0.86
120	0.87
121	0.88
122	0.9
123	0.91
124	0.92
125	0.89
126	0.9
127	0.85
128	0.83
129	0.79
130	0.77
131	0.74
132	0.71
133	0.68
134	0.65
135	0.67
136	0.59
137	0.58
138	0.59
139	0.58
140	0.56
141	0.55
142	0.53
143	0.51
144	0.56
145	0.55
146	0.49
147	0.46
148	0.43
149	0.41
150	0.36
151	0.3
152	0.24
153	0.22
154	0.18
155	0.15
156	0.18
157	0.16
158	0.18
159	0.21
160	0.22
161	0.22
162	0.21
163	0.21
164	0.18
165	0.19
166	0.16
167	0.12
168	0.11
169	0.1
170	0.1
171	0.09
172	0.09
173	0.13
174	0.15
175	0.17
176	0.24
177	0.3
178	0.36
179	0.43
180	0.53
181	0.57
182	0.61
183	0.64
184	0.56
185	0.54
186	0.5
187	0.47
188	0.38
189	0.34
190	0.29
191	0.28
192	0.28
193	0.25
194	0.21
195	0.18
196	0.19
197	0.16
198	0.22
199	0.22
200	0.22
201	0.24
202	0.25
203	0.24
204	0.23
205	0.2
206	0.13
207	0.11
208	0.1
209	0.08
210	0.08
211	0.06
212	0.06
213	0.05
214	0.04
215	0.03
216	0.03
217	0.04
218	0.04
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.06
224	0.06
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.07
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.09
234	0.09
235	0.1
236	0.1
237	0.09
238	0.09
239	0.11
240	0.17
241	0.19
242	0.23
243	0.23
244	0.26
245	0.32
246	0.34
247	0.33
248	0.3
249	0.3
250	0.29
251	0.29
252	0.27
253	0.23
254	0.22
255	0.22
256	0.19
257	0.16
258	0.13
259	0.12
260	0.11
261	0.1
262	0.08
263	0.08
264	0.12
265	0.12
266	0.12
267	0.12
268	0.12
269	0.11
270	0.11
271	0.1
272	0.05
273	0.06
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.06
278	0.05
279	0.05
280	0.06
281	0.07
282	0.08
283	0.12
284	0.13
285	0.13
286	0.14
287	0.16
288	0.15
289	0.14
290	0.13
291	0.09
292	0.08
293	0.07
294	0.06
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.06
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.09
319	0.11
320	0.12
321	0.11
322	0.11
323	0.13
324	0.13
325	0.16
326	0.13
327	0.11
328	0.1
329	0.11
330	0.11
331	0.09
332	0.09
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.03
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.05
348	0.05
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.07
353	0.07
354	0.08
355	0.09
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.07
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.08
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.09
375	0.1
376	0.1
377	0.1
378	0.11
379	0.12
380	0.12
381	0.14
382	0.14
383	0.15
384	0.17
385	0.21
386	0.25
387	0.26
388	0.26
389	0.24
390	0.26
391	0.26
392	0.24
393	0.23
394	0.2
395	0.19
396	0.19
397	0.17
398	0.15
399	0.14
400	0.13
401	0.1
402	0.07
403	0.06
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.05
409	0.05
410	0.06
411	0.06
412	0.06
413	0.06
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.06
423	0.06
424	0.07
425	0.08
426	0.09
427	0.08
428	0.08
429	0.09
430	0.1
431	0.1
432	0.11
433	0.1
434	0.11
435	0.13
436	0.15
437	0.13
438	0.17
439	0.16
440	0.16
441	0.16
442	0.14
443	0.13
444	0.12
445	0.11
446	0.07
447	0.08
448	0.11
449	0.13
450	0.18
451	0.17
452	0.23
453	0.3
454	0.37
455	0.43
456	0.42
457	0.45
458	0.46
459	0.5
460	0.5
461	0.48
462	0.47
463	0.42
464	0.39
465	0.35
466	0.29
467	0.24
468	0.18
469	0.12
470	0.06
471	0.05
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.04
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.05
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.06
488	0.07
489	0.07
490	0.09
491	0.11
492	0.11
493	0.13
494	0.13
495	0.13
496	0.13
497	0.14
498	0.12
499	0.11
500	0.11
501	0.1
502	0.1
503	0.1
504	0.14
505	0.12
506	0.11
507	0.11
508	0.11
509	0.1
510	0.11
511	0.15
512	0.12
513	0.13
514	0.16
515	0.19
516	0.23
517	0.24
518	0.23
519	0.18
520	0.18
521	0.19
522	0.17
523	0.13
524	0.09
525	0.08
526	0.07
527	0.09
528	0.11
529	0.1
530	0.1
531	0.11
532	0.11
533	0.18
534	0.24
535	0.24
536	0.26
537	0.29
538	0.32
539	0.36
540	0.39
541	0.38
542	0.38
543	0.36
544	0.34
545	0.3
546	0.26
547	0.22
548	0.19
549	0.13
550	0.08
551	0.09
552	0.09
553	0.08
554	0.09
555	0.1
556	0.11
557	0.13
558	0.13
559	0.13
560	0.13
561	0.13
562	0.12
563	0.11
564	0.11
565	0.1
566	0.09
567	0.08
568	0.07
569	0.07
570	0.11
571	0.13
572	0.17
573	0.19
574	0.22
575	0.25
576	0.31
577	0.39
578	0.44
579	0.5
580	0.55
581	0.55
582	0.56
583	0.62
584	0.59
585	0.53
586	0.54
587	0.54
588	0.52
589	0.5
590	0.47
591	0.38
592	0.35
593	0.37
594	0.29
595	0.24
596	0.2
597	0.22
598	0.26
599	0.35
600	0.36
601	0.33
602	0.33
603	0.37
604	0.43
605	0.45
606	0.45
607	0.47
608	0.57
609	0.63
610	0.71
611	0.74
612	0.77
613	0.77
614	0.75
615	0.73
616	0.7
617	0.69
618	0.62
619	0.63
620	0.55
621	0.54
622	0.54
623	0.46
624	0.38
625	0.31
626	0.3
627	0.21
628	0.21
629	0.18
630	0.15
631	0.18
632	0.19
633	0.21
634	0.2
635	0.18
636	0.17
637	0.17
638	0.23

C5FN46

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer