Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3MK84

Protein Details
Accession A0A5C3MK84    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-37LEDERARHDKRVKLKQLNLTSSGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MDSVSNTQPVVSTRLEDERARHDKRVKLKQLNLTSSGLEESAKLDSSLKRHTALIKRIRLSMATENREQIFKDIESLSLGKYIDEIAGAVVEGLARCKTEKDVWGAVEIISSLHRRFPSTFTPALVSALASALSAPSRASLATLAPEQREKEDSVRVTRQRPILRICSELALVGIIKDAQDRSGGEWIMKVIKELLSNDPSLSSLPLLTTFLKSYSRPYLGIVPPASHKQIAASVEPGTLSGAHIEMQEDDTFLALSNEEDELVEQDIRDRFRRMCEGYFDNVCKKLLIEHKRLQEQDKKNHEAYIRSGEIFEDRQQAYEKMTKGYEKLLASCQSLSELLYLPLPSLPTTSQKSDSILIGSNTNQLLGDDADELLTSGGKWEDEEERRFYEDVQDLKDFVPSSVLGIDDSEESEDRDTEEKAKERIEREKEEVRKLEEELEKLDVDKGVDATVPNGSIEADMDEDQLPTPTPGTPKASTPPLSPQLAPQGPSQLLTALLVRLPDATNRAMVDQAAIDFAFLNSKAARKRLVKFLSQVPKNRTDLLPHYSRLIATLNKYMPDIGSDIVAFLDEEFRYLQRKKNVVKELSEVRLKNITFLSNLTKFRVVPPHLVLHIFKVCLDDFSGVNVENIALLLEGCGRFLLRSEDTSERFGTMLELMRRKQSMQHFDQRQLLLLENAYYQCNPPERAPRQEKQRTPMELFIRHLIYDVLAKKTIDKVLKLIRKLDWDDEEIRKTLHKVFTKPWKIKYSNISLLAMLTYDLTRYRPAFAIAVVDQVLEDVRRGLEQNVYSTNQRRVATMKYLGELYIYRLLSSSIIFDTLWTIVTFGHTDGRPLPHQVVPLDTPDDFFRVRLVCVLLDTCGMCFDRGTQKKKLDNFLIFFQYYILCKEPLPMDVDFMLSDSLEAVRPKLGMAKNVEQAAVAVDEMFNSAFQSTDINEDSGEDSGDEGERRDQDDGEEEEEEEGNPESPVGDRAPSPDQEVVLSNVQENLGPTEEAEAEFAKELAKMVTDNSAESRKVDKKTALALWDSAVLPPTIRKKRAEDFDEEGETQSTVGNGNVMNFTVITKRGNKQLSKQLAVPSESPLAVHTRSAQMQDKVEQQHLKRLVLDYEQREEAEEFKALEARNRAGAIKIRYIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.31
3 0.32
4 0.34
5 0.4
6 0.48
7 0.51
8 0.55
9 0.57
10 0.61
11 0.68
12 0.75
13 0.76
14 0.77
15 0.8
16 0.82
17 0.84
18 0.82
19 0.76
20 0.67
21 0.57
22 0.48
23 0.41
24 0.31
25 0.21
26 0.16
27 0.13
28 0.13
29 0.13
30 0.12
31 0.15
32 0.19
33 0.24
34 0.31
35 0.33
36 0.33
37 0.35
38 0.44
39 0.49
40 0.55
41 0.6
42 0.61
43 0.61
44 0.63
45 0.61
46 0.54
47 0.5
48 0.5
49 0.5
50 0.47
51 0.47
52 0.47
53 0.47
54 0.47
55 0.43
56 0.35
57 0.3
58 0.25
59 0.26
60 0.22
61 0.21
62 0.22
63 0.23
64 0.2
65 0.19
66 0.19
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.11
71 0.1
72 0.1
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.11
85 0.16
86 0.21
87 0.26
88 0.31
89 0.35
90 0.35
91 0.36
92 0.36
93 0.31
94 0.25
95 0.2
96 0.14
97 0.12
98 0.14
99 0.13
100 0.18
101 0.19
102 0.22
103 0.24
104 0.29
105 0.34
106 0.38
107 0.39
108 0.35
109 0.37
110 0.34
111 0.33
112 0.28
113 0.21
114 0.14
115 0.12
116 0.1
117 0.07
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.12
130 0.16
131 0.18
132 0.2
133 0.24
134 0.24
135 0.26
136 0.28
137 0.28
138 0.28
139 0.33
140 0.35
141 0.39
142 0.47
143 0.5
144 0.52
145 0.55
146 0.6
147 0.58
148 0.6
149 0.59
150 0.59
151 0.55
152 0.54
153 0.49
154 0.42
155 0.36
156 0.3
157 0.23
158 0.15
159 0.12
160 0.09
161 0.08
162 0.06
163 0.06
164 0.08
165 0.09
166 0.08
167 0.1
168 0.11
169 0.14
170 0.18
171 0.19
172 0.17
173 0.17
174 0.18
175 0.2
176 0.19
177 0.17
178 0.14
179 0.16
180 0.18
181 0.2
182 0.24
183 0.23
184 0.24
185 0.23
186 0.22
187 0.2
188 0.19
189 0.17
190 0.11
191 0.09
192 0.08
193 0.09
194 0.11
195 0.12
196 0.13
197 0.13
198 0.14
199 0.17
200 0.17
201 0.22
202 0.27
203 0.28
204 0.27
205 0.28
206 0.35
207 0.34
208 0.39
209 0.35
210 0.29
211 0.31
212 0.34
213 0.34
214 0.26
215 0.24
216 0.19
217 0.22
218 0.23
219 0.21
220 0.19
221 0.17
222 0.17
223 0.17
224 0.16
225 0.12
226 0.1
227 0.08
228 0.07
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.08
251 0.09
252 0.07
253 0.11
254 0.14
255 0.18
256 0.2
257 0.22
258 0.23
259 0.28
260 0.35
261 0.35
262 0.35
263 0.38
264 0.4
265 0.41
266 0.44
267 0.42
268 0.39
269 0.37
270 0.34
271 0.28
272 0.24
273 0.26
274 0.3
275 0.36
276 0.4
277 0.45
278 0.52
279 0.58
280 0.61
281 0.61
282 0.62
283 0.63
284 0.64
285 0.66
286 0.65
287 0.6
288 0.62
289 0.57
290 0.5
291 0.45
292 0.43
293 0.35
294 0.3
295 0.29
296 0.25
297 0.25
298 0.24
299 0.22
300 0.21
301 0.19
302 0.2
303 0.22
304 0.22
305 0.24
306 0.27
307 0.26
308 0.22
309 0.24
310 0.24
311 0.23
312 0.25
313 0.27
314 0.22
315 0.23
316 0.25
317 0.26
318 0.26
319 0.25
320 0.22
321 0.18
322 0.17
323 0.15
324 0.12
325 0.1
326 0.09
327 0.1
328 0.1
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.09
334 0.1
335 0.14
336 0.18
337 0.21
338 0.23
339 0.24
340 0.25
341 0.25
342 0.24
343 0.21
344 0.19
345 0.17
346 0.15
347 0.15
348 0.16
349 0.14
350 0.14
351 0.12
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.09
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.07
369 0.13
370 0.18
371 0.21
372 0.24
373 0.25
374 0.27
375 0.27
376 0.26
377 0.25
378 0.25
379 0.24
380 0.24
381 0.23
382 0.22
383 0.22
384 0.24
385 0.19
386 0.14
387 0.13
388 0.1
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.09
404 0.1
405 0.12
406 0.16
407 0.19
408 0.2
409 0.24
410 0.27
411 0.3
412 0.38
413 0.41
414 0.42
415 0.44
416 0.51
417 0.52
418 0.54
419 0.53
420 0.47
421 0.42
422 0.38
423 0.4
424 0.34
425 0.3
426 0.25
427 0.24
428 0.2
429 0.19
430 0.19
431 0.12
432 0.1
433 0.1
434 0.08
435 0.06
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.08
454 0.07
455 0.06
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.11
460 0.16
461 0.17
462 0.18
463 0.22
464 0.26
465 0.26
466 0.26
467 0.29
468 0.29
469 0.3
470 0.28
471 0.26
472 0.29
473 0.29
474 0.29
475 0.23
476 0.22
477 0.21
478 0.21
479 0.2
480 0.12
481 0.11
482 0.1
483 0.09
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.05
488 0.06
489 0.06
490 0.07
491 0.09
492 0.09
493 0.09
494 0.1
495 0.1
496 0.09
497 0.09
498 0.09
499 0.06
500 0.06
501 0.05
502 0.05
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.06
510 0.09
511 0.11
512 0.13
513 0.19
514 0.24
515 0.27
516 0.36
517 0.38
518 0.38
519 0.39
520 0.46
521 0.49
522 0.49
523 0.52
524 0.47
525 0.49
526 0.48
527 0.47
528 0.39
529 0.33
530 0.32
531 0.31
532 0.3
533 0.25
534 0.25
535 0.23
536 0.22
537 0.19
538 0.17
539 0.14
540 0.13
541 0.17
542 0.16
543 0.16
544 0.16
545 0.15
546 0.13
547 0.12
548 0.11
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.05
554 0.05
555 0.04
556 0.03
557 0.05
558 0.04
559 0.05
560 0.06
561 0.06
562 0.11
563 0.13
564 0.18
565 0.23
566 0.3
567 0.34
568 0.42
569 0.49
570 0.48
571 0.48
572 0.47
573 0.45
574 0.43
575 0.43
576 0.34
577 0.28
578 0.3
579 0.28
580 0.25
581 0.22
582 0.19
583 0.14
584 0.16
585 0.19
586 0.19
587 0.21
588 0.2
589 0.21
590 0.2
591 0.22
592 0.28
593 0.25
594 0.24
595 0.25
596 0.26
597 0.25
598 0.26
599 0.24
600 0.19
601 0.19
602 0.15
603 0.13
604 0.13
605 0.12
606 0.11
607 0.11
608 0.1
609 0.08
610 0.09
611 0.1
612 0.08
613 0.08
614 0.07
615 0.06
616 0.05
617 0.05
618 0.04
619 0.03
620 0.03
621 0.03
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.04
626 0.04
627 0.04
628 0.05
629 0.09
630 0.09
631 0.1
632 0.14
633 0.18
634 0.2
635 0.23
636 0.22
637 0.19
638 0.18
639 0.17
640 0.13
641 0.11
642 0.13
643 0.14
644 0.17
645 0.17
646 0.2
647 0.21
648 0.21
649 0.25
650 0.29
651 0.34
652 0.37
653 0.46
654 0.47
655 0.49
656 0.54
657 0.48
658 0.42
659 0.35
660 0.29
661 0.2
662 0.16
663 0.13
664 0.09
665 0.1
666 0.09
667 0.09
668 0.09
669 0.11
670 0.14
671 0.15
672 0.17
673 0.27
674 0.3
675 0.39
676 0.47
677 0.5
678 0.57
679 0.65
680 0.66
681 0.61
682 0.65
683 0.6
684 0.56
685 0.57
686 0.51
687 0.45
688 0.42
689 0.4
690 0.32
691 0.27
692 0.25
693 0.18
694 0.14
695 0.15
696 0.15
697 0.14
698 0.15
699 0.15
700 0.16
701 0.19
702 0.23
703 0.21
704 0.2
705 0.23
706 0.3
707 0.35
708 0.36
709 0.37
710 0.34
711 0.37
712 0.38
713 0.37
714 0.31
715 0.29
716 0.32
717 0.32
718 0.32
719 0.27
720 0.25
721 0.23
722 0.22
723 0.24
724 0.27
725 0.28
726 0.3
727 0.37
728 0.47
729 0.56
730 0.59
731 0.61
732 0.63
733 0.61
734 0.63
735 0.63
736 0.61
737 0.57
738 0.54
739 0.47
740 0.38
741 0.35
742 0.3
743 0.23
744 0.14
745 0.08
746 0.05
747 0.05
748 0.06
749 0.07
750 0.1
751 0.11
752 0.13
753 0.13
754 0.14
755 0.14
756 0.13
757 0.16
758 0.13
759 0.13
760 0.11
761 0.11
762 0.09
763 0.08
764 0.09
765 0.05
766 0.05
767 0.04
768 0.05
769 0.06
770 0.07
771 0.08
772 0.12
773 0.13
774 0.15
775 0.18
776 0.2
777 0.23
778 0.26
779 0.31
780 0.32
781 0.32
782 0.31
783 0.3
784 0.32
785 0.34
786 0.35
787 0.31
788 0.26
789 0.26
790 0.24
791 0.23
792 0.19
793 0.17
794 0.17
795 0.16
796 0.15
797 0.15
798 0.15
799 0.15
800 0.15
801 0.13
802 0.07
803 0.08
804 0.08
805 0.08
806 0.09
807 0.08
808 0.09
809 0.07
810 0.07
811 0.06
812 0.08
813 0.08
814 0.08
815 0.12
816 0.11
817 0.13
818 0.16
819 0.2
820 0.2
821 0.22
822 0.25
823 0.22
824 0.25
825 0.24
826 0.24
827 0.21
828 0.22
829 0.22
830 0.18
831 0.18
832 0.16
833 0.18
834 0.15
835 0.14
836 0.14
837 0.13
838 0.14
839 0.14
840 0.14
841 0.12
842 0.13
843 0.13
844 0.11
845 0.11
846 0.11
847 0.09
848 0.1
849 0.1
850 0.09
851 0.09
852 0.12
853 0.21
854 0.3
855 0.35
856 0.41
857 0.48
858 0.55
859 0.6
860 0.64
861 0.61
862 0.59
863 0.57
864 0.54
865 0.51
866 0.44
867 0.38
868 0.32
869 0.25
870 0.2
871 0.2
872 0.17
873 0.13
874 0.13
875 0.16
876 0.16
877 0.17
878 0.19
879 0.17
880 0.17
881 0.16
882 0.17
883 0.14
884 0.13
885 0.11
886 0.08
887 0.07
888 0.06
889 0.06
890 0.08
891 0.09
892 0.09
893 0.1
894 0.1
895 0.11
896 0.18
897 0.19
898 0.22
899 0.28
900 0.33
901 0.36
902 0.37
903 0.37
904 0.29
905 0.27
906 0.23
907 0.16
908 0.11
909 0.07
910 0.06
911 0.06
912 0.06
913 0.06
914 0.05
915 0.05
916 0.05
917 0.05
918 0.06
919 0.07
920 0.07
921 0.11
922 0.12
923 0.12
924 0.12
925 0.13
926 0.14
927 0.13
928 0.12
929 0.08
930 0.07
931 0.08
932 0.09
933 0.09
934 0.09
935 0.13
936 0.14
937 0.16
938 0.17
939 0.17
940 0.17
941 0.22
942 0.23
943 0.21
944 0.2
945 0.19
946 0.18
947 0.19
948 0.17
949 0.13
950 0.12
951 0.09
952 0.09
953 0.08
954 0.07
955 0.08
956 0.1
957 0.1
958 0.11
959 0.11
960 0.15
961 0.2
962 0.21
963 0.24
964 0.23
965 0.23
966 0.23
967 0.24
968 0.23
969 0.22
970 0.21
971 0.17
972 0.17
973 0.16
974 0.16
975 0.15
976 0.14
977 0.12
978 0.12
979 0.11
980 0.13
981 0.13
982 0.13
983 0.13
984 0.11
985 0.11
986 0.11
987 0.11
988 0.09
989 0.09
990 0.09
991 0.08
992 0.09
993 0.08
994 0.09
995 0.14
996 0.14
997 0.16
998 0.19
999 0.23
1000 0.22
1001 0.24
1002 0.31
1003 0.33
1004 0.36
1005 0.41
1006 0.41
1007 0.4
1008 0.47
1009 0.49
1010 0.44
1011 0.4
1012 0.36
1013 0.32
1014 0.31
1015 0.27
1016 0.21
1017 0.17
1018 0.14
1019 0.12
1020 0.18
1021 0.27
1022 0.33
1023 0.38
1024 0.42
1025 0.48
1026 0.57
1027 0.67
1028 0.66
1029 0.63
1030 0.6
1031 0.61
1032 0.6
1033 0.53
1034 0.46
1035 0.37
1036 0.31
1037 0.24
1038 0.18
1039 0.13
1040 0.09
1041 0.08
1042 0.09
1043 0.08
1044 0.1
1045 0.11
1046 0.11
1047 0.11
1048 0.1
1049 0.11
1050 0.13
1051 0.14
1052 0.18
1053 0.23
1054 0.27
1055 0.35
1056 0.44
1057 0.47
1058 0.53
1059 0.61
1060 0.65
1061 0.63
1062 0.63
1063 0.61
1064 0.58
1065 0.57
1066 0.49
1067 0.43
1068 0.37
1069 0.33
1070 0.29
1071 0.24
1072 0.23
1073 0.2
1074 0.21
1075 0.2
1076 0.22
1077 0.25
1078 0.3
1079 0.36
1080 0.36
1081 0.39
1082 0.41
1083 0.46
1084 0.45
1085 0.5
1086 0.52
1087 0.47
1088 0.52
1089 0.53
1090 0.51
1091 0.47
1092 0.45
1093 0.41
1094 0.41
1095 0.47
1096 0.43
1097 0.43
1098 0.43
1099 0.4
1100 0.4
1101 0.37
1102 0.32
1103 0.26
1104 0.23
1105 0.18
1106 0.18
1107 0.22
1108 0.2
1109 0.25
1110 0.28
1111 0.28
1112 0.3
1113 0.31
1114 0.3
1115 0.31
1116 0.38
1117 0.37