FuNGI

A0A5C3LHA6

Protein Details

Accession

A0A5C3LHA6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
124-143	MPPPKTVQSKSQPPKKPEPE	Hydrophilic
393-415	RELAKRVVKRRIKEERKKAKETG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
395-421	LAKRVVKRRIKEERKKAKETGASQKRR

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, mito 7, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012340 NA-bd_OB-fold IPR040260 RFA2-like

Amino Acid Sequences

MSSTATVTVAAKSISKSTDRYSVIQLSPSKRRCLSDEGCRKPTTQELWAWTLTPDAVAPCSLRDVLQMKENDTEDNSDFFWLGRVPCRTVKVVGMVIGVQAYEKRVIYSIDDGTSVVDCNHLQMPPPKTVQSKSQPPKKPEPEPLPKPIAYVGQFVRVIGKVQRKFDSRQIIIERIVRCSSANDELNHCRAVRELHRMTYSLDEPFSIPPLPTLPPPPMTPARIQEPSTPSTVVSDSESSATYSPTKSEAGQLVCLSFSFETPQKLRHPSRLHSRDLTDNTFRIYMKHYMDHAPDFTPEPVRESDYDSDMAVGTSLTLVPSTPTKPSRHRHEDHTPRAKITAGTSESTPRPRVPALRFGGSEPIYSTTVSSAKPQSNIRGFTLSYLRRVPELRELAKRVVKRRIKEERKKAKETGASQKRRTALESNIGPKMKRLFQWAIVLLLKEGGVVLWDGESRPILDNPCSEMSRLWRSSNSTIGADSTVFSVTSGTIREIDDDELSDPGVDEEIYLPLKPAYLAVEVEKAIKALSDAAEKMRHNASDPRVLTGGFTKDSILSFMKKDDRWRHIGDWHVEDALKFLELEGRAWCIGKGRWVLTL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.22
3	0.25
4	0.28
5	0.36
6	0.38
7	0.39
8	0.42
9	0.46
10	0.44
11	0.47
12	0.5
13	0.48
14	0.55
15	0.57
16	0.58
17	0.55
18	0.57
19	0.55
20	0.58
21	0.58
22	0.59
23	0.65
24	0.66
25	0.68
26	0.66
27	0.62
28	0.56
29	0.57
30	0.51
31	0.46
32	0.43
33	0.42
34	0.45
35	0.44
36	0.41
37	0.34
38	0.29
39	0.23
40	0.18
41	0.13
42	0.1
43	0.1
44	0.11
45	0.11
46	0.11
47	0.14
48	0.14
49	0.13
50	0.17
51	0.19
52	0.2
53	0.27
54	0.28
55	0.27
56	0.32
57	0.32
58	0.29
59	0.27
60	0.3
61	0.24
62	0.24
63	0.22
64	0.18
65	0.17
66	0.15
67	0.15
68	0.14
69	0.14
70	0.19
71	0.22
72	0.25
73	0.29
74	0.33
75	0.34
76	0.34
77	0.34
78	0.32
79	0.3
80	0.27
81	0.24
82	0.2
83	0.17
84	0.15
85	0.12
86	0.08
87	0.07
88	0.08
89	0.1
90	0.1
91	0.1
92	0.11
93	0.13
94	0.15
95	0.18
96	0.19
97	0.17
98	0.17
99	0.17
100	0.16
101	0.16
102	0.14
103	0.09
104	0.09
105	0.08
106	0.1
107	0.13
108	0.12
109	0.15
110	0.22
111	0.25
112	0.28
113	0.31
114	0.34
115	0.35
116	0.38
117	0.43
118	0.45
119	0.53
120	0.58
121	0.65
122	0.69
123	0.72
124	0.81
125	0.8
126	0.79
127	0.78
128	0.78
129	0.79
130	0.76
131	0.76
132	0.72
133	0.63
134	0.56
135	0.48
136	0.43
137	0.34
138	0.33
139	0.26
140	0.26
141	0.25
142	0.24
143	0.25
144	0.2
145	0.2
146	0.22
147	0.3
148	0.29
149	0.34
150	0.4
151	0.41
152	0.45
153	0.51
154	0.54
155	0.46
156	0.49
157	0.49
158	0.46
159	0.45
160	0.46
161	0.4
162	0.34
163	0.33
164	0.26
165	0.22
166	0.21
167	0.22
168	0.23
169	0.25
170	0.23
171	0.28
172	0.31
173	0.33
174	0.33
175	0.29
176	0.23
177	0.2
178	0.24
179	0.23
180	0.29
181	0.29
182	0.31
183	0.33
184	0.33
185	0.33
186	0.32
187	0.29
188	0.2
189	0.18
190	0.15
191	0.15
192	0.15
193	0.15
194	0.12
195	0.1
196	0.09
197	0.11
198	0.12
199	0.12
200	0.15
201	0.15
202	0.17
203	0.18
204	0.22
205	0.24
206	0.25
207	0.26
208	0.27
209	0.3
210	0.31
211	0.32
212	0.33
213	0.33
214	0.32
215	0.31
216	0.28
217	0.23
218	0.21
219	0.19
220	0.15
221	0.13
222	0.12
223	0.1
224	0.11
225	0.11
226	0.1
227	0.1
228	0.11
229	0.1
230	0.1
231	0.1
232	0.11
233	0.12
234	0.11
235	0.14
236	0.17
237	0.16
238	0.18
239	0.17
240	0.15
241	0.14
242	0.14
243	0.12
244	0.08
245	0.07
246	0.08
247	0.1
248	0.13
249	0.14
250	0.18
251	0.22
252	0.3
253	0.32
254	0.39
255	0.42
256	0.44
257	0.55
258	0.56
259	0.55
260	0.5
261	0.5
262	0.47
263	0.46
264	0.45
265	0.36
266	0.31
267	0.28
268	0.27
269	0.24
270	0.19
271	0.19
272	0.19
273	0.18
274	0.2
275	0.21
276	0.22
277	0.23
278	0.24
279	0.21
280	0.17
281	0.16
282	0.15
283	0.14
284	0.14
285	0.12
286	0.14
287	0.13
288	0.15
289	0.14
290	0.17
291	0.17
292	0.16
293	0.17
294	0.14
295	0.13
296	0.12
297	0.11
298	0.07
299	0.06
300	0.04
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.04
307	0.06
308	0.07
309	0.11
310	0.16
311	0.21
312	0.29
313	0.37
314	0.46
315	0.54
316	0.55
317	0.59
318	0.66
319	0.71
320	0.73
321	0.76
322	0.67
323	0.58
324	0.56
325	0.49
326	0.39
327	0.3
328	0.26
329	0.18
330	0.18
331	0.18
332	0.21
333	0.23
334	0.25
335	0.26
336	0.2
337	0.21
338	0.22
339	0.28
340	0.28
341	0.34
342	0.34
343	0.35
344	0.35
345	0.34
346	0.37
347	0.31
348	0.28
349	0.19
350	0.18
351	0.16
352	0.15
353	0.15
354	0.11
355	0.12
356	0.13
357	0.15
358	0.17
359	0.18
360	0.22
361	0.24
362	0.3
363	0.33
364	0.35
365	0.33
366	0.31
367	0.29
368	0.28
369	0.33
370	0.27
371	0.25
372	0.25
373	0.24
374	0.24
375	0.25
376	0.25
377	0.26
378	0.31
379	0.32
380	0.36
381	0.38
382	0.41
383	0.45
384	0.48
385	0.46
386	0.5
387	0.52
388	0.51
389	0.58
390	0.64
391	0.7
392	0.76
393	0.8
394	0.81
395	0.84
396	0.86
397	0.79
398	0.76
399	0.72
400	0.68
401	0.68
402	0.67
403	0.67
404	0.64
405	0.66
406	0.61
407	0.55
408	0.52
409	0.46
410	0.4
411	0.4
412	0.42
413	0.41
414	0.43
415	0.43
416	0.39
417	0.38
418	0.38
419	0.34
420	0.31
421	0.34
422	0.32
423	0.34
424	0.4
425	0.37
426	0.36
427	0.32
428	0.3
429	0.23
430	0.2
431	0.16
432	0.1
433	0.08
434	0.05
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.05
440	0.05
441	0.06
442	0.07
443	0.08
444	0.1
445	0.12
446	0.14
447	0.16
448	0.17
449	0.21
450	0.24
451	0.24
452	0.22
453	0.22
454	0.26
455	0.33
456	0.34
457	0.32
458	0.32
459	0.37
460	0.39
461	0.42
462	0.39
463	0.31
464	0.28
465	0.27
466	0.24
467	0.19
468	0.16
469	0.12
470	0.1
471	0.09
472	0.08
473	0.08
474	0.07
475	0.08
476	0.09
477	0.09
478	0.1
479	0.11
480	0.12
481	0.14
482	0.15
483	0.14
484	0.14
485	0.14
486	0.12
487	0.12
488	0.1
489	0.09
490	0.07
491	0.07
492	0.06
493	0.05
494	0.06
495	0.08
496	0.09
497	0.09
498	0.1
499	0.1
500	0.1
501	0.1
502	0.1
503	0.1
504	0.11
505	0.12
506	0.13
507	0.16
508	0.16
509	0.18
510	0.17
511	0.14
512	0.12
513	0.11
514	0.1
515	0.1
516	0.11
517	0.13
518	0.14
519	0.18
520	0.24
521	0.25
522	0.28
523	0.3
524	0.29
525	0.29
526	0.35
527	0.37
528	0.4
529	0.41
530	0.41
531	0.38
532	0.37
533	0.34
534	0.32
535	0.31
536	0.22
537	0.22
538	0.19
539	0.19
540	0.2
541	0.22
542	0.2
543	0.19
544	0.2
545	0.26
546	0.32
547	0.34
548	0.44
549	0.5
550	0.55
551	0.59
552	0.63
553	0.62
554	0.6
555	0.66
556	0.62
557	0.57
558	0.52
559	0.47
560	0.41
561	0.36
562	0.32
563	0.24
564	0.18
565	0.13
566	0.11
567	0.14
568	0.14
569	0.16
570	0.15
571	0.18
572	0.18
573	0.19
574	0.19
575	0.19
576	0.2
577	0.27
578	0.31

A0A5C3LHA6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer