Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3MKB2

Protein Details
Accession A0A5C3MKB2    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
230-252STSQPQPSEKKPPRKSRIPAGVIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-247KKPPRKSRI
266-282KKSERSTFGQGRRKKGG
305-316GGKSAVKGKKRK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013699  Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd  
IPR026270  SRP72  
IPR031545  SRP_TPR-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF08492  SRP72  
PF17004  SRP_TPR_like  
Amino Acid Sequences MTTKSKAAPLTTSKGKASARKATPKQPLPVPERLKRLFTSLCAQVDGGHFSNAIKTCDKILRLSPGDADALQTKLFLLLQTEQYTPALALIDEIETSNKGEHAFERAYSLYRMQHEDEAREVLKELKEGNGEEDRGVVHLEAQLNYREGGYEAAFELYNQLLDTAEPQSEEHTDILTNLQASQHHLEFITSGYLRALDALPTAVSSTLESNPPPAVSSPHAIPSASQVASTSQPQPSEKKPPRKSRIPAGVIPGVTPSPDPERWLKKSERSTFGQGRRKKGGAGGGATQGASVAEPSVSAVGGGGGKSAVKGKKRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.52
3 0.53
4 0.54
5 0.56
6 0.58
7 0.64
8 0.7
9 0.73
10 0.78
11 0.78
12 0.76
13 0.73
14 0.73
15 0.69
16 0.72
17 0.71
18 0.67
19 0.69
20 0.66
21 0.63
22 0.56
23 0.56
24 0.48
25 0.43
26 0.42
27 0.39
28 0.37
29 0.33
30 0.32
31 0.28
32 0.27
33 0.28
34 0.23
35 0.17
36 0.16
37 0.15
38 0.21
39 0.21
40 0.22
41 0.19
42 0.18
43 0.22
44 0.27
45 0.29
46 0.26
47 0.28
48 0.33
49 0.35
50 0.35
51 0.32
52 0.28
53 0.28
54 0.25
55 0.23
56 0.16
57 0.14
58 0.13
59 0.12
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.14
67 0.16
68 0.17
69 0.17
70 0.17
71 0.17
72 0.14
73 0.12
74 0.09
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.15
93 0.15
94 0.16
95 0.16
96 0.18
97 0.17
98 0.18
99 0.21
100 0.2
101 0.25
102 0.24
103 0.25
104 0.24
105 0.23
106 0.21
107 0.18
108 0.17
109 0.15
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.16
117 0.15
118 0.15
119 0.14
120 0.14
121 0.12
122 0.11
123 0.11
124 0.07
125 0.05
126 0.07
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.1
134 0.08
135 0.07
136 0.08
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.08
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.1
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.07
194 0.08
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.1
202 0.12
203 0.13
204 0.16
205 0.15
206 0.18
207 0.19
208 0.18
209 0.17
210 0.19
211 0.21
212 0.18
213 0.17
214 0.14
215 0.15
216 0.17
217 0.2
218 0.19
219 0.17
220 0.19
221 0.22
222 0.27
223 0.3
224 0.4
225 0.47
226 0.55
227 0.63
228 0.71
229 0.77
230 0.83
231 0.84
232 0.83
233 0.84
234 0.79
235 0.72
236 0.67
237 0.62
238 0.52
239 0.46
240 0.37
241 0.26
242 0.21
243 0.17
244 0.14
245 0.16
246 0.17
247 0.2
248 0.27
249 0.35
250 0.39
251 0.46
252 0.49
253 0.52
254 0.62
255 0.67
256 0.65
257 0.63
258 0.67
259 0.7
260 0.74
261 0.74
262 0.71
263 0.7
264 0.71
265 0.67
266 0.59
267 0.54
268 0.52
269 0.48
270 0.44
271 0.39
272 0.34
273 0.34
274 0.31
275 0.27
276 0.19
277 0.14
278 0.1
279 0.08
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.16
296 0.21