Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LVM2

Protein Details
Accession A0A5C3LVM2    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-124AENQKSLEEPPKKRRKRFGAVEAADHydrophilic
166-200EQVKKAKSTSNKKEEEKKKKKRAKDPDSRARRRTIBasic
546-569ELTQGWKKRCREAGKVSRRRGKGVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-116PKKRRKR
169-198KKAKSTSNKKEEEKKKKKRAKDPDSRARRR
553-567KRCREAGKVSRRRGK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13, nucl 12, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034138  NOP8_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12226  RRM_NOL8  
Amino Acid Sequences MTSDVRDDPITKRLHVSGLTPTISAEDINKRLSTFGTVRSVDGVGLLDGLGQPRKFGYVTIETTTGKLAKCMNLLSGSTWKGTKLRIGEAKADFAERIAAENQKSLEEPPKKRRKRFGAVEAADMSPITPENVGGKGGWKVTPMGRIVRPVRMRPEHPLPPMLQEEQVKKAKSTSNKKEEEKKKKKRAKDPDSRARRRTIDPTKWGSTHLKGIFLDVEASGTRKRLLEDKRMDESTNSSEGESEEESEKEGAPAPAPVATNTAFAPAPEVPPTRAPSPQTVHIAPVPSSAPPTTKSTALPDNNTDIALEKAQTFNLLYSLFGGKDDDDWVGRESVGSDVDEEELSKRVPMVMDEDDGDFEVVPMEDGGRRKKGYVMVAGKNGVEEDDEEEEDEMEVGDTLVKSSPEPVEGKVKGPITLRDLFAPREEEAGFSLLGHLDLDLELDEELPFTTETVPESAPIPAYTPSFSIPLPSSVPSTAPINLNLKQALFFPLPADSTAFNKNARPKDLFDLAKEGGWNWRDPAFGFYRTDTEEGIRKRWEEQRGELTQGWKKRCREAGKVSRRRGKGVDADAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.33
3 0.33
4 0.33
5 0.35
6 0.35
7 0.3
8 0.28
9 0.26
10 0.25
11 0.22
12 0.19
13 0.21
14 0.23
15 0.26
16 0.27
17 0.26
18 0.27
19 0.27
20 0.29
21 0.25
22 0.27
23 0.32
24 0.32
25 0.32
26 0.33
27 0.32
28 0.25
29 0.23
30 0.18
31 0.1
32 0.09
33 0.08
34 0.07
35 0.07
36 0.1
37 0.14
38 0.13
39 0.14
40 0.14
41 0.17
42 0.16
43 0.17
44 0.2
45 0.23
46 0.27
47 0.29
48 0.32
49 0.3
50 0.3
51 0.32
52 0.29
53 0.22
54 0.21
55 0.22
56 0.22
57 0.24
58 0.24
59 0.23
60 0.23
61 0.23
62 0.23
63 0.26
64 0.24
65 0.24
66 0.23
67 0.23
68 0.23
69 0.24
70 0.27
71 0.25
72 0.31
73 0.36
74 0.39
75 0.44
76 0.43
77 0.45
78 0.4
79 0.38
80 0.29
81 0.23
82 0.23
83 0.15
84 0.16
85 0.15
86 0.19
87 0.18
88 0.21
89 0.21
90 0.2
91 0.2
92 0.21
93 0.28
94 0.33
95 0.41
96 0.49
97 0.6
98 0.69
99 0.77
100 0.84
101 0.85
102 0.86
103 0.87
104 0.86
105 0.86
106 0.78
107 0.73
108 0.65
109 0.55
110 0.45
111 0.34
112 0.24
113 0.14
114 0.12
115 0.08
116 0.06
117 0.06
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.11
123 0.13
124 0.14
125 0.14
126 0.13
127 0.15
128 0.17
129 0.21
130 0.22
131 0.25
132 0.25
133 0.32
134 0.34
135 0.4
136 0.43
137 0.43
138 0.49
139 0.5
140 0.51
141 0.51
142 0.57
143 0.55
144 0.53
145 0.52
146 0.43
147 0.42
148 0.42
149 0.36
150 0.32
151 0.29
152 0.29
153 0.33
154 0.38
155 0.34
156 0.31
157 0.34
158 0.36
159 0.42
160 0.49
161 0.53
162 0.57
163 0.64
164 0.7
165 0.76
166 0.81
167 0.83
168 0.84
169 0.84
170 0.85
171 0.86
172 0.9
173 0.9
174 0.91
175 0.9
176 0.9
177 0.9
178 0.89
179 0.92
180 0.91
181 0.84
182 0.8
183 0.73
184 0.67
185 0.66
186 0.66
187 0.63
188 0.62
189 0.64
190 0.61
191 0.57
192 0.56
193 0.5
194 0.42
195 0.42
196 0.35
197 0.31
198 0.27
199 0.28
200 0.24
201 0.2
202 0.18
203 0.1
204 0.1
205 0.07
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.18
213 0.23
214 0.32
215 0.38
216 0.43
217 0.46
218 0.47
219 0.46
220 0.39
221 0.37
222 0.3
223 0.26
224 0.21
225 0.16
226 0.15
227 0.15
228 0.16
229 0.13
230 0.11
231 0.09
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.08
237 0.1
238 0.08
239 0.07
240 0.08
241 0.07
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.12
250 0.09
251 0.09
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.12
256 0.13
257 0.12
258 0.15
259 0.18
260 0.18
261 0.2
262 0.2
263 0.23
264 0.25
265 0.27
266 0.28
267 0.26
268 0.26
269 0.24
270 0.24
271 0.19
272 0.17
273 0.14
274 0.1
275 0.11
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.15
280 0.15
281 0.16
282 0.17
283 0.19
284 0.26
285 0.27
286 0.26
287 0.24
288 0.25
289 0.24
290 0.23
291 0.2
292 0.13
293 0.12
294 0.1
295 0.09
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.07
301 0.06
302 0.07
303 0.07
304 0.06
305 0.07
306 0.08
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.06
311 0.07
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.11
345 0.07
346 0.06
347 0.05
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.07
353 0.1
354 0.14
355 0.18
356 0.18
357 0.19
358 0.22
359 0.26
360 0.27
361 0.33
362 0.37
363 0.36
364 0.38
365 0.39
366 0.35
367 0.31
368 0.27
369 0.18
370 0.12
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.09
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.09
379 0.09
380 0.06
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.05
385 0.04
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.09
391 0.1
392 0.12
393 0.14
394 0.15
395 0.22
396 0.23
397 0.25
398 0.27
399 0.27
400 0.27
401 0.28
402 0.29
403 0.27
404 0.29
405 0.28
406 0.27
407 0.29
408 0.27
409 0.27
410 0.27
411 0.22
412 0.21
413 0.2
414 0.17
415 0.16
416 0.16
417 0.13
418 0.1
419 0.1
420 0.08
421 0.08
422 0.07
423 0.06
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.04
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.07
438 0.07
439 0.08
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.11
444 0.11
445 0.12
446 0.11
447 0.12
448 0.12
449 0.13
450 0.13
451 0.13
452 0.14
453 0.15
454 0.14
455 0.16
456 0.16
457 0.17
458 0.18
459 0.18
460 0.19
461 0.18
462 0.2
463 0.18
464 0.19
465 0.19
466 0.19
467 0.22
468 0.24
469 0.26
470 0.29
471 0.28
472 0.26
473 0.24
474 0.23
475 0.24
476 0.2
477 0.17
478 0.15
479 0.16
480 0.16
481 0.16
482 0.17
483 0.13
484 0.16
485 0.2
486 0.22
487 0.22
488 0.27
489 0.35
490 0.4
491 0.44
492 0.45
493 0.44
494 0.48
495 0.55
496 0.52
497 0.46
498 0.46
499 0.41
500 0.38
501 0.35
502 0.29
503 0.27
504 0.27
505 0.26
506 0.22
507 0.23
508 0.22
509 0.23
510 0.28
511 0.25
512 0.26
513 0.28
514 0.27
515 0.29
516 0.31
517 0.31
518 0.27
519 0.26
520 0.3
521 0.31
522 0.35
523 0.36
524 0.34
525 0.39
526 0.46
527 0.52
528 0.5
529 0.53
530 0.58
531 0.57
532 0.61
533 0.58
534 0.57
535 0.55
536 0.57
537 0.58
538 0.57
539 0.57
540 0.61
541 0.67
542 0.68
543 0.71
544 0.74
545 0.77
546 0.8
547 0.86
548 0.88
549 0.88
550 0.83
551 0.8
552 0.73
553 0.7
554 0.68