Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3MMY0

Protein Details
Accession A0A5C3MMY0    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-71EEKLEKIKGKKIQHKSRGKRGREAIKIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-68EKIKGKKIQHKSRGKRGREA
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 11, cyto_mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MPKVSLSSLPISGLFGVVKPSGPTSMSIIHDLQQLVARSKLFADEEKLEKIKGKKIQHKSRGKRGREAIKIGQGGTLDPLADGVLVIGVGKGTKKLSDFLNCTKEYSTTCLLGCETDTYDSEGSRMRVAPWRHVTREKVEAALAQFTGEIMQTPPIFSALKMDGMPLYDYARKGIPLPRPIEPRKVVIHSLELVEWKGTDHSFSWPTKIFSDEDKKAVETALHGAGEDISLKDEPETEAADETPAAFVLKMKVSGGTYVRSIVHDLAHAVGSAGHVVTLTRSRQGRFVFEPTEEGDRACVPWEVFEKGLKDSEDVDEDGWKEWEREVIDRLEIVDGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.1
3 0.13
4 0.12
5 0.13
6 0.13
7 0.14
8 0.15
9 0.15
10 0.16
11 0.17
12 0.22
13 0.23
14 0.25
15 0.25
16 0.25
17 0.28
18 0.26
19 0.24
20 0.23
21 0.23
22 0.22
23 0.24
24 0.22
25 0.19
26 0.19
27 0.21
28 0.19
29 0.19
30 0.22
31 0.25
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.35
37 0.37
38 0.39
39 0.43
40 0.49
41 0.54
42 0.64
43 0.74
44 0.78
45 0.85
46 0.87
47 0.9
48 0.9
49 0.86
50 0.84
51 0.82
52 0.82
53 0.78
54 0.75
55 0.7
56 0.67
57 0.63
58 0.54
59 0.46
60 0.36
61 0.29
62 0.23
63 0.18
64 0.1
65 0.08
66 0.08
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.03
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.04
78 0.06
79 0.06
80 0.08
81 0.1
82 0.12
83 0.17
84 0.23
85 0.28
86 0.34
87 0.4
88 0.39
89 0.39
90 0.38
91 0.35
92 0.3
93 0.29
94 0.25
95 0.19
96 0.19
97 0.18
98 0.18
99 0.16
100 0.15
101 0.12
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.19
115 0.2
116 0.28
117 0.34
118 0.39
119 0.41
120 0.46
121 0.48
122 0.45
123 0.49
124 0.42
125 0.34
126 0.29
127 0.26
128 0.22
129 0.2
130 0.15
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.1
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.07
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.12
161 0.17
162 0.21
163 0.25
164 0.28
165 0.31
166 0.39
167 0.41
168 0.47
169 0.43
170 0.41
171 0.38
172 0.38
173 0.34
174 0.28
175 0.27
176 0.2
177 0.19
178 0.16
179 0.14
180 0.11
181 0.1
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.11
189 0.15
190 0.16
191 0.19
192 0.2
193 0.22
194 0.21
195 0.22
196 0.2
197 0.22
198 0.3
199 0.29
200 0.29
201 0.28
202 0.28
203 0.26
204 0.25
205 0.19
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.06
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.12
241 0.15
242 0.16
243 0.15
244 0.15
245 0.17
246 0.17
247 0.16
248 0.18
249 0.15
250 0.14
251 0.13
252 0.13
253 0.12
254 0.11
255 0.1
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.05
262 0.04
263 0.05
264 0.07
265 0.11
266 0.12
267 0.18
268 0.21
269 0.23
270 0.29
271 0.32
272 0.36
273 0.36
274 0.41
275 0.38
276 0.36
277 0.37
278 0.33
279 0.36
280 0.3
281 0.25
282 0.21
283 0.19
284 0.18
285 0.18
286 0.17
287 0.12
288 0.16
289 0.19
290 0.21
291 0.21
292 0.24
293 0.25
294 0.25
295 0.29
296 0.25
297 0.23
298 0.23
299 0.24
300 0.24
301 0.23
302 0.21
303 0.2
304 0.2
305 0.21
306 0.21
307 0.19
308 0.17
309 0.16
310 0.21
311 0.2
312 0.23
313 0.25
314 0.25
315 0.25
316 0.25
317 0.25
318 0.24