Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FZ13

Protein Details
Accession C5FZ13    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-41GEISRLSRSPKRPRHGSNDKVRLEHydrophilic
215-239PPLYENPTHRQKRKHGKQVGHQHDIBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MPLVQYSDTESEESGRDGEISRLSRSPKRPRHGSNDKVRLEADGQDHAALPPLPNEFRDLYSTSVRVSVQDDPSLHNGRTRAVPHVVGNWPTHIYLEWYPNNSELGVLSEVIKRCERSALDGMSIHSLLYSDLGAQLPLHISLSRPVVLLTEQRESFLNLFHESIYKSKIQPLDWVSNFEHTRWFLVLRLNCPKNDGLNRLLRLSNTTLAHFSQPPLYENPTHRQKRKHGKQVGHQHDISPYSGPGDTDYTDCFHISIAWTLKEPGARDKERLLSIDFQPHKLNFKFNNVKVKVGNQIHSEALLTSTMDEDGFEGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.12
4 0.12
5 0.15
6 0.19
7 0.2
8 0.23
9 0.26
10 0.32
11 0.4
12 0.48
13 0.57
14 0.61
15 0.68
16 0.75
17 0.79
18 0.84
19 0.86
20 0.86
21 0.86
22 0.86
23 0.79
24 0.71
25 0.63
26 0.55
27 0.46
28 0.41
29 0.32
30 0.25
31 0.24
32 0.22
33 0.22
34 0.19
35 0.2
36 0.16
37 0.13
38 0.13
39 0.16
40 0.16
41 0.16
42 0.2
43 0.19
44 0.2
45 0.23
46 0.22
47 0.22
48 0.25
49 0.25
50 0.22
51 0.22
52 0.21
53 0.18
54 0.2
55 0.22
56 0.21
57 0.24
58 0.24
59 0.24
60 0.31
61 0.33
62 0.3
63 0.27
64 0.26
65 0.24
66 0.28
67 0.27
68 0.25
69 0.24
70 0.26
71 0.24
72 0.29
73 0.3
74 0.28
75 0.27
76 0.24
77 0.23
78 0.21
79 0.2
80 0.15
81 0.16
82 0.15
83 0.21
84 0.22
85 0.23
86 0.24
87 0.24
88 0.24
89 0.2
90 0.18
91 0.11
92 0.11
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.12
97 0.13
98 0.16
99 0.17
100 0.15
101 0.15
102 0.19
103 0.18
104 0.2
105 0.24
106 0.23
107 0.23
108 0.23
109 0.23
110 0.2
111 0.2
112 0.14
113 0.09
114 0.08
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.07
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.12
137 0.12
138 0.14
139 0.14
140 0.14
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.14
145 0.13
146 0.1
147 0.11
148 0.1
149 0.11
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.13
154 0.12
155 0.16
156 0.18
157 0.18
158 0.22
159 0.25
160 0.31
161 0.29
162 0.33
163 0.3
164 0.33
165 0.33
166 0.28
167 0.26
168 0.19
169 0.2
170 0.16
171 0.16
172 0.12
173 0.18
174 0.2
175 0.22
176 0.31
177 0.32
178 0.31
179 0.33
180 0.32
181 0.32
182 0.34
183 0.33
184 0.29
185 0.33
186 0.35
187 0.34
188 0.34
189 0.28
190 0.27
191 0.26
192 0.26
193 0.2
194 0.2
195 0.19
196 0.2
197 0.22
198 0.2
199 0.18
200 0.17
201 0.17
202 0.18
203 0.19
204 0.22
205 0.24
206 0.27
207 0.35
208 0.41
209 0.49
210 0.53
211 0.58
212 0.65
213 0.72
214 0.79
215 0.81
216 0.79
217 0.79
218 0.82
219 0.86
220 0.84
221 0.79
222 0.69
223 0.6
224 0.54
225 0.48
226 0.39
227 0.29
228 0.2
229 0.15
230 0.15
231 0.14
232 0.13
233 0.13
234 0.13
235 0.13
236 0.14
237 0.14
238 0.15
239 0.15
240 0.13
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.15
245 0.16
246 0.16
247 0.17
248 0.18
249 0.2
250 0.22
251 0.22
252 0.25
253 0.32
254 0.34
255 0.35
256 0.39
257 0.43
258 0.43
259 0.43
260 0.38
261 0.34
262 0.35
263 0.42
264 0.4
265 0.37
266 0.4
267 0.4
268 0.44
269 0.41
270 0.46
271 0.4
272 0.49
273 0.56
274 0.57
275 0.65
276 0.6
277 0.63
278 0.57
279 0.57
280 0.56
281 0.52
282 0.51
283 0.43
284 0.44
285 0.4
286 0.37
287 0.34
288 0.24
289 0.19
290 0.15
291 0.12
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.08