Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LTA1

Protein Details
Accession A0A5C3LTA1    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-119LSERAQLEKERRERQKRLRKQAGLDDDEHydrophilic
452-472EDWLDKPKKQREKASYPPIKVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-110RRERQKRLR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 7, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
IPR003903  UIM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
PF02809  UIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50330  UIM  
CDD cd09122  PLDc_Tdp1_1  
cd09123  PLDc_Tdp1_2  
Amino Acid Sequences MDPNEDDDLARAIALSLQDAQRKTEVITIDDSDEESDDDARFQAELKRALEASRAEEVRKPEASTSKPQVPPLPKPQPAEILQSQHPASVFLSERAQLEKERRERQKRLRKQAGLDDDEDQPKSNANGADDDEDDIDKPPAKRQHFSSSSNSRTAYADKRGVSSSGTASSSKPTREQLFWDGECRQTAAMHAEPRKDGKPTFRLTDILGKTSDIAFAIMSSYALDFPWIYQFFDPSVPVIMVAQPDATGAASVKNVLPNWIKTTPPLRGGFGCQHMKFMLLFHKTGRLRVVISTANLIAYDWRDMENTVWLQDVPLRASPTRADPKVTDDFPAVLTYVLGSLNIRPALSSMIMDNHPDLAIKSIEEIRTHWDWSKVKAHLVPSIAGKHEGWPAVIKTGHPRLMMVVRKLGLRTGKGVSKKQVVLECQGSSIGIYTTQWMNEFHYSARGESAEDWLDKPKKQREKASYPPIKVVFPTLATVRANANGESGGGTIFCRRRQWSAKNFPKDHFYDSKSKAGPVLMHSKMIIATKQDLSSNSEGHDSDTEDDSDDDEIQVIDPAIGWAYVGSHNFTPSAWGTLSGSSFNPILNISNYEVGVVFPLKDEEAANQFACFERPPKKYASGRDEPWIQEESVYHQPDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.13
4 0.17
5 0.23
6 0.23
7 0.26
8 0.26
9 0.27
10 0.27
11 0.27
12 0.25
13 0.22
14 0.25
15 0.24
16 0.24
17 0.23
18 0.23
19 0.19
20 0.17
21 0.15
22 0.13
23 0.12
24 0.11
25 0.11
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.11
30 0.16
31 0.21
32 0.26
33 0.26
34 0.29
35 0.29
36 0.3
37 0.34
38 0.3
39 0.28
40 0.3
41 0.31
42 0.29
43 0.33
44 0.37
45 0.38
46 0.38
47 0.35
48 0.33
49 0.39
50 0.42
51 0.47
52 0.5
53 0.54
54 0.55
55 0.57
56 0.6
57 0.6
58 0.63
59 0.65
60 0.67
61 0.64
62 0.64
63 0.64
64 0.62
65 0.58
66 0.57
67 0.51
68 0.46
69 0.43
70 0.44
71 0.4
72 0.35
73 0.32
74 0.26
75 0.22
76 0.21
77 0.2
78 0.17
79 0.19
80 0.19
81 0.21
82 0.22
83 0.23
84 0.23
85 0.29
86 0.37
87 0.44
88 0.52
89 0.61
90 0.69
91 0.77
92 0.84
93 0.87
94 0.89
95 0.91
96 0.92
97 0.88
98 0.84
99 0.84
100 0.82
101 0.75
102 0.66
103 0.58
104 0.52
105 0.48
106 0.42
107 0.33
108 0.24
109 0.22
110 0.2
111 0.22
112 0.18
113 0.17
114 0.19
115 0.19
116 0.21
117 0.2
118 0.2
119 0.17
120 0.16
121 0.15
122 0.13
123 0.13
124 0.15
125 0.15
126 0.22
127 0.29
128 0.34
129 0.37
130 0.42
131 0.51
132 0.53
133 0.58
134 0.6
135 0.61
136 0.61
137 0.6
138 0.55
139 0.46
140 0.41
141 0.41
142 0.38
143 0.35
144 0.36
145 0.33
146 0.34
147 0.34
148 0.33
149 0.29
150 0.25
151 0.2
152 0.17
153 0.18
154 0.17
155 0.16
156 0.21
157 0.24
158 0.24
159 0.25
160 0.27
161 0.3
162 0.31
163 0.35
164 0.35
165 0.38
166 0.37
167 0.38
168 0.34
169 0.32
170 0.31
171 0.27
172 0.21
173 0.14
174 0.15
175 0.16
176 0.18
177 0.22
178 0.25
179 0.26
180 0.28
181 0.32
182 0.32
183 0.31
184 0.3
185 0.31
186 0.36
187 0.38
188 0.4
189 0.38
190 0.37
191 0.36
192 0.42
193 0.35
194 0.3
195 0.26
196 0.22
197 0.21
198 0.2
199 0.18
200 0.09
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.11
215 0.11
216 0.12
217 0.12
218 0.13
219 0.14
220 0.15
221 0.15
222 0.09
223 0.1
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.08
242 0.09
243 0.12
244 0.15
245 0.15
246 0.21
247 0.22
248 0.21
249 0.22
250 0.26
251 0.25
252 0.29
253 0.29
254 0.25
255 0.24
256 0.28
257 0.28
258 0.3
259 0.33
260 0.27
261 0.27
262 0.26
263 0.25
264 0.22
265 0.2
266 0.2
267 0.16
268 0.17
269 0.16
270 0.24
271 0.24
272 0.25
273 0.25
274 0.2
275 0.19
276 0.19
277 0.21
278 0.14
279 0.14
280 0.14
281 0.12
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.07
286 0.06
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.1
301 0.08
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.13
306 0.13
307 0.18
308 0.24
309 0.23
310 0.23
311 0.22
312 0.28
313 0.31
314 0.3
315 0.25
316 0.19
317 0.19
318 0.17
319 0.17
320 0.11
321 0.07
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.06
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.06
349 0.08
350 0.1
351 0.11
352 0.11
353 0.12
354 0.15
355 0.16
356 0.18
357 0.18
358 0.23
359 0.23
360 0.27
361 0.33
362 0.29
363 0.31
364 0.32
365 0.32
366 0.29
367 0.29
368 0.26
369 0.21
370 0.22
371 0.2
372 0.19
373 0.17
374 0.16
375 0.17
376 0.16
377 0.14
378 0.13
379 0.13
380 0.15
381 0.15
382 0.14
383 0.17
384 0.22
385 0.25
386 0.23
387 0.23
388 0.22
389 0.29
390 0.32
391 0.28
392 0.25
393 0.23
394 0.24
395 0.24
396 0.25
397 0.21
398 0.18
399 0.2
400 0.2
401 0.24
402 0.28
403 0.32
404 0.34
405 0.37
406 0.38
407 0.39
408 0.39
409 0.37
410 0.36
411 0.35
412 0.3
413 0.25
414 0.23
415 0.19
416 0.14
417 0.13
418 0.08
419 0.05
420 0.05
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.09
425 0.1
426 0.13
427 0.14
428 0.15
429 0.13
430 0.18
431 0.18
432 0.17
433 0.18
434 0.15
435 0.14
436 0.14
437 0.17
438 0.14
439 0.14
440 0.14
441 0.21
442 0.24
443 0.26
444 0.34
445 0.4
446 0.48
447 0.54
448 0.63
449 0.65
450 0.71
451 0.78
452 0.82
453 0.81
454 0.73
455 0.72
456 0.64
457 0.56
458 0.47
459 0.39
460 0.3
461 0.22
462 0.22
463 0.16
464 0.18
465 0.17
466 0.18
467 0.16
468 0.18
469 0.18
470 0.16
471 0.16
472 0.12
473 0.12
474 0.12
475 0.1
476 0.07
477 0.06
478 0.06
479 0.12
480 0.16
481 0.18
482 0.23
483 0.26
484 0.34
485 0.43
486 0.53
487 0.57
488 0.65
489 0.73
490 0.78
491 0.79
492 0.74
493 0.72
494 0.65
495 0.61
496 0.57
497 0.51
498 0.51
499 0.51
500 0.57
501 0.5
502 0.48
503 0.43
504 0.38
505 0.36
506 0.31
507 0.35
508 0.28
509 0.28
510 0.27
511 0.26
512 0.26
513 0.25
514 0.22
515 0.16
516 0.19
517 0.2
518 0.22
519 0.23
520 0.23
521 0.27
522 0.28
523 0.26
524 0.23
525 0.24
526 0.22
527 0.23
528 0.23
529 0.18
530 0.18
531 0.19
532 0.18
533 0.17
534 0.17
535 0.15
536 0.15
537 0.13
538 0.11
539 0.09
540 0.09
541 0.08
542 0.09
543 0.08
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.05
549 0.05
550 0.04
551 0.06
552 0.09
553 0.1
554 0.12
555 0.13
556 0.14
557 0.15
558 0.14
559 0.17
560 0.15
561 0.17
562 0.15
563 0.16
564 0.16
565 0.18
566 0.2
567 0.17
568 0.17
569 0.16
570 0.16
571 0.14
572 0.14
573 0.13
574 0.14
575 0.14
576 0.17
577 0.17
578 0.19
579 0.19
580 0.19
581 0.18
582 0.15
583 0.15
584 0.13
585 0.11
586 0.09
587 0.11
588 0.11
589 0.12
590 0.12
591 0.14
592 0.17
593 0.21
594 0.2
595 0.19
596 0.19
597 0.19
598 0.2
599 0.19
600 0.22
601 0.28
602 0.32
603 0.35
604 0.4
605 0.49
606 0.54
607 0.62
608 0.65
609 0.64
610 0.64
611 0.68
612 0.68
613 0.61
614 0.57
615 0.5
616 0.4
617 0.33
618 0.3
619 0.29
620 0.32