Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LIM4

Protein Details
Accession A0A5C3LIM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
291-316VRPERKLRKAVEKRRADPKRGKHFEGBasic
318-338ILTRRESRTRRIITRNGRLSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
293-329PERKLRKAVEKRRADPKRGKHFEGAILTRRESRTRRI
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 15, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR006016  UspA  
Pfam View protein in Pfam  
PF00582  Usp  
CDD cd00293  USP_Like  
Amino Acid Sequences MYTDDTAHTHQPLPPAPLRSAMKQTSPVTSPATSPFISRVPLPGASLTTSPTSSTAPLPSTPPSGLLSPYSIYSPTPSHAASALSTPYPATASSVNSSTSVNITGNHDHHHVRNLSPTPGYTPKVSFDTFENPMASMFSFTLQVKSEGYRRTRNTRVFLCATSPDESGREALDWCLESLVQDGDELIVFRGIDEEVFEKDHNVVREEARDLMRTIQEKSVEYDSERKLSLVLEYIPGKITDTLDRLIALYRPDSVVVGTRGRKTWQAIGVIGMGSVSKYCLSHSPVPVIVVRPERKLRKAVEKRRADPKRGKHFEGAILTRRESRTRRIITRNGRLSIHRQTPNSRRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.4
3 0.38
4 0.44
5 0.45
6 0.44
7 0.48
8 0.45
9 0.44
10 0.47
11 0.48
12 0.45
13 0.43
14 0.41
15 0.37
16 0.35
17 0.33
18 0.29
19 0.32
20 0.27
21 0.26
22 0.26
23 0.24
24 0.24
25 0.23
26 0.22
27 0.21
28 0.22
29 0.22
30 0.2
31 0.19
32 0.2
33 0.2
34 0.18
35 0.17
36 0.16
37 0.15
38 0.16
39 0.16
40 0.15
41 0.17
42 0.18
43 0.18
44 0.19
45 0.21
46 0.22
47 0.24
48 0.22
49 0.22
50 0.21
51 0.2
52 0.2
53 0.19
54 0.18
55 0.15
56 0.16
57 0.15
58 0.13
59 0.13
60 0.14
61 0.14
62 0.14
63 0.16
64 0.15
65 0.15
66 0.16
67 0.16
68 0.14
69 0.14
70 0.14
71 0.12
72 0.12
73 0.11
74 0.1
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.11
80 0.13
81 0.14
82 0.15
83 0.15
84 0.15
85 0.14
86 0.13
87 0.12
88 0.11
89 0.11
90 0.14
91 0.18
92 0.18
93 0.2
94 0.22
95 0.22
96 0.23
97 0.28
98 0.26
99 0.23
100 0.29
101 0.29
102 0.28
103 0.27
104 0.26
105 0.24
106 0.28
107 0.29
108 0.23
109 0.22
110 0.23
111 0.26
112 0.25
113 0.21
114 0.2
115 0.23
116 0.23
117 0.24
118 0.22
119 0.18
120 0.18
121 0.17
122 0.14
123 0.1
124 0.08
125 0.07
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.13
133 0.17
134 0.21
135 0.25
136 0.31
137 0.35
138 0.42
139 0.49
140 0.53
141 0.54
142 0.51
143 0.52
144 0.46
145 0.42
146 0.37
147 0.31
148 0.27
149 0.24
150 0.21
151 0.16
152 0.14
153 0.14
154 0.13
155 0.11
156 0.09
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.09
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.14
191 0.13
192 0.15
193 0.16
194 0.18
195 0.16
196 0.17
197 0.16
198 0.16
199 0.19
200 0.19
201 0.2
202 0.19
203 0.2
204 0.2
205 0.22
206 0.22
207 0.19
208 0.2
209 0.25
210 0.24
211 0.24
212 0.23
213 0.2
214 0.18
215 0.18
216 0.17
217 0.12
218 0.11
219 0.12
220 0.12
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.13
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.14
232 0.13
233 0.13
234 0.13
235 0.12
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.12
243 0.13
244 0.18
245 0.21
246 0.23
247 0.25
248 0.26
249 0.3
250 0.29
251 0.33
252 0.31
253 0.3
254 0.28
255 0.28
256 0.27
257 0.23
258 0.19
259 0.13
260 0.09
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.08
267 0.12
268 0.19
269 0.25
270 0.28
271 0.31
272 0.31
273 0.33
274 0.33
275 0.31
276 0.3
277 0.32
278 0.33
279 0.36
280 0.44
281 0.49
282 0.52
283 0.57
284 0.59
285 0.61
286 0.69
287 0.74
288 0.75
289 0.78
290 0.8
291 0.84
292 0.85
293 0.83
294 0.82
295 0.82
296 0.83
297 0.81
298 0.79
299 0.74
300 0.7
301 0.67
302 0.66
303 0.61
304 0.57
305 0.53
306 0.5
307 0.5
308 0.49
309 0.5
310 0.47
311 0.5
312 0.53
313 0.58
314 0.65
315 0.68
316 0.75
317 0.77
318 0.83
319 0.83
320 0.77
321 0.71
322 0.67
323 0.66
324 0.65
325 0.64
326 0.61
327 0.58
328 0.64