Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3M4N1

Protein Details
Accession A0A5C3M4N1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-83VSGCFTFFKSHKKRSRKLKRVKQEQATGMSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-75SHKKRSRKLKRVK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001810  F-box_dom  
IPR032675  LRR_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF12937  F-box-like  
Amino Acid Sequences MDHELITHDELQYWLRDFRTLMDTDLIRIKHSIQRQEQVLYHLSIDLDAYTNSVSGCFTFFKSHKKRSRKLKRVKQEQATGMSSKKQLQSLLAPIRRLPPELLSEIFLHCVQPCDQFVKPSPKEAPMLLGQICASWRTLALSTPRLWSSLELCRTWSSFNGKSSVHDAAALMKLWLERSGQRPLSISIRDDLLEDPTVRELFIRVTPRWQHILIDVPRSVTSPLFSPHEHASQLESVTVRSSKGLEPAQVENMSLTLLAAQRLQYFNWDNSELESTPINMAWSALTHVTLNAAISVEQCMYILQDSPNLVDASFQCISAPSESMCPLMPSIVLPKLKSLVLGGGYDISPILDFITLPNLLELVLNVREWPQDALCRFFRRSRCPLMSFNLYFPSFTESDFIECLELLSASLKEFTVQMDPLGPSILTDDVLDRLTYKEEEEKNCLCPALDVIAAYDCISCTDNRFSKMVESRVRAPVTLNDNGTFVSPVKVIELYEKERELVKELKELRREGLILKIYSEVDGQPIDMDPEDVRQLQALRDSGLILRVYDPTSGLFGQVMD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.21
4 0.21
5 0.24
6 0.28
7 0.25
8 0.25
9 0.27
10 0.26
11 0.27
12 0.33
13 0.29
14 0.25
15 0.25
16 0.27
17 0.28
18 0.36
19 0.43
20 0.44
21 0.51
22 0.53
23 0.57
24 0.55
25 0.53
26 0.49
27 0.4
28 0.33
29 0.27
30 0.23
31 0.18
32 0.17
33 0.12
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.07
43 0.1
44 0.11
45 0.13
46 0.2
47 0.23
48 0.34
49 0.43
50 0.53
51 0.61
52 0.7
53 0.77
54 0.81
55 0.9
56 0.9
57 0.91
58 0.92
59 0.93
60 0.93
61 0.95
62 0.92
63 0.9
64 0.85
65 0.79
66 0.72
67 0.64
68 0.55
69 0.49
70 0.43
71 0.4
72 0.38
73 0.34
74 0.32
75 0.32
76 0.34
77 0.39
78 0.45
79 0.43
80 0.41
81 0.4
82 0.45
83 0.44
84 0.41
85 0.34
86 0.27
87 0.28
88 0.3
89 0.29
90 0.25
91 0.24
92 0.23
93 0.23
94 0.2
95 0.16
96 0.14
97 0.15
98 0.14
99 0.17
100 0.18
101 0.2
102 0.21
103 0.24
104 0.31
105 0.39
106 0.39
107 0.42
108 0.43
109 0.42
110 0.43
111 0.39
112 0.36
113 0.28
114 0.31
115 0.24
116 0.22
117 0.18
118 0.17
119 0.17
120 0.13
121 0.12
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.1
126 0.13
127 0.17
128 0.2
129 0.21
130 0.24
131 0.25
132 0.23
133 0.23
134 0.22
135 0.21
136 0.25
137 0.27
138 0.24
139 0.26
140 0.27
141 0.27
142 0.27
143 0.27
144 0.26
145 0.27
146 0.28
147 0.3
148 0.29
149 0.3
150 0.32
151 0.3
152 0.23
153 0.19
154 0.17
155 0.16
156 0.17
157 0.15
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.1
164 0.12
165 0.16
166 0.24
167 0.25
168 0.25
169 0.26
170 0.27
171 0.31
172 0.29
173 0.26
174 0.19
175 0.19
176 0.19
177 0.18
178 0.16
179 0.13
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.09
188 0.09
189 0.13
190 0.17
191 0.16
192 0.23
193 0.26
194 0.3
195 0.32
196 0.31
197 0.27
198 0.24
199 0.32
200 0.28
201 0.29
202 0.26
203 0.23
204 0.23
205 0.23
206 0.23
207 0.14
208 0.12
209 0.1
210 0.12
211 0.13
212 0.13
213 0.16
214 0.18
215 0.19
216 0.19
217 0.18
218 0.18
219 0.16
220 0.16
221 0.14
222 0.11
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.09
227 0.08
228 0.1
229 0.1
230 0.14
231 0.15
232 0.16
233 0.18
234 0.19
235 0.21
236 0.2
237 0.19
238 0.14
239 0.13
240 0.1
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.12
252 0.14
253 0.14
254 0.16
255 0.17
256 0.15
257 0.15
258 0.18
259 0.14
260 0.13
261 0.12
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.05
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.13
300 0.13
301 0.13
302 0.11
303 0.12
304 0.13
305 0.12
306 0.12
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.08
318 0.12
319 0.14
320 0.13
321 0.14
322 0.16
323 0.16
324 0.16
325 0.13
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.03
339 0.04
340 0.04
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.09
356 0.11
357 0.09
358 0.14
359 0.15
360 0.2
361 0.23
362 0.28
363 0.3
364 0.35
365 0.41
366 0.44
367 0.5
368 0.54
369 0.56
370 0.56
371 0.57
372 0.57
373 0.58
374 0.51
375 0.45
376 0.41
377 0.35
378 0.3
379 0.27
380 0.26
381 0.18
382 0.17
383 0.17
384 0.12
385 0.14
386 0.14
387 0.13
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.07
392 0.06
393 0.05
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.09
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.12
406 0.12
407 0.12
408 0.12
409 0.11
410 0.08
411 0.09
412 0.09
413 0.07
414 0.07
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.09
419 0.08
420 0.09
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.19
425 0.25
426 0.29
427 0.35
428 0.36
429 0.36
430 0.37
431 0.35
432 0.27
433 0.22
434 0.2
435 0.15
436 0.14
437 0.11
438 0.11
439 0.11
440 0.11
441 0.11
442 0.1
443 0.07
444 0.08
445 0.09
446 0.09
447 0.12
448 0.21
449 0.24
450 0.27
451 0.28
452 0.28
453 0.34
454 0.4
455 0.45
456 0.44
457 0.44
458 0.47
459 0.54
460 0.54
461 0.46
462 0.42
463 0.4
464 0.39
465 0.39
466 0.36
467 0.29
468 0.28
469 0.28
470 0.27
471 0.22
472 0.16
473 0.14
474 0.12
475 0.11
476 0.12
477 0.13
478 0.12
479 0.17
480 0.22
481 0.25
482 0.29
483 0.3
484 0.29
485 0.32
486 0.33
487 0.31
488 0.32
489 0.29
490 0.33
491 0.4
492 0.47
493 0.5
494 0.5
495 0.47
496 0.45
497 0.44
498 0.37
499 0.38
500 0.36
501 0.3
502 0.3
503 0.3
504 0.26
505 0.26
506 0.26
507 0.18
508 0.15
509 0.14
510 0.13
511 0.12
512 0.12
513 0.13
514 0.11
515 0.12
516 0.1
517 0.13
518 0.16
519 0.16
520 0.16
521 0.17
522 0.18
523 0.19
524 0.23
525 0.22
526 0.2
527 0.2
528 0.21
529 0.19
530 0.22
531 0.21
532 0.16
533 0.17
534 0.18
535 0.18
536 0.18
537 0.17
538 0.14
539 0.17
540 0.16
541 0.16