Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LYC7

Protein Details
Accession A0A5C3LYC7    Localization Confidence Low Confidence Score 7.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
587-606TEEKESGKKRDRERDREQAABasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11.5, cyto_mito 9.5, nucl 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10367  Vps39_2  
Amino Acid Sequences MSRHTFPRSSVLILGPNSIQSLLPSTLISQVEALINQHRLTDAAEVVDQRRRKLEGGLVVDPDEADELRYAYQLIGFQCFTETLFEDAGKHLFNGELDPRVLIGYYPELRGGLFSKDDQLDVYAGVIERMPPEASVDDVICINLVRNYSPHMSPNTRSAPPTAELRRILAMAAEDMLEAFLRKWRIRQSLESGSVNGATRHPPDPVTDTVLAKLYALHEKTTDLYALLNSPHSIIISEVEAAFRKAGQYNALCILYRQTNNDTKLLDTWAKLIEGSWSDPDIPNPLADMIALLTKKGDRALTRQWGIWLTKRDPDRGLQLLMPKETTGGKRRERERPEDDVALLAEIEQANPEAGQRYLEWLVLQRRSSSKDLHTRLALSCIEQLLDSLSDESVLKLWRAKASSYSSSPSTSAQSPSIASPSAVSPPPSGASPSPTSFLSYLASTTPDSPAKRTRLKTILFLAGSTLYNPLPIRKKLKAAGREKVLGLEEAILEGKIGNHREALFLLVHNLHDSSSAEAYCSLGGSVVPPKVALNVAENCALDTWGSLFASTTGKKGAATGKVERQASISEELKKELLKVLLEVYMTEEKESGKKRDRERDREQAARLLNAQAVNLDVIDVIELVPEKWPLRAMTSFLERSFRRTLHTKQEGKIVKHISAGQNLEVKDRIYPIIREEGAIVEEYVESDDEESRNMLDEKPALAEKVVLHLTTQSQAYVTDIPPKPPSHDDEDVEAGSSLPREVILGRDEKLSEVHGYEVDADSDLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.27
3 0.25
4 0.23
5 0.21
6 0.17
7 0.12
8 0.16
9 0.15
10 0.15
11 0.15
12 0.15
13 0.2
14 0.2
15 0.2
16 0.15
17 0.16
18 0.16
19 0.16
20 0.17
21 0.17
22 0.19
23 0.19
24 0.19
25 0.18
26 0.17
27 0.18
28 0.19
29 0.15
30 0.13
31 0.15
32 0.18
33 0.21
34 0.27
35 0.28
36 0.28
37 0.32
38 0.33
39 0.33
40 0.35
41 0.38
42 0.39
43 0.43
44 0.44
45 0.41
46 0.39
47 0.37
48 0.32
49 0.25
50 0.18
51 0.12
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.1
60 0.13
61 0.14
62 0.16
63 0.16
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.15
68 0.15
69 0.15
70 0.14
71 0.15
72 0.15
73 0.15
74 0.16
75 0.17
76 0.15
77 0.13
78 0.12
79 0.11
80 0.12
81 0.14
82 0.16
83 0.17
84 0.17
85 0.17
86 0.16
87 0.16
88 0.15
89 0.11
90 0.11
91 0.14
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.16
96 0.16
97 0.18
98 0.18
99 0.14
100 0.14
101 0.15
102 0.19
103 0.2
104 0.2
105 0.19
106 0.18
107 0.16
108 0.14
109 0.13
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.1
117 0.1
118 0.08
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.14
135 0.17
136 0.19
137 0.23
138 0.27
139 0.31
140 0.33
141 0.4
142 0.42
143 0.41
144 0.4
145 0.38
146 0.35
147 0.33
148 0.39
149 0.35
150 0.35
151 0.34
152 0.35
153 0.34
154 0.3
155 0.28
156 0.2
157 0.16
158 0.1
159 0.1
160 0.08
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.08
168 0.13
169 0.14
170 0.2
171 0.28
172 0.36
173 0.4
174 0.46
175 0.5
176 0.54
177 0.58
178 0.54
179 0.47
180 0.4
181 0.37
182 0.32
183 0.25
184 0.18
185 0.16
186 0.18
187 0.18
188 0.19
189 0.17
190 0.19
191 0.23
192 0.23
193 0.25
194 0.25
195 0.24
196 0.24
197 0.24
198 0.22
199 0.17
200 0.16
201 0.13
202 0.16
203 0.17
204 0.16
205 0.15
206 0.16
207 0.18
208 0.18
209 0.16
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.14
235 0.15
236 0.16
237 0.19
238 0.2
239 0.18
240 0.17
241 0.19
242 0.19
243 0.2
244 0.21
245 0.23
246 0.29
247 0.31
248 0.34
249 0.31
250 0.27
251 0.27
252 0.27
253 0.24
254 0.18
255 0.17
256 0.15
257 0.15
258 0.14
259 0.12
260 0.11
261 0.11
262 0.12
263 0.11
264 0.11
265 0.12
266 0.13
267 0.13
268 0.14
269 0.13
270 0.11
271 0.11
272 0.1
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.05
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.12
285 0.11
286 0.17
287 0.24
288 0.31
289 0.32
290 0.32
291 0.32
292 0.32
293 0.33
294 0.33
295 0.31
296 0.26
297 0.3
298 0.31
299 0.32
300 0.31
301 0.31
302 0.3
303 0.27
304 0.26
305 0.23
306 0.25
307 0.24
308 0.23
309 0.22
310 0.16
311 0.15
312 0.16
313 0.19
314 0.22
315 0.28
316 0.34
317 0.41
318 0.47
319 0.55
320 0.59
321 0.63
322 0.62
323 0.61
324 0.58
325 0.52
326 0.46
327 0.37
328 0.31
329 0.23
330 0.16
331 0.09
332 0.07
333 0.05
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.12
349 0.17
350 0.19
351 0.19
352 0.18
353 0.2
354 0.24
355 0.26
356 0.25
357 0.28
358 0.34
359 0.37
360 0.37
361 0.36
362 0.33
363 0.31
364 0.31
365 0.25
366 0.17
367 0.14
368 0.12
369 0.11
370 0.09
371 0.09
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.08
384 0.1
385 0.12
386 0.13
387 0.13
388 0.16
389 0.21
390 0.24
391 0.24
392 0.25
393 0.24
394 0.24
395 0.24
396 0.21
397 0.18
398 0.16
399 0.16
400 0.14
401 0.14
402 0.14
403 0.13
404 0.13
405 0.11
406 0.09
407 0.08
408 0.08
409 0.1
410 0.1
411 0.11
412 0.1
413 0.11
414 0.11
415 0.11
416 0.12
417 0.1
418 0.13
419 0.15
420 0.15
421 0.16
422 0.16
423 0.17
424 0.16
425 0.16
426 0.13
427 0.1
428 0.1
429 0.09
430 0.1
431 0.09
432 0.1
433 0.12
434 0.15
435 0.15
436 0.18
437 0.25
438 0.3
439 0.37
440 0.38
441 0.43
442 0.46
443 0.47
444 0.47
445 0.45
446 0.43
447 0.36
448 0.33
449 0.27
450 0.21
451 0.19
452 0.15
453 0.13
454 0.08
455 0.1
456 0.1
457 0.14
458 0.19
459 0.24
460 0.3
461 0.31
462 0.36
463 0.4
464 0.48
465 0.52
466 0.54
467 0.56
468 0.54
469 0.54
470 0.49
471 0.45
472 0.38
473 0.28
474 0.21
475 0.15
476 0.1
477 0.08
478 0.08
479 0.06
480 0.05
481 0.05
482 0.06
483 0.08
484 0.1
485 0.1
486 0.12
487 0.12
488 0.13
489 0.13
490 0.14
491 0.11
492 0.1
493 0.12
494 0.1
495 0.1
496 0.1
497 0.1
498 0.08
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.1
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.1
507 0.08
508 0.08
509 0.06
510 0.05
511 0.05
512 0.06
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.1
517 0.1
518 0.11
519 0.12
520 0.11
521 0.12
522 0.14
523 0.15
524 0.17
525 0.17
526 0.16
527 0.15
528 0.15
529 0.1
530 0.08
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.06
536 0.08
537 0.12
538 0.13
539 0.12
540 0.12
541 0.13
542 0.13
543 0.16
544 0.19
545 0.21
546 0.25
547 0.29
548 0.34
549 0.39
550 0.4
551 0.38
552 0.34
553 0.3
554 0.28
555 0.28
556 0.25
557 0.25
558 0.25
559 0.27
560 0.27
561 0.25
562 0.23
563 0.22
564 0.21
565 0.15
566 0.15
567 0.15
568 0.16
569 0.15
570 0.14
571 0.15
572 0.17
573 0.16
574 0.16
575 0.15
576 0.15
577 0.21
578 0.27
579 0.3
580 0.36
581 0.43
582 0.52
583 0.62
584 0.72
585 0.75
586 0.78
587 0.81
588 0.79
589 0.79
590 0.72
591 0.68
592 0.59
593 0.51
594 0.44
595 0.35
596 0.3
597 0.24
598 0.21
599 0.15
600 0.13
601 0.11
602 0.09
603 0.08
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.04
608 0.04
609 0.04
610 0.05
611 0.05
612 0.06
613 0.09
614 0.1
615 0.1
616 0.13
617 0.13
618 0.18
619 0.19
620 0.21
621 0.23
622 0.29
623 0.31
624 0.3
625 0.36
626 0.32
627 0.36
628 0.39
629 0.35
630 0.34
631 0.39
632 0.44
633 0.48
634 0.58
635 0.59
636 0.55
637 0.64
638 0.66
639 0.62
640 0.64
641 0.57
642 0.48
643 0.45
644 0.48
645 0.43
646 0.42
647 0.4
648 0.35
649 0.36
650 0.35
651 0.35
652 0.3
653 0.26
654 0.22
655 0.22
656 0.22
657 0.2
658 0.21
659 0.22
660 0.28
661 0.28
662 0.27
663 0.25
664 0.24
665 0.21
666 0.2
667 0.17
668 0.1
669 0.09
670 0.09
671 0.09
672 0.08
673 0.07
674 0.08
675 0.1
676 0.1
677 0.11
678 0.11
679 0.1
680 0.13
681 0.14
682 0.14
683 0.15
684 0.17
685 0.17
686 0.2
687 0.21
688 0.18
689 0.17
690 0.19
691 0.16
692 0.2
693 0.21
694 0.17
695 0.16
696 0.18
697 0.19
698 0.2
699 0.2
700 0.14
701 0.13
702 0.13
703 0.16
704 0.18
705 0.17
706 0.24
707 0.26
708 0.3
709 0.35
710 0.37
711 0.39
712 0.4
713 0.45
714 0.43
715 0.47
716 0.45
717 0.45
718 0.47
719 0.41
720 0.37
721 0.32
722 0.24
723 0.18
724 0.16
725 0.12
726 0.08
727 0.08
728 0.08
729 0.08
730 0.11
731 0.15
732 0.18
733 0.19
734 0.22
735 0.23
736 0.23
737 0.24
738 0.23
739 0.2
740 0.18
741 0.19
742 0.16
743 0.16
744 0.17
745 0.17
746 0.15