Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LKK3

Protein Details
Accession A0A5C3LKK3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-53TQKLKFVPTLPQRRKKEEVKAEPTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
65-85RGRGRGRGKGDGRGRGRGRGA
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 14.5, nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSSNDPPSGSTPKAIGSLAKKQSDVTRQGTQKLKFVPTLPQRRKKEEVKAEPTTSVVPAVPSTERGRGRGRGKGDGRGRGRGRGAAPPVLEMTASGPFAMGPALAGSTGRRSTPRSNFTPSVPTALGASAALGVNLSRSAAPSLKKENNADAKGKGKAMEEEGEVYSDPDDGVEIIDMERIRDMDWMAPESLQNERQLKKFKKEPSEGVAGEVDLAKALDLSESEEEEELEDIIEDFAAPTEIDTDPTLREERLYFFQFPQPFPTFLPKASESVADVIMGDATDKKVTFAPDVMPSVTPGTSRTSSAVPTELLMTEPLDGIIGELEVYRSGAVKIRLTNGILFDVSAGTQPSFLQQVTYLDKENKRLCVLGEVNKQFVVSPNVDTLLAAMEEADNAPVTIEGGENLIKMDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.28
3 0.28
4 0.36
5 0.42
6 0.43
7 0.42
8 0.42
9 0.49
10 0.52
11 0.53
12 0.49
13 0.51
14 0.52
15 0.59
16 0.65
17 0.59
18 0.57
19 0.56
20 0.54
21 0.49
22 0.47
23 0.49
24 0.51
25 0.6
26 0.64
27 0.68
28 0.71
29 0.76
30 0.82
31 0.81
32 0.81
33 0.81
34 0.81
35 0.79
36 0.79
37 0.74
38 0.66
39 0.6
40 0.5
41 0.4
42 0.3
43 0.22
44 0.15
45 0.13
46 0.15
47 0.14
48 0.17
49 0.19
50 0.26
51 0.27
52 0.31
53 0.36
54 0.41
55 0.45
56 0.48
57 0.49
58 0.51
59 0.53
60 0.58
61 0.59
62 0.61
63 0.6
64 0.62
65 0.6
66 0.56
67 0.55
68 0.5
69 0.46
70 0.44
71 0.43
72 0.38
73 0.36
74 0.31
75 0.3
76 0.25
77 0.22
78 0.15
79 0.13
80 0.11
81 0.1
82 0.09
83 0.08
84 0.07
85 0.08
86 0.07
87 0.05
88 0.03
89 0.03
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.14
98 0.19
99 0.28
100 0.37
101 0.43
102 0.44
103 0.51
104 0.52
105 0.52
106 0.53
107 0.45
108 0.41
109 0.34
110 0.29
111 0.22
112 0.2
113 0.17
114 0.1
115 0.1
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.05
126 0.07
127 0.1
128 0.13
129 0.17
130 0.25
131 0.29
132 0.33
133 0.34
134 0.4
135 0.45
136 0.47
137 0.45
138 0.4
139 0.39
140 0.37
141 0.36
142 0.3
143 0.23
144 0.21
145 0.2
146 0.19
147 0.16
148 0.16
149 0.15
150 0.14
151 0.13
152 0.12
153 0.09
154 0.07
155 0.07
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.12
179 0.12
180 0.15
181 0.19
182 0.2
183 0.25
184 0.34
185 0.37
186 0.42
187 0.47
188 0.5
189 0.54
190 0.57
191 0.56
192 0.51
193 0.53
194 0.46
195 0.4
196 0.33
197 0.24
198 0.19
199 0.16
200 0.11
201 0.05
202 0.05
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.05
229 0.05
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.1
235 0.12
236 0.09
237 0.11
238 0.11
239 0.13
240 0.17
241 0.21
242 0.21
243 0.21
244 0.27
245 0.29
246 0.29
247 0.32
248 0.3
249 0.28
250 0.28
251 0.33
252 0.29
253 0.27
254 0.31
255 0.25
256 0.24
257 0.24
258 0.23
259 0.17
260 0.17
261 0.16
262 0.11
263 0.1
264 0.08
265 0.07
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.1
274 0.12
275 0.13
276 0.14
277 0.15
278 0.17
279 0.19
280 0.19
281 0.17
282 0.16
283 0.17
284 0.16
285 0.13
286 0.12
287 0.15
288 0.15
289 0.16
290 0.17
291 0.17
292 0.18
293 0.19
294 0.19
295 0.14
296 0.14
297 0.14
298 0.12
299 0.11
300 0.11
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.07
318 0.11
319 0.14
320 0.17
321 0.19
322 0.23
323 0.25
324 0.26
325 0.27
326 0.24
327 0.23
328 0.2
329 0.17
330 0.14
331 0.12
332 0.1
333 0.1
334 0.09
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.1
339 0.12
340 0.11
341 0.11
342 0.12
343 0.16
344 0.21
345 0.23
346 0.25
347 0.31
348 0.35
349 0.42
350 0.45
351 0.45
352 0.42
353 0.41
354 0.38
355 0.39
356 0.41
357 0.42
358 0.47
359 0.46
360 0.45
361 0.44
362 0.43
363 0.35
364 0.34
365 0.3
366 0.22
367 0.22
368 0.22
369 0.23
370 0.23
371 0.22
372 0.18
373 0.14
374 0.12
375 0.09
376 0.08
377 0.06
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.08
390 0.09
391 0.09