Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LYI5

Protein Details
Accession A0A5C3LYI5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
946-968GSDVKRPPPQMHRGRGRRDQMPPBasic
976-1000QGQGQGHSRPPNRRQYRNNAPNSGYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 7, cyto 3, pero 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MPHKPVIQPRAWGTRFDTLPSSPPVSPTRGSHKVDSIHALAHSSLQPHPNDNRETKQPHDASVFVGSLPTNIDLGVLTRMLTDHLSKHATVKDVKVIRDNNGGVCAFVQCENAASASALIETLHSSEQIPFMGRILRYEPARAMRSLLISYRAPMEVITHLDGPGAHSKELIPLEPPFAMLVWKPKYNRFHSIVYNDEAIDIHARNTETEGLSLKERGVFLKPVLFDAESIQKIAGQFGPLERLEMFQSNDTNLSCGQKYPEPHDAQRSKNMDTGCWEVKWAHRDDCVDALMTLRKIPHITVSWAHRPPGYVYDQQRRLGWVGSSPGSRFLHPGQSRDRFSESSAEQSFSSSVNAATTSSTSAQRKWTETDFPPLSMTSSEHGHARTDSERPALSSSEVHTSHSTMDDSNRQKEDVSSHQLGVSDGFVDHEELRSTSRNGSQFMHDNCPHHIERELDPTTLFVGGLEMFGPGAWDETKLQAVFGRFGGLENVRLISPQNSHTAFAFVKYNNTESPARAVAEEHNRVYEGRAMRVQLRDCNPNRGWKHGGRSRGRFYHHNFAPQRQFNNGGSSRFTEDEEHEDFSGDGQHEDSQQGIVSTPKDSAPAEGDSEHKDADTESLLGQSSNKLDSGVSSVSSPSEAAGATDESSHSVIFSPDSPHSIHSSPCPVAISKEVVISPKAIESSDPPQDTKPVIVVTEASPQVYQEWYDRPASAPVLGSQSTSMPQAMSSSYAVPPGYYASLPWMHPYQGQYAMPYYGGYVGYPMPNHQALPQFGAPPNMDSNGSASRPPAWSPMGIYGAYIPYPAASSAKDQGVGDIPVSQHANGQPPVVPAGFIQNEQGTLIAVYQPEALDKYMAGTGGSPPATTQSISNVMRWPQNGFPYPYSFQAPSQNISMLPQGFASPGRQSWNPHLQSFLSSPPGLHFQQPATVQSSGPPPFRGPYYGSDVKRPPPQMHRGRGRRDQMPPLNPPWQGQGQGQGHSRPPNRRQYRNNAPNSGYTERSELEQFQPRHPALNTDNWARL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.49
3 0.45
4 0.43
5 0.34
6 0.38
7 0.39
8 0.39
9 0.31
10 0.35
11 0.36
12 0.36
13 0.38
14 0.38
15 0.43
16 0.47
17 0.51
18 0.51
19 0.53
20 0.52
21 0.52
22 0.53
23 0.45
24 0.38
25 0.34
26 0.31
27 0.25
28 0.24
29 0.22
30 0.2
31 0.22
32 0.25
33 0.27
34 0.32
35 0.38
36 0.42
37 0.47
38 0.51
39 0.53
40 0.56
41 0.6
42 0.58
43 0.62
44 0.57
45 0.54
46 0.51
47 0.46
48 0.39
49 0.37
50 0.33
51 0.22
52 0.22
53 0.17
54 0.14
55 0.15
56 0.13
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.08
61 0.09
62 0.1
63 0.09
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.1
68 0.12
69 0.13
70 0.13
71 0.18
72 0.21
73 0.21
74 0.26
75 0.28
76 0.31
77 0.33
78 0.34
79 0.38
80 0.4
81 0.42
82 0.46
83 0.45
84 0.45
85 0.48
86 0.47
87 0.39
88 0.39
89 0.36
90 0.28
91 0.25
92 0.22
93 0.15
94 0.15
95 0.14
96 0.1
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.11
114 0.12
115 0.13
116 0.14
117 0.13
118 0.14
119 0.18
120 0.17
121 0.19
122 0.21
123 0.24
124 0.24
125 0.26
126 0.3
127 0.32
128 0.34
129 0.32
130 0.32
131 0.29
132 0.3
133 0.3
134 0.27
135 0.24
136 0.22
137 0.22
138 0.22
139 0.2
140 0.17
141 0.15
142 0.16
143 0.14
144 0.16
145 0.18
146 0.16
147 0.15
148 0.16
149 0.16
150 0.17
151 0.22
152 0.21
153 0.19
154 0.18
155 0.19
156 0.24
157 0.25
158 0.22
159 0.17
160 0.16
161 0.19
162 0.18
163 0.18
164 0.13
165 0.12
166 0.13
167 0.12
168 0.19
169 0.21
170 0.27
171 0.29
172 0.37
173 0.45
174 0.5
175 0.57
176 0.53
177 0.54
178 0.55
179 0.58
180 0.54
181 0.49
182 0.44
183 0.35
184 0.31
185 0.25
186 0.2
187 0.18
188 0.14
189 0.11
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.15
194 0.17
195 0.15
196 0.16
197 0.16
198 0.15
199 0.17
200 0.17
201 0.16
202 0.15
203 0.15
204 0.16
205 0.18
206 0.18
207 0.18
208 0.21
209 0.21
210 0.2
211 0.22
212 0.2
213 0.17
214 0.18
215 0.23
216 0.19
217 0.19
218 0.18
219 0.17
220 0.16
221 0.18
222 0.16
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.16
227 0.14
228 0.15
229 0.14
230 0.14
231 0.15
232 0.17
233 0.18
234 0.16
235 0.17
236 0.16
237 0.18
238 0.17
239 0.16
240 0.15
241 0.17
242 0.15
243 0.15
244 0.18
245 0.19
246 0.22
247 0.27
248 0.35
249 0.37
250 0.4
251 0.49
252 0.52
253 0.52
254 0.58
255 0.55
256 0.48
257 0.47
258 0.44
259 0.35
260 0.33
261 0.35
262 0.28
263 0.25
264 0.24
265 0.22
266 0.26
267 0.31
268 0.3
269 0.27
270 0.27
271 0.29
272 0.3
273 0.3
274 0.26
275 0.21
276 0.17
277 0.16
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.12
282 0.13
283 0.13
284 0.14
285 0.17
286 0.16
287 0.19
288 0.22
289 0.28
290 0.34
291 0.36
292 0.37
293 0.33
294 0.32
295 0.31
296 0.31
297 0.3
298 0.29
299 0.34
300 0.42
301 0.47
302 0.47
303 0.46
304 0.43
305 0.39
306 0.34
307 0.27
308 0.2
309 0.18
310 0.18
311 0.19
312 0.17
313 0.23
314 0.22
315 0.22
316 0.23
317 0.22
318 0.3
319 0.3
320 0.34
321 0.36
322 0.42
323 0.44
324 0.44
325 0.46
326 0.37
327 0.36
328 0.37
329 0.3
330 0.3
331 0.29
332 0.27
333 0.22
334 0.22
335 0.22
336 0.16
337 0.16
338 0.09
339 0.08
340 0.07
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.1
347 0.15
348 0.16
349 0.18
350 0.24
351 0.26
352 0.28
353 0.3
354 0.31
355 0.32
356 0.33
357 0.4
358 0.34
359 0.32
360 0.31
361 0.28
362 0.25
363 0.19
364 0.19
365 0.11
366 0.12
367 0.12
368 0.13
369 0.13
370 0.13
371 0.13
372 0.14
373 0.15
374 0.16
375 0.16
376 0.17
377 0.17
378 0.17
379 0.18
380 0.16
381 0.15
382 0.14
383 0.14
384 0.17
385 0.18
386 0.19
387 0.18
388 0.18
389 0.17
390 0.17
391 0.16
392 0.11
393 0.13
394 0.19
395 0.22
396 0.27
397 0.27
398 0.26
399 0.26
400 0.26
401 0.28
402 0.26
403 0.29
404 0.26
405 0.25
406 0.25
407 0.26
408 0.24
409 0.21
410 0.15
411 0.08
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.09
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.17
425 0.18
426 0.2
427 0.21
428 0.22
429 0.27
430 0.29
431 0.34
432 0.32
433 0.31
434 0.3
435 0.34
436 0.31
437 0.26
438 0.25
439 0.21
440 0.2
441 0.26
442 0.26
443 0.21
444 0.21
445 0.2
446 0.18
447 0.16
448 0.13
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.04
454 0.04
455 0.03
456 0.03
457 0.04
458 0.03
459 0.04
460 0.04
461 0.05
462 0.05
463 0.06
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.09
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.08
473 0.09
474 0.1
475 0.09
476 0.09
477 0.08
478 0.09
479 0.08
480 0.08
481 0.08
482 0.08
483 0.1
484 0.1
485 0.15
486 0.15
487 0.15
488 0.15
489 0.17
490 0.15
491 0.15
492 0.16
493 0.12
494 0.14
495 0.14
496 0.16
497 0.13
498 0.17
499 0.17
500 0.14
501 0.17
502 0.15
503 0.14
504 0.13
505 0.14
506 0.14
507 0.2
508 0.22
509 0.2
510 0.19
511 0.19
512 0.19
513 0.19
514 0.19
515 0.14
516 0.13
517 0.14
518 0.15
519 0.18
520 0.21
521 0.22
522 0.22
523 0.25
524 0.31
525 0.31
526 0.38
527 0.37
528 0.42
529 0.42
530 0.42
531 0.44
532 0.39
533 0.47
534 0.43
535 0.51
536 0.49
537 0.54
538 0.55
539 0.54
540 0.54
541 0.52
542 0.54
543 0.54
544 0.49
545 0.52
546 0.48
547 0.49
548 0.53
549 0.5
550 0.46
551 0.38
552 0.41
553 0.33
554 0.38
555 0.34
556 0.27
557 0.25
558 0.25
559 0.26
560 0.22
561 0.22
562 0.17
563 0.16
564 0.19
565 0.19
566 0.19
567 0.17
568 0.16
569 0.15
570 0.13
571 0.14
572 0.1
573 0.08
574 0.08
575 0.08
576 0.09
577 0.09
578 0.09
579 0.07
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.07
584 0.07
585 0.08
586 0.08
587 0.08
588 0.1
589 0.1
590 0.11
591 0.12
592 0.12
593 0.12
594 0.12
595 0.14
596 0.15
597 0.16
598 0.15
599 0.12
600 0.11
601 0.1
602 0.11
603 0.1
604 0.07
605 0.06
606 0.07
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.08
611 0.08
612 0.08
613 0.08
614 0.08
615 0.07
616 0.08
617 0.11
618 0.1
619 0.09
620 0.09
621 0.09
622 0.09
623 0.09
624 0.08
625 0.05
626 0.06
627 0.05
628 0.05
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.06
634 0.07
635 0.08
636 0.07
637 0.06
638 0.06
639 0.06
640 0.07
641 0.08
642 0.1
643 0.11
644 0.13
645 0.13
646 0.14
647 0.18
648 0.18
649 0.18
650 0.17
651 0.21
652 0.2
653 0.2
654 0.2
655 0.16
656 0.17
657 0.18
658 0.18
659 0.14
660 0.15
661 0.15
662 0.15
663 0.15
664 0.14
665 0.13
666 0.11
667 0.11
668 0.09
669 0.09
670 0.11
671 0.16
672 0.21
673 0.22
674 0.22
675 0.23
676 0.25
677 0.25
678 0.22
679 0.19
680 0.13
681 0.12
682 0.12
683 0.12
684 0.11
685 0.16
686 0.16
687 0.14
688 0.14
689 0.14
690 0.14
691 0.13
692 0.13
693 0.1
694 0.13
695 0.15
696 0.16
697 0.16
698 0.17
699 0.18
700 0.18
701 0.16
702 0.14
703 0.13
704 0.15
705 0.15
706 0.14
707 0.12
708 0.12
709 0.12
710 0.12
711 0.11
712 0.08
713 0.08
714 0.08
715 0.08
716 0.09
717 0.09
718 0.11
719 0.11
720 0.12
721 0.12
722 0.11
723 0.11
724 0.11
725 0.11
726 0.09
727 0.09
728 0.11
729 0.13
730 0.14
731 0.16
732 0.16
733 0.16
734 0.18
735 0.2
736 0.2
737 0.22
738 0.22
739 0.21
740 0.21
741 0.2
742 0.18
743 0.16
744 0.13
745 0.1
746 0.09
747 0.08
748 0.08
749 0.09
750 0.1
751 0.1
752 0.11
753 0.14
754 0.14
755 0.15
756 0.17
757 0.21
758 0.2
759 0.25
760 0.25
761 0.25
762 0.25
763 0.28
764 0.26
765 0.22
766 0.23
767 0.19
768 0.18
769 0.15
770 0.18
771 0.18
772 0.19
773 0.17
774 0.16
775 0.18
776 0.19
777 0.2
778 0.21
779 0.18
780 0.18
781 0.19
782 0.22
783 0.21
784 0.19
785 0.19
786 0.16
787 0.15
788 0.14
789 0.12
790 0.08
791 0.06
792 0.07
793 0.08
794 0.08
795 0.08
796 0.11
797 0.15
798 0.16
799 0.18
800 0.17
801 0.18
802 0.19
803 0.19
804 0.16
805 0.14
806 0.13
807 0.15
808 0.16
809 0.14
810 0.15
811 0.17
812 0.22
813 0.21
814 0.22
815 0.21
816 0.2
817 0.23
818 0.19
819 0.18
820 0.12
821 0.18
822 0.18
823 0.16
824 0.18
825 0.16
826 0.16
827 0.16
828 0.15
829 0.09
830 0.08
831 0.08
832 0.08
833 0.07
834 0.08
835 0.08
836 0.08
837 0.09
838 0.1
839 0.1
840 0.09
841 0.09
842 0.1
843 0.1
844 0.1
845 0.09
846 0.09
847 0.1
848 0.13
849 0.14
850 0.12
851 0.11
852 0.14
853 0.15
854 0.15
855 0.14
856 0.14
857 0.22
858 0.24
859 0.26
860 0.27
861 0.29
862 0.33
863 0.34
864 0.34
865 0.3
866 0.36
867 0.39
868 0.39
869 0.39
870 0.41
871 0.42
872 0.41
873 0.41
874 0.35
875 0.33
876 0.37
877 0.37
878 0.33
879 0.33
880 0.31
881 0.27
882 0.27
883 0.29
884 0.21
885 0.19
886 0.16
887 0.15
888 0.15
889 0.16
890 0.17
891 0.15
892 0.16
893 0.21
894 0.23
895 0.28
896 0.35
897 0.45
898 0.46
899 0.43
900 0.44
901 0.4
902 0.41
903 0.39
904 0.34
905 0.29
906 0.25
907 0.25
908 0.24
909 0.29
910 0.26
911 0.27
912 0.26
913 0.22
914 0.27
915 0.29
916 0.29
917 0.28
918 0.27
919 0.25
920 0.25
921 0.31
922 0.31
923 0.31
924 0.31
925 0.28
926 0.3
927 0.33
928 0.33
929 0.29
930 0.29
931 0.35
932 0.42
933 0.41
934 0.47
935 0.49
936 0.52
937 0.57
938 0.58
939 0.56
940 0.57
941 0.66
942 0.68
943 0.73
944 0.78
945 0.79
946 0.83
947 0.85
948 0.84
949 0.81
950 0.79
951 0.79
952 0.78
953 0.76
954 0.73
955 0.7
956 0.69
957 0.62
958 0.56
959 0.52
960 0.46
961 0.42
962 0.36
963 0.4
964 0.36
965 0.4
966 0.43
967 0.41
968 0.42
969 0.49
970 0.55
971 0.55
972 0.6
973 0.66
974 0.72
975 0.78
976 0.82
977 0.83
978 0.87
979 0.88
980 0.88
981 0.85
982 0.78
983 0.74
984 0.72
985 0.66
986 0.57
987 0.48
988 0.43
989 0.36
990 0.36
991 0.33
992 0.3
993 0.32
994 0.38
995 0.39
996 0.4
997 0.48
998 0.45
999 0.48
1000 0.45
1001 0.46
1002 0.42
1003 0.49
1004 0.5