Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3M5D0

Protein Details
Accession A0A5C3M5D0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MAPVRSLPPPSKKRKIQKDVGRVQTIKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-264PPKLKRAKK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 11, cyto_nucl 7.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MAPVRSLPPPSKKRKIQKDVGRVQTIKQLEDQLTRAVASNTSLNQLADLLDLGLTLEDPQDTSKAIYALYRVFVTIITNDKLGLSGDEAAKTVKAWLLERLNIYVEFLVGLLKDEEKFLRTSALQILFSLQKHLSTSYSKPSHPQFHNSHFRKIINALLTCPRSARPGSRKSSTSKDDTDIDPDVLNQFYDTWFSVYDDIRWYFLRESATLLGNGSSQTHPNIAANLLSILERLTTFPTEQAELNSWWVTEMGTKPPKLKRAKKAADGAESSDEDEEKPTGDRDEEDDDWRKFFEDEPAPVDDKKGGGVRLHQMTIHQSLHALSSHQAVFTRAWLTLLPRLSVARDGERSRTLATRALNIMHRGVLPHLTRPVLVMDWVGACVDYGGTVGLLALNALFHLMKEYNLDYPSFYTRLYAFLDRDVLHLKHRARFFRLTELFLSSTHLPATLLASFIKRLSRLSLTAPPAAIVMAIPFTYNILKRHPALMVMIHRIDVSDVLDDPFLAEETDPLVTRAIDSSLWELLSHSSHYHASVSVLCKIFSEAFTKPGYAMEDFLDHTYATLFDTEAGRKTKREPALGMELVKGVNMFPVASNDEKPKGVDPEMAAVTSGDVVSELWSFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.9
3 0.9
4 0.91
5 0.91
6 0.91
7 0.9
8 0.88
9 0.78
10 0.7
11 0.68
12 0.59
13 0.5
14 0.43
15 0.4
16 0.34
17 0.37
18 0.37
19 0.31
20 0.3
21 0.28
22 0.27
23 0.22
24 0.18
25 0.17
26 0.19
27 0.17
28 0.19
29 0.2
30 0.18
31 0.17
32 0.17
33 0.15
34 0.11
35 0.1
36 0.08
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.06
46 0.07
47 0.08
48 0.09
49 0.1
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.13
54 0.15
55 0.16
56 0.17
57 0.16
58 0.14
59 0.14
60 0.14
61 0.14
62 0.14
63 0.17
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.16
68 0.16
69 0.15
70 0.13
71 0.1
72 0.12
73 0.13
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.14
78 0.13
79 0.13
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.2
84 0.23
85 0.27
86 0.28
87 0.28
88 0.29
89 0.26
90 0.26
91 0.19
92 0.14
93 0.11
94 0.09
95 0.08
96 0.06
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.1
102 0.11
103 0.13
104 0.14
105 0.13
106 0.16
107 0.15
108 0.17
109 0.22
110 0.24
111 0.22
112 0.22
113 0.24
114 0.24
115 0.24
116 0.25
117 0.19
118 0.17
119 0.18
120 0.19
121 0.19
122 0.2
123 0.23
124 0.29
125 0.33
126 0.33
127 0.38
128 0.44
129 0.51
130 0.5
131 0.55
132 0.53
133 0.58
134 0.68
135 0.66
136 0.66
137 0.61
138 0.58
139 0.52
140 0.47
141 0.42
142 0.37
143 0.34
144 0.3
145 0.32
146 0.33
147 0.3
148 0.3
149 0.25
150 0.24
151 0.26
152 0.32
153 0.34
154 0.42
155 0.48
156 0.52
157 0.55
158 0.56
159 0.62
160 0.58
161 0.55
162 0.48
163 0.45
164 0.43
165 0.4
166 0.39
167 0.32
168 0.28
169 0.22
170 0.19
171 0.17
172 0.14
173 0.13
174 0.09
175 0.08
176 0.07
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.12
183 0.12
184 0.13
185 0.15
186 0.16
187 0.16
188 0.17
189 0.18
190 0.16
191 0.18
192 0.19
193 0.15
194 0.17
195 0.17
196 0.18
197 0.16
198 0.15
199 0.13
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.12
210 0.1
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.1
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.16
240 0.2
241 0.22
242 0.27
243 0.31
244 0.4
245 0.47
246 0.55
247 0.57
248 0.63
249 0.69
250 0.7
251 0.74
252 0.69
253 0.64
254 0.56
255 0.48
256 0.39
257 0.33
258 0.27
259 0.19
260 0.15
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.1
271 0.15
272 0.15
273 0.19
274 0.24
275 0.23
276 0.23
277 0.23
278 0.21
279 0.17
280 0.16
281 0.19
282 0.16
283 0.17
284 0.19
285 0.21
286 0.22
287 0.22
288 0.21
289 0.15
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.12
296 0.16
297 0.18
298 0.18
299 0.16
300 0.15
301 0.17
302 0.2
303 0.18
304 0.13
305 0.12
306 0.12
307 0.13
308 0.12
309 0.1
310 0.07
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.13
324 0.13
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.14
330 0.14
331 0.13
332 0.17
333 0.18
334 0.2
335 0.21
336 0.21
337 0.2
338 0.21
339 0.19
340 0.19
341 0.19
342 0.19
343 0.18
344 0.19
345 0.2
346 0.2
347 0.19
348 0.15
349 0.15
350 0.12
351 0.12
352 0.15
353 0.14
354 0.15
355 0.16
356 0.16
357 0.16
358 0.16
359 0.16
360 0.11
361 0.11
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.02
381 0.02
382 0.02
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.08
390 0.1
391 0.12
392 0.13
393 0.13
394 0.12
395 0.14
396 0.16
397 0.16
398 0.14
399 0.13
400 0.13
401 0.15
402 0.18
403 0.18
404 0.16
405 0.16
406 0.19
407 0.18
408 0.2
409 0.22
410 0.19
411 0.19
412 0.25
413 0.27
414 0.3
415 0.35
416 0.38
417 0.39
418 0.45
419 0.44
420 0.48
421 0.47
422 0.44
423 0.4
424 0.39
425 0.34
426 0.28
427 0.29
428 0.2
429 0.18
430 0.15
431 0.14
432 0.11
433 0.1
434 0.12
435 0.09
436 0.09
437 0.09
438 0.1
439 0.1
440 0.12
441 0.14
442 0.12
443 0.13
444 0.16
445 0.18
446 0.19
447 0.23
448 0.29
449 0.3
450 0.31
451 0.3
452 0.26
453 0.23
454 0.21
455 0.16
456 0.09
457 0.06
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.06
463 0.09
464 0.13
465 0.14
466 0.18
467 0.22
468 0.23
469 0.26
470 0.26
471 0.24
472 0.22
473 0.25
474 0.25
475 0.26
476 0.25
477 0.23
478 0.22
479 0.21
480 0.2
481 0.15
482 0.11
483 0.08
484 0.08
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.09
489 0.08
490 0.08
491 0.07
492 0.06
493 0.05
494 0.07
495 0.09
496 0.08
497 0.09
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.1
502 0.1
503 0.09
504 0.1
505 0.12
506 0.13
507 0.13
508 0.12
509 0.12
510 0.13
511 0.14
512 0.14
513 0.12
514 0.13
515 0.14
516 0.15
517 0.15
518 0.14
519 0.14
520 0.17
521 0.2
522 0.24
523 0.24
524 0.23
525 0.22
526 0.24
527 0.24
528 0.21
529 0.23
530 0.18
531 0.21
532 0.22
533 0.22
534 0.19
535 0.2
536 0.22
537 0.18
538 0.18
539 0.16
540 0.16
541 0.17
542 0.18
543 0.17
544 0.13
545 0.12
546 0.12
547 0.1
548 0.09
549 0.08
550 0.08
551 0.09
552 0.12
553 0.14
554 0.19
555 0.24
556 0.26
557 0.28
558 0.33
559 0.4
560 0.43
561 0.47
562 0.44
563 0.46
564 0.53
565 0.54
566 0.5
567 0.42
568 0.37
569 0.31
570 0.28
571 0.21
572 0.12
573 0.1
574 0.09
575 0.09
576 0.08
577 0.12
578 0.16
579 0.18
580 0.22
581 0.26
582 0.29
583 0.3
584 0.31
585 0.33
586 0.34
587 0.33
588 0.34
589 0.3
590 0.33
591 0.33
592 0.31
593 0.27
594 0.21
595 0.2
596 0.16
597 0.14
598 0.07
599 0.06
600 0.06
601 0.07