Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3M2R4

Protein Details
Accession A0A5C3M2R4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-55QSSNPPQSSTRPSKKRKWNNSKGKGKQHQHQNHAQHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-45PSKKRKWNNSKGKGK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 6, pero 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MSRPVISYDDITLPYDQPTQSSNPPQSSTRPSKKRKWNNSKGKGKQHQHQNHAQHWDDPALLGTSMNYGGASSSKQAEEEVYEGEMEEEDDDDEEEEEEGSRRLTHQEVWDDSALINAWDAAMEEYEAYNGPDKGWKKEPVNKSPLWYNIPTKNTTRKPASKKIKLEASTPVPTGEVEADSQPINFDTFVPSHDASLPGTVLAMENYAFTEAPAGQVSQDEAFAHALNATYWAGYWTAMYHAQRTVGTEMTASAGKEEGEEVEENEVDAQMNGFEEEEEFVSTQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.2
4 0.19
5 0.2
6 0.23
7 0.29
8 0.37
9 0.41
10 0.41
11 0.44
12 0.46
13 0.49
14 0.54
15 0.58
16 0.6
17 0.64
18 0.68
19 0.75
20 0.84
21 0.89
22 0.9
23 0.91
24 0.91
25 0.92
26 0.94
27 0.95
28 0.94
29 0.94
30 0.92
31 0.89
32 0.87
33 0.86
34 0.85
35 0.81
36 0.81
37 0.78
38 0.74
39 0.73
40 0.66
41 0.57
42 0.49
43 0.43
44 0.34
45 0.26
46 0.2
47 0.14
48 0.12
49 0.1
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.07
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.09
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.07
73 0.06
74 0.05
75 0.05
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.08
91 0.1
92 0.12
93 0.16
94 0.2
95 0.21
96 0.24
97 0.24
98 0.22
99 0.2
100 0.18
101 0.14
102 0.09
103 0.07
104 0.04
105 0.04
106 0.03
107 0.04
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.11
120 0.13
121 0.17
122 0.22
123 0.27
124 0.3
125 0.39
126 0.47
127 0.49
128 0.54
129 0.51
130 0.48
131 0.46
132 0.45
133 0.4
134 0.35
135 0.32
136 0.32
137 0.34
138 0.34
139 0.35
140 0.4
141 0.4
142 0.44
143 0.46
144 0.49
145 0.54
146 0.62
147 0.69
148 0.68
149 0.69
150 0.69
151 0.69
152 0.62
153 0.57
154 0.52
155 0.47
156 0.41
157 0.36
158 0.3
159 0.23
160 0.21
161 0.19
162 0.14
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.13
178 0.13
179 0.14
180 0.14
181 0.15
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.07
198 0.06
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.09
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.06
224 0.09
225 0.14
226 0.15
227 0.17
228 0.17
229 0.19
230 0.2
231 0.22
232 0.22
233 0.18
234 0.17
235 0.15
236 0.15
237 0.15
238 0.16
239 0.13
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.13
253 0.12
254 0.1
255 0.09
256 0.08
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.09
264 0.09
265 0.11