Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LSW9

Protein Details
Accession A0A5C3LSW9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-68VEEVKGKKMKGKGKRKEKDKGKSIQKGKRKQVIKPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-64KGKKMKGKGKRKEKDKGKSIQKGKRKQ
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
Amino Acid Sequences MDPLAFTEGKEKKDAEKAAAEDVAVNELSTEGAVEEVKGKKMKGKGKRKEKDKGKSIQKGKRKQVIKPSLDEEGLKEDTVVEAQQAAMDPLLLNDGILVGIVEIPLFNSDPNDDLSNIDPVLLQVSIPMALSFTVTPTLTPPPTMLVEEAVSTFVAKEVSVFLQNKQGLAQISMVDKLLGLNKDKLDQFILTDDEVKIKEQVWVELNCDYLEALTARGDQQESGILTKSRKNLIKKNSKYSKCINYNTLKDLFVKGGGLLSFTAVMTTSNDNKDNNDLYIMGMGDKSNSNGMMVIVKEEPGTVATAPPKMVELWQKRPTLNDNNLDAEEPSKDEKDDSYGWDDGYEQEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.4
3 0.42
4 0.41
5 0.41
6 0.4
7 0.34
8 0.27
9 0.25
10 0.22
11 0.16
12 0.13
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.07
17 0.06
18 0.04
19 0.05
20 0.05
21 0.06
22 0.11
23 0.13
24 0.19
25 0.21
26 0.22
27 0.28
28 0.36
29 0.45
30 0.5
31 0.59
32 0.65
33 0.73
34 0.83
35 0.86
36 0.88
37 0.9
38 0.9
39 0.88
40 0.87
41 0.87
42 0.87
43 0.88
44 0.87
45 0.86
46 0.86
47 0.86
48 0.85
49 0.8
50 0.77
51 0.78
52 0.8
53 0.74
54 0.69
55 0.63
56 0.58
57 0.54
58 0.46
59 0.37
60 0.32
61 0.28
62 0.22
63 0.18
64 0.14
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.04
85 0.03
86 0.02
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.04
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.07
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.12
103 0.13
104 0.12
105 0.11
106 0.09
107 0.08
108 0.09
109 0.07
110 0.06
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.08
125 0.12
126 0.11
127 0.12
128 0.11
129 0.12
130 0.13
131 0.13
132 0.12
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.06
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.18
151 0.19
152 0.19
153 0.18
154 0.19
155 0.15
156 0.15
157 0.15
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.12
169 0.12
170 0.16
171 0.16
172 0.16
173 0.15
174 0.14
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.1
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.09
186 0.13
187 0.12
188 0.14
189 0.16
190 0.16
191 0.17
192 0.17
193 0.17
194 0.14
195 0.13
196 0.11
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.11
212 0.12
213 0.14
214 0.18
215 0.21
216 0.26
217 0.31
218 0.38
219 0.44
220 0.53
221 0.62
222 0.65
223 0.73
224 0.76
225 0.75
226 0.73
227 0.73
228 0.72
229 0.7
230 0.67
231 0.64
232 0.62
233 0.61
234 0.6
235 0.55
236 0.45
237 0.39
238 0.35
239 0.28
240 0.21
241 0.17
242 0.12
243 0.12
244 0.1
245 0.1
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.05
252 0.06
253 0.07
254 0.11
255 0.15
256 0.18
257 0.21
258 0.21
259 0.23
260 0.27
261 0.27
262 0.24
263 0.21
264 0.18
265 0.16
266 0.16
267 0.15
268 0.1
269 0.09
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.12
280 0.11
281 0.13
282 0.11
283 0.12
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.09
288 0.1
289 0.08
290 0.11
291 0.14
292 0.15
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.15
297 0.19
298 0.26
299 0.32
300 0.4
301 0.47
302 0.51
303 0.51
304 0.55
305 0.59
306 0.59
307 0.59
308 0.57
309 0.53
310 0.53
311 0.53
312 0.49
313 0.41
314 0.33
315 0.26
316 0.21
317 0.22
318 0.19
319 0.19
320 0.19
321 0.2
322 0.24
323 0.25
324 0.27
325 0.28
326 0.28
327 0.27
328 0.26
329 0.25