Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LRJ3

Protein Details
Accession A0A5C3LRJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-84EGDVEKAERKEKKRSNKSKSKKKKTVKDDDGPLLEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-74KAERKEKKRSNKSKSKKKKT
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, extr 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF13414  TPR_11  
PF13432  TPR_16  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSDAPAPSLVERVQDFVSENKRAVLLGAAAVIAVGGVAYYAASTSRGGVEGDVEKAERKEKKRSNKSKSKKKKTVKDDDGPLLEERKPKVEVVEEEAVETVTDEEVAAMNEEQRNERAASYKKRGNDAYNNKNFAQAVELYTLAIKVSPIPQPVFYSNRAACYANFKPPQNEKVIADCNQALTLDHNYIKALNRRATACENLLKYEDALRDYTAATILDKFQNSSTSNSVERILKLIAETKAREILATREPRLPSYTFIASYFAAFRPRAPPTLPENPSQGDQTLLLGVQALEAGDYAHAVTFVNEAIEQGISFDQGKAEALNLRGTFKFLMGDVDGAGDDFEESLKIVPTFTQSLVKIASVHMEKGDSDRAFERFNQAVACNPNDPDIYYHRGQVLFIMNKFEEAAENYIKSTELDENFVFSHIQLAVAYYKMSQTAKSMATFRSTLRKFPERSEPYNYYGELLLDQNNFDEAVQKFDRAVEIENSKTRPNVLPLVNKGLALYQMKQDIGAAERCCNEALRIDNECEAALATLAQLSLQQSRIEDAAKLFERQAKLARSEPELMNAITYQYATQAQVEFLKNYPEKAQELAALAHQMM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.25
4 0.31
5 0.3
6 0.3
7 0.29
8 0.28
9 0.27
10 0.26
11 0.2
12 0.14
13 0.12
14 0.11
15 0.09
16 0.09
17 0.08
18 0.07
19 0.05
20 0.03
21 0.02
22 0.02
23 0.02
24 0.02
25 0.02
26 0.02
27 0.03
28 0.04
29 0.05
30 0.06
31 0.07
32 0.08
33 0.09
34 0.1
35 0.1
36 0.13
37 0.14
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.17
42 0.19
43 0.27
44 0.32
45 0.36
46 0.45
47 0.53
48 0.64
49 0.73
50 0.82
51 0.85
52 0.88
53 0.93
54 0.94
55 0.96
56 0.96
57 0.96
58 0.95
59 0.95
60 0.94
61 0.94
62 0.93
63 0.91
64 0.87
65 0.84
66 0.75
67 0.67
68 0.58
69 0.5
70 0.44
71 0.4
72 0.34
73 0.31
74 0.3
75 0.28
76 0.29
77 0.32
78 0.31
79 0.33
80 0.36
81 0.32
82 0.31
83 0.3
84 0.27
85 0.2
86 0.18
87 0.11
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.07
95 0.06
96 0.1
97 0.12
98 0.13
99 0.15
100 0.15
101 0.18
102 0.18
103 0.19
104 0.23
105 0.29
106 0.37
107 0.43
108 0.47
109 0.48
110 0.54
111 0.57
112 0.57
113 0.6
114 0.61
115 0.64
116 0.68
117 0.68
118 0.62
119 0.6
120 0.53
121 0.42
122 0.35
123 0.26
124 0.19
125 0.16
126 0.16
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.09
131 0.08
132 0.06
133 0.06
134 0.1
135 0.13
136 0.16
137 0.18
138 0.19
139 0.22
140 0.27
141 0.29
142 0.28
143 0.33
144 0.3
145 0.32
146 0.32
147 0.3
148 0.26
149 0.31
150 0.32
151 0.33
152 0.37
153 0.37
154 0.42
155 0.47
156 0.51
157 0.48
158 0.48
159 0.4
160 0.42
161 0.44
162 0.39
163 0.36
164 0.31
165 0.26
166 0.23
167 0.22
168 0.16
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.15
176 0.2
177 0.24
178 0.27
179 0.28
180 0.3
181 0.32
182 0.35
183 0.37
184 0.35
185 0.33
186 0.32
187 0.29
188 0.27
189 0.28
190 0.24
191 0.21
192 0.22
193 0.2
194 0.16
195 0.16
196 0.15
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.1
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.12
209 0.16
210 0.17
211 0.19
212 0.19
213 0.2
214 0.2
215 0.21
216 0.22
217 0.2
218 0.19
219 0.17
220 0.15
221 0.13
222 0.12
223 0.16
224 0.16
225 0.17
226 0.17
227 0.17
228 0.19
229 0.19
230 0.18
231 0.15
232 0.16
233 0.21
234 0.25
235 0.26
236 0.28
237 0.28
238 0.29
239 0.32
240 0.29
241 0.23
242 0.23
243 0.22
244 0.18
245 0.18
246 0.18
247 0.15
248 0.15
249 0.14
250 0.11
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.16
255 0.18
256 0.19
257 0.18
258 0.22
259 0.25
260 0.35
261 0.36
262 0.33
263 0.34
264 0.33
265 0.33
266 0.3
267 0.23
268 0.14
269 0.12
270 0.1
271 0.08
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.02
280 0.03
281 0.03
282 0.02
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.07
308 0.07
309 0.1
310 0.11
311 0.13
312 0.13
313 0.14
314 0.13
315 0.12
316 0.11
317 0.08
318 0.09
319 0.07
320 0.08
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.08
338 0.09
339 0.1
340 0.14
341 0.13
342 0.15
343 0.15
344 0.15
345 0.13
346 0.12
347 0.15
348 0.12
349 0.12
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.12
354 0.18
355 0.14
356 0.15
357 0.17
358 0.18
359 0.19
360 0.2
361 0.23
362 0.17
363 0.18
364 0.18
365 0.16
366 0.19
367 0.2
368 0.22
369 0.18
370 0.17
371 0.18
372 0.17
373 0.17
374 0.16
375 0.17
376 0.21
377 0.2
378 0.21
379 0.22
380 0.22
381 0.21
382 0.21
383 0.24
384 0.22
385 0.21
386 0.23
387 0.21
388 0.21
389 0.21
390 0.19
391 0.13
392 0.11
393 0.14
394 0.12
395 0.13
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.12
400 0.13
401 0.14
402 0.13
403 0.17
404 0.17
405 0.18
406 0.18
407 0.18
408 0.16
409 0.11
410 0.12
411 0.09
412 0.09
413 0.07
414 0.08
415 0.08
416 0.09
417 0.09
418 0.07
419 0.07
420 0.1
421 0.11
422 0.1
423 0.12
424 0.16
425 0.18
426 0.2
427 0.22
428 0.2
429 0.23
430 0.24
431 0.23
432 0.29
433 0.29
434 0.32
435 0.36
436 0.43
437 0.42
438 0.45
439 0.55
440 0.52
441 0.56
442 0.59
443 0.56
444 0.52
445 0.53
446 0.48
447 0.39
448 0.32
449 0.27
450 0.2
451 0.17
452 0.16
453 0.13
454 0.13
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.1
459 0.15
460 0.11
461 0.18
462 0.18
463 0.19
464 0.18
465 0.19
466 0.21
467 0.16
468 0.19
469 0.17
470 0.21
471 0.25
472 0.29
473 0.31
474 0.31
475 0.3
476 0.31
477 0.29
478 0.29
479 0.32
480 0.34
481 0.39
482 0.41
483 0.49
484 0.46
485 0.42
486 0.38
487 0.31
488 0.3
489 0.26
490 0.23
491 0.19
492 0.21
493 0.21
494 0.21
495 0.21
496 0.18
497 0.18
498 0.22
499 0.2
500 0.21
501 0.22
502 0.23
503 0.24
504 0.23
505 0.2
506 0.19
507 0.22
508 0.24
509 0.27
510 0.28
511 0.28
512 0.28
513 0.26
514 0.22
515 0.18
516 0.12
517 0.09
518 0.07
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.06
524 0.08
525 0.11
526 0.13
527 0.14
528 0.14
529 0.16
530 0.18
531 0.18
532 0.18
533 0.16
534 0.22
535 0.23
536 0.24
537 0.25
538 0.29
539 0.3
540 0.32
541 0.38
542 0.36
543 0.38
544 0.42
545 0.43
546 0.42
547 0.46
548 0.43
549 0.41
550 0.38
551 0.34
552 0.29
553 0.26
554 0.22
555 0.16
556 0.16
557 0.11
558 0.11
559 0.13
560 0.13
561 0.15
562 0.15
563 0.16
564 0.21
565 0.24
566 0.24
567 0.23
568 0.31
569 0.3
570 0.31
571 0.34
572 0.33
573 0.32
574 0.33
575 0.33
576 0.27
577 0.28
578 0.27
579 0.24