Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LJB3

Protein Details
Accession A0A5C3LJB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
410-429TSKTSPAKPVPKPKHRGQDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
397-401GKRKE
416-423AKPVPKPK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033472  RMI1-like_N_hel  
IPR013894  RMI1_N  
IPR042470  RMI1_N_C_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF08585  RMI1_N  
Amino Acid Sequences MIPSAVADWLEKNYPRPRIDEEWLKECYDWITTDQNLSPTTNLQGLLNALETQLLQSDLRDSMNHSTGLPEHVALPTTTTVVEGKPILVEITALTEVGSSAFQLDQIRVAREERMRTGGEEGEEDGDLEVEGEGPMPKYPRGMLRFELTDGKTTLQAMEYRMIKELTLGVTPLGYKMQLKNVRVRRGIAFLEPNNTILKGGKTVERDNNRDADFARGLRMRLGLPVDEVEDRENQAAPPTPPPPAPAPAPQPARAAPTPAPARQPNRTRVRSPLAEISPPPSPPPMYNDDEDLEPRRRKIPNHGGSIASSGSTLVGSAARSTTSSYFASGSGTTAASGSAPATRGPALDFSLLPASTRYNVPSLSPEMEDMEEFDFDLMDEIEQGAKKTQLSTGNKGKRKEAAPAPTTATSKTSPAKPVPKPKHRGQDSDDMFFGGDSMDMDDDEFLKEIEKAESSALARGPAQPPSSGSASGSGSATDPPSVSSHASASISNVMSRGRRDIFPPMPTPMKRPTPTPIDVIEIASDGDEEERGGEMEVEEVEAEDKENMPVPTRHVRRRLFGGSQSQTRSQGRGGGVMAVHAEEVIDISD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.44
3 0.48
4 0.52
5 0.54
6 0.6
7 0.63
8 0.61
9 0.58
10 0.58
11 0.55
12 0.47
13 0.41
14 0.34
15 0.26
16 0.22
17 0.2
18 0.23
19 0.23
20 0.26
21 0.27
22 0.29
23 0.28
24 0.28
25 0.25
26 0.21
27 0.23
28 0.21
29 0.2
30 0.17
31 0.16
32 0.16
33 0.16
34 0.15
35 0.13
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.09
40 0.09
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.11
45 0.12
46 0.13
47 0.13
48 0.16
49 0.2
50 0.23
51 0.23
52 0.21
53 0.21
54 0.22
55 0.24
56 0.21
57 0.16
58 0.14
59 0.15
60 0.16
61 0.13
62 0.14
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.11
69 0.13
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.11
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.06
78 0.09
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.04
87 0.06
88 0.06
89 0.08
90 0.09
91 0.1
92 0.14
93 0.16
94 0.18
95 0.19
96 0.2
97 0.24
98 0.28
99 0.32
100 0.3
101 0.32
102 0.31
103 0.31
104 0.32
105 0.28
106 0.24
107 0.21
108 0.19
109 0.16
110 0.15
111 0.13
112 0.1
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.08
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.14
127 0.21
128 0.25
129 0.28
130 0.29
131 0.32
132 0.33
133 0.33
134 0.38
135 0.31
136 0.3
137 0.27
138 0.25
139 0.22
140 0.2
141 0.19
142 0.14
143 0.15
144 0.14
145 0.18
146 0.19
147 0.19
148 0.21
149 0.2
150 0.18
151 0.17
152 0.17
153 0.13
154 0.11
155 0.1
156 0.08
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.07
162 0.09
163 0.11
164 0.2
165 0.26
166 0.29
167 0.37
168 0.45
169 0.52
170 0.52
171 0.53
172 0.46
173 0.44
174 0.43
175 0.37
176 0.35
177 0.28
178 0.3
179 0.28
180 0.27
181 0.23
182 0.21
183 0.18
184 0.14
185 0.13
186 0.12
187 0.13
188 0.16
189 0.19
190 0.24
191 0.31
192 0.37
193 0.4
194 0.41
195 0.44
196 0.41
197 0.39
198 0.34
199 0.3
200 0.26
201 0.22
202 0.23
203 0.2
204 0.19
205 0.19
206 0.2
207 0.15
208 0.16
209 0.16
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.11
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.09
222 0.1
223 0.13
224 0.13
225 0.15
226 0.16
227 0.17
228 0.17
229 0.19
230 0.2
231 0.2
232 0.21
233 0.22
234 0.25
235 0.3
236 0.33
237 0.32
238 0.32
239 0.3
240 0.33
241 0.29
242 0.28
243 0.21
244 0.25
245 0.27
246 0.26
247 0.3
248 0.31
249 0.35
250 0.39
251 0.45
252 0.48
253 0.54
254 0.57
255 0.54
256 0.55
257 0.57
258 0.51
259 0.47
260 0.44
261 0.36
262 0.33
263 0.31
264 0.28
265 0.23
266 0.22
267 0.2
268 0.14
269 0.14
270 0.13
271 0.17
272 0.2
273 0.21
274 0.21
275 0.22
276 0.21
277 0.21
278 0.22
279 0.22
280 0.22
281 0.21
282 0.22
283 0.26
284 0.28
285 0.29
286 0.38
287 0.45
288 0.46
289 0.5
290 0.51
291 0.46
292 0.43
293 0.43
294 0.32
295 0.21
296 0.14
297 0.08
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.03
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.07
309 0.07
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.1
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.12
349 0.14
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.14
354 0.14
355 0.14
356 0.13
357 0.12
358 0.1
359 0.08
360 0.08
361 0.07
362 0.06
363 0.05
364 0.06
365 0.04
366 0.03
367 0.04
368 0.04
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.09
375 0.1
376 0.14
377 0.21
378 0.26
379 0.34
380 0.43
381 0.51
382 0.56
383 0.57
384 0.57
385 0.54
386 0.51
387 0.51
388 0.48
389 0.48
390 0.45
391 0.45
392 0.46
393 0.43
394 0.42
395 0.35
396 0.3
397 0.22
398 0.24
399 0.26
400 0.26
401 0.28
402 0.34
403 0.43
404 0.47
405 0.58
406 0.64
407 0.7
408 0.74
409 0.77
410 0.8
411 0.77
412 0.76
413 0.7
414 0.7
415 0.63
416 0.59
417 0.5
418 0.4
419 0.34
420 0.27
421 0.22
422 0.11
423 0.07
424 0.04
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.08
437 0.09
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.13
442 0.13
443 0.15
444 0.14
445 0.14
446 0.14
447 0.18
448 0.19
449 0.21
450 0.22
451 0.2
452 0.21
453 0.24
454 0.25
455 0.21
456 0.2
457 0.18
458 0.18
459 0.18
460 0.17
461 0.13
462 0.12
463 0.12
464 0.13
465 0.11
466 0.1
467 0.1
468 0.12
469 0.14
470 0.14
471 0.14
472 0.14
473 0.16
474 0.17
475 0.15
476 0.16
477 0.18
478 0.18
479 0.17
480 0.17
481 0.17
482 0.19
483 0.21
484 0.25
485 0.24
486 0.25
487 0.28
488 0.36
489 0.39
490 0.42
491 0.43
492 0.42
493 0.47
494 0.47
495 0.5
496 0.49
497 0.53
498 0.49
499 0.5
500 0.51
501 0.51
502 0.52
503 0.51
504 0.44
505 0.39
506 0.38
507 0.35
508 0.29
509 0.21
510 0.18
511 0.14
512 0.12
513 0.07
514 0.07
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.08
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.06
528 0.07
529 0.07
530 0.08
531 0.08
532 0.09
533 0.09
534 0.14
535 0.14
536 0.18
537 0.2
538 0.25
539 0.35
540 0.43
541 0.51
542 0.56
543 0.61
544 0.63
545 0.69
546 0.7
547 0.66
548 0.65
549 0.66
550 0.64
551 0.66
552 0.64
553 0.6
554 0.6
555 0.56
556 0.52
557 0.43
558 0.42
559 0.36
560 0.35
561 0.31
562 0.27
563 0.24
564 0.22
565 0.21
566 0.15
567 0.14
568 0.1
569 0.09
570 0.05