Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3MIX0

Protein Details
Accession A0A5C3MIX0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-46ASEVPAKIRKTEKKDGKGKGRDREFHVBasic
306-334AEEKETVKTDKRRKLKAEAREGKEKKQKLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-15KRKHP
23-40VPAKIRKTEKKDGKGKGR
313-337KTDKRRKLKAEAREGKEKKQKLKKS
Subcellular Location(s) cyto_mito 11.166, cyto 11, mito 10, cyto_nucl 8.166, mito_nucl 7.666, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MSPVTITPSKKRKHPVVSSASEVPAKIRKTEKKDGKGKGRDREFHVVNASLLVSIPPVFSANLRAGVDEMLDSMVMRYIPALRGVVLSHSNVRFAEKTATIKADCPFLVCKVNFDATVWSPHVGMKLVGKVNLCSPDHVSLLVHRTFNVSIPRHHIPSDTWEFEYGPAENDPEFAPDALNDVDAGTSDTKEKQEEESGGKWVHKLTGQKLGDTDGQLEFTVIGLTVANEMLSLLGSIQADPFSPEYIIRSRSPMKAGEAELDTENIDTGRGDMSADEDDIDSDEDAFAVLGRKADEAAAEEVRHRAEEKETVKTDKRRKLKAEAREGKEKKQKLKKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.79
3 0.79
4 0.78
5 0.76
6 0.7
7 0.63
8 0.54
9 0.44
10 0.38
11 0.35
12 0.32
13 0.32
14 0.38
15 0.44
16 0.52
17 0.62
18 0.69
19 0.72
20 0.8
21 0.84
22 0.85
23 0.87
24 0.86
25 0.86
26 0.85
27 0.81
28 0.79
29 0.79
30 0.7
31 0.63
32 0.58
33 0.49
34 0.4
35 0.34
36 0.27
37 0.17
38 0.15
39 0.11
40 0.08
41 0.07
42 0.07
43 0.06
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.12
48 0.13
49 0.17
50 0.17
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.15
55 0.12
56 0.1
57 0.06
58 0.06
59 0.05
60 0.05
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.07
66 0.08
67 0.1
68 0.1
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.13
73 0.13
74 0.14
75 0.17
76 0.17
77 0.18
78 0.18
79 0.21
80 0.19
81 0.19
82 0.21
83 0.19
84 0.22
85 0.22
86 0.25
87 0.23
88 0.25
89 0.25
90 0.24
91 0.21
92 0.2
93 0.19
94 0.18
95 0.24
96 0.21
97 0.22
98 0.21
99 0.23
100 0.21
101 0.2
102 0.21
103 0.15
104 0.19
105 0.18
106 0.16
107 0.14
108 0.15
109 0.15
110 0.13
111 0.12
112 0.1
113 0.14
114 0.15
115 0.17
116 0.16
117 0.16
118 0.18
119 0.23
120 0.21
121 0.18
122 0.19
123 0.19
124 0.19
125 0.19
126 0.16
127 0.13
128 0.17
129 0.18
130 0.16
131 0.13
132 0.15
133 0.15
134 0.18
135 0.23
136 0.2
137 0.2
138 0.26
139 0.28
140 0.27
141 0.27
142 0.26
143 0.19
144 0.24
145 0.28
146 0.24
147 0.22
148 0.22
149 0.21
150 0.21
151 0.21
152 0.14
153 0.1
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.11
179 0.12
180 0.14
181 0.16
182 0.19
183 0.19
184 0.21
185 0.21
186 0.21
187 0.19
188 0.17
189 0.16
190 0.16
191 0.18
192 0.18
193 0.27
194 0.27
195 0.27
196 0.27
197 0.28
198 0.27
199 0.23
200 0.22
201 0.12
202 0.13
203 0.12
204 0.12
205 0.09
206 0.07
207 0.06
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.08
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.11
233 0.15
234 0.19
235 0.18
236 0.23
237 0.26
238 0.28
239 0.31
240 0.3
241 0.3
242 0.31
243 0.31
244 0.29
245 0.26
246 0.25
247 0.22
248 0.21
249 0.17
250 0.13
251 0.12
252 0.09
253 0.08
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.06
259 0.05
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.15
285 0.16
286 0.16
287 0.17
288 0.19
289 0.2
290 0.2
291 0.18
292 0.16
293 0.18
294 0.26
295 0.29
296 0.36
297 0.39
298 0.45
299 0.52
300 0.6
301 0.66
302 0.68
303 0.74
304 0.74
305 0.77
306 0.81
307 0.81
308 0.81
309 0.83
310 0.83
311 0.81
312 0.83
313 0.8
314 0.79
315 0.8
316 0.78
317 0.77