Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LFR4

Protein Details
Accession A0A5C3LFR4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
407-443AEDSDEPKVKKRKRKPEKDPLTVKKKKGKNSVAVEGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
414-435KVKKRKRKPEKDPLTVKKKKGK
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 13.333, nucl 9.5, mito_nucl 5.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MPEIPAGAQIFDVVFHPRFSTVYTGLLTGHIKAFSYDDQGNHKQAFSLRPSKKSCRGLALDDDGSHLYAVGKSKALNIIDTVTEGIDIVAKAHDSPINRVKHLMPWILATGDDEGVIKLWDTRQKQCTRTYTQHFDYISDFLWLQDKKQLVATSGDGTLSIMDVRSKKPEPIAQSEDQEDELLSIVAIKGGTKVVVGTQLGILSIFNRSSGWGDCVDRVPGHPLSVDALCTLPALLPNVDTASTILTGSSDGYVRAVQILPTKLLGVVADHGEWPIERIAIGGGEGQLTLDQEDEGTNAKPEKSKKDESLESDDEEAEVEERQSQHGRWWVGSVGHEDVLRMTDLEGFFRDKEKDDESGKRALGMAVGEGDSDTGDGASEKDPENEPEGEASGSVIPTQDSDGDDSAEDSDEPKVKKRKRKPEKDPLTVKKKKGKNSVAVEGTFFDDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.16
4 0.16
5 0.17
6 0.18
7 0.22
8 0.19
9 0.21
10 0.21
11 0.2
12 0.2
13 0.22
14 0.21
15 0.18
16 0.18
17 0.15
18 0.15
19 0.15
20 0.18
21 0.16
22 0.21
23 0.22
24 0.23
25 0.31
26 0.36
27 0.4
28 0.38
29 0.36
30 0.33
31 0.35
32 0.38
33 0.38
34 0.44
35 0.45
36 0.52
37 0.6
38 0.66
39 0.72
40 0.73
41 0.7
42 0.68
43 0.67
44 0.63
45 0.62
46 0.59
47 0.51
48 0.43
49 0.41
50 0.32
51 0.28
52 0.22
53 0.16
54 0.11
55 0.11
56 0.14
57 0.13
58 0.14
59 0.14
60 0.17
61 0.22
62 0.21
63 0.2
64 0.18
65 0.18
66 0.17
67 0.18
68 0.16
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.09
80 0.12
81 0.12
82 0.19
83 0.26
84 0.3
85 0.31
86 0.33
87 0.32
88 0.36
89 0.4
90 0.36
91 0.29
92 0.26
93 0.26
94 0.24
95 0.23
96 0.18
97 0.13
98 0.1
99 0.1
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.1
107 0.17
108 0.2
109 0.28
110 0.37
111 0.43
112 0.48
113 0.55
114 0.59
115 0.6
116 0.65
117 0.66
118 0.64
119 0.61
120 0.62
121 0.54
122 0.48
123 0.42
124 0.34
125 0.27
126 0.2
127 0.17
128 0.11
129 0.17
130 0.16
131 0.15
132 0.17
133 0.18
134 0.17
135 0.21
136 0.21
137 0.17
138 0.19
139 0.19
140 0.17
141 0.17
142 0.16
143 0.12
144 0.11
145 0.09
146 0.07
147 0.06
148 0.04
149 0.07
150 0.09
151 0.11
152 0.16
153 0.18
154 0.19
155 0.23
156 0.27
157 0.29
158 0.35
159 0.4
160 0.36
161 0.37
162 0.37
163 0.34
164 0.3
165 0.25
166 0.17
167 0.11
168 0.09
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.04
180 0.05
181 0.04
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.13
203 0.13
204 0.12
205 0.11
206 0.14
207 0.12
208 0.12
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.04
220 0.05
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.05
240 0.06
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.11
246 0.12
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.05
282 0.06
283 0.07
284 0.08
285 0.09
286 0.11
287 0.15
288 0.2
289 0.28
290 0.34
291 0.39
292 0.43
293 0.49
294 0.53
295 0.54
296 0.58
297 0.52
298 0.46
299 0.41
300 0.35
301 0.28
302 0.23
303 0.17
304 0.1
305 0.08
306 0.06
307 0.08
308 0.08
309 0.11
310 0.13
311 0.14
312 0.18
313 0.24
314 0.25
315 0.23
316 0.24
317 0.23
318 0.23
319 0.24
320 0.22
321 0.18
322 0.18
323 0.17
324 0.16
325 0.14
326 0.13
327 0.12
328 0.09
329 0.08
330 0.1
331 0.1
332 0.12
333 0.13
334 0.14
335 0.15
336 0.18
337 0.19
338 0.18
339 0.22
340 0.23
341 0.27
342 0.31
343 0.37
344 0.37
345 0.41
346 0.38
347 0.35
348 0.33
349 0.28
350 0.24
351 0.17
352 0.14
353 0.09
354 0.09
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.06
360 0.05
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.06
365 0.07
366 0.1
367 0.11
368 0.14
369 0.16
370 0.18
371 0.22
372 0.21
373 0.21
374 0.2
375 0.2
376 0.17
377 0.15
378 0.14
379 0.11
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.08
384 0.08
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.13
389 0.14
390 0.14
391 0.14
392 0.14
393 0.14
394 0.13
395 0.12
396 0.1
397 0.14
398 0.18
399 0.2
400 0.28
401 0.38
402 0.46
403 0.57
404 0.67
405 0.74
406 0.8
407 0.9
408 0.92
409 0.93
410 0.95
411 0.95
412 0.95
413 0.94
414 0.94
415 0.91
416 0.89
417 0.88
418 0.85
419 0.84
420 0.84
421 0.83
422 0.82
423 0.81
424 0.82
425 0.78
426 0.72
427 0.63
428 0.54