FuNGI

A0A5C3MHQ0

Protein Details

Accession

A0A5C3MHQ0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
270-321	PREAQEKQRGKRRRLEKKKKNEDVSVAAKAKEKEREREGRRRKPKATVEWPW	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
276-314	KQRGKRRRLEKKKKNEDVSVAAKAKEKEREREGRRRKPK

Subcellular Location(s)

cyto 12, mito 11, nucl 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MKIVTTFHNSSSVLCSLKCRLASRDIEHLIVAKLNRIDVYSLQPQGLRHECTTEIRGKVLCIRAIPISGSGRSKLVLMIAHPDPELIFFSFKLPVEETAELVADKQLSLYERTPRPAEFFNNIIVHPSGKLAVVSCYTGKLKIVTFKAGSYEQDFDVSLPELNVFSVAFLPTSEDEYAIAILHIDHQERIQLLARDISIDDLELSPHPSALLHQTPISSKNLPYPTEFIPQLVTVPTVLPEDDADADEEGFPGGVLVVGGKKILFYELTPREAQEKQRGKRRRLEKKKKNEDVSVAAKAKEKEREREGRRRKPKATVEWPWTEVTAWCAIDEEPLRFFLGDSYGRLSLLSLDNLKYIGLVLLPLGETSAPTTLTYLTNQTLYIGSHMGDSQLVQVSPSPLSYIDSPTLPIPLDINTVTPNALTMPGGTKKGKGKAIANDDMDVDEDTTNDVSVGCVVNSTGSYINVVESYKNIAPIMDAVLADTDGSGQSQIVTCSGGHNTGSVNVVRNGADFQELASVLGVPDVVRIWSMRLMHNDKFDTHIIASTLTSTHLFKINDSGSSTTLTYVKDKTSDAFITDKPTLAFANVFGRNINIDSGYVDSSMVVQATPAGLYLLEGNSDTGEYELIASWDAVANTPPGQRQYEVVAASVNSSQIAVALARGELLIFKLTEKKEFELVIKHPTNAREISAVSITPLNPTAPYSSYVTLAYWSSKVIEIFILKPHSRTRDLILESLGKSEPLPALIRSLLLFNFGLEHKSNELNYHPYLIAGLSDGSIATYSWKLKELKKEGELKDRKIVSLGHAPVTLTPCIVEGKPAVFAAGNRASILSWKKERLIHSPIMIKDVCAAFPLNTPTFSTSLVLATSSGLTIGRVRELDKMHVRSIPFGLDNPRKIAYEPTLKVFIVACTRTEPGRIGDIESVTSSFRLLDDSTFAQLAKFNCEPDEEITSLTTFPLPTEGNATPLFCVGTYFYKADDKEPASGRILIFTAHETPGQSPTLQLSLVASQYVKGCVYAIVTVKNKIIAAVNSSVMIFRIDSSQDGSAPSITLKALPEWNHNYLVTSLASHGDHVVAGDQISSVSLLKVEESRIKSVARDYGPLWPVCVEVSDAEHIITANDALNLFTFSLNLNLGRSVLERDGSYHVADLITKFIRGALSVSDTPTLTPTQIFFTSSGRIGVIVDVVDATLSLGLTAVQRNLASTIPGIGGTSHTRYRAPKNTRGRSDADAVAFGFIDGDFLEQFLTLLGSPPQLQKVIEGQSEPERLTMSVEEIQKVLENLQSLH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.27
3	0.28
4	0.33
5	0.36
6	0.35
7	0.37
8	0.43
9	0.5
10	0.5
11	0.55
12	0.52
13	0.48
14	0.45
15	0.42
16	0.34
17	0.31
18	0.27
19	0.22
20	0.21
21	0.21
22	0.21
23	0.2
24	0.21
25	0.2
26	0.26
27	0.28
28	0.28
29	0.28
30	0.3
31	0.3
32	0.36
33	0.39
34	0.37
35	0.32
36	0.33
37	0.35
38	0.37
39	0.42
40	0.41
41	0.37
42	0.35
43	0.35
44	0.34
45	0.39
46	0.39
47	0.36
48	0.3
49	0.31
50	0.29
51	0.3
52	0.29
53	0.27
54	0.25
55	0.27
56	0.28
57	0.27
58	0.26
59	0.25
60	0.24
61	0.2
62	0.19
63	0.16
64	0.14
65	0.19
66	0.2
67	0.21
68	0.2
69	0.2
70	0.17
71	0.17
72	0.18
73	0.14
74	0.14
75	0.12
76	0.15
77	0.19
78	0.19
79	0.21
80	0.2
81	0.21
82	0.25
83	0.25
84	0.24
85	0.21
86	0.21
87	0.18
88	0.16
89	0.16
90	0.1
91	0.09
92	0.09
93	0.1
94	0.11
95	0.16
96	0.19
97	0.27
98	0.31
99	0.36
100	0.39
101	0.38
102	0.41
103	0.42
104	0.44
105	0.39
106	0.37
107	0.38
108	0.37
109	0.35
110	0.34
111	0.3
112	0.25
113	0.21
114	0.2
115	0.14
116	0.13
117	0.13
118	0.11
119	0.13
120	0.13
121	0.15
122	0.15
123	0.18
124	0.19
125	0.19
126	0.2
127	0.2
128	0.21
129	0.27
130	0.29
131	0.32
132	0.31
133	0.31
134	0.34
135	0.33
136	0.33
137	0.29
138	0.29
139	0.23
140	0.23
141	0.22
142	0.18
143	0.18
144	0.16
145	0.13
146	0.11
147	0.11
148	0.1
149	0.09
150	0.1
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.08
155	0.07
156	0.07
157	0.1
158	0.1
159	0.14
160	0.14
161	0.13
162	0.12
163	0.13
164	0.13
165	0.1
166	0.09
167	0.06
168	0.06
169	0.09
170	0.11
171	0.12
172	0.12
173	0.12
174	0.15
175	0.15
176	0.17
177	0.19
178	0.19
179	0.19
180	0.21
181	0.21
182	0.19
183	0.19
184	0.19
185	0.13
186	0.11
187	0.11
188	0.09
189	0.1
190	0.1
191	0.12
192	0.11
193	0.11
194	0.1
195	0.09
196	0.11
197	0.16
198	0.19
199	0.18
200	0.19
201	0.21
202	0.23
203	0.26
204	0.29
205	0.24
206	0.22
207	0.29
208	0.33
209	0.33
210	0.34
211	0.35
212	0.34
213	0.38
214	0.37
215	0.29
216	0.26
217	0.24
218	0.22
219	0.19
220	0.15
221	0.1
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.09
226	0.09
227	0.08
228	0.09
229	0.1
230	0.1
231	0.1
232	0.09
233	0.1
234	0.09
235	0.09
236	0.07
237	0.06
238	0.05
239	0.04
240	0.04
241	0.03
242	0.03
243	0.04
244	0.04
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.06
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.17
254	0.21
255	0.25
256	0.25
257	0.26
258	0.29
259	0.32
260	0.38
261	0.39
262	0.45
263	0.48
264	0.58
265	0.66
266	0.69
267	0.74
268	0.79
269	0.8
270	0.82
271	0.86
272	0.87
273	0.89
274	0.94
275	0.94
276	0.9
277	0.85
278	0.78
279	0.74
280	0.69
281	0.65
282	0.56
283	0.48
284	0.45
285	0.41
286	0.41
287	0.43
288	0.42
289	0.42
290	0.48
291	0.57
292	0.61
293	0.7
294	0.76
295	0.78
296	0.84
297	0.86
298	0.83
299	0.83
300	0.84
301	0.83
302	0.82
303	0.8
304	0.76
305	0.71
306	0.68
307	0.59
308	0.49
309	0.4
310	0.3
311	0.23
312	0.2
313	0.15
314	0.12
315	0.12
316	0.12
317	0.16
318	0.17
319	0.16
320	0.13
321	0.14
322	0.14
323	0.13
324	0.14
325	0.1
326	0.13
327	0.13
328	0.13
329	0.15
330	0.15
331	0.15
332	0.15
333	0.14
334	0.13
335	0.13
336	0.14
337	0.13
338	0.13
339	0.13
340	0.13
341	0.13
342	0.1
343	0.09
344	0.07
345	0.05
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.05
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.07
359	0.08
360	0.1
361	0.11
362	0.12
363	0.13
364	0.13
365	0.13
366	0.13
367	0.12
368	0.11
369	0.11
370	0.09
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.09
382	0.1
383	0.1
384	0.1
385	0.09
386	0.08
387	0.1
388	0.11
389	0.13
390	0.12
391	0.12
392	0.13
393	0.13
394	0.14
395	0.12
396	0.11
397	0.09
398	0.09
399	0.1
400	0.1
401	0.1
402	0.1
403	0.1
404	0.1
405	0.09
406	0.08
407	0.07
408	0.07
409	0.06
410	0.06
411	0.09
412	0.12
413	0.16
414	0.16
415	0.2
416	0.25
417	0.31
418	0.34
419	0.34
420	0.37
421	0.41
422	0.48
423	0.49
424	0.45
425	0.4
426	0.36
427	0.32
428	0.28
429	0.2
430	0.14
431	0.08
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.06
436	0.06
437	0.05
438	0.04
439	0.05
440	0.06
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.07
447	0.06
448	0.06
449	0.07
450	0.07
451	0.07
452	0.08
453	0.08
454	0.07
455	0.07
456	0.11
457	0.11
458	0.12
459	0.11
460	0.1
461	0.1
462	0.11
463	0.12
464	0.08
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.07
469	0.06
470	0.06
471	0.04
472	0.03
473	0.03
474	0.04
475	0.03
476	0.04
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.06
481	0.06
482	0.07
483	0.08
484	0.09
485	0.08
486	0.08
487	0.08
488	0.08
489	0.1
490	0.09
491	0.11
492	0.11
493	0.12
494	0.12
495	0.12
496	0.11
497	0.1
498	0.1
499	0.08
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.06
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.03
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.05
516	0.08
517	0.1
518	0.12
519	0.19
520	0.24
521	0.26
522	0.3
523	0.3
524	0.27
525	0.29
526	0.27
527	0.22
528	0.18
529	0.16
530	0.12
531	0.12
532	0.11
533	0.08
534	0.08
535	0.07
536	0.08
537	0.08
538	0.08
539	0.13
540	0.13
541	0.13
542	0.17
543	0.17
544	0.17
545	0.18
546	0.18
547	0.14
548	0.15
549	0.15
550	0.11
551	0.12
552	0.12
553	0.13
554	0.13
555	0.13
556	0.13
557	0.14
558	0.13
559	0.15
560	0.15
561	0.14
562	0.15
563	0.15
564	0.19
565	0.19
566	0.19
567	0.15
568	0.16
569	0.14
570	0.12
571	0.11
572	0.07
573	0.13
574	0.13
575	0.13
576	0.12
577	0.13
578	0.13
579	0.13
580	0.12
581	0.06
582	0.05
583	0.06
584	0.07
585	0.07
586	0.06
587	0.06
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.05
592	0.04
593	0.03
594	0.03
595	0.03
596	0.03
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.03
601	0.04
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.04
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.03
613	0.03
614	0.04
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.04
619	0.05
620	0.04
621	0.05
622	0.05
623	0.06
624	0.08
625	0.08
626	0.1
627	0.11
628	0.11
629	0.12
630	0.13
631	0.15
632	0.15
633	0.14
634	0.12
635	0.11
636	0.11
637	0.11
638	0.08
639	0.05
640	0.05
641	0.04
642	0.04
643	0.05
644	0.04
645	0.03
646	0.04
647	0.03
648	0.04
649	0.04
650	0.03
651	0.03
652	0.04
653	0.04
654	0.04
655	0.05
656	0.1
657	0.11
658	0.15
659	0.16
660	0.17
661	0.19
662	0.2
663	0.2
664	0.2
665	0.21
666	0.25
667	0.25
668	0.24
669	0.25
670	0.25
671	0.27
672	0.23
673	0.22
674	0.14
675	0.14
676	0.14
677	0.12
678	0.11
679	0.09
680	0.09
681	0.09
682	0.08
683	0.09
684	0.07
685	0.07
686	0.08
687	0.09
688	0.09
689	0.11
690	0.12
691	0.12
692	0.13
693	0.13
694	0.13
695	0.12
696	0.11
697	0.1
698	0.09
699	0.08
700	0.08
701	0.09
702	0.08
703	0.08
704	0.08
705	0.09
706	0.09
707	0.12
708	0.16
709	0.15
710	0.18
711	0.21
712	0.24
713	0.26
714	0.26
715	0.26
716	0.29
717	0.31
718	0.29
719	0.27
720	0.26
721	0.23
722	0.24
723	0.2
724	0.13
725	0.11
726	0.12
727	0.1
728	0.09
729	0.1
730	0.08
731	0.1
732	0.1
733	0.1
734	0.09
735	0.1
736	0.08
737	0.09
738	0.09
739	0.07
740	0.08
741	0.08
742	0.1
743	0.1
744	0.11
745	0.11
746	0.13
747	0.13
748	0.13
749	0.15
750	0.16
751	0.16
752	0.17
753	0.15
754	0.14
755	0.13
756	0.12
757	0.1
758	0.06
759	0.06
760	0.04
761	0.04
762	0.04
763	0.04
764	0.04
765	0.04
766	0.05
767	0.07
768	0.08
769	0.08
770	0.13
771	0.17
772	0.21
773	0.3
774	0.36
775	0.4
776	0.45
777	0.53
778	0.52
779	0.6
780	0.61
781	0.55
782	0.55
783	0.5
784	0.44
785	0.37
786	0.34
787	0.27
788	0.3
789	0.28
790	0.22
791	0.21
792	0.21
793	0.21
794	0.23
795	0.19
796	0.11
797	0.1
798	0.09
799	0.11
800	0.1
801	0.1
802	0.08
803	0.09
804	0.1
805	0.1
806	0.09
807	0.08
808	0.08
809	0.13
810	0.15
811	0.14
812	0.13
813	0.14
814	0.13
815	0.17
816	0.2
817	0.2
818	0.21
819	0.23
820	0.27
821	0.31
822	0.34
823	0.37
824	0.4
825	0.37
826	0.37
827	0.41
828	0.37
829	0.38
830	0.34
831	0.27
832	0.24
833	0.22
834	0.18
835	0.13
836	0.14
837	0.1
838	0.12
839	0.17
840	0.14
841	0.14
842	0.15
843	0.16
844	0.17
845	0.17
846	0.15
847	0.11
848	0.11
849	0.1
850	0.1
851	0.08
852	0.07
853	0.06
854	0.06
855	0.05
856	0.05
857	0.05
858	0.07
859	0.07
860	0.09
861	0.09
862	0.1
863	0.15
864	0.17
865	0.23
866	0.29
867	0.31
868	0.32
869	0.34
870	0.33
871	0.31
872	0.3
873	0.25
874	0.19
875	0.17
876	0.24
877	0.27
878	0.29
879	0.29
880	0.3
881	0.28
882	0.29
883	0.3
884	0.28
885	0.31
886	0.3
887	0.31
888	0.32
889	0.31
890	0.31
891	0.28
892	0.24
893	0.2
894	0.2
895	0.17
896	0.17
897	0.19
898	0.18
899	0.19
900	0.19
901	0.15
902	0.18
903	0.18
904	0.17
905	0.18
906	0.18
907	0.17
908	0.16
909	0.15
910	0.11
911	0.11
912	0.09
913	0.07
914	0.07
915	0.08
916	0.08
917	0.08
918	0.1
919	0.12
920	0.13
921	0.13
922	0.13
923	0.11
924	0.14
925	0.14
926	0.18
927	0.17
928	0.17
929	0.17
930	0.19
931	0.2
932	0.2
933	0.23
934	0.17
935	0.17
936	0.16
937	0.16
938	0.15
939	0.13
940	0.11
941	0.08
942	0.07
943	0.1
944	0.1
945	0.09
946	0.15
947	0.15
948	0.17
949	0.18
950	0.18
951	0.15
952	0.15
953	0.15
954	0.09
955	0.1
956	0.09
957	0.11
958	0.14
959	0.14
960	0.15
961	0.2
962	0.21
963	0.22
964	0.27
965	0.25
966	0.28
967	0.3
968	0.32
969	0.29
970	0.32
971	0.29
972	0.24
973	0.22
974	0.17
975	0.15
976	0.15
977	0.15
978	0.13
979	0.14
980	0.14
981	0.15
982	0.17
983	0.18
984	0.15
985	0.13
986	0.14
987	0.14
988	0.13
989	0.12
990	0.1
991	0.11
992	0.11
993	0.11
994	0.09
995	0.1
996	0.11
997	0.12
998	0.11
999	0.1
1000	0.1
1001	0.09
1002	0.1
1003	0.12
1004	0.13
1005	0.18
1006	0.2
1007	0.22
1008	0.22
1009	0.23
1010	0.22
1011	0.2
1012	0.22
1013	0.16
1014	0.18
1015	0.18
1016	0.18
1017	0.17
1018	0.17
1019	0.16
1020	0.13
1021	0.12
1022	0.08
1023	0.07
1024	0.09
1025	0.09
1026	0.1
1027	0.13
1028	0.13
1029	0.13
1030	0.14
1031	0.15
1032	0.13
1033	0.12
1034	0.12
1035	0.1
1036	0.09
1037	0.1
1038	0.1
1039	0.12
1040	0.17
1041	0.19
1042	0.27
1043	0.31
1044	0.34
1045	0.35
1046	0.34
1047	0.33
1048	0.28
1049	0.28
1050	0.2
1051	0.15
1052	0.13
1053	0.13
1054	0.13
1055	0.12
1056	0.12
1057	0.1
1058	0.1
1059	0.09
1060	0.09
1061	0.07
1062	0.07
1063	0.06
1064	0.06
1065	0.05
1066	0.06
1067	0.06
1068	0.06
1069	0.05
1070	0.06
1071	0.06
1072	0.08
1073	0.09
1074	0.12
1075	0.19
1076	0.22
1077	0.25
1078	0.27
1079	0.28
1080	0.28
1081	0.31
1082	0.35
1083	0.29
1084	0.29
1085	0.27
1086	0.33
1087	0.37
1088	0.35
1089	0.32
1090	0.25
1091	0.24
1092	0.21
1093	0.2
1094	0.13
1095	0.09
1096	0.12
1097	0.12
1098	0.12
1099	0.12
1100	0.12
1101	0.11
1102	0.1
1103	0.1
1104	0.08
1105	0.07
1106	0.07
1107	0.07
1108	0.07
1109	0.08
1110	0.09
1111	0.09
1112	0.08
1113	0.08
1114	0.08
1115	0.1
1116	0.11
1117	0.11
1118	0.11
1119	0.11
1120	0.11
1121	0.12
1122	0.13
1123	0.14
1124	0.14
1125	0.15
1126	0.14
1127	0.17
1128	0.21
1129	0.21
1130	0.21
1131	0.18
1132	0.17
1133	0.16
1134	0.16
1135	0.14
1136	0.15
1137	0.14
1138	0.14
1139	0.13
1140	0.14
1141	0.14
1142	0.14
1143	0.14
1144	0.11
1145	0.17
1146	0.18
1147	0.2
1148	0.2
1149	0.2
1150	0.2
1151	0.21
1152	0.19
1153	0.14
1154	0.14
1155	0.14
1156	0.16
1157	0.17
1158	0.19
1159	0.18
1160	0.19
1161	0.22
1162	0.21
1163	0.21
1164	0.17
1165	0.16
1166	0.14
1167	0.13
1168	0.12
1169	0.08
1170	0.08
1171	0.06
1172	0.06
1173	0.06
1174	0.05
1175	0.05
1176	0.04
1177	0.04
1178	0.04
1179	0.04
1180	0.05
1181	0.07
1182	0.09
1183	0.1
1184	0.11
1185	0.11
1186	0.13
1187	0.14
1188	0.14
1189	0.13
1190	0.12
1191	0.13
1192	0.11
1193	0.11
1194	0.11
1195	0.1
1196	0.12
1197	0.15
1198	0.2
1199	0.21
1200	0.23
1201	0.27
1202	0.33
1203	0.43
1204	0.5
1205	0.55
1206	0.6
1207	0.68
1208	0.76
1209	0.79
1210	0.79
1211	0.74
1212	0.68
1213	0.66
1214	0.6
1215	0.51
1216	0.42
1217	0.34
1218	0.29
1219	0.25
1220	0.19
1221	0.14
1222	0.09
1223	0.08
1224	0.06
1225	0.07
1226	0.06
1227	0.06
1228	0.07
1229	0.06
1230	0.06
1231	0.06
1232	0.07
1233	0.06
1234	0.08
1235	0.09
1236	0.11
1237	0.14
1238	0.17
1239	0.2
1240	0.21
1241	0.21
1242	0.22
1243	0.27
1244	0.31
1245	0.31
1246	0.29
1247	0.29
1248	0.34
1249	0.37
1250	0.35
1251	0.29
1252	0.25
1253	0.23
1254	0.25
1255	0.22
1256	0.19
1257	0.22
1258	0.25
1259	0.25
1260	0.23
1261	0.24
1262	0.23
1263	0.23
1264	0.2
1265	0.16

A0A5C3MHQ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer