Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LTN1

Protein Details
Accession A0A5C3LTN1    Localization Confidence Low Confidence Score 6.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
152-171ASYRKQMRERHRKYNTPMRQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 8.5, cyto_nucl 7, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003196  TFIIF_beta  
IPR040504  TFIIF_beta_N  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005674  C:transcription factor TFIIF complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF17683  TFIIF_beta_N  
CDD cd07980  TFIIF_beta  
Amino Acid Sequences MLDQGNGRVWLVKIPKFLMERWSAVKVEDVHLATLRVYTAEPGKKTRIILFLPPNQDPNAPAPGTPPPVDPKRPTFEYTTTFPTSGAEPDCYELEMVNDAVENQIVVAERPKDPTLSASTSAAAATTNTRARTTILTGRIKHECNLRPAFSASYRKQMRERHRKYNTPMRQIRMIEDAGVVGGRGGVNRLTSSVGVGAGGAFGDLIKTKPKQPKGAFEHMTRMPRNQLLDAIFLHFRESSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.37
3 0.37
4 0.38
5 0.38
6 0.36
7 0.36
8 0.37
9 0.39
10 0.33
11 0.31
12 0.34
13 0.29
14 0.27
15 0.28
16 0.25
17 0.22
18 0.23
19 0.23
20 0.18
21 0.16
22 0.14
23 0.1
24 0.09
25 0.1
26 0.16
27 0.21
28 0.24
29 0.28
30 0.32
31 0.34
32 0.36
33 0.38
34 0.36
35 0.34
36 0.39
37 0.43
38 0.45
39 0.47
40 0.46
41 0.44
42 0.4
43 0.38
44 0.32
45 0.27
46 0.26
47 0.21
48 0.19
49 0.19
50 0.22
51 0.25
52 0.24
53 0.23
54 0.25
55 0.3
56 0.36
57 0.38
58 0.4
59 0.43
60 0.46
61 0.46
62 0.44
63 0.42
64 0.4
65 0.4
66 0.4
67 0.35
68 0.32
69 0.29
70 0.25
71 0.22
72 0.2
73 0.18
74 0.13
75 0.11
76 0.13
77 0.13
78 0.12
79 0.11
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.04
89 0.04
90 0.03
91 0.03
92 0.04
93 0.04
94 0.06
95 0.08
96 0.09
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.14
102 0.16
103 0.16
104 0.17
105 0.15
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.11
110 0.07
111 0.06
112 0.05
113 0.08
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.12
118 0.13
119 0.14
120 0.17
121 0.19
122 0.24
123 0.29
124 0.3
125 0.33
126 0.36
127 0.36
128 0.35
129 0.38
130 0.34
131 0.36
132 0.39
133 0.36
134 0.33
135 0.34
136 0.34
137 0.31
138 0.36
139 0.3
140 0.36
141 0.37
142 0.39
143 0.45
144 0.51
145 0.57
146 0.6
147 0.66
148 0.67
149 0.73
150 0.78
151 0.79
152 0.81
153 0.79
154 0.78
155 0.77
156 0.7
157 0.68
158 0.61
159 0.56
160 0.49
161 0.4
162 0.3
163 0.24
164 0.19
165 0.13
166 0.12
167 0.09
168 0.04
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.06
193 0.11
194 0.14
195 0.22
196 0.32
197 0.4
198 0.49
199 0.54
200 0.64
201 0.67
202 0.75
203 0.73
204 0.66
205 0.67
206 0.62
207 0.65
208 0.57
209 0.52
210 0.48
211 0.46
212 0.47
213 0.41
214 0.39
215 0.33
216 0.34
217 0.31
218 0.29
219 0.26
220 0.22
221 0.23