Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3MDE4

Protein Details
Accession A0A5C3MDE4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
491-520RSPPTPQSWEGPRRNRSRGRHSPSRSPPAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
503-513RRNRSRGRHSP
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011333  SKP1/BTB/POZ_sf  
Amino Acid Sequences MLSSTKPRSQTPRASHTPTHPPISYPLNSGRPSSQSTIVPPSPPQTPPTGRRPSISNTMHWLSRTSTQSSTSTPYSPSKPTRISEPKLARSIELLAQPRSGVLGAGATVVRTPDEALRETGVRLTYDGKANEQAREASARVKEFDSKKRATAPEEPPSPPTSPPLPPLPMPGDNEEEILEAETEAEPMKMPPRPTRAPPSAPSLPPTNNQPSPSFQPSLRPSLKQRTSSSAEETFPVPPLPANIPLCPSSPPFRPILMSEVPGGQVDPSKIIVTIETCTTTFKTTLETIYSRPSHLSSYVSSLFPRQRSHSTASSVYSTASDDMEAYHHHLASQGLLSQASFNLHIFLDRPSAPYTYILNYLRSPVGSLECPEILPRGVQLHSSSHARLDSLIELRDEAAYLKLDDLHKMCTDEIRLRHGPRFHTRGNSSTSTAGSVHSLHASVYSLHTLLERVESDIRSSTSNHRGSDPCDSNHQGGKDSTSDVVTIPARSPPTPQSWEGPRRNRSRGRHSPSRSPPAGWI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.74
3 0.73
4 0.74
5 0.7
6 0.67
7 0.58
8 0.52
9 0.5
10 0.51
11 0.46
12 0.4
13 0.42
14 0.43
15 0.44
16 0.45
17 0.43
18 0.4
19 0.43
20 0.42
21 0.39
22 0.34
23 0.37
24 0.42
25 0.41
26 0.39
27 0.37
28 0.36
29 0.36
30 0.35
31 0.33
32 0.34
33 0.4
34 0.44
35 0.52
36 0.58
37 0.56
38 0.56
39 0.58
40 0.56
41 0.58
42 0.55
43 0.48
44 0.45
45 0.47
46 0.46
47 0.42
48 0.38
49 0.31
50 0.35
51 0.35
52 0.32
53 0.31
54 0.32
55 0.34
56 0.34
57 0.36
58 0.32
59 0.3
60 0.3
61 0.33
62 0.34
63 0.4
64 0.43
65 0.46
66 0.49
67 0.49
68 0.55
69 0.6
70 0.6
71 0.63
72 0.65
73 0.64
74 0.65
75 0.64
76 0.53
77 0.46
78 0.44
79 0.37
80 0.34
81 0.32
82 0.27
83 0.26
84 0.26
85 0.23
86 0.21
87 0.17
88 0.11
89 0.07
90 0.06
91 0.05
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.09
101 0.12
102 0.14
103 0.15
104 0.17
105 0.17
106 0.17
107 0.19
108 0.17
109 0.14
110 0.14
111 0.15
112 0.16
113 0.21
114 0.22
115 0.21
116 0.27
117 0.29
118 0.29
119 0.28
120 0.26
121 0.22
122 0.24
123 0.22
124 0.21
125 0.22
126 0.22
127 0.22
128 0.23
129 0.29
130 0.33
131 0.41
132 0.44
133 0.43
134 0.44
135 0.5
136 0.51
137 0.49
138 0.52
139 0.51
140 0.52
141 0.54
142 0.53
143 0.48
144 0.48
145 0.44
146 0.36
147 0.32
148 0.27
149 0.25
150 0.27
151 0.29
152 0.28
153 0.27
154 0.3
155 0.31
156 0.3
157 0.3
158 0.3
159 0.28
160 0.26
161 0.26
162 0.22
163 0.17
164 0.14
165 0.12
166 0.09
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.1
176 0.12
177 0.15
178 0.21
179 0.28
180 0.32
181 0.37
182 0.45
183 0.48
184 0.5
185 0.5
186 0.52
187 0.49
188 0.46
189 0.43
190 0.39
191 0.35
192 0.31
193 0.35
194 0.34
195 0.31
196 0.33
197 0.32
198 0.31
199 0.35
200 0.38
201 0.34
202 0.27
203 0.33
204 0.33
205 0.4
206 0.39
207 0.36
208 0.37
209 0.45
210 0.51
211 0.49
212 0.48
213 0.46
214 0.49
215 0.48
216 0.47
217 0.39
218 0.34
219 0.29
220 0.28
221 0.22
222 0.18
223 0.16
224 0.11
225 0.08
226 0.09
227 0.1
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.16
232 0.17
233 0.18
234 0.18
235 0.18
236 0.17
237 0.18
238 0.19
239 0.19
240 0.18
241 0.19
242 0.18
243 0.21
244 0.19
245 0.17
246 0.16
247 0.14
248 0.14
249 0.13
250 0.12
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.2
277 0.2
278 0.18
279 0.18
280 0.18
281 0.17
282 0.17
283 0.18
284 0.12
285 0.16
286 0.18
287 0.17
288 0.16
289 0.2
290 0.23
291 0.24
292 0.26
293 0.25
294 0.28
295 0.31
296 0.36
297 0.35
298 0.35
299 0.34
300 0.33
301 0.3
302 0.26
303 0.22
304 0.17
305 0.15
306 0.12
307 0.1
308 0.08
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.12
336 0.11
337 0.14
338 0.14
339 0.15
340 0.16
341 0.16
342 0.17
343 0.15
344 0.21
345 0.2
346 0.21
347 0.2
348 0.22
349 0.21
350 0.19
351 0.18
352 0.13
353 0.14
354 0.13
355 0.14
356 0.14
357 0.14
358 0.14
359 0.14
360 0.14
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.11
366 0.13
367 0.14
368 0.15
369 0.18
370 0.21
371 0.2
372 0.19
373 0.19
374 0.18
375 0.17
376 0.16
377 0.16
378 0.16
379 0.16
380 0.14
381 0.14
382 0.15
383 0.14
384 0.12
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.12
391 0.13
392 0.17
393 0.17
394 0.19
395 0.19
396 0.21
397 0.21
398 0.2
399 0.23
400 0.26
401 0.27
402 0.32
403 0.37
404 0.39
405 0.44
406 0.46
407 0.49
408 0.52
409 0.56
410 0.53
411 0.56
412 0.56
413 0.54
414 0.56
415 0.52
416 0.46
417 0.41
418 0.37
419 0.3
420 0.27
421 0.23
422 0.18
423 0.16
424 0.15
425 0.13
426 0.13
427 0.11
428 0.11
429 0.11
430 0.11
431 0.11
432 0.12
433 0.11
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.11
438 0.13
439 0.12
440 0.14
441 0.18
442 0.18
443 0.19
444 0.21
445 0.22
446 0.2
447 0.23
448 0.27
449 0.33
450 0.38
451 0.38
452 0.4
453 0.42
454 0.44
455 0.52
456 0.49
457 0.42
458 0.45
459 0.47
460 0.46
461 0.48
462 0.46
463 0.39
464 0.35
465 0.36
466 0.3
467 0.28
468 0.25
469 0.21
470 0.2
471 0.16
472 0.2
473 0.18
474 0.18
475 0.17
476 0.2
477 0.23
478 0.23
479 0.28
480 0.29
481 0.35
482 0.39
483 0.41
484 0.43
485 0.5
486 0.6
487 0.66
488 0.7
489 0.71
490 0.75
491 0.82
492 0.84
493 0.84
494 0.85
495 0.86
496 0.85
497 0.86
498 0.85
499 0.86
500 0.87
501 0.88
502 0.8