FuNGI

A0A5C3M5A7

Protein Details

Accession

A0A5C3M5A7

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
117-139	GDVLKRVRQSRERQSSKNFARFK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 19.5, cyto_mito 12.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MSQNNSALIGSIIERKLTATARSPQPSSSGKTGFPTVQHRSKSAFSRNREESRKTSGLLRPEEPPTLLPVKSSPPNPVEDWREQISKENEKRVAGMSPEEIEEEKRQIIDRFGADIGDVLKRVRQSRERQSSKNFARFKAVPLPNNDGEETPPRMKEVPITRSESPSRVKSPERARSPPPPALLASGSRPSSRLDRRLRFAELGPDDVHVYESAPPSPTKKALALTAPTGDDGDVVSLGQWHGTMAPQPSEPPSLEPTEPEEGSAEYIRRRYFPDAPADDPNLAWMNMAPATPDMTSSSLRFDLHGNPIALALSSTLPTHLGLHHHAEGEHAGYTLDDIFLLSRSTVPAQRANMLGILARIAEKIAKVRKGDVDGLQEVVGKEEDLRKRIVAAGVEAMSERGGVGAHAVEVIWVCVVAWDEDLIDIEGVELESPAHSAIKSLPLDFMLPQIAAIFAQGDALPESRSQLLAILHRLAQESNEIATTIAATPKLLSSVLQTFLLTPIPPTESAPLPDPSAFQFFITIALSSRSNAKLVEELSDPLLRYLTFLPSSSPYPAALTSSLITATLHLYTVLASYGFYSHISTTVMEQLNQVAQYILSEACTSRKLLERWAGLVESWTVCAVDPHKTTPTHEILWSQVVGWGWNEEISELQARLGTEEKDWGVWTKTWDAQAAWLEGSKVNAIKGGEDERAQFVVSVSPRFESGKQKEVVLCAIDAIQAGLLKTTSLVDDDGFTDTLHSLFCYANLLTAAIRLWLSCLPSHLDGPPSSPPFSLPFTQISELCRQLLVHPVWTLVSSLEKSPACRYVFCRGLSSLLSIYLKFSRRLPDISQDLWMAQALSILSRLMPGDEDFALQIVQDITCLLTPDWAATRSIAVPPVIWEKSGMSAITPFLTNTLRPFQDVYIGPLSMSPQSIQAATTQRLPAPFKLRTFGLPVFRDWTLTPLDHLLRSGDSTVFKALPADWDSSEVEVTRAALFFTMVARDVLHRFMLNSFVLTREEAVFGCMKVFMLEHGQPQNDSAEEVFRDGIVGQLMDDVLRPYTIGAIGTSSALVAPAGEESLEKVAVRFLGTSVPFYQYYTDFVALYDAISFSHPLFARLLLPSTSMRYPVDYRKHLWNDFNHVMRTIRTPFEQVISGDLREYLHPLEADPQLIGSYLRSLLKGSLQEFVRLVALHHLASNIWIDLEKEGYNDERAGKLLKTIVDQGSKELVSEVVRYRQSRAGPVVLPPLCFLGLDDVKEARIQSLRRWGGEPLVERLEALFHT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.17
3	0.21
4	0.23
5	0.25
6	0.25
7	0.34
8	0.42
9	0.48
10	0.48
11	0.45
12	0.49
13	0.5
14	0.49
15	0.48
16	0.43
17	0.39
18	0.41
19	0.44
20	0.41
21	0.41
22	0.44
23	0.45
24	0.49
25	0.51
26	0.5
27	0.5
28	0.54
29	0.57
30	0.59
31	0.6
32	0.59
33	0.65
34	0.71
35	0.76
36	0.78
37	0.76
38	0.71
39	0.71
40	0.67
41	0.59
42	0.58
43	0.54
44	0.55
45	0.54
46	0.51
47	0.47
48	0.47
49	0.48
50	0.41
51	0.37
52	0.34
53	0.32
54	0.3
55	0.26
56	0.25
57	0.29
58	0.34
59	0.35
60	0.37
61	0.35
62	0.4
63	0.42
64	0.47
65	0.48
66	0.46
67	0.49
68	0.47
69	0.47
70	0.43
71	0.48
72	0.48
73	0.52
74	0.54
75	0.57
76	0.56
77	0.54
78	0.56
79	0.49
80	0.45
81	0.37
82	0.33
83	0.27
84	0.24
85	0.24
86	0.24
87	0.22
88	0.22
89	0.22
90	0.22
91	0.21
92	0.21
93	0.23
94	0.23
95	0.26
96	0.27
97	0.25
98	0.25
99	0.24
100	0.23
101	0.2
102	0.19
103	0.17
104	0.14
105	0.14
106	0.11
107	0.14
108	0.19
109	0.23
110	0.31
111	0.38
112	0.46
113	0.57
114	0.67
115	0.73
116	0.76
117	0.8
118	0.82
119	0.83
120	0.83
121	0.77
122	0.68
123	0.68
124	0.62
125	0.59
126	0.59
127	0.56
128	0.52
129	0.52
130	0.58
131	0.52
132	0.54
133	0.49
134	0.39
135	0.36
136	0.35
137	0.36
138	0.32
139	0.29
140	0.29
141	0.3
142	0.29
143	0.34
144	0.38
145	0.39
146	0.41
147	0.47
148	0.47
149	0.52
150	0.55
151	0.52
152	0.5
153	0.49
154	0.48
155	0.48
156	0.5
157	0.53
158	0.6
159	0.64
160	0.66
161	0.65
162	0.67
163	0.7
164	0.73
165	0.7
166	0.62
167	0.55
168	0.48
169	0.45
170	0.4
171	0.33
172	0.3
173	0.29
174	0.28
175	0.26
176	0.26
177	0.25
178	0.33
179	0.38
180	0.44
181	0.49
182	0.55
183	0.61
184	0.65
185	0.66
186	0.6
187	0.54
188	0.53
189	0.45
190	0.41
191	0.34
192	0.3
193	0.27
194	0.24
195	0.23
196	0.13
197	0.12
198	0.13
199	0.14
200	0.14
201	0.16
202	0.17
203	0.19
204	0.24
205	0.25
206	0.24
207	0.26
208	0.26
209	0.29
210	0.32
211	0.32
212	0.3
213	0.29
214	0.27
215	0.24
216	0.22
217	0.18
218	0.13
219	0.1
220	0.08
221	0.06
222	0.05
223	0.05
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.06
231	0.1
232	0.11
233	0.13
234	0.14
235	0.15
236	0.18
237	0.21
238	0.21
239	0.2
240	0.21
241	0.23
242	0.23
243	0.23
244	0.25
245	0.27
246	0.26
247	0.24
248	0.21
249	0.17
250	0.19
251	0.2
252	0.17
253	0.15
254	0.2
255	0.21
256	0.21
257	0.25
258	0.29
259	0.33
260	0.36
261	0.43
262	0.43
263	0.46
264	0.48
265	0.47
266	0.41
267	0.34
268	0.32
269	0.24
270	0.2
271	0.16
272	0.11
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.09
277	0.08
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.1
282	0.12
283	0.13
284	0.13
285	0.16
286	0.16
287	0.16
288	0.17
289	0.17
290	0.19
291	0.23
292	0.27
293	0.24
294	0.23
295	0.23
296	0.22
297	0.19
298	0.15
299	0.11
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.08
306	0.09
307	0.09
308	0.12
309	0.14
310	0.18
311	0.19
312	0.19
313	0.19
314	0.19
315	0.18
316	0.16
317	0.13
318	0.09
319	0.08
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.05
325	0.04
326	0.05
327	0.05
328	0.06
329	0.05
330	0.06
331	0.07
332	0.1
333	0.13
334	0.16
335	0.2
336	0.21
337	0.23
338	0.23
339	0.23
340	0.21
341	0.18
342	0.15
343	0.11
344	0.09
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.13
352	0.19
353	0.23
354	0.24
355	0.27
356	0.3
357	0.33
358	0.36
359	0.33
360	0.32
361	0.28
362	0.28
363	0.25
364	0.23
365	0.19
366	0.17
367	0.14
368	0.09
369	0.09
370	0.16
371	0.19
372	0.19
373	0.2
374	0.19
375	0.2
376	0.22
377	0.23
378	0.17
379	0.14
380	0.15
381	0.14
382	0.14
383	0.13
384	0.11
385	0.08
386	0.08
387	0.06
388	0.04
389	0.04
390	0.03
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.03
400	0.03
401	0.03
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.06
410	0.05
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.03
418	0.03
419	0.03
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.05
425	0.06
426	0.13
427	0.13
428	0.14
429	0.14
430	0.14
431	0.15
432	0.14
433	0.14
434	0.09
435	0.08
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.03
443	0.04
444	0.04
445	0.05
446	0.05
447	0.06
448	0.07
449	0.06
450	0.08
451	0.08
452	0.08
453	0.08
454	0.09
455	0.1
456	0.12
457	0.14
458	0.13
459	0.14
460	0.14
461	0.15
462	0.13
463	0.12
464	0.11
465	0.1
466	0.09
467	0.08
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.07
472	0.06
473	0.07
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.07
479	0.06
480	0.06
481	0.08
482	0.1
483	0.11
484	0.11
485	0.11
486	0.11
487	0.12
488	0.12
489	0.09
490	0.07
491	0.07
492	0.08
493	0.09
494	0.1
495	0.11
496	0.11
497	0.13
498	0.15
499	0.15
500	0.15
501	0.15
502	0.14
503	0.14
504	0.16
505	0.15
506	0.12
507	0.11
508	0.1
509	0.11
510	0.11
511	0.09
512	0.07
513	0.08
514	0.08
515	0.08
516	0.11
517	0.11
518	0.11
519	0.11
520	0.11
521	0.12
522	0.12
523	0.14
524	0.12
525	0.12
526	0.13
527	0.14
528	0.13
529	0.11
530	0.11
531	0.08
532	0.09
533	0.09
534	0.1
535	0.09
536	0.1
537	0.11
538	0.12
539	0.14
540	0.14
541	0.14
542	0.12
543	0.12
544	0.12
545	0.12
546	0.1
547	0.1
548	0.09
549	0.08
550	0.08
551	0.07
552	0.07
553	0.06
554	0.06
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.05
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.05
567	0.05
568	0.06
569	0.06
570	0.07
571	0.07
572	0.07
573	0.08
574	0.13
575	0.13
576	0.12
577	0.13
578	0.12
579	0.13
580	0.12
581	0.12
582	0.06
583	0.05
584	0.05
585	0.06
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.06
591	0.07
592	0.08
593	0.09
594	0.14
595	0.14
596	0.18
597	0.23
598	0.22
599	0.22
600	0.23
601	0.21
602	0.16
603	0.16
604	0.13
605	0.08
606	0.07
607	0.06
608	0.05
609	0.05
610	0.06
611	0.07
612	0.11
613	0.12
614	0.13
615	0.17
616	0.17
617	0.19
618	0.23
619	0.25
620	0.21
621	0.21
622	0.2
623	0.18
624	0.19
625	0.17
626	0.12
627	0.1
628	0.09
629	0.09
630	0.08
631	0.07
632	0.06
633	0.06
634	0.06
635	0.04
636	0.04
637	0.05
638	0.06
639	0.06
640	0.06
641	0.06
642	0.06
643	0.07
644	0.09
645	0.08
646	0.08
647	0.09
648	0.09
649	0.08
650	0.09
651	0.09
652	0.1
653	0.1
654	0.12
655	0.13
656	0.15
657	0.15
658	0.16
659	0.14
660	0.15
661	0.16
662	0.15
663	0.12
664	0.1
665	0.1
666	0.09
667	0.1
668	0.08
669	0.07
670	0.07
671	0.09
672	0.08
673	0.08
674	0.09
675	0.11
676	0.11
677	0.12
678	0.12
679	0.11
680	0.12
681	0.11
682	0.1
683	0.08
684	0.11
685	0.11
686	0.11
687	0.1
688	0.11
689	0.12
690	0.13
691	0.16
692	0.22
693	0.25
694	0.31
695	0.31
696	0.32
697	0.32
698	0.31
699	0.29
700	0.2
701	0.17
702	0.09
703	0.09
704	0.08
705	0.07
706	0.05
707	0.04
708	0.04
709	0.04
710	0.04
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.04
717	0.05
718	0.05
719	0.06
720	0.07
721	0.08
722	0.08
723	0.07
724	0.07
725	0.07
726	0.07
727	0.07
728	0.06
729	0.06
730	0.05
731	0.06
732	0.07
733	0.07
734	0.08
735	0.08
736	0.08
737	0.07
738	0.07
739	0.07
740	0.05
741	0.06
742	0.05
743	0.06
744	0.07
745	0.08
746	0.08
747	0.09
748	0.11
749	0.12
750	0.13
751	0.13
752	0.15
753	0.13
754	0.16
755	0.2
756	0.2
757	0.2
758	0.19
759	0.19
760	0.19
761	0.22
762	0.21
763	0.18
764	0.18
765	0.19
766	0.21
767	0.21
768	0.21
769	0.22
770	0.21
771	0.19
772	0.17
773	0.15
774	0.14
775	0.21
776	0.19
777	0.17
778	0.16
779	0.16
780	0.16
781	0.16
782	0.15
783	0.08
784	0.09
785	0.08
786	0.09
787	0.13
788	0.14
789	0.15
790	0.17
791	0.24
792	0.23
793	0.24
794	0.28
795	0.31
796	0.36
797	0.35
798	0.35
799	0.29
800	0.3
801	0.28
802	0.25
803	0.18
804	0.15
805	0.14
806	0.12
807	0.13
808	0.16
809	0.18
810	0.18
811	0.2
812	0.23
813	0.25
814	0.29
815	0.29
816	0.32
817	0.34
818	0.33
819	0.32
820	0.27
821	0.25
822	0.21
823	0.19
824	0.12
825	0.07
826	0.07
827	0.05
828	0.05
829	0.06
830	0.05
831	0.05
832	0.05
833	0.06
834	0.05
835	0.06
836	0.06
837	0.08
838	0.08
839	0.08
840	0.08
841	0.08
842	0.08
843	0.06
844	0.07
845	0.05
846	0.05
847	0.04
848	0.05
849	0.05
850	0.05
851	0.07
852	0.06
853	0.06
854	0.07
855	0.08
856	0.09
857	0.1
858	0.1
859	0.09
860	0.11
861	0.11
862	0.12
863	0.12
864	0.11
865	0.1
866	0.12
867	0.17
868	0.16
869	0.15
870	0.15
871	0.14
872	0.16
873	0.17
874	0.14
875	0.09
876	0.1
877	0.1
878	0.1
879	0.1
880	0.08
881	0.09
882	0.1
883	0.11
884	0.13
885	0.18
886	0.17
887	0.18
888	0.2
889	0.18
890	0.22
891	0.22
892	0.24
893	0.2
894	0.2
895	0.19
896	0.18
897	0.19
898	0.14
899	0.14
900	0.1
901	0.09
902	0.1
903	0.1
904	0.1
905	0.13
906	0.17
907	0.18
908	0.21
909	0.21
910	0.21
911	0.25
912	0.28
913	0.29
914	0.31
915	0.35
916	0.33
917	0.34
918	0.34
919	0.32
920	0.35
921	0.34
922	0.34
923	0.31
924	0.31
925	0.32
926	0.3
927	0.3
928	0.25
929	0.23
930	0.18
931	0.17
932	0.16
933	0.17
934	0.18
935	0.17
936	0.17
937	0.16
938	0.14
939	0.15
940	0.15
941	0.13
942	0.12
943	0.13
944	0.15
945	0.14
946	0.14
947	0.13
948	0.12
949	0.15
950	0.16
951	0.17
952	0.15
953	0.17
954	0.18
955	0.18
956	0.18
957	0.14
958	0.12
959	0.1
960	0.1
961	0.09
962	0.08
963	0.07
964	0.07
965	0.07
966	0.07
967	0.07
968	0.07
969	0.07
970	0.07
971	0.08
972	0.1
973	0.11
974	0.13
975	0.13
976	0.12
977	0.13
978	0.13
979	0.16
980	0.14
981	0.14
982	0.12
983	0.13
984	0.14
985	0.13
986	0.14
987	0.12
988	0.13
989	0.11
990	0.13
991	0.13
992	0.12
993	0.12
994	0.1
995	0.09
996	0.09
997	0.09
998	0.08
999	0.12
1000	0.14
1001	0.19
1002	0.22
1003	0.23
1004	0.23
1005	0.24
1006	0.24
1007	0.19
1008	0.18
1009	0.13
1010	0.12
1011	0.12
1012	0.13
1013	0.12
1014	0.1
1015	0.11
1016	0.09
1017	0.1
1018	0.08
1019	0.07
1020	0.06
1021	0.06
1022	0.06
1023	0.06
1024	0.07
1025	0.06
1026	0.06
1027	0.06
1028	0.06
1029	0.06
1030	0.07
1031	0.08
1032	0.07
1033	0.07
1034	0.07
1035	0.08
1036	0.08
1037	0.08
1038	0.07
1039	0.06
1040	0.06
1041	0.05
1042	0.04
1043	0.04
1044	0.04
1045	0.04
1046	0.04
1047	0.04
1048	0.06
1049	0.07
1050	0.08
1051	0.08
1052	0.08
1053	0.09
1054	0.1
1055	0.1
1056	0.1
1057	0.09
1058	0.14
1059	0.15
1060	0.17
1061	0.18
1062	0.2
1063	0.2
1064	0.2
1065	0.22
1066	0.17
1067	0.2
1068	0.2
1069	0.2
1070	0.16
1071	0.16
1072	0.17
1073	0.15
1074	0.14
1075	0.11
1076	0.08
1077	0.07
1078	0.08
1079	0.09
1080	0.08
1081	0.14
1082	0.14
1083	0.15
1084	0.16
1085	0.17
1086	0.18
1087	0.19
1088	0.21
1089	0.15
1090	0.17
1091	0.17
1092	0.2
1093	0.21
1094	0.21
1095	0.2
1096	0.22
1097	0.27
1098	0.34
1099	0.42
1100	0.42
1101	0.45
1102	0.53
1103	0.6
1104	0.61
1105	0.63
1106	0.59
1107	0.59
1108	0.61
1109	0.62
1110	0.53
1111	0.47
1112	0.43
1113	0.38
1114	0.39
1115	0.33
1116	0.3
1117	0.27
1118	0.29
1119	0.29
1120	0.3
1121	0.3
1122	0.25
1123	0.26
1124	0.25
1125	0.23
1126	0.2
1127	0.19
1128	0.18
1129	0.16
1130	0.18
1131	0.14
1132	0.15
1133	0.14
1134	0.15
1135	0.19
1136	0.19
1137	0.19
1138	0.16
1139	0.16
1140	0.13
1141	0.13
1142	0.13
1143	0.08
1144	0.09
1145	0.12
1146	0.13
1147	0.13
1148	0.14
1149	0.15
1150	0.2
1151	0.23
1152	0.23
1153	0.26
1154	0.26
1155	0.28
1156	0.27
1157	0.27
1158	0.24
1159	0.19
1160	0.19
1161	0.18
1162	0.19
1163	0.17
1164	0.17
1165	0.16
1166	0.15
1167	0.16
1168	0.16
1169	0.11
1170	0.1
1171	0.1
1172	0.1
1173	0.1
1174	0.13
1175	0.12
1176	0.11
1177	0.13
1178	0.15
1179	0.17
1180	0.19
1181	0.2
1182	0.19
1183	0.2
1184	0.22
1185	0.2
1186	0.21
1187	0.22
1188	0.22
1189	0.23
1190	0.28
1191	0.31
1192	0.34
1193	0.34
1194	0.34
1195	0.36
1196	0.33
1197	0.31
1198	0.25
1199	0.22
1200	0.17
1201	0.21
1202	0.22
1203	0.25
1204	0.31
1205	0.32
1206	0.36
1207	0.4
1208	0.42
1209	0.44
1210	0.45
1211	0.43
1212	0.39
1213	0.41
1214	0.46
1215	0.42
1216	0.4
1217	0.34
1218	0.31
1219	0.25
1220	0.23
1221	0.21
1222	0.2
1223	0.2
1224	0.21
1225	0.23
1226	0.22
1227	0.22
1228	0.24
1229	0.24
1230	0.19
1231	0.22
1232	0.23
1233	0.27
1234	0.38
1235	0.42
1236	0.42
1237	0.44
1238	0.42
1239	0.42
1240	0.47
1241	0.44
1242	0.39
1243	0.38
1244	0.35
1245	0.33
1246	0.31

A0A5C3M5A7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer