Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C3LTT3

Protein Details
Accession A0A5C3LTT3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-55LYDEKRELKHHLRNAEKYRRDBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036809  AF1782-like_sf  
IPR000555  JAMM/MPN+_dom  
IPR037518  MPN  
IPR044098  STAMBP/STALP-like_MPN  
IPR015063  USP8_dimer  
Gene Ontology GO:0061578  F:K63-linked deubiquitinase activity  
GO:0140492  F:metal-dependent deubiquitinase activity  
GO:0070536  P:protein K63-linked deubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF01398  JAB  
PF08969  USP8_dimer  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50249  MPN  
CDD cd08066  MPN_AMSH_like  
Amino Acid Sequences MSSSAPLSRNPSHVRNSPRRPPTISELANKALEGLYDEKRELKHHLRNAEKYRRDAKAFLEKDDLENAFVMYAKAATLVLDKLPTHRDYHKLLNSSQRQNLGMHGQDILESLTEIKPMLVARSDQWQAQHPEYSDNDHPPDSRQESMPAEQPTSSLDDFTNALLQQQKMAGETAIEEELAKWKQLREDRDRLAQEDREREERERGSRGAGRVDLRQDPAVAAAARQAPITPQRAPDYTFSRTPLQNAGYGTQHTAVLSDGSRRVDDQARYQQQEDMRRREEDIARKRAEQKRRQEQQEGIARRQQEADNAARDIRQTTAVNNPGATLSATSSASSISSSSSPMFNTPTAPSSLATTPSSSFQQIPPTPINYPPIGASSSSNVRAPQAYRSRPPSFLDVGECPTPLPLESPTKYDGDSTDSESITNHHDYRRGKQKHVDNSKTPTRTPLRSPSYPPPTTTTSPPPPESGSILYPQLMSYHQRAQGYWPSLNSMFVPPPDAHLGKGSSLLFPVPADPNSHTPTNKPLYPPEALQRQPSNPQQWAPGQNQYQQQHPPPHQPPNPRPPPAPPIPPSHSHPQGQYSSYPGSSRPEPPAPRAEPSPKPPTEERIIPNNAQSSTPALKTVILPRECLPRFLSIAKLNTVRNRETCGLLLGKDKGSKYVVSTLLIPKQHSTSDTCTMDEEELVMEFTEERNLITLGWIHTHPSQSCFMSSVDLHTHSGFQCMLSESFAVVCAPKSNPNFGIFRLTDPPGLQTILHCKEKEAFHPHPDLPIYTDADKGHVHMRDAPLEIVDLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.68
3 0.74
4 0.76
5 0.78
6 0.78
7 0.76
8 0.74
9 0.72
10 0.72
11 0.67
12 0.64
13 0.6
14 0.58
15 0.53
16 0.46
17 0.39
18 0.29
19 0.23
20 0.2
21 0.19
22 0.2
23 0.22
24 0.23
25 0.26
26 0.28
27 0.31
28 0.36
29 0.42
30 0.46
31 0.51
32 0.6
33 0.65
34 0.73
35 0.8
36 0.83
37 0.79
38 0.78
39 0.79
40 0.76
41 0.71
42 0.64
43 0.61
44 0.62
45 0.57
46 0.53
47 0.51
48 0.45
49 0.43
50 0.45
51 0.39
52 0.29
53 0.27
54 0.23
55 0.16
56 0.16
57 0.13
58 0.08
59 0.08
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.13
68 0.13
69 0.16
70 0.22
71 0.23
72 0.26
73 0.3
74 0.34
75 0.37
76 0.46
77 0.5
78 0.49
79 0.51
80 0.57
81 0.61
82 0.63
83 0.62
84 0.56
85 0.51
86 0.48
87 0.47
88 0.43
89 0.36
90 0.29
91 0.24
92 0.2
93 0.19
94 0.19
95 0.15
96 0.09
97 0.08
98 0.09
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.12
106 0.12
107 0.13
108 0.14
109 0.2
110 0.22
111 0.22
112 0.23
113 0.29
114 0.32
115 0.34
116 0.37
117 0.31
118 0.34
119 0.34
120 0.38
121 0.35
122 0.35
123 0.35
124 0.33
125 0.33
126 0.31
127 0.37
128 0.35
129 0.33
130 0.29
131 0.32
132 0.34
133 0.36
134 0.39
135 0.33
136 0.3
137 0.28
138 0.27
139 0.23
140 0.24
141 0.21
142 0.16
143 0.14
144 0.14
145 0.15
146 0.15
147 0.16
148 0.11
149 0.13
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.17
154 0.17
155 0.15
156 0.16
157 0.13
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.13
166 0.13
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.22
171 0.29
172 0.37
173 0.41
174 0.49
175 0.52
176 0.59
177 0.6
178 0.56
179 0.55
180 0.52
181 0.49
182 0.47
183 0.47
184 0.44
185 0.45
186 0.45
187 0.47
188 0.46
189 0.45
190 0.42
191 0.39
192 0.39
193 0.4
194 0.39
195 0.36
196 0.34
197 0.32
198 0.31
199 0.34
200 0.31
201 0.29
202 0.28
203 0.25
204 0.21
205 0.19
206 0.18
207 0.14
208 0.11
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.18
216 0.22
217 0.2
218 0.22
219 0.25
220 0.27
221 0.29
222 0.31
223 0.31
224 0.32
225 0.32
226 0.32
227 0.33
228 0.33
229 0.32
230 0.32
231 0.28
232 0.27
233 0.25
234 0.24
235 0.21
236 0.21
237 0.2
238 0.16
239 0.15
240 0.12
241 0.11
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.13
249 0.13
250 0.16
251 0.21
252 0.22
253 0.27
254 0.35
255 0.4
256 0.42
257 0.43
258 0.43
259 0.42
260 0.5
261 0.5
262 0.47
263 0.44
264 0.43
265 0.44
266 0.46
267 0.48
268 0.48
269 0.5
270 0.51
271 0.5
272 0.53
273 0.6
274 0.62
275 0.67
276 0.65
277 0.67
278 0.69
279 0.76
280 0.78
281 0.75
282 0.69
283 0.67
284 0.68
285 0.61
286 0.53
287 0.47
288 0.42
289 0.37
290 0.37
291 0.29
292 0.22
293 0.22
294 0.23
295 0.22
296 0.22
297 0.21
298 0.19
299 0.19
300 0.17
301 0.13
302 0.14
303 0.12
304 0.13
305 0.19
306 0.22
307 0.22
308 0.21
309 0.2
310 0.17
311 0.17
312 0.15
313 0.09
314 0.06
315 0.07
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.12
331 0.11
332 0.12
333 0.12
334 0.13
335 0.13
336 0.14
337 0.13
338 0.13
339 0.14
340 0.15
341 0.14
342 0.14
343 0.13
344 0.14
345 0.15
346 0.14
347 0.14
348 0.13
349 0.2
350 0.2
351 0.23
352 0.23
353 0.24
354 0.24
355 0.25
356 0.26
357 0.19
358 0.18
359 0.15
360 0.14
361 0.13
362 0.12
363 0.11
364 0.1
365 0.13
366 0.13
367 0.14
368 0.13
369 0.13
370 0.14
371 0.14
372 0.2
373 0.25
374 0.27
375 0.31
376 0.38
377 0.4
378 0.4
379 0.41
380 0.37
381 0.31
382 0.28
383 0.27
384 0.2
385 0.2
386 0.18
387 0.17
388 0.12
389 0.11
390 0.1
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.13
395 0.13
396 0.16
397 0.18
398 0.18
399 0.18
400 0.18
401 0.16
402 0.15
403 0.15
404 0.16
405 0.17
406 0.16
407 0.16
408 0.15
409 0.16
410 0.15
411 0.17
412 0.14
413 0.13
414 0.19
415 0.21
416 0.28
417 0.38
418 0.39
419 0.4
420 0.46
421 0.53
422 0.58
423 0.66
424 0.65
425 0.59
426 0.62
427 0.66
428 0.61
429 0.53
430 0.51
431 0.46
432 0.43
433 0.43
434 0.46
435 0.45
436 0.45
437 0.51
438 0.52
439 0.56
440 0.54
441 0.5
442 0.45
443 0.43
444 0.43
445 0.41
446 0.39
447 0.37
448 0.4
449 0.39
450 0.37
451 0.33
452 0.32
453 0.3
454 0.25
455 0.19
456 0.17
457 0.16
458 0.15
459 0.13
460 0.12
461 0.11
462 0.1
463 0.11
464 0.13
465 0.18
466 0.21
467 0.21
468 0.22
469 0.25
470 0.3
471 0.31
472 0.29
473 0.24
474 0.24
475 0.24
476 0.24
477 0.21
478 0.17
479 0.14
480 0.13
481 0.15
482 0.12
483 0.14
484 0.18
485 0.17
486 0.15
487 0.16
488 0.17
489 0.14
490 0.18
491 0.16
492 0.12
493 0.12
494 0.11
495 0.09
496 0.09
497 0.1
498 0.09
499 0.1
500 0.12
501 0.14
502 0.18
503 0.22
504 0.25
505 0.23
506 0.23
507 0.29
508 0.32
509 0.32
510 0.3
511 0.3
512 0.31
513 0.32
514 0.33
515 0.32
516 0.34
517 0.33
518 0.37
519 0.37
520 0.35
521 0.4
522 0.45
523 0.44
524 0.39
525 0.39
526 0.38
527 0.4
528 0.42
529 0.39
530 0.4
531 0.37
532 0.4
533 0.46
534 0.43
535 0.43
536 0.42
537 0.45
538 0.46
539 0.47
540 0.52
541 0.51
542 0.59
543 0.61
544 0.66
545 0.68
546 0.71
547 0.76
548 0.7
549 0.66
550 0.62
551 0.64
552 0.6
553 0.59
554 0.51
555 0.5
556 0.5
557 0.52
558 0.52
559 0.52
560 0.51
561 0.45
562 0.44
563 0.42
564 0.41
565 0.39
566 0.34
567 0.3
568 0.27
569 0.26
570 0.25
571 0.2
572 0.22
573 0.23
574 0.26
575 0.28
576 0.34
577 0.36
578 0.4
579 0.48
580 0.46
581 0.46
582 0.48
583 0.49
584 0.47
585 0.51
586 0.56
587 0.49
588 0.51
589 0.5
590 0.5
591 0.49
592 0.49
593 0.46
594 0.45
595 0.49
596 0.45
597 0.46
598 0.44
599 0.39
600 0.32
601 0.29
602 0.26
603 0.24
604 0.24
605 0.21
606 0.18
607 0.18
608 0.2
609 0.27
610 0.3
611 0.28
612 0.3
613 0.31
614 0.4
615 0.4
616 0.39
617 0.34
618 0.29
619 0.31
620 0.3
621 0.34
622 0.29
623 0.31
624 0.33
625 0.35
626 0.36
627 0.4
628 0.43
629 0.42
630 0.38
631 0.42
632 0.39
633 0.38
634 0.34
635 0.32
636 0.28
637 0.25
638 0.27
639 0.24
640 0.25
641 0.27
642 0.26
643 0.26
644 0.26
645 0.26
646 0.24
647 0.28
648 0.27
649 0.24
650 0.28
651 0.3
652 0.33
653 0.35
654 0.33
655 0.29
656 0.29
657 0.3
658 0.28
659 0.28
660 0.28
661 0.34
662 0.34
663 0.32
664 0.31
665 0.31
666 0.3
667 0.25
668 0.19
669 0.11
670 0.1
671 0.1
672 0.08
673 0.07
674 0.06
675 0.07
676 0.09
677 0.08
678 0.08
679 0.09
680 0.1
681 0.09
682 0.1
683 0.13
684 0.12
685 0.15
686 0.15
687 0.17
688 0.19
689 0.25
690 0.25
691 0.25
692 0.28
693 0.27
694 0.27
695 0.26
696 0.24
697 0.22
698 0.21
699 0.22
700 0.22
701 0.23
702 0.24
703 0.22
704 0.25
705 0.22
706 0.24
707 0.2
708 0.16
709 0.16
710 0.17
711 0.17
712 0.15
713 0.15
714 0.13
715 0.13
716 0.13
717 0.12
718 0.09
719 0.1
720 0.12
721 0.14
722 0.21
723 0.24
724 0.3
725 0.32
726 0.36
727 0.37
728 0.36
729 0.42
730 0.35
731 0.36
732 0.36
733 0.35
734 0.33
735 0.32
736 0.32
737 0.26
738 0.26
739 0.22
740 0.2
741 0.28
742 0.32
743 0.38
744 0.35
745 0.35
746 0.41
747 0.44
748 0.5
749 0.49
750 0.48
751 0.48
752 0.55
753 0.53
754 0.53
755 0.51
756 0.44
757 0.39
758 0.37
759 0.35
760 0.29
761 0.32
762 0.27
763 0.28
764 0.27
765 0.25
766 0.28
767 0.26
768 0.27
769 0.3
770 0.34
771 0.34
772 0.36
773 0.35
774 0.28