Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FDN6

Protein Details
Accession C5FDN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
234-259SAAPAAKPKPKPKPKPAPKNKAQANPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-269AAPAAKPKPKPKPKPAPKNKAQANPLRPPKQRNPK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019194  Tscrpt_elong_fac_Eaf_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF09816  EAF  
Amino Acid Sequences MATISAPQTPNLNGGLMVDPTRQGEYPILLGDKLAGRESARGRQYVNVTYNYKTKGGTPQQKTTITSAGAPDRYKLTIQDKAGNAEQTNLTYVYSGGVDPESTNSKAENSNLVLIFDPKRKAFILEPVSTRLNFNLKSAPGKTDRQVAEQYPQLSTSFSNNDQSTDGNKQTENESEDEDLGPADEENPYDYRHFLPKKETEESKQHTVESNSTPGTPDPHHVVSKPVAPRSVPSAAPAAKPKPKPKPKPAPKNKAQANPLRPPKQRNPKAAATGGNANTNTNVKEPEPAAPVAISLPPNKPEPVETIIPSVETPDLVGAYSASDDEPKRLAGSPGSNIIVDGDLIIDMGSPPPQRPAFKIDPTNFASNNTSAGSDDEDDMEEPRPTFLGRRLVEEDEEEEEEDEDEDEAMEDAQASDNAEDDEEPADFEDDLVAEMEAALEESAREEEEERARLAMEQQQQRYVNRVESDDESEVSEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.16
4 0.17
5 0.15
6 0.15
7 0.17
8 0.19
9 0.17
10 0.17
11 0.18
12 0.18
13 0.18
14 0.2
15 0.19
16 0.17
17 0.16
18 0.17
19 0.18
20 0.17
21 0.17
22 0.16
23 0.15
24 0.22
25 0.27
26 0.32
27 0.33
28 0.34
29 0.34
30 0.39
31 0.43
32 0.44
33 0.44
34 0.43
35 0.42
36 0.43
37 0.48
38 0.45
39 0.41
40 0.34
41 0.33
42 0.37
43 0.44
44 0.51
45 0.53
46 0.58
47 0.64
48 0.67
49 0.66
50 0.59
51 0.53
52 0.44
53 0.38
54 0.34
55 0.33
56 0.34
57 0.31
58 0.29
59 0.28
60 0.28
61 0.27
62 0.29
63 0.29
64 0.31
65 0.34
66 0.4
67 0.39
68 0.41
69 0.44
70 0.41
71 0.35
72 0.31
73 0.29
74 0.22
75 0.22
76 0.18
77 0.15
78 0.12
79 0.12
80 0.1
81 0.09
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.1
88 0.14
89 0.14
90 0.15
91 0.14
92 0.16
93 0.18
94 0.19
95 0.21
96 0.19
97 0.22
98 0.22
99 0.22
100 0.2
101 0.22
102 0.24
103 0.25
104 0.26
105 0.22
106 0.25
107 0.24
108 0.27
109 0.26
110 0.31
111 0.33
112 0.34
113 0.36
114 0.37
115 0.39
116 0.36
117 0.35
118 0.28
119 0.27
120 0.23
121 0.23
122 0.24
123 0.23
124 0.28
125 0.28
126 0.31
127 0.3
128 0.33
129 0.33
130 0.36
131 0.36
132 0.35
133 0.38
134 0.34
135 0.33
136 0.33
137 0.32
138 0.24
139 0.24
140 0.2
141 0.17
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.17
146 0.22
147 0.21
148 0.22
149 0.22
150 0.22
151 0.22
152 0.23
153 0.24
154 0.2
155 0.2
156 0.2
157 0.21
158 0.24
159 0.22
160 0.18
161 0.18
162 0.17
163 0.18
164 0.17
165 0.15
166 0.11
167 0.09
168 0.08
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.11
178 0.12
179 0.21
180 0.23
181 0.23
182 0.3
183 0.34
184 0.39
185 0.43
186 0.45
187 0.41
188 0.48
189 0.51
190 0.5
191 0.45
192 0.41
193 0.38
194 0.37
195 0.35
196 0.28
197 0.25
198 0.2
199 0.19
200 0.19
201 0.16
202 0.17
203 0.15
204 0.14
205 0.16
206 0.18
207 0.19
208 0.18
209 0.21
210 0.19
211 0.23
212 0.25
213 0.22
214 0.21
215 0.2
216 0.2
217 0.22
218 0.24
219 0.18
220 0.17
221 0.19
222 0.19
223 0.21
224 0.24
225 0.24
226 0.27
227 0.33
228 0.39
229 0.46
230 0.56
231 0.63
232 0.7
233 0.77
234 0.81
235 0.87
236 0.91
237 0.9
238 0.88
239 0.88
240 0.84
241 0.8
242 0.75
243 0.72
244 0.68
245 0.67
246 0.68
247 0.67
248 0.64
249 0.64
250 0.67
251 0.7
252 0.71
253 0.7
254 0.68
255 0.64
256 0.65
257 0.61
258 0.53
259 0.44
260 0.41
261 0.34
262 0.31
263 0.26
264 0.21
265 0.19
266 0.18
267 0.17
268 0.12
269 0.13
270 0.1
271 0.13
272 0.14
273 0.16
274 0.17
275 0.16
276 0.15
277 0.14
278 0.13
279 0.11
280 0.13
281 0.11
282 0.11
283 0.13
284 0.14
285 0.16
286 0.17
287 0.17
288 0.16
289 0.18
290 0.2
291 0.21
292 0.2
293 0.2
294 0.2
295 0.2
296 0.18
297 0.15
298 0.11
299 0.08
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.08
311 0.08
312 0.1
313 0.11
314 0.11
315 0.12
316 0.13
317 0.14
318 0.14
319 0.17
320 0.17
321 0.2
322 0.2
323 0.19
324 0.17
325 0.17
326 0.13
327 0.1
328 0.08
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.03
334 0.03
335 0.04
336 0.07
337 0.08
338 0.09
339 0.15
340 0.18
341 0.2
342 0.23
343 0.31
344 0.35
345 0.41
346 0.5
347 0.46
348 0.5
349 0.52
350 0.54
351 0.46
352 0.42
353 0.38
354 0.3
355 0.29
356 0.23
357 0.19
358 0.14
359 0.15
360 0.14
361 0.12
362 0.13
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.13
367 0.13
368 0.12
369 0.12
370 0.11
371 0.11
372 0.11
373 0.14
374 0.18
375 0.26
376 0.25
377 0.31
378 0.35
379 0.36
380 0.37
381 0.36
382 0.32
383 0.26
384 0.26
385 0.21
386 0.17
387 0.15
388 0.14
389 0.13
390 0.11
391 0.08
392 0.07
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.06
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.08
420 0.07
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.05
430 0.06
431 0.07
432 0.08
433 0.09
434 0.15
435 0.2
436 0.23
437 0.22
438 0.22
439 0.22
440 0.22
441 0.24
442 0.27
443 0.31
444 0.37
445 0.39
446 0.46
447 0.5
448 0.51
449 0.54
450 0.5
451 0.47
452 0.42
453 0.41
454 0.38
455 0.38
456 0.42
457 0.37
458 0.34
459 0.29