Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5FH24

Protein Details
Accession C5FH24    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
323-342PDPGRPKRAGRKRSYLDSSFHydrophilic
364-386DDGSSAGKKKRKKMQEHAAGGPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
327-334RPKRAGRK
370-376GKKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 13, cyto 8, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSFSPQNYESSSSTTQSTSPAHTAAQSANLSSPPSSVAMHPHSVSQSTVTTSTSCPTPASSTGGPVRDGPDGTAMTASFAGGKIPFEALGTDAKLLAHDQSSNEKSISTHKSSSNDSNDHDPMEIDLKDGAGPPEDLSLESLQRDVGEAIGLCKSTYTSTLPTPKFDIVSLYGLGPIAASVARTDPVTGEKINRLRKSYEGKIKGLGLAGRNKPVKQEPGAPGGLRSLMMWPDEEWYNQKVAGKEITIAEPDTAFYKQQLRAMKMEPGLTPRNEYWEDVLGHEKPSKNVAEQLPKKAAAGSFKHTPQSNGTPAAQASSAAAVPDPGRPKRAGRKRSYLDSSFVGYGEGFPDDDDLEGSLYSNEDDGSSAGKKKRKKMQEHAAGGPAPFERGGSYGVGMFGIGAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.27
4 0.28
5 0.26
6 0.25
7 0.25
8 0.24
9 0.24
10 0.26
11 0.22
12 0.26
13 0.22
14 0.2
15 0.2
16 0.21
17 0.21
18 0.19
19 0.18
20 0.14
21 0.15
22 0.15
23 0.15
24 0.21
25 0.24
26 0.27
27 0.27
28 0.28
29 0.28
30 0.28
31 0.28
32 0.23
33 0.2
34 0.18
35 0.19
36 0.17
37 0.17
38 0.17
39 0.18
40 0.17
41 0.17
42 0.15
43 0.16
44 0.19
45 0.19
46 0.24
47 0.22
48 0.26
49 0.3
50 0.31
51 0.3
52 0.28
53 0.28
54 0.25
55 0.25
56 0.2
57 0.19
58 0.18
59 0.17
60 0.16
61 0.14
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.08
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.19
88 0.21
89 0.22
90 0.22
91 0.21
92 0.21
93 0.27
94 0.32
95 0.29
96 0.32
97 0.34
98 0.37
99 0.41
100 0.48
101 0.47
102 0.43
103 0.4
104 0.42
105 0.4
106 0.37
107 0.32
108 0.25
109 0.19
110 0.19
111 0.17
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.1
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.1
145 0.11
146 0.16
147 0.25
148 0.26
149 0.27
150 0.29
151 0.28
152 0.27
153 0.24
154 0.22
155 0.15
156 0.16
157 0.15
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.07
163 0.05
164 0.04
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.07
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.16
178 0.23
179 0.3
180 0.32
181 0.33
182 0.32
183 0.37
184 0.42
185 0.45
186 0.47
187 0.45
188 0.43
189 0.42
190 0.41
191 0.36
192 0.3
193 0.24
194 0.18
195 0.21
196 0.21
197 0.25
198 0.27
199 0.26
200 0.28
201 0.3
202 0.31
203 0.26
204 0.32
205 0.29
206 0.32
207 0.33
208 0.3
209 0.27
210 0.23
211 0.21
212 0.14
213 0.11
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.12
223 0.12
224 0.13
225 0.14
226 0.16
227 0.14
228 0.16
229 0.16
230 0.14
231 0.14
232 0.15
233 0.14
234 0.13
235 0.12
236 0.11
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.09
243 0.15
244 0.16
245 0.21
246 0.26
247 0.27
248 0.3
249 0.32
250 0.34
251 0.31
252 0.31
253 0.27
254 0.27
255 0.29
256 0.26
257 0.28
258 0.23
259 0.27
260 0.27
261 0.26
262 0.23
263 0.23
264 0.23
265 0.21
266 0.25
267 0.2
268 0.21
269 0.25
270 0.24
271 0.2
272 0.24
273 0.24
274 0.22
275 0.27
276 0.31
277 0.38
278 0.41
279 0.46
280 0.46
281 0.45
282 0.44
283 0.39
284 0.36
285 0.32
286 0.31
287 0.3
288 0.31
289 0.33
290 0.38
291 0.37
292 0.37
293 0.36
294 0.38
295 0.37
296 0.35
297 0.34
298 0.31
299 0.3
300 0.29
301 0.23
302 0.17
303 0.13
304 0.1
305 0.1
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.08
310 0.13
311 0.2
312 0.21
313 0.24
314 0.27
315 0.35
316 0.45
317 0.55
318 0.6
319 0.62
320 0.7
321 0.73
322 0.8
323 0.8
324 0.72
325 0.66
326 0.58
327 0.53
328 0.42
329 0.36
330 0.27
331 0.19
332 0.16
333 0.13
334 0.12
335 0.08
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.07
352 0.07
353 0.1
354 0.13
355 0.2
356 0.26
357 0.33
358 0.4
359 0.49
360 0.59
361 0.66
362 0.73
363 0.77
364 0.82
365 0.87
366 0.86
367 0.82
368 0.77
369 0.69
370 0.58
371 0.49
372 0.38
373 0.29
374 0.22
375 0.17
376 0.12
377 0.12
378 0.14
379 0.12
380 0.13
381 0.12
382 0.12
383 0.12
384 0.1