FuNGI

C5FIT3

Protein Details

Accession

C5FIT3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
170-193	KTQFSRAKYMLRKRKKYLHRFTVV	Hydrophilic
380-409	LASWKPSKRAMHFKKKRRWTRVRNAVDETR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
384-399	KPSKRAMHFKKKRRWT

Subcellular Location(s)

mito 13, cyto 9, nucl 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017423 TRM6
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0031515 C:tRNA (m1A) methyltransferase complex GO:0030488 P:tRNA methylation
Pfam	View protein in Pfam PF04189 Gcd10p

Amino Acid Sequences

MHSSIPPNVYVALKLPSDVTKVVKTVPNSYGFLISLALLRSNIANGNDRNVSLGKYGSFPCNQIIGRPFYATFEIADHPDADGHVLHIVSAAELHTEALIADGEGDGDVETDANTPTIPFPQEDNRHIIDQRSTQQLTMAQIEELKQSSTHAGREIISKLLESHSALDQKTQFSRAKYMLRKRKKYLHRFTVVPMDVGILTEWMLEQKDPGRIMELRDEMIGLIGAWANVHYGGTGEVGGAKADEMVNRENGRWLIVDDTGGLVVAAMAERAGILYPPEVLSGEGLPNTTKQGARLIQPTEDETPAAEAASASHTTLTVIHPNLQPNLSMLKYFSHDINEPSETHPLSTHLKTLSWLQLLHPSEDAIYDMEPPKIGEEELASWKPSKRAMHFKKKRRWTRVRNAVDETRAGGFDGLIVATLMDPTSILRHTVPLLAGSAQVVVYSPYIEPLVQLADLYSTARRTAYITYKREVAEGAAEDKEEEFPVDPTLLLAPTLHTSRVRTWQVLPGRTHPLMTGRGGAEGYVFHAVRVLPAMGKVEARGVQAKKRRKMADETESS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.19
3	0.19
4	0.22
5	0.23
6	0.25
7	0.24
8	0.25
9	0.29
10	0.32
11	0.33
12	0.36
13	0.39
14	0.4
15	0.38
16	0.38
17	0.36
18	0.31
19	0.28
20	0.22
21	0.17
22	0.14
23	0.13
24	0.12
25	0.1
26	0.11
27	0.11
28	0.12
29	0.15
30	0.15
31	0.22
32	0.22
33	0.27
34	0.28
35	0.27
36	0.29
37	0.26
38	0.25
39	0.2
40	0.21
41	0.17
42	0.19
43	0.21
44	0.23
45	0.24
46	0.24
47	0.25
48	0.29
49	0.28
50	0.3
51	0.32
52	0.33
53	0.33
54	0.33
55	0.32
56	0.28
57	0.31
58	0.26
59	0.21
60	0.18
61	0.18
62	0.18
63	0.18
64	0.16
65	0.14
66	0.14
67	0.13
68	0.12
69	0.1
70	0.09
71	0.09
72	0.08
73	0.08
74	0.09
75	0.08
76	0.07
77	0.07
78	0.07
79	0.06
80	0.06
81	0.06
82	0.05
83	0.05
84	0.05
85	0.05
86	0.05
87	0.04
88	0.04
89	0.04
90	0.04
91	0.04
92	0.04
93	0.04
94	0.04
95	0.04
96	0.04
97	0.04
98	0.05
99	0.06
100	0.06
101	0.06
102	0.06
103	0.07
104	0.1
105	0.11
106	0.11
107	0.14
108	0.24
109	0.3
110	0.33
111	0.37
112	0.37
113	0.39
114	0.39
115	0.38
116	0.33
117	0.32
118	0.33
119	0.36
120	0.33
121	0.3
122	0.31
123	0.31
124	0.29
125	0.27
126	0.23
127	0.16
128	0.16
129	0.17
130	0.17
131	0.15
132	0.13
133	0.1
134	0.11
135	0.15
136	0.16
137	0.17
138	0.17
139	0.18
140	0.18
141	0.21
142	0.22
143	0.19
144	0.17
145	0.16
146	0.15
147	0.15
148	0.15
149	0.12
150	0.13
151	0.15
152	0.18
153	0.18
154	0.21
155	0.22
156	0.24
157	0.25
158	0.28
159	0.28
160	0.26
161	0.31
162	0.32
163	0.39
164	0.45
165	0.54
166	0.59
167	0.66
168	0.73
169	0.75
170	0.8
171	0.82
172	0.84
173	0.85
174	0.84
175	0.78
176	0.72
177	0.68
178	0.67
179	0.57
180	0.46
181	0.35
182	0.25
183	0.2
184	0.18
185	0.15
186	0.06
187	0.05
188	0.05
189	0.04
190	0.04
191	0.05
192	0.05
193	0.06
194	0.08
195	0.12
196	0.12
197	0.13
198	0.15
199	0.16
200	0.18
201	0.22
202	0.2
203	0.17
204	0.17
205	0.17
206	0.13
207	0.12
208	0.1
209	0.05
210	0.04
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.04
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.07
233	0.08
234	0.12
235	0.12
236	0.13
237	0.14
238	0.14
239	0.14
240	0.12
241	0.11
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.07
246	0.07
247	0.06
248	0.05
249	0.05
250	0.03
251	0.02
252	0.02
253	0.02
254	0.02
255	0.02
256	0.02
257	0.02
258	0.02
259	0.02
260	0.02
261	0.03
262	0.03
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.05
269	0.05
270	0.06
271	0.05
272	0.05
273	0.06
274	0.06
275	0.07
276	0.08
277	0.08
278	0.08
279	0.13
280	0.15
281	0.17
282	0.21
283	0.21
284	0.2
285	0.21
286	0.22
287	0.2
288	0.18
289	0.16
290	0.11
291	0.11
292	0.1
293	0.09
294	0.06
295	0.04
296	0.04
297	0.06
298	0.07
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.07
304	0.08
305	0.1
306	0.1
307	0.14
308	0.16
309	0.18
310	0.19
311	0.18
312	0.17
313	0.15
314	0.17
315	0.13
316	0.12
317	0.1
318	0.1
319	0.12
320	0.13
321	0.13
322	0.13
323	0.14
324	0.15
325	0.17
326	0.18
327	0.17
328	0.18
329	0.21
330	0.18
331	0.17
332	0.16
333	0.16
334	0.19
335	0.19
336	0.2
337	0.17
338	0.17
339	0.18
340	0.21
341	0.22
342	0.19
343	0.18
344	0.16
345	0.23
346	0.24
347	0.24
348	0.21
349	0.17
350	0.15
351	0.15
352	0.15
353	0.08
354	0.07
355	0.09
356	0.1
357	0.1
358	0.1
359	0.1
360	0.1
361	0.1
362	0.1
363	0.08
364	0.07
365	0.1
366	0.15
367	0.16
368	0.16
369	0.18
370	0.2
371	0.21
372	0.26
373	0.29
374	0.31
375	0.41
376	0.51
377	0.6
378	0.68
379	0.77
380	0.81
381	0.86
382	0.9
383	0.9
384	0.91
385	0.9
386	0.91
387	0.92
388	0.9
389	0.86
390	0.82
391	0.75
392	0.66
393	0.56
394	0.46
395	0.36
396	0.28
397	0.22
398	0.15
399	0.1
400	0.08
401	0.08
402	0.05
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.03
410	0.03
411	0.04
412	0.06
413	0.07
414	0.08
415	0.09
416	0.1
417	0.11
418	0.13
419	0.13
420	0.12
421	0.13
422	0.11
423	0.11
424	0.1
425	0.09
426	0.07
427	0.07
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.07
432	0.06
433	0.07
434	0.08
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.09
439	0.08
440	0.08
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.09
445	0.09
446	0.09
447	0.1
448	0.11
449	0.11
450	0.12
451	0.18
452	0.27
453	0.35
454	0.38
455	0.4
456	0.44
457	0.44
458	0.43
459	0.37
460	0.28
461	0.23
462	0.21
463	0.21
464	0.17
465	0.16
466	0.16
467	0.16
468	0.16
469	0.12
470	0.12
471	0.1
472	0.1
473	0.12
474	0.12
475	0.11
476	0.1
477	0.11
478	0.1
479	0.1
480	0.09
481	0.09
482	0.12
483	0.14
484	0.16
485	0.17
486	0.2
487	0.24
488	0.34
489	0.37
490	0.37
491	0.38
492	0.44
493	0.5
494	0.54
495	0.53
496	0.49
497	0.53
498	0.5
499	0.48
500	0.41
501	0.38
502	0.34
503	0.32
504	0.31
505	0.24
506	0.25
507	0.24
508	0.22
509	0.17
510	0.14
511	0.14
512	0.15
513	0.15
514	0.13
515	0.15
516	0.15
517	0.15
518	0.18
519	0.16
520	0.11
521	0.13
522	0.16
523	0.15
524	0.16
525	0.16
526	0.18
527	0.2
528	0.22
529	0.28
530	0.3
531	0.38
532	0.46
533	0.56
534	0.6
535	0.67
536	0.71
537	0.69
538	0.75
539	0.76

C5FIT3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer