FuNGI

C5FGT8

Protein Details

Accession

C5FGT8

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-50	GPFMVRRRPKPADPLVRPKKRPIPRPTAPGM	Hydrophilic
538-560	ASGTDTSRKKPKNKHLSTQLSTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
24-45	VRRRPKPADPLVRPKKRPIPRP
520-530	KRAQAAARKRP

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSSTPPNPPLGRTPPGGPNGPFMVRRRPKPADPLVRPKKRPIPRPTAPGMSQGHGNGQGQVRPLAANGTSTLPLQPPRPQPQTSAPSQPKPIPSADDLTANGFSGPLLSETFSDYPLVTTKRALREGLRHHIAKLISKKSVDPRDESQFTRPVRLQRRDPRATTTTPAVNDKEDSNPRRGFRDPNHGLTEAEREELDAKKEARAKEREDNLAQIAPSVNSGPKKVNAPKQRTQQVFKSTITPEEAAKSQIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGKYEAAMSETYATFVLENSGKMKMVPIDKWYKFTAKNQFKVLTIEEAEKHMAKKIRDPRWFMEKEQARAQERELQQYARQRKIYTGQSRNAPVTDRFEGDDMDFDEDRFADDEEHVGLFDEDEDAKTAEKRIKQDQLKANIFDLKDEKDYDEEEHQEKKHKEDLKSFGKQVRKALQRREKNFDYSSGSDANPYSDDESTDESEMERQREEQKKLEEDPKRKENQSDKLSGTSTKGTNTPSGRPKHTDPLKRAQAAARKRPGSPNLSDASGTDTSRKKPKNKHLSTQLSTSQPASRPISPAPQGQRKSSGVANPNDTSNANQAAVGAKKRVRNGPGKAGSTSDVEKAVASGPEMSDSAISKRMKLNVPTGKSNTGTPIGSRATSPTPAGKALTSCHRHIYPIWLRISTGLCLRSQRDGRGTPCLVPYRF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.51
3	0.53
4	0.45
5	0.43
6	0.43
7	0.44
8	0.44
9	0.41
10	0.47
11	0.5
12	0.55
13	0.6
14	0.63
15	0.65
16	0.7
17	0.76
18	0.76
19	0.77
20	0.82
21	0.83
22	0.86
23	0.84
24	0.84
25	0.84
26	0.82
27	0.83
28	0.82
29	0.81
30	0.79
31	0.83
32	0.8
33	0.77
34	0.69
35	0.68
36	0.61
37	0.52
38	0.46
39	0.39
40	0.36
41	0.31
42	0.3
43	0.27
44	0.26
45	0.26
46	0.25
47	0.26
48	0.23
49	0.19
50	0.19
51	0.17
52	0.15
53	0.14
54	0.13
55	0.15
56	0.15
57	0.15
58	0.17
59	0.17
60	0.2
61	0.23
62	0.3
63	0.36
64	0.44
65	0.5
66	0.5
67	0.52
68	0.59
69	0.61
70	0.58
71	0.6
72	0.58
73	0.58
74	0.61
75	0.61
76	0.56
77	0.53
78	0.5
79	0.44
80	0.4
81	0.39
82	0.34
83	0.32
84	0.28
85	0.28
86	0.26
87	0.21
88	0.18
89	0.13
90	0.11
91	0.09
92	0.09
93	0.07
94	0.07
95	0.08
96	0.08
97	0.13
98	0.14
99	0.14
100	0.14
101	0.13
102	0.13
103	0.18
104	0.2
105	0.16
106	0.2
107	0.26
108	0.31
109	0.34
110	0.36
111	0.35
112	0.42
113	0.49
114	0.54
115	0.55
116	0.49
117	0.47
118	0.49
119	0.46
120	0.44
121	0.45
122	0.41
123	0.39
124	0.39
125	0.44
126	0.48
127	0.56
128	0.52
129	0.49
130	0.48
131	0.53
132	0.56
133	0.53
134	0.49
135	0.47
136	0.45
137	0.46
138	0.44
139	0.45
140	0.51
141	0.56
142	0.61
143	0.64
144	0.73
145	0.74
146	0.73
147	0.71
148	0.66
149	0.62
150	0.55
151	0.5
152	0.44
153	0.38
154	0.4
155	0.34
156	0.31
157	0.29
158	0.27
159	0.3
160	0.35
161	0.36
162	0.39
163	0.43
164	0.43
165	0.46
166	0.47
167	0.48
168	0.45
169	0.53
170	0.5
171	0.51
172	0.53
173	0.5
174	0.47
175	0.4
176	0.39
177	0.29
178	0.24
179	0.18
180	0.14
181	0.16
182	0.17
183	0.18
184	0.17
185	0.17
186	0.21
187	0.27
188	0.29
189	0.35
190	0.4
191	0.43
192	0.48
193	0.52
194	0.54
195	0.5
196	0.49
197	0.42
198	0.38
199	0.32
200	0.24
201	0.19
202	0.13
203	0.12
204	0.11
205	0.12
206	0.12
207	0.14
208	0.15
209	0.17
210	0.25
211	0.31
212	0.39
213	0.46
214	0.53
215	0.59
216	0.66
217	0.72
218	0.7
219	0.68
220	0.66
221	0.64
222	0.6
223	0.53
224	0.5
225	0.42
226	0.39
227	0.36
228	0.3
229	0.23
230	0.21
231	0.2
232	0.18
233	0.2
234	0.18
235	0.16
236	0.18
237	0.17
238	0.16
239	0.17
240	0.19
241	0.18
242	0.2
243	0.19
244	0.18
245	0.17
246	0.17
247	0.16
248	0.13
249	0.16
250	0.17
251	0.18
252	0.17
253	0.18
254	0.19
255	0.19
256	0.18
257	0.15
258	0.13
259	0.12
260	0.13
261	0.12
262	0.11
263	0.11
264	0.1
265	0.1
266	0.09
267	0.08
268	0.08
269	0.07
270	0.06
271	0.06
272	0.08
273	0.07
274	0.08
275	0.08
276	0.09
277	0.09
278	0.09
279	0.1
280	0.11
281	0.14
282	0.15
283	0.19
284	0.27
285	0.28
286	0.31
287	0.32
288	0.33
289	0.33
290	0.39
291	0.45
292	0.44
293	0.47
294	0.48
295	0.48
296	0.44
297	0.44
298	0.37
299	0.29
300	0.22
301	0.2
302	0.16
303	0.16
304	0.16
305	0.15
306	0.14
307	0.15
308	0.18
309	0.17
310	0.25
311	0.33
312	0.41
313	0.46
314	0.51
315	0.51
316	0.57
317	0.58
318	0.51
319	0.51
320	0.46
321	0.43
322	0.43
323	0.45
324	0.38
325	0.37
326	0.37
327	0.36
328	0.32
329	0.35
330	0.31
331	0.26
332	0.27
333	0.34
334	0.39
335	0.36
336	0.37
337	0.32
338	0.33
339	0.38
340	0.43
341	0.45
342	0.45
343	0.43
344	0.46
345	0.48
346	0.46
347	0.41
348	0.34
349	0.26
350	0.24
351	0.22
352	0.19
353	0.17
354	0.17
355	0.17
356	0.14
357	0.14
358	0.1
359	0.11
360	0.1
361	0.1
362	0.1
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.08
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.07
372	0.06
373	0.06
374	0.05
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.04
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.06
383	0.07
384	0.09
385	0.12
386	0.16
387	0.2
388	0.25
389	0.34
390	0.38
391	0.46
392	0.51
393	0.56
394	0.56
395	0.53
396	0.48
397	0.43
398	0.39
399	0.33
400	0.28
401	0.2
402	0.18
403	0.18
404	0.17
405	0.15
406	0.16
407	0.16
408	0.17
409	0.18
410	0.19
411	0.22
412	0.23
413	0.3
414	0.3
415	0.31
416	0.36
417	0.39
418	0.41
419	0.44
420	0.52
421	0.52
422	0.56
423	0.56
424	0.55
425	0.54
426	0.53
427	0.52
428	0.52
429	0.53
430	0.55
431	0.62
432	0.66
433	0.69
434	0.72
435	0.74
436	0.69
437	0.65
438	0.6
439	0.53
440	0.49
441	0.41
442	0.38
443	0.32
444	0.28
445	0.24
446	0.22
447	0.2
448	0.15
449	0.14
450	0.13
451	0.11
452	0.12
453	0.11
454	0.14
455	0.15
456	0.14
457	0.13
458	0.12
459	0.16
460	0.18
461	0.18
462	0.16
463	0.17
464	0.26
465	0.34
466	0.37
467	0.39
468	0.42
469	0.45
470	0.5
471	0.57
472	0.56
473	0.56
474	0.61
475	0.64
476	0.64
477	0.62
478	0.65
479	0.64
480	0.65
481	0.64
482	0.61
483	0.54
484	0.5
485	0.49
486	0.43
487	0.37
488	0.31
489	0.26
490	0.22
491	0.22
492	0.22
493	0.27
494	0.28
495	0.33
496	0.37
497	0.42
498	0.45
499	0.48
500	0.5
501	0.54
502	0.6
503	0.62
504	0.6
505	0.64
506	0.68
507	0.64
508	0.62
509	0.57
510	0.57
511	0.58
512	0.61
513	0.6
514	0.54
515	0.55
516	0.6
517	0.61
518	0.59
519	0.52
520	0.48
521	0.41
522	0.4
523	0.37
524	0.3
525	0.29
526	0.25
527	0.23
528	0.23
529	0.25
530	0.29
531	0.38
532	0.46
533	0.49
534	0.57
535	0.68
536	0.73
537	0.78
538	0.83
539	0.84
540	0.86
541	0.81
542	0.76
543	0.7
544	0.62
545	0.56
546	0.48
547	0.42
548	0.34
549	0.37
550	0.35
551	0.32
552	0.32
553	0.33
554	0.38
555	0.37
556	0.41
557	0.44
558	0.49
559	0.5
560	0.5
561	0.54
562	0.48
563	0.48
564	0.45
565	0.44
566	0.42
567	0.44
568	0.46
569	0.41
570	0.4
571	0.39
572	0.36
573	0.31
574	0.27
575	0.25
576	0.19
577	0.17
578	0.17
579	0.19
580	0.22
581	0.23
582	0.24
583	0.26
584	0.31
585	0.37
586	0.43
587	0.47
588	0.52
589	0.56
590	0.61
591	0.64
592	0.63
593	0.58
594	0.53
595	0.48
596	0.42
597	0.37
598	0.28
599	0.22
600	0.19
601	0.18
602	0.16
603	0.16
604	0.13
605	0.12
606	0.12
607	0.11
608	0.12
609	0.12
610	0.12
611	0.11
612	0.12
613	0.14
614	0.2
615	0.2
616	0.22
617	0.26
618	0.32
619	0.38
620	0.41
621	0.49
622	0.51
623	0.56
624	0.6
625	0.6
626	0.59
627	0.53
628	0.51
629	0.45
630	0.39
631	0.35
632	0.28
633	0.29
634	0.27
635	0.26
636	0.25
637	0.25
638	0.25
639	0.27
640	0.28
641	0.28
642	0.28
643	0.29
644	0.3
645	0.27
646	0.25
647	0.27
648	0.35
649	0.35
650	0.35
651	0.4
652	0.39
653	0.4
654	0.4
655	0.46
656	0.45
657	0.47
658	0.49
659	0.43
660	0.42
661	0.43
662	0.44
663	0.36
664	0.33
665	0.27
666	0.26
667	0.3
668	0.33
669	0.39
670	0.41
671	0.45
672	0.47
673	0.52
674	0.53
675	0.57
676	0.57
677	0.51
678	0.53

C5FGT8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer